2024年3月16日-17日

ハンタウイルス 米国 EID
エムポックス コンゴ(民) Eurosurveillance
腸チフス サブサハラ,ワクチン

● ハンタウイルス 米国
PRO/AH/EDR> Hantavirus - Americas (09): USA (MI)
Archive Number: 20240317.8715441
 情報源 Emerging Infectious Diseases 2024年3月16日
原著タイトル Case of human orthohantavirus infection, Michigan, USA, 2021. Emerg Infect Dis.
Abstract
オルトハンタウイルス Orthohantaviruses はハンタウイルス心肺症候群 hantavirus cardiopulmonary syndrome の原因となる; 症例の多くは米国南西部 the southwest region of the United States で発生する。
今回、ミシガン Michigan 州の65歳女性のオルトハンタウイルス感染症の症例について、系統発生学的関連と捕獲したげっ歯類 the phylogeographic link of partial viral fragments from the patient and rodents captured near the presumed site of infection について検討する。
[Background, abridged]
主なハンタウイルス The dominant orthohantavirus that causes HCPS in the United States は Sin Nombre virus (SNV) で the western deer mouse (_Peromyscus sonoriensis_) が保有すると考えられている。
New York virus (NYV) はもう1種類のウイルス another pathogenic variant of orthohantavirus で、white-footed deer mice (_Peromyscus leucopus_) が保有する; 症例は基本的に the Northeast region of the country にみられる。
Although multiple host reservoirs for orthohantaviruses are distributed throughout the United States, most human cases are caused by SNV (4,5).
[The case]
2021年5月、生来健康であった65歳女性が、救急室 an emergency department in Washtenaw County, Michigan, USA を受診し、3-6日間の発熱があり、血小板数減少、軽度トランスアミナーゼ上昇、原因不明ながら気管内挿管を必要とする急性低酸素性呼吸不全を認めた。広範囲の感染症スクリーニング An extensive infectious disease workup により SARS-CoV-2, common respiratory viruses, fungal agents, and _Legionella_ spp などの呼吸器疾患の病原体は除外された。家族からの聞き取りで、過去1年間のミシガン州外への旅行はなく、未殺菌乳製品や加熱不十分な肉の摂取もないことが確認された。室内犬を飼育し、near a natural area の居住ではあるが、trails/sidewalks は立ち入らず、自宅内のげっ歯類も確認されていなかった。ただし配偶者から、2年間使用していなかった親族の家屋の清掃を最近行っており、そこには mice が棲みついていた、との情報が得られた。
[Results, abridged]
We compared fragments by using phylogenetic analysis against several known orthohantavirus reference sequences to determine potential identification. The partial sequences of SNV short [S] and medium [M] segments from the patient formed a phylogenetic lineage with SNV sequences from the rodents collected in or near the suspected site of exposure in Michigan. However, the patient's large fragment [L] formed a lineage with NYV, suggesting that this species may be an SNV or NYV variant (Figure [available at source URL]).
[Results and conclusions, abridged]
... We found infected _P. leucopus_ mice and _T. striatus_ chipmunks at the site of exposure, both of which have been reported to carry NYV or SNV; _P. leucopus_ mice are susceptible and capable vessels for SNV replication after laboratory infection (6,8-10). 
以上の結果から、orthohantaviruses は、以前から考えてられている以外の宿主にも保有されている  may not be as species host-restricted as previously thought。
写真 white-footed deer mice _(Peromyscus leucopus_) https://animals-are-cool.fandom.com/wiki/White-Footed_Mouse and Eastern chipmunks (_Tamias striatus_) at https://www.treehugger.com/things-you-dont-know-about-chipmunks-4864283
参考項目 2021
Hantavirus - Americas (05): USA (MI, NV) 20210611.8439979

● 麻疹 米国,カナダ
PRO/EDR> Measles - USA, Canada: up to date numbers
Archive Number: 20240317.8715438
[1] USA
 情報源 CBS News 2024年3月15日
USA measles milestone: 60 cases so far in 2024 -- more than all of 2023
The USA has now tallied at least 60 confirmed or suspected measles cases investigated so far in 2024 by authorities in 17 states -- more than the 58 cases reported nationwide in all of 2023. 
[2] Canada: Canadian Broadcasting Corp 3月16日
Canada heading toward major measles outbreak without vaccine boost, new modeling suggests
As measles cases keep appearing in more parts of the country, new projections suggest there's a high chance Canada may experience a "sizable outbreak" -- with anywhere from dozens to thousands of people infected if the disease strikes communities with low vaccination rates.
As of Friday [15 Mar 2024], at least 31 cases of measles have been reported so far this year across Canada, according to a CBC News tally of provincial and regional figures released by public health teams.
Quebec / 21
Ontario / 8
British Columbia / 1
Saskatchewan / 1
関連項目 
Measles - USA (21): (OH) Cincinnati arena performance exposure 20240315.8715408

● エムポックス コンゴ(民)

PRO/AH/EDR> Mpox update (13): Congo DR, cases in new regions, clade I sub-lineage
Archive Number: 20240317.8715437
[1] First mpox virus cases in new regions
 情報源 Firstpost 2024年3月15日
保健省 the health ministry によると,国内の複数の地点 the Republic of Congo in a number of locations において,(地域で)初めてのエムポックス its 1st instances of mpox が確認されており,2023年に大陸内初の性感染が確認されて以来,アフリカ全域に感染が拡大しつつあることが示唆されるとしている。このウイルスは通常,ヒトの感染が起きる前に野生動物が感染し,その後ヒトでの感染が拡がる。研究用のサルではじめてウイルスが発見されたため,かつてサル痘 monkeypox と呼ばれていた。
2023年11月,the World Health Organisation により the 1st-ever sexual transmission of mpox in Congo が確認され,African scientists がコントロール不能となることを懸念していた。
3月13日 the health ministry of the Republic of Congo の発表で,43 cases in 9 out of the country's 12 departments が報告されたとされているが,他のコメントはなかった。
[Mod.CS- 最小限の介入しか行われていないので,The further spread of mpox within DRC は残念だが不思議ではない。the 2022 outbreak 以降,症例の増加が続いているが,性的嗜好への偏見 discriminatory views of the LGBTQ population に伴う疾患へのスティグマ a large stigma もあり,ワクチン接種へのアクセスが確保されていない。Without prompt intervention we should expect to continue to see the spread of mpox both within and outside of the DRC.]
[2] A novel clade I sub-lineage
 情報源 Eurosurveillance 2024年3月14日
原著タイトル Ongoing mpox outbreak in Kamituga, South Kivu province, associated with monkeypox virus of a novel Clade I sub-lineage, Democratic Republic of the Congo, 2024. Euro Surveill. 2024;29(11):pii=2400106.
Introduction
コンゴ民主共和国 the Democratic Republic of the Congo (DRC) において,2023年初以降,エムポックスの原因ウイルス mpox virus (MPXV) の感染が疑われる患者が増え続けており,up to 12 Nov 2023 の時点で年間最多となる1万2569例 suspected mpox cases が報告されている。致死率は4.6%; さらに過去に感染が確認されていなかった地域 Kinshasa and South Kivu province で新たな感染例が確認された。このような懸念される状況にあるにもかかわらず,感染循環するウイルスに関する遺伝情報はごく限られているが,Clade I に属すると考えられている。
... we sequenced mpox viral genomes from recently diagnosed cases in South Kivu, DRC.
Discussion
MPXV is an emerging zoonotic virus belonging to the Poxviridae family and the genus Orthopoxvirus. 
過去において MPXV は基本的には West and Central Africa にみられる疾患であったが,2022年に the World Health Organization (WHO) が a multi-country global outbreak of MPXV of Clade IIb を宣言した。このアウトブレイクは主に communities of men having sex with men (MSM) の感染とされているが,感染のある患者と性的接触のない人々の間でも限定的な感染が報告されている。
1970年にはじめてヒトの感染が報告された DRC では,その後徐々に報告が増え続けていた。とりわけ2023年に国内で suspected MPXV cases の増加があり,なじみのない地域であったことから,ウイルスの特徴と疫学に変化が起きている可能性が考えられている。
そのため,感染循環する株の遺伝学的情報を得ることは重要で,Rwanda and DRC の研究者らに最近,both wet-laboratory sequencing and dry-laboratory sequence analysis を行うための MPXV whole genome Nanopore sequencing training が施された。
the mpox outbreak in Kamituga, South Kivu のアウトブレイクでは,6件の完全に近い解析 near-to-complete MPXV sequences derived from local patients hospitalised with mpox が得られている。
発生系統学的解析 Phylogenetic analyses of these sequences together with those available for other Clade I and II viruses により,これらのウイルス株は a new sub-lineage near the root of Clade I に位置し,この地域で発生したアウトブレイクは新たな導入によるものであることが示唆され, from a zoonotic reservoir による可能性がもっとも高い。
sequences from a small 2023 Kinshasa outbreak は入手できないが,系統樹上の位置 the placement of those sequences in a published phylogenetic tree から,the outbreak in Kinshasa には関連しないことが示唆される。
Our findings therefore suggest that there are at least 2 independent outbreaks ongoing in DRC .... 
Conclusion
まとめると,今回の知見から,現行の DRC のアウトブレイク mpox cases の原因となるウイルスの全遺伝子塩基配列 whole genome sequencing of a larger subset of MPXV と情報の共有が,流行の理解に不可欠であることが示された。

● E型肝炎 チャド
PRO/EDR> Hepatitis E - Chad: (OA) Sudanese refugees
Archive Number: 20240316.8715430
 情報源 Source: ReliefWeb via Médecins Sans Frontières (MSF) 2024年3月15日
Urgent action needed as hepatitis E spreads through Sudanese refugee camps in Chad
E型肝炎 Hepatitis E が,55万人を超えるスーダンからの難民 Sudanese fleeing the conflict in neighboring Sudan のいる東部の難民キャンプ refugee camps in eastern Chad に蔓延していると Médecins Sans Frontières (MSF) が警戒を呼び掛けている。across Chad's Ouaddai province 全域に点在する各キャンプでは,不衛生な環境と絶望的な水不足により事態が悪化している。
[Mod.LL- The following is from the WHO's hepatitis E fact sheet:
"Cases of hepatitis E を,臨床的に他の急性ウイルス性肝炎と鑑別することはできないが,蔓延状況や水の汚染のリスク,妊娠女性の重症化,A型肝炎の除外などの疫学状況により,強く疑うことは可能となる。
"Definitive diagnosis of hepatitis E infection 確定診断は,患者の血中特異 IgM 抗体 specific anti-HEV immunoglobulin M (IgM) antibodies の確認; 疾患が多い地域では適切であることが多い。迅速検査 Rapid tests are available for field use。Additional tests include reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR) to detect the hepatitis E virus RNA in blood and stool(血液または便). This assay requires specialized laboratory facilities." (WHO).
以下に現在のワクチンに関するレビューを示す。
対象地域が辺地にあり,コールドチェーンを必要とし,3回接種となることが接種を困難にあする。コレラワクチンは,アウトブレイクで使用されるずっと以前から使用されていたことは注目に値する。
Prophylactic Hepatitis E Vaccine. In: Wang Y (ed) Hepatitis E Virus. Advances in Experimental Medicine and Biology (AEMB), vol 1417. Springer, Singapore. 
Abstract
"The hepatitis E has been increasingly recognized as an underestimated global disease burden in recent years. Subpopulations with more serious infection-associated damage or death include pregnant women, patients with basic liver diseases, and elderly persons. Vaccine would be the most effective means for prevention of HEV infection. The lack of an efficient cell culture system for HEV makes the development of classic inactive or attenuated vaccine infeasible. Hence, the recombinant vaccine approaches are explored deeply. The neutralizing sites are located almost exclusively in the capsid protein, pORF2, of the virion. Based on pORF2, many vaccine candidates showed potential of protecting primate animals; 2 of them were tested in human and evidenced to be well-tolerated in adults and highly efficacious in preventing hepatitis E. The world's first hepatitis E vaccine, Hecolin (HEV 239 vaccine), was licensed in China and launched in 2012."]

● ポリオ パキスタン
PRO/EDR> Poliomyelitis update (08): Pakistan (BA) new case
Archive Number: 20240316.8715429
 情報源 Samaa TV 2024年3月14日
パキスタン Pakistan から2024年初のポリオ its first polio case of the year 2024 を報告した [This seems to be the 2nd case in 2024 in Pakistan- Mod.PKB]
the Dera Bugti district of Balochistan の2歳半の症例である。
the National Institute of Health (NIH) は,残念ながら同地域で13年ぶりの再興である the reappearance of polio in the Dera Bugti district after a prolonged hiatus of 13 years と報告している。患児に発熱と筋力低下があり,2月22日に行われた検査で明らかになった。the NIH の検査で,the presence of poliovirus type 1 in the affected child と確認され,コミュニティ内の感染伝播が懸念されている。
[Mod.PKB- Afghanistan and Pakistan are the only 2 remaining polio-endemic countries in the world.
The yearly wild poliovirus (WPV) cases in Pakistan since 2019
この情報から,2024年にパキスタン国内で2例の野生株ポリオウイルス感染例 WPV cases が確認されおり,one case each in Dera Bugti district and Chaman district in Balochistan province となっている]
参考項目 2023
Poliomyelitis update (36): Pakistan (KP) 6th case, sewage (WPV1) 20231204.8713492

● 腸チフス サブサハラ,ワクチン

PRO/EDR> Typhoid fever - Sub Saharan Africa: vaccine indication
Archive Number: 20240317.8715432
 情報源 EurekAlert! 2024年3月12日
Major typhoid fever surveillance study in sub-Saharan Africa indicates need for the introduction of typhoid conjugate vaccines in endemic countries
sub-Saharan African countries サブサハラのアフリカ諸国に,腸チフス typhoid fever の大きな負荷がかかっていることが,3月12日の The Lancet Global Health 掲載の論文で示されている。
This high ben [?] に加え,抗生物質治療に抵抗性の腸チフス菌株がみられることから,安全な水の確保,衛生状態の改善とともに,常在地域における腸チフス結合型ワクチン接種 typhoid conjugate vaccines (TCVs) の供給と実施を含むより強固な感染防止策が求められている。
この4年間の研究 this 4-year study,the Severe Typhoid in Africa (SETA) program では,ブルキナファソ,コンゴ(民),エチオピア,ガーナ,マダガスカル,ナイジェリアの6か国の腸チフスの発生状況 new typhoid fever burden の結果が与えられ,うち4か国では a high burden とされる人口10万人当たり年間100例以上が記録されている。最も腸チフスの発生率が高いのは人口10万対315例/年のコンゴ(民)で,調査したすべての地点 across all 25 study sites において,2-14歳の小児に最も高い感染リスクが認められた。毎年1250万ー1630万例の腸チフス感染と,14万例の死亡が発生する計算となる。発熱など一般的な症状であり,確定診断に血液検査が必要となることから,政府当局が正確な発生状況をとらえることは難しい ...
さらに,抗生物質耐性腸チフス菌 the emergence of antimicrobial resistance (AMR) in _Salmonella_ Typhi, the bacterium that causes typhoid fever の新興が,従来からの第1選択の抗生物質治療を超える信頼性(のある方法)を求める led to more reliance beyond 結果となっている。治療が行われなければ,重症例では消化管穿孔と死亡につながるおそれもある。
There are 2 TCVs(腸チフス結合型ワクチン)prequalified by the World Health Organization (WHO) and available through Gavi, the Vaccine Alliance. In February 2024, IVI and SK bioscience announced that a 3rd TCV, SKYTyphoid™, also achieved WHO PQ, paving the way for public procurement and increasing the global supply. Alongside the SETA disease burden study, IVI has been working with colleagues in 3 African countries to show the real-world impact of TCV vaccination. These studies include a cluster-randomized trial in Agogo, Ghana and 2 effectiveness studies following mass vaccination in Kisantu, DRC and Imerintsiatosika, Madagascar."
[Mod.LL- Typhoid fever, so-called enteric fever(いわゆる腸チフス)は、チフス菌 _Salmonella enterica_ serotype Typhi を原因とし、より一般的なサルモネラ感染症とはまったく違う症状を示す。疫学上、汚染のある食品または水により感染が拡大し、他のサルモネラ感染症のような人獣共通感染症ではない。臨床症状として、典型的には嘔吐と下痢はみられない: それどころか、便秘を報告することがよくある。
全身性疾患であるため、enteric fever では、血液培養と便培養の陽性率は、特の病初期においては、少なくとも同程度であり、骨髄培養がもっとも鋭敏かもしれない。
古典的症状 The symptoms of classical typhoid fever には、発熱、食欲不振、嗜眠、倦怠、持続性の鈍い頭痛、乾性咳嗽、不明瞭な腹痛、便秘などがある。
発熱(しばしば高熱)のわりに、脈拍数の上昇はわずかであることが多い。疾患の第2週目に入ると、遷延性の発熱と精神的鈍化 mental dullness, classically called coma vigil(覚醒昏睡)と呼ばれている、がみられるようになる。下痢を発症することもあるが、常にではない。多くの患者に肝腫大・脾腫がみられる。第1週目が過ぎる頃、多数の患者で上腹部の斑状丘疹 a maculopapular rash ("rose spots、バラ疹 ?") が現れる: 直径約2cmで圧迫により消退する。2-4日間持続し、may come and go. 軽症例 Mild や非典型例 atypical infections も多い。
The word typhoid (as in typhus-like) の用語が、シラミが媒介する発疹チフス the louse-borne rickettsial disease epidemic typhus と typhoid fever において似ており、実際にある地域では今も typhoid fever は腸チフス abdominal typhus と呼ばれている...
The study cited is: Incidence of typhoid fever in Burkina Faso, Democratic Republic of the Congo, Ethiopia, Ghana, Madagascar, and Nigeria (the Severe Typhoid in Africa programme): a population-based study. Lancet Global Health 2024;12:e599-610.
Abstract
"Background: Typhoid Fever remains a major cause of morbidity and mortality in low-income settings. The Severe Typhoid in Africa programme was designed to address regional gaps in typhoid burden data and identify populations eligible for interventions using novel typhoid conjugate vaccines.
Methods
Findings
Interpretation: High disease incidence (i.e., >100 per 100 000 person-years of observation) recorded in 4 countries, the prevalence of typhoid hospitalizations and complicated disease, and the threat of resistant typhoid strains strengthen the need for rapid dispatch and implementation of effective typhoid conjugate vaccines along with measures designed to improve clean water, sanitation, and hygiene practices."]

● 豚熱 日本
PRO/AH/EDR> Classical swine fever - Japan: wild, domestic, WOAH
Archive Number: 20240317.8715443
 情報源 WOAH-WAHIS (World Animal Health Information System) 2024年3月15日CLASSICAL SWINE FEVER - JAPAN: WILD, DOMESTIC, WOAH
Japan - Classical swine fever virus (Inf. with) - Follow-up report 24
Started: 1 Jan 2022
Reason for notification: Recurrence of an eradicated disease
Disease: Classical swine fever
Causal agent: Classical swine fever virus
Diagnosis details: Clinical, laboratory
Genotype / Serotype / Subtype: -
Date of last occurrence: 7 Jan 2022
Event status: Ongoing
Quantitative data summary (total):
感染した種/個体数/感染数/死亡/廃棄/処分/ワクチン
Wild boar (wild) / - / 2006 / 463 / 1543 / 0 / 0
Swine (domestic) / 89 602 / 298 / 250 / 89 352 / 0 / 0
All species / 89 602 / 2304 / 713 / 90 895 / 0 / 0

● 鳥インフルエンザ カナダ,米国 H5N1
PRO/AH/EDR> Avian influenza (29): Americas (USA, Canada) HPAI, H5N1, commercial poultry, layers, turkey
Archive Number: 20240317.8715431
Canada
[1] Alberta (Mountain View County): commercial poultry
 情報源 St Albert Gazette 2024年2月23日
Bird flu detected on Central Alberta farm
The province's 2nd H5N1 highly pathogenic avian influenza outbreak of 2024 was declared this week at a commercial poultry operation in Mountain View County.
USA
[2] Missouri (Dallas County): turkeys
 情報源 WattPoultry 2月23日
Avian flu infects 3 turkey flocks in same Missouri county
Three commercial meat turkey flocks in Missouri have been infected with highly pathogenic avian influenza (HPAI).
The United States Department of Agriculture (USDA) Animal and Plant Health Inspection Service (APHIS) reported the presence of HPAI was confirmed on 3 premises in Dallas County on 21 Feb 2024.
[3] Missouri (Dallas County): commercial layers
 情報源 WattPoultry 2月26日
More avian influenza confirmed in Dallas County, Missouri
Highly pathogenic avian influenza (HPAI) has appeared in a commercial table egg layer flock in the same Missouri county where 3 commercial turkey flocks had just been affected by the virus.
The United States Department of Agriculture (USDA) Animal and Plant Health Inspection Service (APHIS) reported a flock of 20 300 layers in Dallas County, Missouri, had been infected with HPAI. This case was confirmed on 23 Feb 2024 just 2 days after [21 Feb 2024] the presence of HPAI was confirmed in 3 flocks in Dallas County.
[4] South Dakota (Hutchinson County): turkeys
 情報源 WattPoultry 3月14日
Avian influenza resurfaces in US commercial poultry
A commercial meat turkey flock in South Dakota is the 1st case of highly pathogenic avian influenza (HPAI) in a U.S. commercial poultry operation in roughly 3 weeks.
The United States Department of Agriculture (USDA) Animal and Plant Health Inspection Service (APHIS) reported the presence of HPAI was confirmed in a turkey flock in Hutchinson County on 12 Mar 2024. There were 31 200 birds affected.
関連項目 
Avian influenza (24): Americas (USA) HPAI, turkey, pheasant, game bird, layer, backyard flock 20240224.8715019

● ヒツジ痘,ヤギ痘 モンゴル
PRO/AH/EDR> Sheep pox & goat pox - Mongolia: sheep, WOAH
Archive Number: 20240316.8715417
 情報源 WOAH-WAHIS (World Animal Health Information System) 2024年3月15日
Mongolia - sheep pox and goat pox - Immediate notification
Started:14 Jan 2024
Date of last occurrence: 22 Aug 2022
Reason for notification: Recurrence of an eradicated disease
Disease: Sheep pox and goat pox
Causal agent: Sheeppox virus and goatpox virus
Genotype / Serotype / Subtype: -
Outbreak location 1: Tsaviin ikher bag, Bayangol, Ovorhangay, Mongolia (ob_133095): Farm
Outbreak location 2: Khongoriin baruun khotol, Erdenedalai, Dundgovi, Mongolia (ob_133094): Farm
感染した種/個体数/感染数/死亡/廃棄/処分/ワクチン
Sheep (domestic) / 1107 / 27 / 0 / 0 / - / 1080

● アフリカ豚熱 モンゴル
PRO/AH/EDR> African swine fever - Asia (14): Mongolia (SL) domestic, WOAH
Archive Number: 20240316.8715416
 情報源 WOAH-WAHIS (World Animal Health Information System) 2024年3月15日
Mongolia - African swine fever virus (Inf. with) - Follow-up report 1
Started: 29 Jul 2023
Date of last occurrence: 27 Mar 2019
Reason for notification: Recurrence of an eradicated disease
Disease: African swine fever
Causal agent: African swine fever virus
Genotype / Serotype / Subtype: -
Outbreak location: Shiree nuur Nomgon 3r bag, Saykhan, Selenge, Mongolia (ob_133090): Farm
感染した種/個体数/感染数/死亡/廃棄/処分/ワクチン
Swine (domestic) / 7 / 7 / 3 / 4 / 0 / -
Quantitative data summary (total, includes new outbreak ob_133090 and updated outbreaks ob_124501 and ob_124502)
感染した種/個体数/感染数/死亡/廃棄/処分/ワクチン
Swine (domestic) / 358 / 73 / 692 / 89 / 0 / 0