● 大腸菌 カナダ キムチ
PRO/AH/EDR> E. coli EHEC - Canada: (AL, SK) O157, kimchi, alert, recall
Archive Number: 20220130.8701165
情報源 Food Poisoning Journal 2022年1月29日
28日現在，14例の大腸菌 O157 感染 laboratory-confirmed cases of _E. coli_ O157 illness が次の各地域 provincesで確認されている : Alberta (13) and Saskatchewan (1)。発病したのは 2021年12月から 2021年1月初旬で，死亡や入院は報告されていない。患者の年齢は 0歳から64歳で，64%が女性である。保健当局 The Public Health Agency of Canada (PHAC) のこれまでの調査で，今回のアウトブレイクとキムチ Hankook (Korean characters only) brand Original Kimchiとの関連が判明している。患者の多くが，発症前にこのキムチを摂取したと報告している ... 28日，賞味期限が 2022年1月29日の 2L容器入り Hankook brand Original Kimchi の自主回収が発表された ...
● リーシュマニア症 ボリビア
PRO/AH/EDR> Leishmaniasis - Bolivia: (TR) susp
Archive Number: 20220130.8701160
情報源 El Pais 2022年1月27日
リーシュマニア症（疑い）アウトブレイク the possible outbreak of leishmaniasis の調査のため，国立衛生研究所 the National Institute of Health Laboratories (Inlasa) and the National Center for Tropical Diseases (Cenetrop) のチームが the city of Villa Montes に到着した。市内で感染例とみられる 2例が確認されているとのべた。
● COVID-19（36）中国 海外由来
PRO/AH/EDR> COVID-19 update (36): animal, human, China (Hong Kong), hamster, foreign origin
Archive Number: 20220130.8701158
情報源 Preprints with the Lancet, SSRN 2022年1月29日
原著 Yen Hui-Ling, Sit THC, Brackman CJ, et al. Transmission of SARS-CoV-2 (Variant Delta) from Pet Hamsters to Humans and Onward Human Propagation of the Adapted Strain: A Case Study. Available at SSRN:
要約
（背景）ヒトから動物へのウイルス感染伝播 Transmission of SARS-CoV-2 が報告されているが，これまでのところ飼育されていたミンク farmed mink をのぞいて，感染動物からヒトへの感染やヒトでの感染伝播の拡がりについての報告はない。ペットショップの店員の感染確認に続き，店内と同店への卸倉庫のペットについてウイルス検査が行われた。
（結果）Over 50% of individually tested Syrian hamsters in the pet shop (8/16) and warehouse (7/12) were positive for SARS-CoV-2 infection in RT-PCR or serological tests.
dwarf hamsters (n = 77), ウサギ (n = 2) で陽性と確認された動物はなかった。感染したヒトとハムスターからの検出されたウイルスはすべてデルタ株 delta variant of concern (AY.127) で，これ以前に地域内での感染は確認されていなかった ...
（解釈）Pet hamsters can be naturally infected in "real-life" settings.
ハムスター間で感染が循環し，ヒトに感染する可能性がある。遺伝学的および疫学的証拠により，2つの独立したハムスターからヒトへの感染伝播事例があったことが強く示唆され，さらにヒトの間に感染が拡がる可能性がある。感染したハムスターの輸入が感染源であった可能性が高い。
[Mod.AS－ ... 原文参照願います。]
関連項目
COVID-19 update (31): animal, human, China (Hong Kong) hamster, origin discussed 20220126.8701086
● COVID-19（35）オミクロンの起源
PRO/AH/EDR> COVID-19 update (35): omicron origin, antibody response, updates, HiP-CT, WHO
Archive Number: 20220130.8701157
[1] Omicron: origin
Where did omicron come from? Three key theories
情報源 Nature 2022年1月28日
南アで初めて発見されてから 2か月と少しが過ぎたところだが，オミクロン変異株はこれまでのどの変異株よりも急速に全世界に拡大した。研究者らが追跡する中，今も起源については判っていない。オミクロンとそれ以前 its predecessors を結びつけるはっきりとしたリンクは確認されていない。デルタやアルファなどの以前の変異株と大きく異なっていて，進化ウイルス学者によると，最も近い遺伝学的祖先は，1年以上前の 2020年中期まで遡ると推定する ...
Craziest genome
Silent spredd
Chronic infection
Mouse or rat
In the dark ... オミクロン新興の答えは，おそらく（上記の）1ないし 3つのシナリオの混合だろう。しかしオミクロンが現在ある過程の説明にはたどり着けていないし，ましてや次の変異株がどのようなものかを予測することなどできない。また多くの科学者らは，オミクロンの起源を明らかにすることはできないかもしれない，と述べている。
[2] Antibody response
情報源 Eurosurveillance 2022年1月27日
原著 Variability in detection of SARS-CoV-2-specific antibody responses following mild infection: a prospective multicentre cross-sectional study, London, United Kingdom, 17 Apr to 17 Jul 2020. Euro Surveill. 2022;27(4):pii=2002076.
要約
（目的）無症候性または軽症の感染後の，抗ヌクレオカプシド anti-nucleocapsid (anti-NP; the majority) および抗受容体結合ドメインを含むスパイクタンパク the potentially neutralising anti-spike antibodies (including anti-receptor-binding domain; anti-RBD) に対する抗体それぞれの検出能の変動を評価し，症状と抗体反応との相関性を分析する。
（結論）絶対的抗体陽性転化 absolute seroconversion および結合比 binding ratios (BR)について，SARS-CoV-2 anti-RBD IgG（抗レセプター結合ドメイン IgG） 抗体と，抗ヌクレオカプシド IgG 抗体に有意な相関が認められた。有症状の，特に発熱の症状のある患者でより結合比が高かった Higher BR 。アッセイ間の変動 Inter-assay variability (12.5%) は明らかで，適切な血清陽性率調査 optimising seroprevalence testing strategies/studiesraises のため，考慮すべきである。
Final Conclusion ...
[3] COVID: updates
COVID-19 tracker: World hits 10B COVID shots administered; serious inflammatory post-COVID illness much more prevalent in unvaccinated kids
情報源 Fierce Pharma 2022年1月28日
27日現在，世界で 100億回分のワクチン接種が完了しているが，ワクチンを接種していない小児は，COVID-19 感染時に multi-system inflammatory syndrome (MIS-C) のリスクが高くなると，an Epic Research study で報告された ...
ほか，参考となる情報と情報源など， ... 原文参照願います。
[4] Recommended reading: hierarchical phase-contrast tomography (HiP-CT)
World's brightest x-rays reveal COVID-19's damage to the body
情報源 National Geographic 2022年1月26日
hierarchical phase-contrast tomography (HiP-CT) と呼ばれる，強力で新たな種類の X線スキャンを開発した国際的研究チームの一部は，人体のうちの，すべての臓器から遂には細小血管や個々の細胞までの拡大像を描出するところにまで至っている。この技術により，肺血管が COVID-19 によりどのようなダメージを受け形を変えたか，という新たな視点が与えられている ...
[5] WHO: daily new cases reported (as of 28 Jan 2022)
情報源 WHO 2022年1月28日
[Data by country, area, or territory for 28 Jan 2022]
[6] Global update: Worldometer accessed 28 Jan 2022 20:17 EST (GMT-5)
情報源 Worldometer 2022年1月28日
[A 7-day series of cumulative data reported by countries, territories, and reporting entities]
Total number of reported deaths: 5 668 110
Total number of worldwide cases: 370 456 718
Number of newly confirmed cases in the past 24 hours: 3 560 087
関連項目
COVID-19 update (34): booster dose, mix & match vaccines, pulse oximeters, WHO 20220128.8701138