2022年2月4日


●　鳥インフルエンザ カナダ 家きん
High pathogenicity avian influenza viruses (poultry) (Inf. with), Canada
PRO/AH/EDR> Avian influenza (34): Americas (Canada) poultry, HPAI H5N1, OIE
Archive Number: 20220204.8701269
　情報源 OIE-WAHIS (World Animal Health Information System) 2022 2022年2月4日
感染開始時期　30 Jan 2022
前回流行時期　28 Jul 2015
病原体　Highly pathogenic avian influenza virus，Serotype: H5N1
新たな感染流行(1)
Outbreak location: Western Nova Scotia, Kings, Subd. A, Kings, Nova Scotia，Farm
種/個体数/感染/死亡/廃棄/と畜/ワクチン接種
Birds / 11 800 / 6146 / 6146 / 0 / 0 / -
Affected population: NS-HPAIP-2022-001 Commercial turkey farm with 2 groups of 5900 birds each: 98% mortality in the 9-week-old birds and 6% mortality in the 3-week-old birds. 

●　炭疽（03）インドネシア，コンゴ(民)
PRO/AH/EDR> Anthrax - Indonesia (03): (YO) livestock, human
Archive Number: 20220204.8701265
　情報源 Reuters 2022年2月4日
炭疽 anthrax により数頭の家畜が死亡したことから，インドネシア政府当局は，ジャワ島 Java island の 2つの村をレッドゾーンに指定し，家畜の移動を禁止したと，4日明らかにされた。死亡した家畜 15頭のうち，ウシ7頭，ヤギ1頭が炭疽と診断されている。23人に皮膚感染症があり，感染動物に触れたり肉を食べたりしたとみられている。

PRO/AH/EDR> Anthrax - Congo DR: (SK) human, guinea pig
Archive Number: 20220204.8701263
　情報源 Outbreak News Today 2022年2月3日
the Kalonge health zone in South Kivu の当局は，the Kalonge group in Kalehe territory in South Kivu で 9人が炭疽に感染したことを確認している。このうち 2人が死亡し，7人が治療を受けている ... 

●　肺炎 ヒツジ　米国
PRO/AH/EDR> Pneumonia, ovine - USA: (WA) bighorn sheep
Archive Number: 20220204.8701264
　情報源 YAKTRINEWS.com 2022年2月2日
野生動物保護当局 The Washington Department of Fish and Wildlife は，the Yakima River Canyon area のビッグホーン bighorn sheep の間で発生する肺炎アウトブレイク a pneumonia outbreak による被害を最小限にとどめる努力を続けている ... 

●　梅毒　米国
PRO/EDR> Syphilis, gonorrhea - USA: (NYC) rising incidence, Black & Latin women, alert
Archive Number: 20220204.8701262
　情報源 NBC New York, NYC Health Department report 2022年2月2日
- The New York City [NYC] Health Department が，2021年上半期の New York City 市内の黒人およびラテン系女性の間で，淋病 gonorrhea と梅毒 syphilis cases 症例の増加がみられたと発表した。
- 2019年上半期から，淋病は 23%，女性の 1期および2期梅毒は 17% の増加がみられた ... 以下，原文参照願います。　

●　トリパノソーマ症 アフリカ　コンゴ(民)
PRO/AH/EDR> Trypanosomiasis, African - Congo DR
Archive Number: 20220204.8701261
　情報源 Congo Réformes [in french]　2022年1月31日
コンゴ民主共和国全 26州のうち，22州で睡眠病 sleeping sickness [アフリカトリパノソーマ症 human African trypanosomiasis] が確認されている。WHO によると 560万人に感染のリスクがあり，コンゴ(民)からアフリカ全体の 85% が報告されている。2021年，全国で 387例が確認された ... ツェツェ蠅がベクターとなり感染が伝播され，治療が行われない場合は死に至る。
[Mod.EP－ Human African trypanosomiasis, HAT, or sleeping sickness, is endemic in Congo DR especially in the western and southern provinces. (The elimination of human African trypanosomiasis: Achievements in relation to WHO road map targets for 2020. PLoS Negl Trop Dis. 2022 Jan 18; 16(1): e0010047; )]
参考項目　2005
Trypanosomiasis - Congo DR (East Kasai): 20050911.2691

●　リンパ系フィラリア症　ナイジェリア
PRO/EDR> Lymphatic filariasis - Nigeria: treatment campaign
Archive Number: 20220204.8701258
　情報源 This Day 2022年2月3日
国際 NGO The Carter Centre は Plateau and Nasarawa states の 3600万人のナイジェリア人に対する，albendazole and Mectizan [ivermectin] による lymphatic filariasis (elephantiasis and hydrocele) 感染予防事業に取り組んでいる ... the onchocerciasis (river blindness) programme について ... 
参考項目 2018
Lymphatic filariasis - Côte d'Ivoire 20180215.5629809

●　リステリア症　米国 死亡，パック入りサラダ レタス
PRO/AH/EDR> Listeriosis - USA: fatal, packaged salad, contaminated lettuce harvester, recall
Archive Number: 20220204.8701257
　情報源 CBS News 2022年2月2日
回収されているサラダ bags of garden salad が関係するリステリア症アウトブレイク An outbreak of [due to] _Listeria_ により，13州において 2人が死亡し，ほか 17人が発症したと，保健当局が明らかにした。Dole, Kroger, and Nature's Promise ほか 11種類の商品名で販売されている，Dole 製パック入りサラダが関係する，と 1日 US Centers for Disease Control and Prevention が報告している。Dole Fresh Vegetables は _Listeria monocytogenes_が検出されたことを受け，2021年10月末に 10州でサラダ製品の自主回収を行っていた，

●　アフリカ豚熱　欧州　ブルガリア ウクライナ モルドバ
PRO/AH/EDR> African swine fever - Europe (08): domestic, wild boar, OIE
Archive Number: 20220204.8701244
[1] Bulgaria (Petrich): domestic
　情報源 OIE-WAHIS (World Animal Health Information System) 2022 2022年2月2日
[2] Bulgaria (Sandanski): domestic
　情報源 OIE-WAHIS (World Animal Health Information System) 2022 2022年2月2日
[3] Ukraine (Kiev): wild boar
　情報源 OIE-WAHIS (World Animal Health Information System) 2022 2022年2月2日
[4] Moldova (Riscani): domestic
　情報源 OIE-WAHIS (World Animal Health Information System) 2022 2022年2月2日

●　ウエストナイルウイルス オーストラリア ウマ
West Nile virus cases in horses rise in NSW as hot, wet summer fuels mosquito population
PRO/AH/EDR> West Nile virus (02): Australia (NS) horse, fatal
Archive Number: 20220204.8701248
　情報源 ABC Rural 2022年2月2日
the outbreak of 2011 開始以降，ニューサウスウェールズ州 the New South Wales Hunter region のウマ 1頭が死亡し，州全域でさらにウエストナイルウイルス West Nile virus が，かつてない規模で拡がっている。its Kunjin strain も含めた感染例は，蚊の繁殖期となった最近では northern and southern parts of NSW に拡がっている。

◎　Baylisascaris procyonis 米国

PRO/AH/EDR> Baylisascaris procyonis - USA: (OK)
Archive Number: 20220204.8701240
　情報源 Outbreak News Today 2022年2月2日
オクラホマ州 [in Pryor, Oklahoma] の生後 17か月の幼児が，アライグマの寄生虫 the potentially very serious raccoon roundworm, _Baylisascaris procyonis_ に感染した。小児神経科医が時間をかけてようやくこの危険な寄生虫の感染であることを診断した。小児はリハビリ中で，数週間以内に退院する見込みである。_B. procyonis_ は，アライグマの小腸内に寄生する回虫・線虫である。卵がアライグマの排泄物中に排泄され，環境条件を満たせば数年間生存可能である。あやまって環境中，水，その他から卵を飲み込むことで，ヒトおよび動物に感染が起きる。アライグマは通常，the bases of trees, raised forks of trees, fallen logs, rooftops, woodpiles, and decks などの決まった場所 favored areas called latrines で排泄する。寄生虫が，眼球，内臓，脳などに侵入すると，重症さらに死亡につながるおそれがある。ヒトからヒトに感染することはない。ヒトの顕性感染例の報告はこれまで 3ダース以下とまれであるが，new University of Georgia research で不顕性感染 asymptomatic infections の可能性が示唆されている。
[参考 Baylisascaris procyonis_-associated meningoencephalitis in a previously healthy adult, California, USA. Emerg Infect Dis. 2016; 22(8): 1480-4;]
参考項目  2017
Baylisascaris procyonis - USA: human exp 20170103.4739629

●　鳥インフルエンザ　カナダ
PRO/AH/EDR> Avian influenza (33): Americas (Canada) domestic geese, HPAI H5N1
Archive Number: 20220204.8701238
　情報源 The Canadian Press 2022年2月1日
食品監視当局 The Canadian Food Inspection Agency (CFIA) が，ガチョウの鳥インフルエンザによる死亡 the death of a Canada goose as a result of avian influenza H5N1 を確認した。Porters Lake の農場 a hobby farm は，1週間に飼育する 60羽中 59羽を失った ... 

●　原因不明の死亡　ウガンダ

PRO/AH/EDR> Undiagnosed deaths - Uganda: (Kyotera) RFI
Archive Number: 20220204.8701246
　情報源 The Independent 2022年2月1日
Kyotera district の原因不明のアウトブレイクによる死者が 10人に達した。1月28日に新たに Kijonjo parish councilor が死亡した。最初に Nakatoke B village, Kijonjo parish, Kasasa sub-county で報告された 45歳の農夫は，首，顔面，胸部，皮膚の有痛性腫脹と低体温を発症し 5日後に死亡した。Kijonjo A, Kijonjo B, Nakatoke A, and Nakatoke B villages, Kijonjo parish in Kasasa sub-county でアウトブレイクが報告されてから 6か月となる。患者らには，発熱，腫脹，腹痛と胸痛，嘔吐，全身の筋力低下の症状がみられ，1週間以内に死亡する。The World Health Organisation (WHO) and the Ministry of Health が協力して死亡の原因を調査している。当初，Ebola, Marburg, Crimean Congo Hemorrhagic Fever (CCHF), and Rift Valley Fever (RVF) と考えられていたが，Uganda Virus Research Institute (UVRI) -Entebbe に送付した検体の検査で否定された。2021年11月時点で 13人の死亡が報告されており，このうち 9人は原因不明だが同じ症状が認められた ... 
[Mod.TY－ ウガンダで最近クリミアコンゴ出血熱 recent cases of Crimean Congo Hemorrhagic Feverとリフトバレー熱 Rift Valley Fever が確認されているが，Ebola, Marburg, Crimean Congo Hemorrhagic Fever, and Rift Valley Fever は否定されており，臨床症状から病因を特定するしかない]

●　COVID-19（39）刑務所，画像，BMIと死亡 BA.2

PRO/AH/EDR> COVID-19 update (39): prisons, imaging, BMI & mortality, variants, WHO
Archive Number: 20220204.8701247
[1] Federal Bureau of Prisons
　情報源 STAT News 2022年2月2日
全米各地の刑務所で COVID-19 が発生し，オミクロン変異株が拍車をかける中，感染のコントロールは不十分なままであると述べられている。パンデミックの開始以来，3000人近い収容者が COVID-19 により死亡し，若年者が多いことを調整しても一般人口の約 3倍，死亡する可能性が高かった ... 
[2] COVID-19 Scan for 2 Feb 2022
　情報源 CIDRAP (Center for Infectious Disease research and Policy) 2022年2月2日
　A. Imaging shows post-vaccine breakthrough COVID-19 less severe
昨日の Radiology 掲載の報告において，ワクチン接種を完了した患者のブレイクスルー感染が，未接種または未了の COVID-19 患者に比べ，より重症化しにくいことを，画像 imaging を利用して調べられている。from [June to August 2021] の期間に COVID-19 で入院した 761人の患者についての，the COVID-19 Korean Imaging Cohort for COVID-19 (KICC-19) の画像が用いられた。合計 47 patients (6.2%) がワクチン接種を完了しており (breakthrough infection), 127 were partially vaccinated (17%), and 587 (77%) were unvaccinated であった。初期の胸部 X 線検査において，接種を完了したブレイクスルー感染の患者の 75% には肺炎像が認められなかったのに対し，ワクチン未接種の患者では 63% にとどまった。胸部 CT 検査でも，ワクチン接種の状況により重症度に違いが見られた。すなわち，CTスキャンで肺炎像が認められなかった割合は，22% (71/326) in unvaccinated patients, 30% (19/64) in partially vaccinated patients, and 59% (13/22) in fully vaccinated patients ... 
[原著 Imaging and Clinical Features of COVID-19 Breakthrough Infections: A Multicenter Study. Radiology. Published Online: 1 Feb 2022.]
　B. High BMI more strongly connected with COVID death in racial minorities
Body mass index (BMI) は，白人に比べ少数人種 racial minorities において COVID-19-related death 関連死との関連性が大きいことが，Nature Communications 掲載の論文で発表された。the University of Leicester in England の研究チームが，from [January to December 2020] の期間の，BMI のデータのある 40歳以上の成人 1260万人のデータ the electronic health records and census and death data を分析した。33951人の死亡のうち，0.29% [29% ?，以下同じ] each were of patients of Black or South Asian race, 0.27% were White, and 0.18% were of other races だった。すべての人種において BMI は COVID-19 death との間に関係性が見られた tied が，White patients に比べ，Black, South Asian, and other races でより強い関連性が認められた。
たとえば，（すべての）死亡のハザード比 hazard ratios (HRs) for death は，a BMI of 22.5 kg/m2 (標準体重 healthy weight) in White patients との比較において，a BMI of 40 kg/m2 (肥満 obese) の人種ごと White, Black, South Asian, and other races でそれぞれ，1.73, 3.01, 5.25, and 3.89 であった。
the risk of COVID-19 death についてみると，White patients と比較した場合， a low BMI of 20 kg/m2 について Black (HR, 0.95) and other minority patients では差が認められなかったが，South Asian patients でやや高かった slightly higher risk (HR, 1.21)。a BMI of 40 kg/m2 の the risk of COVID-19 death in Black, South Asian, and other minority groups relative to White patients は，1.74, 3.05, and 2.25, respectively と差が開いた ... 
肥満があると，脂肪組織で産生される炎症メディエーターの変化が COVID-19 outcomes を悪化させる可能性がある，と述べている。
[原著 A population-based cohort study of obesity, ethnicity and COVID-19 mortality in 12.6 million adults in England. Nat Commun 13, 624 (2022).
[3] Opinion: detection of new variants
　情報源 New York Times 2022年2月2日
 ... 原文参照願います。

[4] BA.2

　情報源 Science 2022年1月31日
12月7日，オミクロン変異株 the original omicron lineage, BA.1 が世界中で暴れる中，関連があるが約 40カ所の変異による違いを持つ a related strain. BA.2 が研究者らにより公式に確認されたが（BA.1 に比べ）その感染例は少ない。[BA.2] はほぼ間違いなく世界中に拡散し，ほとんどの国々で優位になるだろう。先週の英国からの報告 a U.K. report とデンマークの大規模調査 [Transmission of SARS-CoV-2 Omicron VOC subvariants BA.1 and BA.2: Evidence from Danish Households. medRxiv 2022.01.28.22270044; doi:] から，BA.2 は BA.1 より感染力が強い性質 inherently more transmissible を有することが明らかになっているが，どの変異によるものかは解明されていない。しかしながら今のところ，BA.2 に感染した患者が，"他の変異株 variants such as delta and beta より重症化リスクが低いとされる" BA.1 より重症化しやすいとの傾向は認められていない。デンマークでは，1月21日までの時点で BA.2 が新規感染例の 65% of new COVID-19 cases を占めている。集中治療の患者は着実に減少しており，入院患者数も減少している，と同国公衆衛生当局者が述べた。2月1日には，この変異株による大混乱は起こらないとして，2月1日にパンデミックに関するすべての制限を解除した。しかし，BA.2 により，オミクロンの影響が延長されると予測する科学者もいる。BA.2 により，BA.1 のみが存在する場合よりも感染が相当長引くだろうが，2022年1月のオミクロンによる大流行ほどの規模にはならないだろう，と computational biologist が Twitter に投稿している。南アフリカにおいてはすでに BA.2 が，2021年12月のピークアウト後の急激な新規感染減少傾向に歯止めをかけている可能性がある。1月30日現在の主要な世界のウイルスデータベースにおいて，BA.2 は全オミクロン株の 4% 未満に過ぎないが，11月17日に世界で最も早く報告した南アフリカを含む 57カ国で発生が確認されている。インド国内 8カ所の大きな州からのデータの分析で，インドにおいても主流となっているとみられている。英国の BA.2 cases の割合も 1月24日までの週末までの 7日間で from 2.2% to 4.4% と倍増している ... すべての COVID-19 感染例のウイルスを解析するデンマークでは，よりはっきりとした傾向 a more dramatic picture が認められている。家庭内感染において，BA.1, 感染例からの家庭内感染は平均 29% であるのに対し，BA.2 では 39% of household members が感染した ... 
数週間前に科学者らから，既往のデルタ株等の感染がオミクロン株に対して防御効果があるかとの疑問が示されていたが，現在は初期のオミクロン株 [BA.1] 流行による BA.2 感染予防効果を示すデータが調べられている。デンマークの状況を見る限り，100％ではないようだ，と述べられている。GlaxoSmithKline は，現時点で唯一 BA.1 への効果が広く認められているモノクローナル抗体の sotrovimab の BA.2 に対する効果の実験室での研究を行っている ... 
BA.2 は，BA.1 が免疫を回避するための変異をすべて保有しているわけではないが，（BA.1 が）保有していないいくつかの変異を有している。Imperial College London のウイルス学者は，相違点の多くが the N-terminal domain (NTD) と呼ばれるスパイクタンパクの領域にあるとしており，（この領域は）抗体の標的部分に当たる。変化／変異があるからといって，必ずその変化による何らかの働きがあるのか（必ずしもそうではないのではないか）？ は，未解明の部分である。（BA.1 にはあるが，BA.2 にはない）1カ所の違い NTD difference -- 69 and 70 の amino acids の欠失 -- は，この新たなオミクロン株の拡がりのモニタリングツールとなる可能性がある。一部の SARS-CoV-2 ウイルスの PCR 検査は，3カ所のウイルスの遺伝子配列を検出するが，BA.1's NTD gene の変異により（BA.1 では）標的のうちの 1つが失われている。BA.2 では，PCR検査が 3カ所の標的すべてを捉えられるので，全ウイルス遺伝子塩基配列が得られない場合のオミクロン株どおしの鑑別の代わりになる。
BA.2 がどのように，なぜ今生まれたか，など， ... 原文参照願います。
[5] WHO: Daily new cases reported (as of 2 Feb 2022)
　情報源 WHO 2022年2月2日
[6] Global update: Worldometer accessed 2 Feb 2022 20:02 EST (GMT-5)
Date: Wed 2 Feb Jan 2022
　情報源 Worldometer 2022年2月2日
Total number of reported deaths: 5 718 888
Total number of worldwide cases: 385 300 334
Number of newly confirmed cases in the past 24 hours: 3 231196
関連項目　
COVID-19 update (38): virus shedding, Argentina, deaths, tests, WHO, global 20220203.8701225