2022年7月7日

サル痘(24)ベルギー 無症候性 ゲノムサーベイランス 

● 日本脳炎など インド
PRO/AH/EDR> Japanese encephalitis & other - India (06): (AS)
Archive Number: 20220707.8704289
 情報源 The Hindu 2022年7月6日
2022年4月以降,アッサム Assam 州において日本脳炎 Japanese encephalitis により 6人死亡した。同時に州内でこれまでに,洪水と降雨による地滑りにより 186人が死亡している。保健当局 the office of the Mission Director of the National Health Mission (NHM) Assam によると,4月から7月6日までの期間に州内で確認された 48例Japanese encephalitis cases のうち,6人が死亡した。2 persons in Jorhat district, a person each died in Kamrup, Lakhimpur, Nagaon and Dhemaji districts が死亡した ... 
関連項目 
Japanese encephalitis & other - India (04): comment 20220425.8702831

● 炭疽 フランス ウシ Anthrax, France
PRO/AH/EDR> Anthrax - France: (AC) cattle, WOAH, RFI
Archive Number: 20220707.8704288
 情報源 WOAH-WAHIS (World Animal Health Information System) 2022年7月6日
Started: 12 Jun 2022
Last occurrence: 20 Dec 2021
Causal agent: _Bacillus anthracis_
Outbreak location 1: Louvie-Juzon, Oloron-Sainte-Marie, Pyrénées-Atlantiques, Nouvelle-Aquitaine.: farm
種/個体数/感染/死亡/廃棄/と畜/ワクチン接種
ウシ Cattle / 50 / 2 / 2 / 0 / 0 / 30
Affected population: Suckler cattle: sudden death of one bovine without diagnosis [6 Jun 2022] and one agonizing bovine with autopsy (intestinal hemorrhage, congested spleen). Identification of an area of pasture at risk where cases of anthrax have been detected previously.
参考項目 2021
Anthrax - France: (MO) cattle, OIE 20211029.8699346

● サル痘(24)ベルギー 無症候性 ゲノムサーベイランス
PRO/AH/EDR> Monkeypox update (24)
Archive Number: 20220707.8704281
[1] Confirmed and suspected cases by country as of 6 Jul 2022:
 情報源 GH Map 2022年7月6日
Country / Number of cases
英国 United Kingdom / 1351
スペイン Spain / 1258
ドイツ Germany / 1242
フランス France / 577
米国 United States / 559
ポルトガル Portugal / 415
オランダ Netherlands / 352
カナダ Canada / 349
イタリア Italy / 233
ベルギー Belgium / 168
スイス Switzerland / 131
ブラジル Brazil / 106 ... 以下,100人以下の国(省略)
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Total 7146
[グラフ graph of the cumulative number of monkeypox cases as of 6 Jul 2022]
[2] 米国 The US CDC reports cases in the following states:
 情報源 Centers for Disease Control and Prevention (CDC) 2022年7月6日
State / Number of cases
California / 117
District of Columbia / 53
Florida / 64*
Illinois / 62
New York / 122 ほか
Total confirmed monkeypox/orthopoxvirus cases: 605
[3] 英国 Wales, United Kingdom
 情報源 Deeside 2022年7月5日
Public Health Wales is today (4 Jul [2022]) confirming that 7 additional cases of monkeypox have been identified in Wales. This brings the total in Wales to 16 ... 
[4] ベルギー 無症候性 Belgium asymptomatics
 情報源 medRxiv 2022年7月5日
原著タイトル Asymptomatic monkeypox virus infections among male sexual health clinic attendees in Belgium. medRxiv. 2022;
要約
Background. 無症候性サル痘感染 Evidence of subclinical monkeypox infection についての報告は少数の免疫学的研究 a few immunological studies に限られ,サル痘感染例に暴露した無症状の接触者において,オルソポックスウイルスに対する免疫が認められたというものである。今回,2022年のベルギーでのサル痘感染流行開始前後の,ベルギーの大規模・性感染症クリニック a large Belgian STI clinic におけるスクリーニング検査を受けた中での無症候性感染の有無について評価を行った。
Methods. 淋菌/クラミジアスクリーニングのために採取された肛門・直腸スワブ検体 Anorectal and oropharyngeal swabs collected for gonorrhoea/chlamydia screening from 1-31 May 2022 について,後ろ向きのサル痘 PCR検査 retrospectively tested by a monkeypox-specific PCR を行った。Cases with a positive PCR result についてクリニック再診と情報収集を行った. ... 
Findings. 保存されている 224 men の検体中,3 cases with a positive anorectal monkeypox PCR を確認した。All 3 men 全員が,検体採取前後の数週間に何ら症状がなかったとしている。いずれも診断を受けたサル痘症例との接触はなく,また接触者の中でサル痘の症状を発症したものもないと報告している。初回検体の採取から 21-37日後に Follow-up samples が採取され,この時点で the monkeypox-specific PCR は陰性であり,(ウイルスが)自然に排除されたもの a consequence of spontaneous clearance of the infection と考えられる
Interpretation.  ... 
[Mod.TY- 症候性感染例に比べると少ない割合の無症候性感染があることが判明したことに,いくつかの重要な疑問点がある。皮膚病変がない中で,精液中のウイルスは確認されているのか。無症候性感染例のウイルス量 virus loads は,感染伝播が起こる程度に高かったのか,また高かった期間はどれくらい続くのか。著者が指摘するとおり,アウトブレイクを封じ込めるためには,症候性感染例の特定と隔離だけでは不十分かもしれない]
[5] ゲノムサーベイランス Genome surveillance
 情報源 The Lancet 2022年7月2日
原著タイトル Monkeypox genomic surveillance will challenge lessons learned from SARS-CoV-2. The Lancet. 2022; 
オルソポックスウイルス orthopoxviruses において,遺伝学的コア部分 a genetic core of about 120 000 base pairs高度に不変 highly conserved であり,基本的なウイルス機能を司る code for basic viral functions と考えられている; しかしながら,末端部分に近づくと可塑性があり大きな部分の欠損が起こりうる  towards the termini the orthopoxvirus genome  plastic, large regions can be readily deleted。このような領域に宿主適応に関係する遺伝子が存在する。variola virus のように 特定種の宿主に適応したオルソポックスウイルスは,適応の過程で,宿主を制限する多数の末端遺伝子が欠失する傾向があり,このことによって感染伝播が容易となり,より重症化することが可能となる。このような欠失は,全身性感染の促進による感染拡大(飛沫関連伝播など)と重症化のいずれに対しても最適化される可能性がある。(現在)感染循環するサル痘ウイルス Circulating monkeypox virus はヒトへの馴化を受けている可能性があり might be undergoing adaption for the human host,注視が必要である。そのためには,SARS-CoV-2 variants 変異株に行われているような単一の長鎖ヌクレオチドの観察 observing lone single nucleotide polymorphisms ではなく,サル痘ウイルス遺伝子末端 the monkeypox virus genomic termini 完全性安全性注意深く観察するようなサーベイランスにシフトする必要がある。このためには常時,サル痘ウイルス遺伝子の全遺伝子塩基配列の解析を行い,single nucleotide polymorphisms だけではなく,any intragenic frameshifts or premature stop codons, that might indicate initial signals of gene loss を見逃さないことが最も重要となる ... --
関連項目 
Monkeypox update (23) 20220706.8704264

● ブルセラ症 シリア ヒト,家畜
PRO/AH/EDR> Brucellosis - Syria: (SU) human, livestock, spread
Archive Number: 20220707.8704276
 情報源 Enab Baladi Online [in Arabic] 2022年6月29日
地域の感染症部門責任者 The head of the Communicable and Chronic Diseases Division in As-Suwayda が,南部 the As-Suwayda Governorate, southern Syriaにおいて過去 2か月間にブルセラ症感染例 cases of brucellosis の増加が見られていると明らかにした。年初以来に記録された 215例のうち,5月と6月だけで約 80例が確認されていると述べた ...