Sarbecoronavirus Khosta-2，コウモリ ロシア
● Sarbecoronavirus Khosta-2，コウモリ ロシア
PRO/AH/EDR> Sarbecoronavirus - Russia: bat, zoonotic potential
Archive Number: 20220927.8705824
情報源 News Medical Life Sciences 2022年9月22日
最近ロシアのコウモリで発見され SARS-CoV-2 に類似する新たなウイルスは，もし溢出があればヒトに感染する能力を有する可能性があり，現在あるワクチンも無効である。Washington State University's Paul G Allen School for Global Health の研究チームが，Khosta-2 と呼ばれるこのコウモリのウイルスから取り出したスパイクタンパクは，ヒトの細胞に感染することが可能であり，SARS-CoV-2 に対するモノクローナル抗体にも，ワクチン接種後のヒトの血清にも抵抗性を示した。Both Khosta-2 and SARS- CoV-2 両ウイルスはともに，sarbecoviruses とよばれる同じコロナウイルス内のグループ the same sub-category of coronaviruses に分類される。さらに詳しい検討の結果，the Khosta-2 virus が発見されたロシア西部も含めた，アジア以外の野生動物で感染循環する sarbecoviruses は，global health の脅威となり得ると，the journal PLoS Pathogens 掲載の研究で述べられている。Khosta-2 が発見されたことにより，SARS-CoV-2 に対してだけでなく，すべての sarbecoviruses の感染への防護作用を示すユニバーサルワクチン開発の必要性が改めて認識されたとしている。近年，アジアのコウモリを中心に多数の hundreds of sarbecoviruses が発見されているものの，ほとんどがヒト細胞への感染能力を持っていない。The Khosta-1 and Khosta-2 viruses は 2020年後半にロシアコウモリ Russian bats で発見されたが，当初はヒトへの影響はないと見られていた。"遺伝学上，これらのロシアで発見されたウイルスは，SARS-CoV-2 のようには見えず not look like，他の地域で発見されたウイルスと同じようなものと思われたが ... 詳しく見てみると，ヒトの細胞に感染することが判り、とても驚いた。" ... Khosta-1 のヒトに対するリスクは小さいが，Khosta-2 はやっかいな特徴を持っていた。
Khosta-2 は SARS-CoV-2 と同じく，スパイクタンパクを利用して，人体内に広く存在する angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2) と呼ばれるレセプターのタンパクに接合し細胞に感染する。現行の COVID-19 ワクチンのこの新たなウイルスに有効性を，ワクチン接種後のヒトの血清を用いて調べたところ，Khosta-2 ウイルスは中和されなかった。さらにオミクロン株 the omicron variant 感染患者からの血清を用いて調べたが，やはり無効だった。幸い，ヒトの病原性に関係すると考えられる遺伝子は持っていないが，SARS-CoV-2 などの別のウイルスと Khosta-2 との組み換え recombining リスクは存在する ...
[Mod.PMB－ Reference
An ACE2-dependent Sarbecovirus in Russian bats is resistant to SARS-CoV-2 vaccines. PLoS Pathog. 2022; 18(9):e1010828; https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1010828
"_Rhinolophus_ species (horseshoe bats) were found to carry a diverse group of SARS-like coronaviruses (Sarbecoronavirus) and, thus, are thought to be the natural reservoirs of this group of viruses. The genome of the Wuhan SARS-CoV-2 shares approximately 80% and 59 96.2% nucleotide sequence identity with SARS-CoV and bat SL-CoV RaTG13, respectively. The Russian bat species in which Khosta-2 was isolated is a lesser horseshoe bat, _R. hipposideros_, captured near the Black Sea. This bat species is widely distributed in Europe and Northern Africa. Sarbecoronaviruses with affinity to the human ACE2 receptor are a major concern as they constitute a hazard for a new emerging infectious disease.]
● サル痘（75）神経・精神症状 自然界での発生と感染拡大
PRO/AH/EDR> Monkeypox update (75)
Archive Number: 20220927.8705819
[1] 世界 Confirmed and suspected cases by country as of 26 Sep 2022:
情報源 Centers for Disease Control and Prevention (CDC)
Total confirmed cases: 65 933
Total deaths: 26
[2] 米国 The US CDC reports cases in the following states:
情報源 CDC
Total confirmed monkeypox/orthopoxvirus cases: 25 162
[3] UK: 2nd vaccine doses（2回目接種提供開始）
情報源 UK Health Security Agence press office 2022年9月23日
サル痘 monkeypox のハイリスクグループの人々に対するワクチンの 2回目接種 2nd doses of the smallpox (Jynneos) vaccine を開始すると，英保健当局 The UK Health Security Agency (UKHSA) が発表した。最も感染リスクのある人々の 25% に接種することで，感染伝播リスクを大いに減少させることができるとしている。sexual health clinics における 1回目接種を継続しながら，a 2nd dose の提供を開始することで感染防御効果が延長する ...
[4] Neurologic and psychiatric presentations（神経・精神症状）
情報源 eClinicalMedicine 2022年9月8日
原著タイトル Neurological and psychiatric presentations associated with human monkeypox virus infection: A systematic review and meta-analysis. eClinicalMedicine. 2022; Online First, 101644
要約
Background
Methods
In this pre-registered (PROSPERO ID 336649) systematic review and meta-analysis, we searched MEDLINE, EMBASE, PsycINFO, AMED, and the preprint server MedRxiv up to 31 May 2022 ...
Findings
19 eligible studies (1512 participants, 1031 with confirmed infection using CDC criteria or PCR testing) のデータから，
3 clinical features（臨床症状）: seizure（けいれん）2.7% (95% CI 0.7-10.2%, I2 0%), confusion（混乱）2.4% (95% CI 1.1-5.2%, I2 0%), and encephalitis（脳炎）2.0% (95% 0.5-8.2%, I2 55.8%)
他の報告が多かった症状として，筋肉痛，頭痛，倦怠感。
Interpretation
There is preliminary evidence for a range of neuropsychiatric presentations including severe neurological complications (encephalitis and seizure) and nonspecific neurological features (confusion, headache, and myalgia).
There is less evidence regarding the psychiatric presentations or sequelae of MPX.
[5] Monkeypox emergence in nature（自然界での発生）
情報源 CABI One Health 2022年9月23日
原著タイトル Monkeypox: we cannot afford to ignore yet another warning. CABI One Health. 2022
Abstract
One Health Impact Statement
Monkeypox (re)emergence
...
サル痘 monkeypox の名前は，1958年にデンマークの研究室においてカニクイザル a group of crab-eating macaque monkeys で最初に発見されたことに由来する (Von Magnus et al, 1958) が，その後，主要宿主はげっ歯類であることが示唆されている ... 血清学的調査で，MPV seropositivity rates が最も高かったのはリス _Funisciurus_ spp squirrels (24%) compared to those in _Heliosciurus_ spp squirrels (15%) or primates 霊長類 (8%) (Khodakevich et al, 1988) だった。1997年のアウトブレイク中に行われた野生動物の調査では，さらに高率 39-60% in _Funisciurus_ spp, 50% in _Heliosciurus_ spp, and 16% in Gambian giant pouched rats（フクロネズミ）だった。(Hutin et al, 2001) 原生熱帯雨林には多くはいないが，ヒトの住む森林 inhabited human-degraded secondary forests，時にアブラヤシが栽培される場所ではよく見かける。
Bushmeat trade（野生動物の肉）
アフリカで bushmeat として知られる野生動物の肉は，野生動物の狩猟により得られ，現地で消費されたり食品として販売することで収入源となる。狩猟により大型の野生動物が減り，動物のサイズが著しく小型化し，より小さい種に依存するようになった。The Gambian giant pouched rat は比較的サイズが大きいことからよく食用にされており，人獣共通感染症の潜在的感染源として特に注目されている
ブリュッセル空港の搭乗客の荷物を調べた A 2018 Belgian study では，毎月平均約 3.7トンの bushmeat が違法に持ち込まれていると推定された; the top countries of origin were DRC（コンゴ（民））, Cameroon（カメルーン）, and Côte d'Ivoire（コートジボワール） ...
Pet trade（ペット）
2003年，米国の 6州が an outbreak of human MPV の影響を受けた。感染源は，ガーナ Ghana to Texas に輸入された，800匹の生きた小型ほ乳類が入った荷物だった。中には，6種類のげっ歯類，すなわち tree squirrels _Heliosciurus_ spp, rope squirrels _Funisciurus_ spp, dormice _Graphiurus_ spp, striped mice _Hybomys_ spp, brushtail porcupines _Atherurus_ spp, and Gambian giant pouched rats _Cricetomys_ spp が入れられていた。(CDC, 2003) ...
Need for a One Health approach
... 原文参照願います。
関連項目
Monkeypox update (74) 20220924.8705776
● エボラ ウガンダ
PRO/AH/EDR> Ebola update (18): Uganda, Ebola Sudan strain, book review W. African outbreak
Archive Number: 20220927.8705817
[1] Case count update
A. Ministry of Health（保健省）
Current #EbolaOutbreakUG update: As of [Sun 25 Sep 2022]
情報源 Ministry of Health - Uganda 2022年9月25日
[Tweet from Ministry of Health - Uganda (<@MinofHealthUG>):]
New confirmed cases: 2
Cumulative cases: 36 (18 confirmed and 18 probable cases)
New deaths: 2
Cumulative deaths: 23 (5 confirmed deaths and 18 probable deaths)
Active cases on admission: 35
B. CIDRAP (Center for Infectious Disease Research and Policy)
情報源 CIDRAP 2022年9月26日
スーダンエボラの感染者数 Ebola Sudan cases は，過去数日間の増加が続き合計 36例となり，23例（64%）が死亡したと，ウガンダ保健省が 16日報告した。また新たな懸念材料として，新たに他の 2箇所でも感染が報告され感染が拡大していると，保健省が 25日明らかにした。わずか 4日前の感染者数は 7例と死者 1例の確認だった。今回のエボラによる感染アウトブレイクは当初，首都カンパラ Kampala の西の Mubende の住民らの間で発生したが，25日に保健省は，交通量の多い道路沿いで Mubende の西にある Kyegegwa 市と，Mubende のすぐ東の Kassanda の症例を報告した。26日の新たな 2例の感染の確認により，アウトブレイクによる合計症例数は 36例となり，うち 18例が確定診断され，18例は probable に分類されている。これまでに 23例が死亡し，うち 5例についてはエボラ感染が確定診断されている。35人が現在治療中である。
先週 the World Health Organization (WHO) は，アウトブレイクの発生地点がコンゴ民主共和国に通じる交通量の多い道路沿いにあり，また金鉱山のある地域で国内外から多数の人々が集まるため，さらなる感染拡大のリスクがあると述べた。
初期調査により，9月はじめの 2週間に Madudu and Kiruma subcounties of Mubende district のコミュニティ内で多数の死亡が発生していたことが確認されたと，26日 The WHO が明らかにした。さらに現在，これらの症例は probable Ebola Sudan cases と考えられている。死亡がコミュニティ内で発生していることから地域内での感染拡大リスクは高い。the 18 lab-confirmed cases のうち，Kyegegwa の 3例と Kassanda の 1例が含まれる。the confirmed and suspected case-patients の 62% が女性で，年齢の中間値は 26歳である。確定患者の致死率は 28% で，これまでに 223人の濃厚接触者がリストアップされた。
The WHO によると 1976年以降，7件のスーダンエボラによるアウトブレイク Ebola Sudan outbreaks が報告されており，うち 4 in Uganda and 3 in Sudan である。過去のアウトブレイクの致死率は 41%-100% の間にある ...
ワクチンが存在せず，初発感染の確認の 3週間前にアウトブレイクが発生していた可能性があることから，ウガンダのリスクは高く，感知されていない複数の感染伝播チェーンが存在する可能性が懸念されると，The WHO は述べている。以前の死亡患者は伝統的な方法で埋葬され，多数の人々が葬儀に参加していた ...
MSF setting up treatment center [20220924.8705775 - Mod.LK]
[2] Book review: Ebola and maternity care, West African outbreak
Book explores the Ebola epidemic and disparities in maternity care
情報源 Ham and High 2022年9月25日
... 原文参照願います。
関連項目
Ebola update (17): Uganda, DRC (NK, IT) 20220926.8705802
● ハンタウイルス パナマ
PRO/AH/EDR> Hantavirus - Americas (29): Panama (VR)
Archive Number: 20220927.8705813
情報源 Telemetro [in Spanish] 2022年9月22日
2022年のこれまでのパナマにおいて，ハンタウイルス hantavirus [infections] による 39例の感染と，Herrera and Veraguas provinces における 2例の死者が確認されている。最新の感染例は the La Solidad community in Sona 在住の 25歳女性であった [An additional report により，the Gorgas Memorial Institute のハンタウイルス検査で陽性が確認されたと示されている] ...
関連項目
Hantavirus - Americas (26): Panama (HE) 20220812.8705003
● リステリア症 スペイン イタリアからのソーセージ
PRO/AH/EDR> Listeriosis - Europe (04): Spain ex Italy, sausage, recall, alert, RFI
Archive Number: 20220927.8705806
情報源 West Observer, El País report 2022年9月24日
イタリアから輸入されてスペイン国内で流通する複数のパック入りソーセージに，リステリア菌 _Listeria_ が検出されたとして，24日消費当局 The Ministry of Consumption から注意喚起が発出された。different batches of the Wudy and Pavo brands とされている。同食品による，イタリアおよび欧州内の他国においてリステリア症アウトブレイクが発生しているが，スペイン国内での発生の有無は明らかにされていない。食品安全当局 The Spanish Agency for Food Safety and Nutrition (AESAN) は，the European Food Alert Network (RASFF) を通じてイタリア政府当局からの [リステリア菌に関する] 注意喚起を受け取っていた。
the brands： Wudy Clásico, Wudy Queso, Wudy Parti, Wudy Happy Hour, Wudy Maxipack Clásico, and Pavo Hot Dog ...
The state agency recalls the importance of extreme hygiene measures to avoid cross contamination to other products [in Spanish]
● 鳥インフルエンザ イタリア
High pathogenicity avian influenza viruses (poultry) (inf. with), Italy
PRO/AH/EDR> Avian influenza (177): Europe (Italy) poultry, HPAI H5N1, WOAH
Archive Number: 20220927.8705805
情報源 WOAH-WAHIS (World Animal Health Information System) 2022 9月26日
Started: 21 Sep 2022
Last occurrence: 25 Apr 2022
Causal agent: highly pathogenic avian influenza virus
Serotype: H5N1
新たな感染流行
Outbreak location: Silea, Treviso, Veneto: farm
種/個体数/感染/死亡/廃棄/と畜/ワクチン接種
Birds / - / 30 / 10 - / - / -
● マイコプラズマ症，ウシ ニュージーランド
PRO/AH/EDR> Mycoplasma bovis - New Zealand (02): (CA) cattle
Archive Number: 20220927.8705781
情報源 Stuff 2022年9月23日
Ashburton 近郊の大規模ウシ肥育場 a large cattle feedlot において実施されている，感染症対策のための飼育頭数削減により，地域経済への深刻な影響が予想されている。ウシマイコプラズマ _Mycoplasma bovis_ (_M. bovis) を一掃するために，Biosecurity New Zealand が，the Five Star Beef Wakanui feedlot 肥育場における 10月13日からの処分 depopulate とその後の一時休業に動いたのは "good biosecurity" であり，必要な措置であると市長が説明した。"同肥育場外に感染が波及していれば，let the feedlot depopulate." と述べた ...
関連項目
Mycoplasma bovis - New Zealand: (CA) livestock 20220622.8704018
● ブルセラ症，イヌ アイスランド
PRO/AH/EDR> Brucellosis, canine - Iceland (02): dog, susp., test results pending
Archive Number: 20220927.8705812
情報源 Icelandic Food and Veterinary Authority (MAST) News [in Icelandic] 2022年9月23日
国内のペットのイヌや愛護センターのイヌの間でこの夏，ブルセラ症 brucellosis infection の発生が疑われた。アイスランド Iceland ではこれまで確認されたことはなく，the Food Agency は大きな懸念をもって注視している ...
● 原因不明の疾患，ブタ エクアドル
PRO/AH/EDR> Undiagnosed disease - Ecuador (02): domestic pig, not CSF/not ASF
Archive Number: 20220927.8705816
投稿者 AGROCALIDAD・Wilson Patricio Almeida Granja 2022年9月23日
20220923.8705748 に関して。
22日，the province of Esmeraldas, canton San Lorenzo, Mataje parish において豚熱 classical swine fever (CSF) の発生が疑われるとの注意喚起を受け取った。8か月前の 10匹の動物の死亡が確認された。51頭中 24頭のブタの検査で，豚熱，アフリカ豚熱のいずれの検査結果も陰性だった ...
● COVID-19 動物 アルゼンチン，アルマジロ
PRO/AH/EDR> COVID-19 update (178): animal, Argentina, armadillo
Archive Number: 20220927.8705807
情報源 BioRxiv 2022年8月23日
原著タイトル An outbreak of SARS-CoV-2 in big hairy armadillos (_Chaetophractus villosus_) associated with Gamma variant in Argentina three months after being undetectable in humans. bioRxiv 2022.08.23.503528; (preprint; not peer-reviewed)
アルゼンチンの 4種類の検体 specimens of _Chaetophractus villosus_ (big hairy armadillo/armadillo peludo，アルマジロ) で，SARS-CoV-2 Gamma variant infection（ガンマ株）が確認されたことを報告する。新たな野生動物種において感受性が確認され，最後のヒトでの感染確認から 3か月後に the Gamma variant の感染が確認されたことは注目に値する。