2024年11月28日

COVID-19

● 水痘 イエメン
PRO/EDR> Varicella - Yemen (01): (MR) expatriate, ship, MOH
Archive Number: 20241128.8720306
 情報源 Mareb Press [in Arabic] 2024年11月25日
オマーンとの国境地域で水痘が確認された the registration of the first case of chickenpox in Al Mahrah Governorate, bordering the Sultanate of Oman と保健当局 Yemeni health authorities が24日明らかにした。Nishtun Port 停泊中の船に乗船するインド国籍の患者であった。

● COVID-19
PRO/AH/EDR> COVID-19 update (43): multiple countries, XEC, antiviral resistance, WHO
Archive Number: 20241128.8720295
[1] Selected countries/regions
 [A] フランス France: COVID-19: What is [the] latest situation in France ahead of Christmas?
 情報源 The Connexion 2024年11月18日
フランスの COVID-19 の発生状況に変化はなく COVID rates are stable、家族が集まり患者が増加するクリスマスまでわずか5週間となった。
保健当局 Health authority Santé Publique France (SPF) が13日、最新の発生状況 its latest update on the virus を公表した。
In the week from 6 to 13 Nov 2024 にプライマリケア施設の発生率 the incidence rate of cases of COVID-19 in primary care (e.g. GP surgeries) が人口10万対25 cases per 100 000 population と推定されており、前週からわずかに増加したものの、active circulation of the virus ではないとされている。
 [B] 米国 USA: fu activity continues slight rise in children as COVID levels remain low
 情報源 CIDRAP 2024年11月16日
米国内の活動性 US flu activity の小児での微増傾向が続いているものの, overall levels remain low nationally であると、15日に the Centers for Disease Control and Prevention (CDC) in its respiratory disease updates で示された。
 [C] カナダ Canada: tracking respiratory viruses in Canada: RSV, influenza, COVID-19
 情報源 CTV News 11月22日
Are we in the middle of flu season? How bad is RSV this year [2024]?
The latest data、which covers the week ending Saturday [16 Nov 2024] によると、カナダの全土で RSV infections の増加が続く一方,  COVID-19 rates are decreasing(減少が続いている)。
 [D] オーストラリア Australia's Therapeutic Goods Administration (TGA) has recently approved a new COVID booster targeting the omicron JN.1 subvariant
 情報源 The Conversation 11月17日
Australia's Therapeutic Goods Administration (TGA) 当局が最近、(ワクチンの)新たな追加接種 a new COVID booster を承認した。Pfizer が開発した the JN.1 sub-variant of omicron を標的とするワクチンである。
[2] COVID-19(ニュージーランド): omicron variant XEC 'rising steadily' in NZ as scientists watch for early signs of Christmas wave
 情報源 NZ Herald 11月22日
[3] COVID becoming resistant to antiviral drugs
 情報源 The East African 11月16日
2024年に the Jama Network Open and the Nature Communications Journals に掲載された報告で、one known as nirmatrelvir and the other remdesivir と呼ばれる治療薬の効果が減弱し found to be less effective、ウイルスの両薬剤への抵抗性が生じていることが示されている。
[Mod.LWW- 
原著タイトル1 Emerging SARS-CoV-2 Resistance After Antiviral Treatment. JAMA Network Open. 2024;7(9):e2435431.
Key Points
Question: 抗ウイルス薬治療を受けている患者において、耐性が獲得されやすいか。
Is there an increased frequency of SARS-CoV-2 antiviral resistance in individuals receiving antiviral therapy?
Findings
156 participants が参加した研究で、nirmatrelvir resistance mutations 耐性変異は、nirmatrelvir の治療を受けた患者、特に免疫不全の患者において、同薬による治療を受けていない患者に比べて多く認められた。しかしながらこれらの変異の存在は比較的少なく present at relatively low frequencies,一過性であり,感染のリバウンド instances of virologic rebound につながる可能性は低いとみられている。
Meaning
In this study, the emergence of SARS-CoV-2 strains with resistance to nirmatrelvir after treatment was rare, irrespective of virologic rebound.
Abstract
Importance
nirmatrelvir 耐性を付与するウイルスの変異 mutations in SARS-CoV-2 strains はこれまでにも報告されていたが,頻度やウイルスの再上昇(感染リバウンド)との関連については明らかにされていなかった。
Objective
To examine the prevalence of emergent antiviral resistance after nirmatrelvir treatment and its association with virologic rebound.
Results
Overall, 156 participants (114 female [73.1%]; median [IQR] age, 56 [38-69] years) were included. 
nirmatrelvir による治療を受けていなかった63人に比べ,治療を受けた79人は高齢で免疫に問題がある症例が多かった。鼻腔スワブ participants' anterior nasal swabs で得られたウイルスの遺伝子の解析 sequencing viral RNA により,nirmatrelvir に対する耐性(遺伝子)が確認されたのは,治療を受けた9人 (11.4%) に対し,治療を受けていなかったのは2人 (3.2%) だった。
Conclusions and Relevance
In this cohort study of 156 participants, treatment-emergent nirmatrelvir resistance mutations were commonly detected, especially in individuals who were immunosuppressed. However, these mutations were generally present at low frequencies and were transient in nature, suggesting a low risk for the spread of nirmatrelvir resistance in the community with the current variants and drug usage patterns.

原著タイトル 2 Emergence of transmissible SARS-CoV-2 variants with decreased sensitivity to antivirals in immunocompromised patients with persistent infections. Nature Communications 15, 7999 (2024). 
Abstract
免疫不全の患者 immunocompromised patients (n = 15) の持続感染中の耐性出現 the emergence of SARS-CoV-2 resistance に対する,抗ウイルス薬治療の影響について検討した。すべての患者が remdesivir and some also received nirmatrelvir-ritonavir (n = 3) or therapeutic monoclonal antibodies (n = 4) を受けた。
遺伝子解析 Sequence analysis により 9人 patients に変異のあるウイルス viruses with mutations in the nsp12 (RNA dependent RNA polymerase) が確認されたのに対し,4人には viruses with nsp5 (3C protease) mutations が確認された。
Infectious SARS-CoV-2 with a double mutation in nsp5 (T169I) and nsp12 (V792I) was recovered from respiratory secretions 77 days after initial COVID-19 diagnosis from a patient sequentially treated with nirmatrelvir-ritonavir and remdesivir. 
In vitro characterization  ... ]
[4] WHO: COVID-19 Epidemiological Update - November 2024
 情報源 World Health Organization(WHO)2024年11月6日
Overview
During the 4-week reporting period from 16 Sep to 13 Oct 2024, weekly SARS-CoV-2 PCR percent test positivity(PCR 検査陽性率)changed from 5.0% in the beginning week of the reporting period to 6.1% in the last week, as detected in integrated sentinel surveillance within the Global Influenza Surveillance and Response System (GISRS).
JN.1 remains the most prevalent VOI, reported in 144 countries and representing 12.2% of sequences in week 41, a decline from 17.2% in week 38. 
Variants KP.3.1.1 and XEC are on the rise, with KP.3.1.1 constituting 51.1% of sequences in week 41, up from 45.2% in week 38, and XEC at 17.2%, increased from 8.9%. 
The prevalence of KP.3, KP.2, JN.1.18, and LB.1 decreased, while JN.1.7 was not detected in week 41, down from 0.1% in week 38.
関連項目
COVID-19 update (42): selected countries/regions, vaccines, research, WHO 20241028.8719642

● 食中毒 ベトナム
PRO/EDR> Foodborne illness - Viet Nam (34): (BV) susp, RFI
Archive Number: 20241128.8720303
 情報源 VN Express [in Vietnamese] 2024年11月27日
ベーカリー Co Ba bakery in Vung Tau city で購入したパンを食べた大勢の人々が胃痛,嘔吐を訴え,食中毒とみられている suspected food poisoning。患者の1人は,a box of sticky rice and a loaf of bread at Co Ba's shop を購入し,妻子とともに26日に食べていた。27日の10時までに45例の患者が確認され,唯一の共通点は同店で購入したパンを食べたことであった。このうち23例が入院した。
関連項目
Foodborne illness - Viet Nam (18): (DT) bread, susp., factory workers, RFI 20240809.8718041

● デング熱 米国
PRO/AH/EDR> Dengue/DHF update (121): USA
Archive Number: 20241128.8720293
 情報源 Vax Before Travel 2024年11月15日
America's Dengue Cases Increase 280%
2024年の世界的なデング熱アウトブレイクが新記録となる中,11月15日に保健当局 the U.S. Centers for Disease Control and Prevention (CDC) は,in the continental U.S.において今年, 2495例のデング熱 dengue cases が確認されたと報告した。2023年は1540例だった。the U.S. territories で 4166 dengue cases in 2024 が報告され,the 782 cases reported last year (2023) をはるかに超える数字となっている。
To alert international travelers of these dengue outbreaks, the CDC reissued its Level 1 advisory.
関連項目 
Dengue/DHF update (113): USA (CA) 20241111.8719945

● アフリカ豚熱 中国
PRO/AH/EDR> African swine fever - Asia (69): China (HK) wild boar, WOAH
Archive Number: 20241128.8720305
 情報源 WOAH-WAHIS (World Animal Health Information System) 2024年11月23日
Hong Kong - African swine fever virus (Inf. with) - Immediate notification
Started: 21 Nov 2024
Reason for notification: Recurrence of an eradicated disease
Date of last occurrence: 19 Jan 2024
End date: -
Disease: African swine fever virus (Inf. with)
Causal agent: African swine fever virus
Genotype/serotype/subtype: -
Event status: Ongoing
This event pertains to the country/territory. 
New outbreaks
種/頭数/症例数/死亡/廃棄/処分/ワクチン
Wild boar (wild) / - / 1 / 0 / 1 / 0 / 0
関連項目
African swine fever - Asia (67): China (HK) domestic, WOAH 20241108.8719871

● ブルータング リビア
PRO/AH/EDR> Bluetongue - Libya (04): (MS) livestock, susp, fatal
Archive Number: 20241128.8720300
[1] 情報源 Al Wasat [in Arabic] 2024年11月23日
The Agricultural Police Authority prepared a report and referred it to the Public Prosecution regarding the death of animals as a result of bluetongue disease in the Sawaweh area.
[2] 情報源 Libya Akhbar [in Arabic] 11月26日
Livestock in Libya face several risks due to the spread of diseases and epidemics that lead to the death of livestock, which consequently affects the availability and prices of meat in the markets, especially during holidays.
関連項目 
Bluetongue - Libya (03): (MR, ZW) sheep, livestock market closure, spread 20241112.8719970

● 鳥インフルエンザ 台湾 H5N1
PRO/AH/EDR> Avian influenza (148): Taiwan, HPAI H5N1, poultry, spread
Archive Number: 20241128.8720297
 情報源 Taiwan News 2024年11月26日
Bird flu found in southern Taiwan poultry farms
Migrating birds bring flu, agriculture ministry encourages vigilance. The Ministry of Agriculture's Animal and Plant Health Inspection Agency said on Monday [25 Nov 2024] it had received reports of H5N1 bird flu in south Taiwan and called on poultry farmers to be vigilant.
The agency said it has been detected in 39 winter migratory birds and 12 birds on poultry farms, per CNA. 
関連項目 
Avian influenza (136): Taiwan (TP) HPAI H5N1, poultry, WOAH 20241114.8720012