インフルエンザ (49) カナダ サウジアラビアから、ハッジ
チクングニア熱 (29) など
WHO/PAHO メキシコ、ベリーズ、ブラジル、コロンビア、ペルー、フィリピン、印、米
診断検査
● 原因不明の疾患、ロブスター－ベトナム RFI
PRO/AH/EDR> Undiagnosed disease, lobster - Viet Nam: RFI
Archive Number: 20151005.3693242
情報源 Viet Nam News、2015年10月5日。
Ly Son Island off central Quang Ngai province のロブスター漁師らは、数日前から発生のロブスターの死亡に苦しめられている。先週 [28 Sep - 4 Oct 2015]、同地域内で飼育されていたロブスターの 15 %が死亡したと、経済担当者 Deputy Head of Economic and Rural Infrastructure Department が明らかにした ...
● 馬ヘルペスウイルス－米国 PA 北米 (21) ウマ
PRO/AH/EDR> Equine herpesvirus, equine - North America (21): USA (PA)
Archive Number: 20151005.3693241
情報源 Daily Racing Form、2015年10月3日。
Parx Racing の 2歳馬 filly 1頭が、馬ヘルペスウイルス the equine herpesvirus 検査で陽性となり、厩舎が隔離 a quarantine of the stable area されている ...
● インフルエンザ (49) カナダ サウジアラビアから、ハッジからの帰還者
PRO/EDR> Influenza (49): Canada ex Saudi Arabia, Hajj returnees, susp., RFI, Alert
Archive Number: 20151005.3693052
投稿者 Alberta Health Services、2015年10月5日。
2週間前より、巡礼を終えメッカ Mecca からカルガリー Calgary に帰国する旅行者らが、 Foothills Medical Center の救急室を受診している。MERS-CoV patients をスクリーニングする中で、これまでに 2例のインフルエンザ患者 laboratory-confirmed influenza A cases を確認している。サウジアラビアで発生したインフルエンザが世界中に患者を拡散させていることを懸念している。
● チクングニア熱 (29)
WHO/PAHO メキシコ、ベリーズ、ブラジル、コロンビア、ペルー、フィリピン、インド、米国
診断検査
PRO/EDR> Chikungunya (29): Americas, Asia
Archive Number: 20151005.3693195
[1] WHO/PAHO report： 2 Oct 2015
[2] メキシコ (national). 28 Sep 2015. (conf.) more than 7000 cases.
[3] ベリーズ (Corozal district). 29 Sep 2015. (susp.) 4 cases
[4] ブラジル Brazil [in Portuguese]:
- Itajai, Santa Catarina state. 25 Sep 2015. (conf.) 1st locally acquired case in the state.
- Avare, Sao Paulo state ex Alagoas state. 30 Sep 2015. (conf.) 1 case.
- Sergipe state. 24 Sep 2015. (susp.) 361 cases, (conf.) 7 cases locally acquired.
[5] コロンビア (national). 24 Sep 2015. [in Spanish] (reported) 439 000 cases in 712 municipalities since outbreak began in 2014 and in 2015, 334 429 cases in 712 municipalities; Deaths 58; Municipalities most affected: Cali, Cucuta, Neiva, Cartagena, Villavicencio, Sincelejo, Ibague, Monteria, Barranquilla, Girardot, Cartago y Palmira; Epidemic declared over by Vice Minister of Public Health.
[6] ペルー (national). 23-29 Aug 2015. [in Spanish] (probable) 48 cases, (conf.) 72 cases; of the 120 cases, 118 imported; Regions most affected: Tumbes 107 cases locally acquired of which 37 confirmed, Piura 13 cases of which 2 confirmed
[7] フィリピン (Zamboanga city, Zamboanga Peninsula region ). 3 Oct 2015. (confirmed) 4 cases.
[8] インド (Phagwara, Punjab state). 24 Sep 2015. (susp.) many cases [no numbers provided] coming to local health care facilities.
[9] 米国
- USA states from ArboNET as of 29 Sep 2015
- Caribbean Islands:
プエルトリコ (imported) 0 cases, (locally acquired) 112 cases
米領バージン諸島 (imported) 0 cases, (locally acquired) 4 cases
[10] 診断テスト
情報源 Genome Medicine、2015年9月29日。
原著タイトル Rapid metagenomic identification of viral pathogens in clinical samples by real-time nanopore sequencing analysis.
要約
MinION nanopore sequencing coupled to a newly developed, web-based pipeline for real-time bioinformatics analysis on a computational server or laptop (MetaPORE). を用いて、4人の血清検体から、チクングニア熱ウイルス chikungunya virus (CHIKV)、エボラウイルス Ebola virus (EBOV)、C 型肝炎ウイルス hepatitis C virus (HCV) の、バイアスのないメタゲノム検出について報告する。from 7 log 10-8 log 10 copies per milliliter の力価 titers において; 4-10分間以内に、急性出血熱の患者 2名から EBOV、無症候性の献血者 1名から CHIKV が判明した。一方 40分間以内に、より力価の低い lower titer HCV virus 5 log 10 copies per milliliter が検出された。
Analysis of mapped nanopore だけでも結果は得られるが、正しく分離された 4件のウイルス検体すべてを識別するための、単独の平均エラー率は 24 [percent (range 8-49 percent)] であり、90 percent of the genome of CHIKV は、97-99 % の精度で回収された。nanopore sequencing を用いると、臨床検体からダイレクトにウイルス病原体がメタゲノム的に同定され、サンプルから結果判明まで 6時間以内というかつてない短時間で完了する ...
[Mod.TY 注－ The rapid turnaround time is remarkable ... ]
● BSE－英国 (03) ウェールズ 古典的、公式情報
PRO/AH/EDR> BSE, bovine - UK (03): (Wales) classical, official update
Archive Number: 20151005.3693147
投稿者 英 ・ Welsh Government Llywodraeth Cymru、2015年10月5日。
the UK's TSE reference laboratory において classical BSE と確定診断されており、2009年生まれのウシである。比較的若いウシであるため、疫学調査が行われている。
● 狂犬病－米国 (39) TX コウモリ
PRO/AH/EDR> Rabies - USA (39): (TX) bat, human exposure, Alert
Archive Number: 20151005.3693066
情報源 Statesman、2015年10月4日。
テキサス州立大学 Texas State University in San Marcos では、[2 Oct 2015] 1頭のコウモリの狂犬病 rabies 検査が陽性となったため、検査が判明する前に、このコウモリを触っていた学生 1名を探している。。
● ランピースキン病、ウシ－ギリシャ (06) MH OIE
Lumpy skin disease [LSD], Greece、Follow-up report No. 4
PRO/AH/EDR> Lumpy skin disease, bovine - Greece (06): (MH) spread, emergency vaccination, OIE
Archive Number: 20151005.3692103
情報源 OIE, WAHID weekly disease information 2015; 28(41)、2015年10月4日。
感染開始時期 2015年8月18日
原因ウイルス Lumpy skin disease virus
新たな感染流行 (4)
[This section addresses 3 new outbreaks in Macedonia and Thrace, of which 3 are in Evros, the region initially infected, and one outbreak in Kavala, which is west of the previous outbreaks. For statistics of each outbreak, please refer to the full report at the source URL. - Mod.AS]
感染した種/個体数/感染数/死亡/廃棄/処分
ウシ Cattle / 163 / 15 / 1 / 162 / 0
● 原因不明の大量死、タヌキ－中国 RFI
PRO/AH/EDR> Undiagnosed die-off, raccoon dogs - China: RFI
Archive Number: 20151005.3692933
情報源 Jinan Network Television [in Chinese]、2015年9月6日。
Hozhai Village (in Jiyang Count of Jinan Province、済南 ・ 山東省) の住民らは、村の背後にある、土でできた丘の横の草深い渓谷付近で、small dogs に似た十数頭の動物を発見したと報告している。一部はすでに死亡していた。付近の住民らによると、最初に発見された時には 100-200頭だったという。生きていたものはトウモロコシ畑に逃げ込み、死体は土に埋めたと話している。動物は仲間の死体を食べていた。死体が発見された溝は潅漑に使用されている。Wang Yuzhi of Shandong University Life Sciences Institute の準教授は: "動物は 'haozi' or 'li.' と呼ばれる、タヌキ raccoon dog の 1種である." と説明している ...
● 原因不明の疾患、ウシ－タイ TK RFIPRO/AH/EDR> Undiagnosed illness, bovine - Thailand: (TK) RFI
Archive Number: 20151005.3690692
情報源 udnbkk.com [in Chinese]、2015年10月3日。
県家畜当局 Tak Province Husbandry Bureau が [2 Oct 2015]、ウシの市場 Mae Sot Cattle Market を一時閉鎖すると発表した。yellow cattle and water buffalo の中国向け輸出の最大のマーケットであるが、最近、原因不明の感染症が発生し、多数のウシの足や口が腐敗し、死亡例もある。当局は、取引を停止する以外に打つ手がない ...
チクングニア熱 (29) など
WHO/PAHO メキシコ、ベリーズ、ブラジル、コロンビア、ペルー、フィリピン、印、米
診断検査
● 原因不明の疾患、ロブスター－ベトナム RFI
PRO/AH/EDR> Undiagnosed disease, lobster - Viet Nam: RFI
Archive Number: 20151005.3693242
情報源 Viet Nam News、2015年10月5日。
Ly Son Island off central Quang Ngai province のロブスター漁師らは、数日前から発生のロブスターの死亡に苦しめられている。先週 [28 Sep - 4 Oct 2015]、同地域内で飼育されていたロブスターの 15 %が死亡したと、経済担当者 Deputy Head of Economic and Rural Infrastructure Department が明らかにした ...
● 馬ヘルペスウイルス－米国 PA 北米 (21) ウマ
PRO/AH/EDR> Equine herpesvirus, equine - North America (21): USA (PA)
Archive Number: 20151005.3693241
情報源 Daily Racing Form、2015年10月3日。
Parx Racing の 2歳馬 filly 1頭が、馬ヘルペスウイルス the equine herpesvirus 検査で陽性となり、厩舎が隔離 a quarantine of the stable area されている ...
● インフルエンザ (49) カナダ サウジアラビアから、ハッジからの帰還者
PRO/EDR> Influenza (49): Canada ex Saudi Arabia, Hajj returnees, susp., RFI, Alert
Archive Number: 20151005.3693052
投稿者 Alberta Health Services、2015年10月5日。
2週間前より、巡礼を終えメッカ Mecca からカルガリー Calgary に帰国する旅行者らが、 Foothills Medical Center の救急室を受診している。MERS-CoV patients をスクリーニングする中で、これまでに 2例のインフルエンザ患者 laboratory-confirmed influenza A cases を確認している。サウジアラビアで発生したインフルエンザが世界中に患者を拡散させていることを懸念している。
● チクングニア熱 (29)
WHO/PAHO メキシコ、ベリーズ、ブラジル、コロンビア、ペルー、フィリピン、インド、米国
診断検査
PRO/EDR> Chikungunya (29): Americas, Asia
Archive Number: 20151005.3693195
[1] WHO/PAHO report： 2 Oct 2015
[2] メキシコ (national). 28 Sep 2015. (conf.) more than 7000 cases.
[3] ベリーズ (Corozal district). 29 Sep 2015. (susp.) 4 cases
[4] ブラジル Brazil [in Portuguese]:
- Itajai, Santa Catarina state. 25 Sep 2015. (conf.) 1st locally acquired case in the state.
- Avare, Sao Paulo state ex Alagoas state. 30 Sep 2015. (conf.) 1 case.
- Sergipe state. 24 Sep 2015. (susp.) 361 cases, (conf.) 7 cases locally acquired.
[5] コロンビア (national). 24 Sep 2015. [in Spanish] (reported) 439 000 cases in 712 municipalities since outbreak began in 2014 and in 2015, 334 429 cases in 712 municipalities; Deaths 58; Municipalities most affected: Cali, Cucuta, Neiva, Cartagena, Villavicencio, Sincelejo, Ibague, Monteria, Barranquilla, Girardot, Cartago y Palmira; Epidemic declared over by Vice Minister of Public Health.
[6] ペルー (national). 23-29 Aug 2015. [in Spanish] (probable) 48 cases, (conf.) 72 cases; of the 120 cases, 118 imported; Regions most affected: Tumbes 107 cases locally acquired of which 37 confirmed, Piura 13 cases of which 2 confirmed
[7] フィリピン (Zamboanga city, Zamboanga Peninsula region ). 3 Oct 2015. (confirmed) 4 cases.
[8] インド (Phagwara, Punjab state). 24 Sep 2015. (susp.) many cases [no numbers provided] coming to local health care facilities.
[9] 米国
- USA states from ArboNET as of 29 Sep 2015
- Caribbean Islands:
プエルトリコ (imported) 0 cases, (locally acquired) 112 cases
米領バージン諸島 (imported) 0 cases, (locally acquired) 4 cases
[10] 診断テスト
情報源 Genome Medicine、2015年9月29日。
原著タイトル Rapid metagenomic identification of viral pathogens in clinical samples by real-time nanopore sequencing analysis.
要約
MinION nanopore sequencing coupled to a newly developed, web-based pipeline for real-time bioinformatics analysis on a computational server or laptop (MetaPORE). を用いて、4人の血清検体から、チクングニア熱ウイルス chikungunya virus (CHIKV)、エボラウイルス Ebola virus (EBOV)、C 型肝炎ウイルス hepatitis C virus (HCV) の、バイアスのないメタゲノム検出について報告する。from 7 log 10-8 log 10 copies per milliliter の力価 titers において; 4-10分間以内に、急性出血熱の患者 2名から EBOV、無症候性の献血者 1名から CHIKV が判明した。一方 40分間以内に、より力価の低い lower titer HCV virus 5 log 10 copies per milliliter が検出された。
Analysis of mapped nanopore だけでも結果は得られるが、正しく分離された 4件のウイルス検体すべてを識別するための、単独の平均エラー率は 24 [percent (range 8-49 percent)] であり、90 percent of the genome of CHIKV は、97-99 % の精度で回収された。nanopore sequencing を用いると、臨床検体からダイレクトにウイルス病原体がメタゲノム的に同定され、サンプルから結果判明まで 6時間以内というかつてない短時間で完了する ...
[Mod.TY 注－ The rapid turnaround time is remarkable ... ]
● BSE－英国 (03) ウェールズ 古典的、公式情報
PRO/AH/EDR> BSE, bovine - UK (03): (Wales) classical, official update
Archive Number: 20151005.3693147
投稿者 英 ・ Welsh Government Llywodraeth Cymru、2015年10月5日。
the UK's TSE reference laboratory において classical BSE と確定診断されており、2009年生まれのウシである。比較的若いウシであるため、疫学調査が行われている。
● 狂犬病－米国 (39) TX コウモリ
PRO/AH/EDR> Rabies - USA (39): (TX) bat, human exposure, Alert
Archive Number: 20151005.3693066
情報源 Statesman、2015年10月4日。
テキサス州立大学 Texas State University in San Marcos では、[2 Oct 2015] 1頭のコウモリの狂犬病 rabies 検査が陽性となったため、検査が判明する前に、このコウモリを触っていた学生 1名を探している。。
● ランピースキン病、ウシ－ギリシャ (06) MH OIE
Lumpy skin disease [LSD], Greece、Follow-up report No. 4
PRO/AH/EDR> Lumpy skin disease, bovine - Greece (06): (MH) spread, emergency vaccination, OIE
Archive Number: 20151005.3692103
情報源 OIE, WAHID weekly disease information 2015; 28(41)、2015年10月4日。
感染開始時期 2015年8月18日
原因ウイルス Lumpy skin disease virus
新たな感染流行 (4)
[This section addresses 3 new outbreaks in Macedonia and Thrace, of which 3 are in Evros, the region initially infected, and one outbreak in Kavala, which is west of the previous outbreaks. For statistics of each outbreak, please refer to the full report at the source URL. - Mod.AS]
感染した種/個体数/感染数/死亡/廃棄/処分
ウシ Cattle / 163 / 15 / 1 / 162 / 0
● 原因不明の大量死、タヌキ－中国 RFI
PRO/AH/EDR> Undiagnosed die-off, raccoon dogs - China: RFI
Archive Number: 20151005.3692933
情報源 Jinan Network Television [in Chinese]、2015年9月6日。
Hozhai Village (in Jiyang Count of Jinan Province、済南 ・ 山東省) の住民らは、村の背後にある、土でできた丘の横の草深い渓谷付近で、small dogs に似た十数頭の動物を発見したと報告している。一部はすでに死亡していた。付近の住民らによると、最初に発見された時には 100-200頭だったという。生きていたものはトウモロコシ畑に逃げ込み、死体は土に埋めたと話している。動物は仲間の死体を食べていた。死体が発見された溝は潅漑に使用されている。Wang Yuzhi of Shandong University Life Sciences Institute の準教授は: "動物は 'haozi' or 'li.' と呼ばれる、タヌキ raccoon dog の 1種である." と説明している ...
Archive Number: 20151005.3690692
情報源 udnbkk.com [in Chinese]、2015年10月3日。
県家畜当局 Tak Province Husbandry Bureau が [2 Oct 2015]、ウシの市場 Mae Sot Cattle Market を一時閉鎖すると発表した。yellow cattle and water buffalo の中国向け輸出の最大のマーケットであるが、最近、原因不明の感染症が発生し、多数のウシの足や口が腐敗し、死亡例もある。当局は、取引を停止する以外に打つ手がない ...