2016年2月10日

エボラ 迅速検査、血清中の細菌遺伝子
アルゼンチン出血熱 アルゼンチン

● エボラ 迅速検査、血清中の細菌遺伝子
PRO/AH/EDR> Ebola update (13): rapid test, updates, research, funding
Archive Number: 20160210.4010884
[1] Opinion: Rapid test for Ebola エボラの迅速診断検査
 情報源 International New York Times Opinion pages,2016年2月9日。
To the Editor:
"Ebola Case Is Reported in West Africa" (news article, 16 Jan 2016) では,少なくとも1カ所の病院を受診していたにもかかわらず,死後までエボラの診断が下されなかった女性の新たなエボラ感染例について報道されている。エボラは,マラリアなどの病気でもみられる一般的な症状しか示さないため,血液検査で確かめる必要がある。the World Health Organization の担当者が,数滴の血液で数分以内に診断できる迅速検査について,偽陽性が多いため使用されていないと説明したことが掲載されていたが,今回の患者のように,診断されるまでに多くの医療施設を受診し,多数の人々を感染にさらしている。迅速検査は患者の振り分けに用いられるもので,偽陽性が最小限となるよう陽性例はすべて従来からの polymerase chain reaction (PCR) による確認検査が行われている。同様の手順は,HIV など多くの疾患で行われている。このような迅速検査を行うことなく,as "clinical case definition, 臨床症状による診断基準" というチェックリストでスクリーニングされており,実際のエボラ患者の 20%見逃されている一方,この(迅速)検査で患者とされたうちのおよそ 70 % は実際にはエボラではなかった。この結果,エボラ治療施設に入院となった患者の最大で 40 % は,実際にはエボラウイルスを保有していないにもかかわらず,エボラウイルスを保有する患者とともに入院させられ,暴露している。
また,ある研究によると,迅速検査は実際のエボラ感染をすべて検出し,偽陽性例はわずか 8% 程度であることが示されている。流行のピークにおいて迅速検査で様相は大きく変わると思われ,患者のスクリーニングに使用すべきだと考える。
[2]
Updates
8 Feb 2016 シエラレオネ: 墓泥棒 Sierra Leone grave robbers plundering tombs of Ebola victims
8 Feb 2016 シエラレオネ: Maternal health crisis in Sierra Leone
[A WaterAid - VSO [Voluntary Service Overseas] study によれば,
 - 出産前ケアを受けられる女性は 18 %減少
 - 出産後ケアは 22 %減少
 - 医療施設での出産は 11 %減少
 - 母体死亡 30 %増加
 - 新生児死亡 24 %増加
 - 現在も稼働しているのは,7 out of 9 critical areas of maternity care]
9 Feb 2016 シエラレオネ: Latest Sierra Leone Ebola case cured but more testing needed--officials
[ ... 保健大臣は,シエラレオネの最新の38歳の患者は,2回の検査で陰性が確認され,the 34 Military Hospital を退院したことを明らかにした。[5 Feb 2016] に退院した後,her central northern home district of Tonkolili に戻った .. しかし,ギニアとの国境に近い the northern city of Kambia において,48人の暴露が疑われる接触者のうち,把握されているのは10人に過ぎないと,保健当局者が話している ...
8 Feb 2016 米国 (CT): Malloy, health officials sued over Ebola quarantines
9 Feb 2016 西アフリカ: Ebola Still Takes Mental Toll on West Africa's "Burial Boys"
Non-government organization
8 Feb 2016: Special Report: The World Health Organization's critical challenge - healing itself
January 2016: World Health Organization (WHO) Clinical care for survivors of Ebola virus disease [Interim guidance]
Research
9 Feb 2016: Bacterial sequences detected in 99 out of 99 serum samples from Ebola patients _Bio Rxiv_. 9 Feb 2016. On-line pub. doi
[要約 エボラ病の進化(進行?)と臨床症状 Evolution and clinical manifestations of Ebola virus (EBOV) infection は,敗血症 sepsis の経過 the pathologic processes と重なる。確かに,ウイルスの一部は免疫システムの寛容を受け,粘膜上皮のバリアの障壁を破り,細菌の転位 bacterial translocation を許す。これらの事実を基に,エボラ病患者 EBOV infected patients の典型的な敗血症性ショック様症状の病原性に細菌が関与する場合,新たな治療法につながるとの可能性を模索した。患者のウイルス遺伝子データ available EBOV patient sequence datasets 内の細菌を探し当てることとした。EBOV は an RNA virus であり,遺伝子塩基配列を決定するための実験 some NGS sequencing experiments は RNA-Seq experiments であることから,もし患者血清中に細菌が存在するとすれば,エボラ患者の遺伝子 the sequenced material に,少なくとも細菌の遺伝子の一部 some bacterial RNA が検出されると考えた。99 Ebola samples from the last outbreak の a RNA-Seq public dataset 内の細菌を探索したところ,驚いたことに細菌の RNA 遺伝子検索の実験条件として十分ではなかったにもかかわらず,すべてのサンプルで細菌が確認された ...]
Funding
関連項目 (12): Sierra Leone, updates, research, funding, vaccine 20160207.4002006

● アルゼンチン出血熱 アルゼンチン

PRO/AH/EDR> Argentine hemorrhagic fever - Argentina (SFSanta Fe)
Archive Number: 20160210.4010670
 情報源 Arroyo Diario [in Spanish],2016年1月28日。
Arroyo Seco 在住の11歳女児が,心血管不全により,小児病院 the Children's Hospital, north zone, in Rosario において死亡した。救急センターで様々な検査が行われ,アルゼンチン出血熱ウイルス Argentine hemorrhagic fever [virus] が死亡原因であったと発表された。母親によれば,40℃の発熱があったため,医療施設 health post SAMCO No. 50 in Arroyo Seco から他の施設に転送されることとなったが,救急車を呼ぶことができず,a motorcycle で Rosario まで運んだと言う。同市到着後,肺炎の症状が出現した。
[Mod. TY- Argentine hemorrhagic fever は Junin virus, an arenavirus による感染症で,the endemic area of Santa Fe province において散発性の発生がある。少女の感染の状況については記述されていないが,げっ歯類の宿主 The hosts of Junin virus は _Mus musculus_, _Calomys spp_. and _Akodon azarae_ で,これらの動物では無症状の慢性感染があり,唾液,尿,血液中にウイルスを排出し続けている ... the GIDEON database によると,このワクチンの接種により予防可能な疾患の患者は,ほとんどが Cordoba, Buenos Aires, and Santa Fe provinces で発生しており,1964年は over 3000 cases が発生する流行年だった。1993 and 1994 年にもそれぞれ 120 cases が発生するピークが起きている ...]

● 黄熱 アンゴラ
PRO/EDR> Yellow fever - Africa (10): Angola (HM)
Archive Number: 20160210.4010453
 情報源 Angop [in Spanish],2016年2月10日。
Huambo province では,黄熱患者 7 probable and 6 suspected yellow fever [YF] cases, and the deaths of 3 people が確認されている。公衆衛生当局の責任者 the head of the Public Health Department は,2例の死亡 deaths occurred in the Central Hospital and one in the Bailundo municipality があり,患者らは流行発生が開始した Luanda からの患者だったと述べた。このほか,11検体が the laboratory in Luanda で検査中であることも明らかにした ... Huambo の the 1st suspected case of yellow fever が確認されたのは 17 Jan 2016 だった。

● サルモネラ感染症 オーストラリア、レタス
PRO/AH/EDR> Salmonellosis - Australia (04): pre-packed lettuce, st. Anatum, alert, recall
Archive Number: 20160210.4009951
 情報源 The Age,2016年2月10日。
回収されているレタス a pre-packed lettuce recall が関係する,ビクトリア Victoria 州のサルモネラ感染症患者 salmonellosis cases が100人となった。8日に発表された62例から約2倍に増えた。回収されているレタスは,Coles 4 Leaf Mix, Woolworths salad mix, SupaSalad Supamix and Wash N Toss salad mix で,4 Feb 2016 に回収が発表されて以来,全国でサルモネラ感染症患者が合計 128 salmonellosis cases 報告されている。ほとんどが Victoria の患者であるが; 12 cases in South Australia, 8 in Queensland, 6 in New South Wales and 2 in Western Australia が確認されている。the 128 cases のうち,確定診断例は10例のみである ..

● ハンタウイルス チリ
PRO/AH/EDR> Hantavirus update - Americas (08): Chile (ML)
Archive Number: 20160210.4009950
 情報源 Pura Noticia [in Spanish.],2016年2月10日。
たった今,公衆衛生研究所 the Public Health Institute (ISP) でハンタウイルス感染症 [a] hantavirus [infection] in Maule が1例確認され,2016年の第3例目の患者となった。the Regional Hospital in Talca に搬送された6歳男児で,集中治療室に収容され状態は安定している 

● ダニ媒介性脳炎 チェコ共和国

PRO/AH> Tick-borne encephalitis - Czech Republic (02): background
Archive Number: 20160210.4009410
 情報源 GIDEON (Global Infectious Disease & Epidemiology Network),2016年2月10日。
20160209.4005602に関し。
1970年代にオーストリアで報告された発生率と同じ。
オーストリアでは1981年にワクチンの一斉接種が行われ,周辺各国の発生率まで減少している。

● 髄膜炎菌性髄膜炎 イタリア

PRO/EDR> Meningitis, meningococcal - Italy (TC Tuscany): increased incidence, sg. C
Archive Number: 20160210.4009797
 情報源 ANSA.it,2016年2月8日。
フィレンツェ Florence 近郊の Campi Bisenzio の50歳女性が,髄膜炎(菌) [meningococcal?] meningitis [serogroup] C に感染し,the region における 2016年のこれまでの患者が12人となったと,8日現地保健当局が明らかにした。Florence's Careggi Hospital の感染症科で治療を受けている。女性は行政職 administrative job で、市民との直接の接触はなかった。当局は45歳までのすべての人々に無料でワクチンを行っている。2015年に同地方で発生した髄膜炎患者は38人だった。

● リーシュマニア症 アルバニア,ヨルダン,パキスタン
PRO/AH/EDR> Leishmaniasis - Albania, Jordan, Pakistan: surveillance 2015
Archive Number: 20160210.4009452
 投稿者 James Crilly,2016年2月10日。
2015年,アルバニア,ヨルダンおよびパキスタンにおいて行われた,The Leishmaniasis Gap Analysis Report and Action Plan の報告によると,今も感染の増加が見られている。実施した団体は regional disease surveillance networks SECID/SEEHN [Southeast European Center for Surveillance and Control of Infectious Diseases/Southeastern Europe Health Network], MECIDS [Middle East Consortium on Infectious Disease Surveillance], and Pak One Health supported by CORDS [Connecting Organizations for Regional Disease Surveillance] Network and funded by the Bill & Melinda Gates Foundation である。

● ハンセン病 米国
PRO/AH/EDR> Leprosy - USA: (FL) increased cases, susp. armadillo transmission, RFI
Archive Number: 20160210.4009277
 情報源 Outbreak News Today,2016年2月5日。
フロリダ Florida 州内で,2016年の最初の5週間で 5例のハンセン病症例 leprosy cases が報告された。2015年に確認された患者数は 27 confirmed leprosy, or Hansen's disease, cases で,例年の10例からかなり多い数だった。2016年も前年 [2015] からの状況が継続している。[8 Feb 2016] までに患者 confirmed cases が報告されたのは Martin County (Stuart), Bay County (Panama City), and 3 in Brevard County (Merritt Island (2) and Titusville (1)) だった

● ベネズエラ出血熱 ベネズエラ 疑い
PRO/AH/EDR> Venezuelan hemorrhagic fever - Venezuela: (BA) susp, RFI
Archive Number: 20160210.4007649
 情報源 El Universal [in Spanish],2016年2月8日。
Barinas [state] で60人が死亡し,デング出血熱と診断された疾患を巡って,ベネズエラ出血熱 an outbreak of Venezuelan hemorrhagic fever [VHF] を疑う疫学者ら the network Defendamos la Epidemiologia [Let's Defend Epidemiology] は警戒している ... [Venezuelan] hemorrhagic fever は Guanarito virus によるウイルス感染症で,ヒトでの感染に与るベクターは the cane rat であり,通常,非攻撃性でヒトから離れて暮らすこのラットの排泄物が,(ヒトの) 気道に入ることで感染する。
最も発生が多い地域は the municipalities in the south of Portuguesa state including Guanarito, Papelon, and San Genaro で,Barinas [state] では東の the municipality of Sosa と西の Guarico である。
2015年に 16 cases of VHF が報告されており,同年には国内で黄熱 the last cases of yellow fever も報告されている。発生が確認されれば,1989年に初めて確認された後,今回が the 5th outbreak of the disease になるとしている。
[Mod.- ...Guanarito virus is an arenavirus. The rodent reservoirs of Guanarito virus are the Alston's cotton rat _Sigmodon alstoni_ (see image ) and the short-tailed cane mouse _Zygodontomys brevicauda_ . ...]

● インフルエンザ WHO
PRO/EDR> Influenza (10): WHO update, risk assessment, Ukraine, E Europe, Middle East H1N1
Archive Number: 20160210.4007591
[1] WHO Influenza update number 256, based on data up to 24 Jan 2015
 情報源 WHO, Influenza updates,2016年2月8日。
北半球では,influenza A(H1N1)pdm09 を中心とした,インフルエンザ活動性レベルの増加が続いている ...
[2] Risk assessment: seasonal influenza A(H1N1)pdm09
 情報源 WHO, Influenza, Publications,2016年2月8日。
過去数年間と比較して,北半球のインフルエンザの活動性開始が,西欧,北米,東アジアの一部の国々で遅れている。influenza-like illness (ILI) rates で示される感染伝播は,各国固有のベースラインレ^とを超え始めているが,東欧と西アジアの一部を除き,全体として低いままである
[3] ウクライナ Ukraine : influenza A(H1N1)
Daily victims of the flu: sanitary-epidemiological station reports frightening statistics
 情報源 IA "Obozrevatel.com, 29 Jan 2016 [in Russian],2016年1月29日。
ウクライナでは連日,インフルエンザおよびインフルエンザ様疾患により,約10人が死亡している。死亡した患者らはワクチンを接種していなかった。1月29日現在,国内でワクチンを受けたのは12万3000人で,欧州各国では人工の30-50 % が接種されているのに対し,人口あたりの接種率が大変低いとされている。死亡した患者が最も多かったのは,the Odessa region の32人で,the Vinnytsia region では11人が死亡している ..
[4] 東欧および中東: influenza A(H1N1)
 情報源 The Guardian,2016年2月9日。
この冬ウクライナで183人がインフルエンザ Swine flu により死亡し,東欧と中東にも広がっている。ロシアでも感染により107人が死亡し,アルメニアで18人,ジョージアで10人であると報告されている。中東では,イランで112人が死亡し,シリアとイラクでは数十名が死亡したとの未確認情報がある ... EU においても重症例 severe H1N1 infection の割合が増加しており,8カ国が過去3週間の集中治療例の増加を報告していることが the World Health Organisation (WHO) から明らかにされている ..

● 腸管出血性大腸菌 米国 O157,ミルク
PRO/AH/EDR> E. coli EHEC - USA (03): (CA) O157, unpasteurized milk, alert, recall
Archive Number: 20160210.4006446
 情報源 Food Safety News,2016年2月8日。
On Mon 8 Feb 2016,カリフォルニア California 州保健当局 The California Department of Public Health (CDPH) は,大腸菌感染流行 a confirmed _E. coli_ outbreak cluster の州内の小児 6 California children のうち4人が,1月に発病する前に,未殺菌ミルク unpasteurized raw milk from Organic Pastures Dairy Co. を飲んでいたことを確認した。検査により all 6 children はすべて同じ菌 the same unique strain of Shiga-toxin producing _E. coli_ O157 の感染であることがわかっている ...

● ニューカッスル病 ブルガリア
PRO/AH/EDR> Newcastle disease - Bulgaria: (KZ) poultry, OIE
Archive Number: 20160210.4010926
 情報源 OIE, WAHID weekly disease information 2016; 29(06),2016年2月10日。
Newcastle disease, Bulgaria,Reoccurrence of a listed disease
流行開始時期 2016年2月2日
前回流行時期 2013年1月24日
原因ウイルス Paramyxovirus virus
新たな感染流行 (1)
発生地 1: Nenkovo, Kardzali [Kurdzhali]: village
感染した種/頭数/症例数/死亡数/廃棄/処分
Birds / 301 / 61 / 61 / 240 / 0
Affected population: Backyard poultry

● 肺炎 カナダ ビックホーン
PRO/AH/EDR> Pneumonia, ovine - Canada: (BC) bighorn sheep
Archive Number: 20160210.4009451
 情報源 CBC (Canadian Broadcasting Corporation) News,2016年2月5日。
ブリティッシュコロンビア州 BC's [British Columbia] interior のビッグホーンの群れ A bighorn sheep herd が,感染のある家畜のヒツジとの接触により, a particular type of pneumonia に感染したと報告された