2017年2月6日

エボラ 死亡リスク予測、ウマ抗体による治療
マラリア 東南アジア アルテミシニン耐性 Lancet
チクングニア熱 PNAS、Science、Nature
ハンセン病 ネパール

● エボラ 死亡リスク予測スケール、ウマ抗体による治療
PRO/AH/EDR> Ebola update (06): research, treatment, funding
Archive Number: 20170206.4819835
Research
2 Feb 2017: New scoring system predicts Ebola severity
EVD [Ebola virus disease] による死亡リスクを予測するスケールを新たに開発したとの研究結果が,PLOS Neglected Tropical Diseases に掲載された。マラリアとの重感染,著しい高齢 extremes in age, 受診の遅れが死亡に関係していた。加えて,見当識障害,吃逆,下痢,結膜炎,息切れ,筋肉痛もすべて死亡の予測因子だった。これらの因子を統計的に重み付けして組み合わせた疾患スコアを用いることで,トリアージの時点で 91 %,トリアージ後では 97 % の確度 accuracy で,死亡を予測することが可能だった。
原著タイトル Predicting Ebola Severity: A Clinical Prioritization Score for Ebola Virus Disease. PLoS Negl Trop Dis 11(2): e0005265. doi:10.1371/journal.pntd.0005265
[Mod.LK-死亡確率の予測は,医療資源が限られた中での,医師の困難な決定に役立つかもしれないが,各個人が持つ遺伝子 human genetics も,予後に重大な影響を与えると考えられる。それにしても,at triage with 91% accuracy and after triage with 97% accuracy は impressive figures である]
Treatment
3 Feb 2017 Queensland AU: Queensland-led team develops effective economical Ebola treatment
エボラ患者に対する,有効かつ経済的な治療法が開発された。ウマから得られた抗体を用いた暴露後治療は,次のアウトブレイクで利用可能かもしれない ...
[Mod.LK-動物由来の抗体による免疫療法は,120年以上前から細菌やウイルス感染症の治療として用いられてきた。よく知られているように,ウマ血清抗体が狂犬病の治療で使用されている。EVD に対する試みとしての論文が,2015年に発表されている (Post-exposure treatment of Ebola virus using passive immunotherapy: proposal for a new strategy. J Venom Anim Toxins Incl Trop Dis. 2015; 21: 3. Published online 2015 Feb 15. doi: 10.1186/s40409-015-0003-1. )]
Funding
3 Feb 2017: Ebola grant expanded from USD 12 million to USD 24 million
AFC invests USD 205 million in Guinea
関連項目 (05): news, vaccine, funding, documentary films 20170129.4801064

● マラリア 東南アジア アルテミシニン耐性
PRO/EDR> Malaria - Southeast Asia, artemisinin resistance spread
Archive Number: 20170206.4819335
 情報源 Lancet Infectious Diseases 2017年2月1日
原著タイトル The spread of artemisinin-resistant Plasmodium falciparum in the Greater Mekong Subregion: a molecular epidemiology observational study Lancet Infect Dis. 2017. pii: S1473-3099(17)30048-8. doi: 10.1016/S1473-3099(17)30048-8.
要約
背景 
熱帯熱マラリアのアルテミシニン耐性 artemisinin resistance in falciparum malaria 獲得に関わる変異 the PfKelch13 mutations は,メコン地域一帯 across the Greater Mekong subregion に複数の独立した起源を有するとのエビデンスが示され,地域的なマラリア根絶が目標とされる理由となっている。分子遺伝学的手法 molecular genotyping により,the Greater Mekong subregion における抗マラリア薬耐性の選択と拡大を評価した。
方法 
ミャンマー,タイ北東部,ラオス南部,カンボジア西部の熱帯熱マラリア原虫 Plasmodium falciparum isolates について,PfKelch13 mutations と,Pfplasmepsin2 gene amplification (piperaquine resistance の指標)を調べた。鏡検または迅速検査で診断された,合併症のない熱帯マラリア患者の血液 blood spots を集め,microsatellite genotyping により遺伝学的関連性 genetic relatedness について評価した。
結果 
[1 Jan 2008]から[31 Dec 2015]までのアルテミシニン耐性マラリアの疫学調査で,434 isolates を得た。In 2014-15 においては,2008年にカンボジアで新興した単一の長いハプロタイプ系統 a single long PfKelch13 C580Y haplotype (-50 to +31•5 kb) lineage が,タイ北東部で 65 of 88 isolates,ラオス南部で 86 of 111 isolates,カンボジア西部で 14 isolates 確認され,国境を越えた激しい選択的一掃 a hard transnational selective sweep が生じていることが示唆された。Pfplasmepsin2 amplification が確認されたのは,この系統のみだった。2015年までに,カンボジアとタイでそれぞれ,非常に近い関係にある原虫 closely related parasites が,10 of the 14 isolates from Cambodia and 15 of 15 isolates from northeastern Thailand 発見されている。ミャンマーの C580Y mutated parasites は a different genetic origin を有していた。
解釈 
優位となっているアルテミシニン耐性熱帯熱マラリアの系統 the dominant artemisinin-resistant P falciparum C580Y lineage は,おそらくカンボジア南部で生じたもので,その後タイとラオスに拡大して,他系統を駆逐し,piperaquine resistance 耐性を獲得したと考えられる。アルテミシニン耐性熱帯熱マラリア fit artemisinin-resistant P falciparum parasite lineages が新興・拡大し,さらに the Greater Mekong subregion 一帯に蔓延する同効薬剤への耐性も獲得したことで,地域のマラリア対策と根絶目標が脅かされる結果となっている。現存の抗マラリア薬が有効であるうちに,熱帯マラリアの同地域からの根絶を加速させなければならない。
[Mod.EP- ... chloroquine resistance, sulfadoxine/pyrimethamine (Fandidar) and mefloquine resistance 各薬剤への耐性はすべて,この同じ地域 the same counties で発生した。東南アジアのこの国々がなぜ,熱帯熱マラリア耐性発生のホットスポットとなっているのか,その理由はわかっていない。しかし,質の悪い薬剤や,不十分な投薬量がその原因と見なされてきた ... これらの問題の解決策として無料のマラリア治療を論議してきた。殺虫剤含浸ネット(蚊帳)や必要時の室内残留スプレーの無料提供も役立つ]
参考項目 2015 
Malaria - Myanmar, artemisinin resistance: 20150222.3183596

● ハンタウイルス チリ 
PRO/AH/EDR> Hantavirus update - Americas (10): Chile (BI)
Archive Number: 20170206.4819246
 情報源 Publimetro [in Spanish] 2017年2月5日
保健省当局者 The Sub secretary of Health は,男女 2人の 15歳の若者が,the Bío Bío Region 郊外への旅行で感染したハンタウイルス感染症 a hantavirus infection により the Clínica Alemana に入院となり,重体であることを明らかにした。a camping trip に参加したスカウトで,心肺症候群を発症したため,同院に搬送され,現在集中治療室で人工呼吸器が装着されている。今夏 this summer season [2016-2017],14 cases of hantavirus [infections] が報告されており,the Los Lagos and Aysén regions が最も多いが,最近数週間に cases in El Maule も確認されている ...
写真 the long-tailed pygmy rice rat (_Oligoryzomys longicaudatus_), the sigmodontine rodent host of Andes hantavirus

● コクシジオイデス症 米国
PRO/EDR> Coccidioidomycosis - USA: (CA) increased cases
Archive Number: 20170206.4817960
 情報源 Cal Coast News 2017年2月4日
San Luis Obispo County [California] において,2017年の初めの 1ヶ月間で,26 confirmed cases of Valley fever and 2 deaths が確認された。過去 8年間で 2倍以上に増加している。2009年に郡内で報告されたのは 87例だったが,2016年は 220 confirmed cases of Valley fever and 5 deaths が発生した。この病気は,アリゾナとカリフォルニア portions of Arizona and California で自然に発生する真菌が原因となる。以前はほとんどの症例が the Central Valley の患者だったが,現在では San Luis Obispo County [a county on the Pacific coast] が a hot spot となりつつある。対照的に,Santa Barbara County [a county on the Pacific coast immediately south of San Luis Obispo County] では 2016年の報告数はわずか 56 cases of Valley fever だった。 (真菌の)芽胞を吸い込んでも,ほとんどの人は発症しない。およそ 40 % に当たる残りの人々は,咳,うっ血,発熱,倦怠感,体部痛,頭痛などのインフルエンザのような症状を発症し,症状が 1ヶ月以上続くこともある。Valley fever では,重症肺炎や髄膜炎,死亡が起きることもある。The Mayo Clinic's website では,真菌が存在する地域の人々に対し,症状に注意するようアドバイスされている。初期に治療が行われれば,ほとんどの患者は問題なく治癒する。
[Mod.ML-コクシジオイデス症 Coccidioidomycosis は,米国南西部(mainly the states of Arizona, California, New Mexico, and Texas, but also Nevada, Utah, and Washington state)各州と,メキシコ北部の一部 parts of northern Mexico,中南米の,高温半砂漠地域の真菌感染症である。原因となるのは _Coccidioides immitis_ と _C. posadasii_ で,地中表面から 5ないし 20 cm で成長する,2種類の病原性真菌 nearly identical species of pathogenic fungi で,この深さで真菌が産生する arthroconidia が,土が掘り返されたときに破壊され空気中に散布される。芽胞は空気の流れによってかなり遠くまで飛ばされる。ヒトや他の動物が空気中の芽胞を吸入すると,急性感染症を起こす可能性がある。カリフォルニア州のThe California counties of Kern, Tulare, Kings, Fresno, Madera, and San Luis Obispo 各郡は,the _Coccidioides_-endemic areas である; coccidioidomycosis の年間発生率が最も高く,from California for the years 2001-2011 累積報告患者総数の 76 % を占めている (1)]

● チクングニア熱 南北アメリカ、アジア

PRO/EDR> Chikungunya (06): Americas, Asia, research
Archive Number: 20170206.4817959
[1] Cases in various countries:
WHO/PAHO report 20 Jan 2017
2017 to EW 3 [week ending (w/e) 20 Jan 2017].
症例数/発生週/地域内疑い/地域内確定/輸入確定/死亡
エルサルバドル/ week 01 [week ending 6 Jan 2017] / 5 / 0 / 0 / 0
コロンビア/ week 01 [week ending 6 Jan 2017] / 20 / 0 / 0 / 0
ベネズエラ/ week 01 [week ending 6 Jan 2017] / 8 / 0 / 0 / 0
[2] ブラジル(national). 8 Dec 2016. [in Portuguese] (conf.) 259 928 cases, nearly 10 times more than last year; deaths (susp.) 138.
[A 21 Dec 2016 report indicated 10 CHIKV-related deaths in Rio de Janeiro state ]
[3] コロンビア(national). 31 Dec 2016. [in Spanish] (reported) weeks 1-52, 19 566; 209 cases (conf. laboratory); 19 133 cases cases (conf. clinically). Departments most affected: Valle del Cauca, Tolima, Cundinamarca, Huila, and Santander reported 68 percent of the cases.
[As of EW 4 (w/e 28 Jan 2017), 136 cases have been reported; 2 cases confirmed by laboratory, 124 confirmed clinically, 11 cases suspected ]
[4] ペルー(Zarumilla, Tumbes region). 30 Jan 2017. [in Spanish] (conf.) 2 cases in adolescents.
[5] インド India
 - Delhi area. 16 Jan 2017. (conf.) 2 new cases; deaths in 2016: at least 15 cases where chikungunya virus infections contributed to the deaths.
 - Ahmedabad, Gujarat state. 3 Jan 2017. (reported) 364 cases since January 2015, 208 cases in November and December 2016, doubled from 59 cases last week to 118 this week [week of 3 Jan 2017].
 - Nashik, Maharashtra state. 28 Dec 2016. (susp.) 2 cases, (conf.) 9 cases.
 - Mumbai, Maharashtra state. 20 Dec 2016. (reported) 3 city hospitals have come across chikungunya in 5 newborn babies, suggestive of a rare mother-to-child transmission of the virus in the womb or through the umbilical cord at the time of delivery.
[6] 台湾 Taiwan ex Bali, Indonesia 11 Jan 2017. (conf.) 2 cases in tourists who had visited Bali.
[7] 米国 州別 (すべて輸入)2016 as of 17 Jan 2017
[8] 複製と病原性 Virus replication and virulence
 情報源 Proceedings of the National Academy of Sciences, USA (PNAS) 2017年1月31日
[原著タイトル ADP-ribosylhydrolase activity of chikungunya virus macrodomain is critical for virus replication and virulence. Proc Natl Acad Sci U S A. 2017. pii: 201621485. doi: 10.1073/pnas.1621485114]
意義 ... 哺乳類での病原性 virulence を決める,enzymatic ADP-ribosylhydrolase activity を有する,a macrodomain-containing CHIKV protein を特定した。すべての all alphaviruses and coronaviruses で viral macrodomains が維持されると仮定すると,今回の研究結果が,多くのウイルス感染症の治療につながる,加水分解作用をブロックする小型分子化学物質のデザインに寄与する可能性がある... 要約,原文参照願います。
[9] 治療
 情報源 Science Translational Medicine 9 (375) 2017年2月1日 DOI: 10.1126/scitranslmed.aah3438
[原著タイトル Therapy with CTLA4-Ig and an antiviral monoclonal antibody controls chikungunya virus arthritis. Science Translational Medicine 2017; 9(375)]
馴化T細胞によるチクングニア関節炎の改善 Taming T cells to ameliorate chikungunya arthritis
何年にも及ぶこともある関節痛に対する治療法がない。チクングニアに感染させたマウスモデルで,関節炎症状を予防する目的で,pathogenic CD4+ T cells を対象とする 2件の研究が行われた。免疫細胞をリンパ臓器内に押しとどめる sequesters 薬理作用を持つ,fingolimod は,ウイルス増幅に影響を与えることなく,関節炎症状を緩和した。T 細胞の共刺激 T cell costimulation をブロックする,abatacept と,ウイルスの複製および重症度の双方を抑制する,ヒトチクングニア中和抗体を併用した。治療のオプションとなりうる。
要約 
[4] ワクチン
 情報源 Nature Medicine doi:10.1038/nm.4253 2016年12月19日
[原著タイトル A chikungunya fever vaccine utilizing an insect-specific virus platform. Nat Med. 2016 Dec 19. doi: 10.1038/nm.4253]
要約 ワクチン開発は,免疫原性と安全性の間のトレードオフで行われてきた。不活化ワクチンと比べ,生ワクチンは即効性と持続性を示すが,安全性を犠牲にした。これらを克服するため,ワクチン製造のプラットフォームとして,昆虫だけに感染するアルファウイルスの,Eilat virus (EILV)を開発した。チクングニア熱の流行への対処として,an EILV cDNA clone を用いて,the chikungunya virus (CHIKV) structural proteins 構造たんぱくを含むキメラウイルスを設計した。The recombinant EILV/CHIKV ウイルスは,電子顕微鏡 single-particle cryo-electron microscopy による観察で,10 Ã のスケールで 野生型ウイルス wild-type CHIKV と構造が一致し structurally identical,viral RNA delivery への接着と侵入から,脊椎細胞での複製初期を再現した。それでもなおこのウイルスは,高い安全性を維持しながら,生産的複製は完全に欠如していた ... 

● ハンセン病 ネパール

PRO/EDR> Leprosy - Nepal: (Palpa) new cases
Archive Number: 20170206.4817958
 情報源 Outbreak News Today 2017年2月4日
国内中央部の地区保健当局 The Palpa District [Province Five] Public Health Office (DPHO) は今週 [week of 30 Jan 2017],新たな ハンセン病患者 13 new leprosy cases を報告したと報じられた。この地区では毎年約 16例が報告されている。WHO によると,2015年に世界中で新たに報告されたハンセン病患者は 20万人を超えている ... 1995年以降,WHO は世界中の全患者に対して多剤併用療法を無料で提供しており,いずれの病型の患者にも有効である。
[Mod.ML- ネパール政府の積極的な調査が,the Palpa district の新たな 13例のハンセン病患者の確認につながったと思われる。 ... しかし,ネパールは ハンセン病の根絶には至っておらず,国内総人口が約 2800万人の国で,2015年に 2427例が報告された。ネパールは,2015年に 1000人以上の患者を報告した 14か国の 1つだった。ネパールの患者数は,しかし,2005年の 6150例から徐々に減少している。the 2751 new cases in 2015 のうち,1487人 (54 percent) は,市中感染を示唆する多細菌型 multibacillary leprosy であった。197人 (7.2 percent) が小児であったことは,現在も感染伝播があることを意味する。さらに 119人 (4.3 percent) に慢性変型と障害を残し,症例発見に問題があると考えられる(WHO)。

ハンセン病 Leprosy は,らい菌 Mycobacterium leprae_ の慢性感染症で,a case of lepromatous (multibacillary) leprosy との密接で持続性の接触,通常は同居により感染伝播する。短時間の接触では,感染しない
2008年,新たな病原体として,_Mycobacterium lepromatosis_ が,死亡患者 patients who died of diffuse lepromatous leprosy (DLL)で確認された()。DLL は,1世紀以上前からメキシココスタリカに常在する,まれな重症病型 a unique severe form of leprosy である。
ハンセン病患者の鼻汁 nasal secretions 中に夥しいらい菌が排出されるため,気道または鼻分泌物を介して感染が拡大すると考えられる。lepromatous leprosy の皮膚病変にも細菌が存在するため,皮膚接触がもう 1つの感染経路とみられている。環境表面上で,らい菌は生存可能であり,物を介する感染伝播も起こりうる ... 参考文献紹介
ハンセン病治療薬 (dapsone, rifampin, and clofazimine)は,1995年から WHO が全患者に無料で配布している (2)。
菌数が少ない患者 Patients with paucibacillary leprosy は,rifampin and dapsone により 6か月以内に,多菌性 multibacillary patients の場合は,rifampin, dapsone, and clofazimine により 12か月以内に治癒する。治療が開始されれば,もはや患者からの感染伝播はおこらない]

● 小麦の病気 欧州,アジア,アフリカ
PRO/PL> Stem & stripe rusts, wheat - Europe, Asia, Africa: new races
Archive Number: 20170206.4820305
 情報源 Food and Agricultural Organisation of the United Nations (FAO) 2017年2月3日
Spread of damaging wheat rusts, new races
科学者らと FAO が協力して行った新たな研究結果により,2016年,欧州,アフリカ,中央アジアで,黄葉病 yellow と黒さび病 stem rusts のいずれでも新種の新興 the emergence of new racesがあり,特に地中海地域の被害が深刻だった。同時に,既存のさび病 existing rust races の新たな地域への拡大も続いている ... 原文参照願います。

● 鳥インフルエンザ 台湾 野禽 HPAI H5N6
PRO/AH/EDR> Avian influenza (45): Taiwan (HL) wildfowl, HPAI H5N6, OIE
Archive Number: 20170206.4820215
 情報源 OIE, WAHID weekly disease information 2017年2月6日
Highly pathogenic influenza A viruses (infection with) (non-poultry including wild birds), Chinese Taipei, New strain of a listed disease in the country
感染開始時期 2017年2月2日
原因ウイルス Highly pathogenic influenza A virus
Serotype: H5N6
新たな感染流行 (1)
Outbreak 1: Yuli Township, Hualien County: Not applicable
種/頭数/感染数/死亡/廃棄/処分
カモ科 _Anatidae_ (unidentified): _Anatidae_ (incognita)(_Anatidae_) / - / 1 / 1 / 0 / 0
Affected population: Goose (2017-hl-1)
Epidemiological comment: One dead young goose was found on a country road in Hualien County

● ウマ伝染性貧血 カナダ
PRO/AH/EDR> Equine infectious anemia - Canada: (QC)
Archive Number: 20170206.4820077
 情報源 The Horse 2017年2月5日
Equestrian Canada (EC) は,ケベック州 the Lanaudière region of Quebec でウマ 1頭が 18日,ウマ伝染性貧血 equine infectious anemia (EIA) の検査で陽性となったと報告した ...
● 皮膚腎糸球体血管症,イヌ 英国
PRO/AH/EDR> Cutaneous & renal glomerular vasculopathy, canine - UK: (England,Wales)
Archive Number: 20170206.4818005
 情報源 Lincolnshire Live 2017年2月4日
イヌ食いウイルス感染例 cases of a flesh eating virus in dogs の増加が,ペットオーナーらを不安にさせている。Alabama rot とよばれる,死亡する可能性もある筋肉の病気 potentially fatal flesh disease で,足 the paws or legs の皮膚病の原因ともなり,特に泥の上を歩かせたあと after muddy walks は,十分にペットを洗うようアドバイスされている。英国で新たな感染が確認された。重症化すると腎不全を起こし,医学的には cutaneous and renal glomerular vasculopathy [CRGV] と呼ばれる病態となる。1980年代後半に米国のグレイハウンド greyhounds での感染として初めて報告され,その後世界中に広まった。懸念される新たな感染例が発生したのは,Devon and Cumbria で,いずれもこれまで報告されたことはなかった。2012年以降,英国内の 27 counties で発生が確認されている。獣医学専門家は,病気の原因は不明のままで,感染を予防する方法もわかっていないと述べた ...

● クリの病気、胴枯れ病 英国
PRO/PL> Blight, sweet chestnut - UK: alert
Archive Number: 20170206.4817724
 情報源 Horticulture Week 2017年1月23日
Sweet chestnut blight warning
植物衛生当局は,クリの胴枯れ病 sweet chestnut blight への注意を呼びかけている。2 sites in Devon で 2016年12月19日に発生が確認され,そのうちの 1か所は森林だった。2016年9月にも Kent で発生が確認されている ...