COVID-19（28）迅速検査 妊孕性 ワクチンとデルタ・ブレイクスルー感染防御
● サルモネラ菌感染症 スペイン 鶏肉
PRO/AH/EDR> Salmonellosis - Spain: (MD) chicken
Archive Number: 20220123.8701041
情報源 Food Safety News 20222年1月20日
2021年後半，マドリード Madrid の 2カ所の高齢者施設において 14人がサルモネラ菌に感染 salmonella infections するなど，スペイン食品安全当局 The Spanish Agency for Food Safety and Nutrition (AESAN) は 1ダースを超えるアウトブレイクへの対応が必要となっており，チキンバーガーの肉との関連が確認されている ...
2021年12月7日，感染した患者が摂取した食品の検査を行ったマドリード当局から，チキンバーガー用の肉を使った製品の 1つからサルモネラ菌が検出されたとして，食品安全に関する注意喚起が行われた。同じ肉は，マルタとポルトガルにも流通しており，製造（流通？）業者 operator がアイルランドにあるとの情報が通知されている ...
PRO/AH/EDR> Salmonellosis - Spain: (MD) chicken
Archive Number: 20220123.8701041
情報源 Food Safety News 20222年1月20日
2021年後半，マドリード Madrid の 2カ所の高齢者施設において 14人がサルモネラ菌に感染 salmonella infections するなど，スペイン食品安全当局 The Spanish Agency for Food Safety and Nutrition (AESAN) は 1ダースを超えるアウトブレイクへの対応が必要となっており，チキンバーガーの肉との関連が確認されている ...
2021年12月7日，感染した患者が摂取した食品の検査を行ったマドリード当局から，チキンバーガー用の肉を使った製品の 1つからサルモネラ菌が検出されたとして，食品安全に関する注意喚起が行われた。同じ肉は，マルタとポルトガルにも流通しており，製造（流通？）業者 operator がアイルランドにあるとの情報が通知されている ...
● キャサヌール森林病 インド
PRO/AH/EDR> Kyasanur Forest disease - India: (KA)
Archive Number: 20220123.8701040
情報源 The Times of India, Times News Network (TNN) 2022年1月22日
Shivamogga では古くからの問題が起こり始めている。Kudige village of Thirthahalli の 57歳女性がキャサヌール森林病 Kyasanur Forest disease [KFD]のため，the taluk hospital に入院となった。2019年以来の患者である。数日前からの発熱があり，同村が森林地帯にあり，かつてこの病気が猛威を振るった地域であったため，KFD の血液検査が行われ ...
● COVID-19（28）迅速検査 妊孕性
PRO/AH/EDR> COVID-19 update (28): rapid tests, fertility, future, WHOArchive Number: 20220123.8701039
[1] 迅速検査 Rapid tests：小児の高い偽陰性率
High false-negative rate limits value of rapid COVID tests for kids
情報源 CIDRAP (Center for Infectious Disease Research and Policy) 2022年1月21日
今週の科学雑誌 the BMJ 掲載のメタアナリシス A meta-analysis において，小児に対する迅速抗原検査 COVID-19 rapid antigen tests for children は，the World Health Organization (WHO) and the US Food and Drug Administration (FDA) が定める最低基準 minimum performance standards を満たさないことが示された。すでに成人においてもメーカー側の報告を遙かに下回る感度であることが示されていた迅速抗原検査（lateral flow tests とも呼ばれる）だが，学校現場，家庭内，医療現場において小児のスクリーニング検査として広く用いられている。市販の検査キットが不足する中，米国市民は政府ウェブサイトを通じて ４キットを無料でオーダーすることができる。BinaxNOW and BD Veritor 等の商品名で販売されている，これら鼻腔スワブ検査について専門家らは，ウイルス感染伝播をある程度抑制する効果があるとしているが，特に，感染力の強い omicron (B.1.1.529) variant による患者急増する現在，その限界を理解することが重要である ... 一般的な消費者は検査結果が陰性であればその意味を理解せず，祖父母とのディナーにでかけるだろう，と述べられている。
Poor sensitivity, acceptable specificity
University of Manchester researchers の研究チームは，英国内の 6335人の小児を含む RT-PCR 検査の結果と迅速抗原検査の結果を比較した 17件の研究を評価した。6つの商品名の 8種類の検査について調べられている。
迅速検査の全般的な感度 sensitivity と特異度 specificity はそれぞれ，64.2% and 99.1% だった。症状のある小児においては，診断感度と特異度は 71.8% and 98.7% であったが，症状がない小児の場合は 56.2% and 98.6% だった。
参考までに，WHO and FDA performance standards for rapid antigen tests specify a minimum sensitivity of 80% and a minimum specificity of 97% とされている。
...
Many questions remain
Tests don't eliminate risks
[2] CIDRAP News Scan for 21 Jan 2022
[A] 妊孕性 Fertility
No reduced fertility with COVID vaccines, but infection ups risk in men
ワクチンによる妊孕性低下はないが，感染による男性（不妊）リスク上昇あり
情報源 CIDRAP (Center for Infectious Disease Research and Policy) 2022年1月21日
米国とカナダの 2000人以上の女性についてのコホート研究で，COVID-19 ワクチン接種は妊孕性の障害しないが，SARS-CoV-2 感染した場合，男性は短期間妊孕性が低下する可能性があることが，女性のパートナーの調査で明らかになった ...
[出典 A prospective cohort study of COVID-19 vaccination, SARS-CoV-2 infection, and fertility. American Journal of Epidemiology. 2022. kwac011. doi]
Moderna vaccine outperforms Pfizer's against delta breakthrough cases
20日の JAMA 掲載の報告によると，the Moderna mRNA vaccine は the Pfizer-BioNTech mRNA vaccine に比べ，米国内のデルタ株流行中の breakthrough COVID-19 cases を予防する効果が高いことが示された。全米 63の医療施設の，2021年7月から11月までの間の，ワクチン mRNA vaccine 接種を完了した患者 63万7千人の記録をもとに調査が行われ，ブースター接種や既感染者は除かれている。
Moderna recipients は，ブレイクスルー感染や入院がより少なかった。
2021年11月の Pfizer ワクチンの接種者 2.8 breakthrough cases per 1000 people であったのに対し，Moderna では 1.6 cases per 1000 であり，60日目の入院率 the 60-day hospitalization rate は 13.3% for Pfizer recipients and 12.7% for Moderna だった。また，60日目の致死率 The 60-day mortality は 1.14% (35/3078) and 1.10% (207/18 737) for Moderna and Pfizer recipients と，いずれも低い数字だった。
[出典 Comparison of mRNA-1273 and BNT162b2 vaccines on breakthrough SARS-CoV-2 infections, hospitalizations, and death during the delta-predominant period. JAMA. Published online 20 Jan 2022. doi]
[3] What happens next
Omicron changed the pandemic. What happens next?
情報源 Buzzfeed 2022年1月19日
... The Center for Disease Control and Prevention は，米国は今後 2週間で COVID cases はピークに達するが，急激な減少前に 1日あたりの新規感染者数が 80万人に達すると予測している。同じ予測の中で，2022年2月の米国内の 1日あたりの死者数が，現在のおよそ 2倍の 3000人に達するとされている。...
他の多くの科学者らは，米国の患者数がオミクロン株流行前のレベルまで減少する保証はないと主張している。...
オミクロンによる患者増のあと一部の地域で，デルタ変異株の再興が確認されている。またデンマークとインドで増加がみられる，"B.A.2" と呼ばれるオミクロン変異株の類似系統 a sister "stealth" lineage への置き換わりが認められている。the post-omicron pandemic はどこも同じではないかもしれない may look different everywhere，ことを示している。
[4] WHO: Daily new cases reported (as of 21 Jan 2022)
情報源 WHO 2022年1月21日
[Data by country, area, or territory for 21 Jan 2022 ]
[5] Global update: Worldometer accessed 21 Jan 2022 20:25 EST (GMT-5)
情報源 Worldometer 2022年1月21日
Total number of reported deaths: 5 603 620
Total number of worldwide cases: 347 061 078
Number of newly confirmed cases in the past 24 hours: 4 014 443
[the detailed global data, a snapshot of the Worldometer table]
[A 7-day series of cumulative totals reported by countries, territories, and reporting entities]
関連項目
COVID-19 update (27): wastewater, neurology, WHO 20220123.8701029
High false-negative rate limits value of rapid COVID tests for kids
情報源 CIDRAP (Center for Infectious Disease Research and Policy) 2022年1月21日
今週の科学雑誌 the BMJ 掲載のメタアナリシス A meta-analysis において，小児に対する迅速抗原検査 COVID-19 rapid antigen tests for children は，the World Health Organization (WHO) and the US Food and Drug Administration (FDA) が定める最低基準 minimum performance standards を満たさないことが示された。すでに成人においてもメーカー側の報告を遙かに下回る感度であることが示されていた迅速抗原検査（lateral flow tests とも呼ばれる）だが，学校現場，家庭内，医療現場において小児のスクリーニング検査として広く用いられている。市販の検査キットが不足する中，米国市民は政府ウェブサイトを通じて ４キットを無料でオーダーすることができる。BinaxNOW and BD Veritor 等の商品名で販売されている，これら鼻腔スワブ検査について専門家らは，ウイルス感染伝播をある程度抑制する効果があるとしているが，特に，感染力の強い omicron (B.1.1.529) variant による患者急増する現在，その限界を理解することが重要である ... 一般的な消費者は検査結果が陰性であればその意味を理解せず，祖父母とのディナーにでかけるだろう，と述べられている。
Poor sensitivity, acceptable specificity
University of Manchester researchers の研究チームは，英国内の 6335人の小児を含む RT-PCR 検査の結果と迅速抗原検査の結果を比較した 17件の研究を評価した。6つの商品名の 8種類の検査について調べられている。
迅速検査の全般的な感度 sensitivity と特異度 specificity はそれぞれ，64.2% and 99.1% だった。症状のある小児においては，診断感度と特異度は 71.8% and 98.7% であったが，症状がない小児の場合は 56.2% and 98.6% だった。
参考までに，WHO and FDA performance standards for rapid antigen tests specify a minimum sensitivity of 80% and a minimum specificity of 97% とされている。
...
Many questions remain
Tests don't eliminate risks
[2] CIDRAP News Scan for 21 Jan 2022
[A] 妊孕性 Fertility
No reduced fertility with COVID vaccines, but infection ups risk in men
ワクチンによる妊孕性低下はないが，感染による男性（不妊）リスク上昇あり
情報源 CIDRAP (Center for Infectious Disease Research and Policy) 2022年1月21日
米国とカナダの 2000人以上の女性についてのコホート研究で，COVID-19 ワクチン接種は妊孕性の障害しないが，SARS-CoV-2 感染した場合，男性は短期間妊孕性が低下する可能性があることが，女性のパートナーの調査で明らかになった ...
[出典 A prospective cohort study of COVID-19 vaccination, SARS-CoV-2 infection, and fertility. American Journal of Epidemiology. 2022. kwac011. doi]
[B] ワクチンによる，デルタ株ブレイクスルー感染予防
Moderna and Pfizer vaccines: protection against delta breakthrough cases
Moderna vaccine outperforms Pfizer's against delta breakthrough cases
20日の JAMA 掲載の報告によると，the Moderna mRNA vaccine は the Pfizer-BioNTech mRNA vaccine に比べ，米国内のデルタ株流行中の breakthrough COVID-19 cases を予防する効果が高いことが示された。全米 63の医療施設の，2021年7月から11月までの間の，ワクチン mRNA vaccine 接種を完了した患者 63万7千人の記録をもとに調査が行われ，ブースター接種や既感染者は除かれている。
Moderna recipients は，ブレイクスルー感染や入院がより少なかった。
2021年11月の Pfizer ワクチンの接種者 2.8 breakthrough cases per 1000 people であったのに対し，Moderna では 1.6 cases per 1000 であり，60日目の入院率 the 60-day hospitalization rate は 13.3% for Pfizer recipients and 12.7% for Moderna だった。また，60日目の致死率 The 60-day mortality は 1.14% (35/3078) and 1.10% (207/18 737) for Moderna and Pfizer recipients と，いずれも低い数字だった。
[出典 Comparison of mRNA-1273 and BNT162b2 vaccines on breakthrough SARS-CoV-2 infections, hospitalizations, and death during the delta-predominant period. JAMA. Published online 20 Jan 2022. doi]
[3] What happens next
Omicron changed the pandemic. What happens next?
情報源 Buzzfeed 2022年1月19日
... The Center for Disease Control and Prevention は，米国は今後 2週間で COVID cases はピークに達するが，急激な減少前に 1日あたりの新規感染者数が 80万人に達すると予測している。同じ予測の中で，2022年2月の米国内の 1日あたりの死者数が，現在のおよそ 2倍の 3000人に達するとされている。...
他の多くの科学者らは，米国の患者数がオミクロン株流行前のレベルまで減少する保証はないと主張している。...
オミクロンによる患者増のあと一部の地域で，デルタ変異株の再興が確認されている。またデンマークとインドで増加がみられる，"B.A.2" と呼ばれるオミクロン変異株の類似系統 a sister "stealth" lineage への置き換わりが認められている。the post-omicron pandemic はどこも同じではないかもしれない may look different everywhere，ことを示している。
[4] WHO: Daily new cases reported (as of 21 Jan 2022)
情報源 WHO 2022年1月21日
[Data by country, area, or territory for 21 Jan 2022 ]
[5] Global update: Worldometer accessed 21 Jan 2022 20:25 EST (GMT-5)
情報源 Worldometer 2022年1月21日
Total number of reported deaths: 5 603 620
Total number of worldwide cases: 347 061 078
Number of newly confirmed cases in the past 24 hours: 4 014 443
[the detailed global data, a snapshot of the Worldometer table]
[A 7-day series of cumulative totals reported by countries, territories, and reporting entities]
関連項目
COVID-19 update (27): wastewater, neurology, WHO 20220123.8701029
● 鳥インフルエンザ，ヒト 中国 H9N2
Human infection with avian influenza A(H9N2) virus
Human infection with avian influenza A(H9N2) virus
PRO/AH/EDR> Avian influenza, human (05): Asia (China) H9N2
Archive Number: 20220123.8700993
情報源 World Health Organization (Avian influenza weekly update 827) 2022年1月24日
Between 7 and 13 Jan 2022 の期間に中国から新たな 4例の鳥インフルエンザ感染例 new cases of human infection with avian influenza A(H9N2) が報告された。
江蘇省鎮江市 Zhenjiang City, Jiangsu Province の7歳女児，11月27日発症
湖北省 Huanggang City, Hubei Province の 3歳女児，12月7日発症
広西壮族自治区南寧市 Nanning City, Guangxi Province の14歳女児，12月9日軽症入院
Huanggang City, Hubei Province の 3歳男児，12月13日発症
4例はすべて軽症ですでに回復し，家族内で発病したものはいない。
2021年の中国において，これまでに 24例の cases of avian influenza A(H9N2) が報告されている。
● ニューカッスル病 ロシア 家きん
Newcastle disease virus, Russia
PRO/AH/EDR> Newcastle disease - Russia: (VL) poultry, OIE
Archive Number: 20220123.8701034
情報源 OIE-WAHIS (World Animal Health Information System) 2022 2022年1月18日
感染開始時期 2021年12月25日
前回流行時期 2021年8月19日
病原体 Paramyxovirus type 1 (PMV-1)
新たな感染流行
Podolets, Yur'ev-Pol'skiy rayon, Vladimir: backyard
種/個体数/感染/死亡/廃棄/と畜
Birds / 30 / 30 / 30 / 0 / 0 / 0
● 口蹄疫 パレスチナ自治区
PRO/AH> Foot & mouth disease - Palestinian Auth: (WE) spread, st O, vacc
Archive Number: 20220123.8701032
[1] PA Ministry of Agriculture statement: FMD spread, control measures, vaccination
情報源 Dunya Al-Watan [in Arabic] 2022年1月21日
[2] Russia restricts FMD-hazardous imports from the PA and Jordan
情報源 Meatinfo [in Russian] 2022年1月20日
● ラッサ熱 ナイジェリア
PRO/AH/EDR> Lassa fever - West Africa (02): Nigeria
Archive Number: 20220123.8701027
情報源 Nigeria Center for Disease Control (NCDC) 2022年1月16日
Key points
Current week (2): 10-16 Jan 2022/ Cumulative 2022 weeks 1-2 / Cumulative 2021 weeks 1-2
- Suspected cases: 48 / 465 / 226
- Confirmed cases: 29 / 96 / 23
- Probable cases: 0 / 0 / 0
- Deaths: 6 / 11 / 4
- Case fatality rate (CFR [%]): 12.5 / 11.5 / 17.4
- Number of states affected: 8 / 11 / 5
- Local government areas (LGAs) affected: 16 / 27 / 12
Images of the rodent reservoirs of Lassa fever virus: _Mastomys natalensis_
関連項目
Lassa fever - West Africa (01): Nigeria 20220107.8700707
● COVID-19（27）下水，神経学
PRO/AH/EDR> COVID-19 update (27): wastewater, neurology, WHO
Archive Number: 20220123.8701029
[1] 下水 Wastewater, and more
情報源 CIDRAP (Center for Infectious Disease Research and Policy) 2022年1月20日
全米 83カ所の市で採取された下水サンプリングの結果，現在のオミクロン変異株による COVID-19 感染例増加は大都市圏ではすでにピークを過ぎたが，農村部では現在も増加が続いていることが示唆されている。下水のサンプルから検出されるウイルスから，New York, Boston, Denver, the Twin Cities of Minneapolis and St. Paul, and San Diego ではすでにピークとなった可能性が高い ...
[Mod.LK－ "オミクロンは，米国で初めての患者確認より 1週間以上前に，New York City's wastewater 下水中に存在していたらしい：the Centers for Disease Control and Prevention
"このサンプルは，2021年11月21日にすでに，New York City の誰かがオミクロン変異株に感染していた可能性を示唆している。これは南アフリカの研究者らが初めて症例を報告する 4日前で，初めての米国の症例が報告される 10日前のことである。2021年11月後半の下水サンプル内のオミクロンの証拠も確認されている。(記事)]
[2] 神経学的後遺症 Neurologic sequelae: publications
原著 Beta-amyloid deposits in young COVID patients. Lancet [preprint]. 2022
COVID survivors の脳症，認知機能障害は，the beta-amyloid deposits による可能性があり，anti-amyloid therapeutics が有効かもしれない。
原著 Nervous system consequences of COVID-19. Science. 2022; 375(6578): 267-9;
... 初期症状が軽症である若年者であっても acute COVID-19 and long COVID neuropsychiatric syndromes を発症することがあり，その機序は明らかではないが，非特異的神経炎症と抗神経自己免疫調節不全 nonspecific neuroinflammation and antineural autoimmune dysregulation など，免疫機能不全が示唆されている。
原著 Counting the neurological cost of COVID-19. Nat Rev Neurol. 2022; 18: 5-6;
システマティックレビューとメタアナリシスから，COVID-19 の神経学的症状の発現が詳説され，神経学的指標が重症度と致死率に関連することが示されている。
[3] CIDRAP news scan
[A] 3回目ワクチン接種によるオミクロン株抗体上昇
3rd COVID vaccine boosts antibodies that neutralize omicron
3rd COVID vaccine boosts antibodies that neutralize omicron
情報源 CIDRAP (Center for Infectious Disease Research and Policy) 2022年1月20日
19日の医学雑誌 The Lancet で，英国の科学者らの実験で，3回目のワクチン接種 3rd dose of COVID-19 vaccine により，オミクロン変異株の中和に十分な抗体価上昇が認められたと報告された。the Francis Crick Institute (FCI) and the National Institute for Health Research (NIHR) UCLH Biomedical Research Centre の研究者らが，ハイスル－中和アッセイ a high-throughput live SARS-CoV-2 neutralization assay を用いて，364人から採取した 620血清検体中のオミクロン，アルファ，デルタ各株に対する中和抗体価を測定した。the Oxford-AstraZeneca vaccine または the Pfizer-BioNTech COVID vaccine ワクチンを 2回だけ接種したヒトの抗体は，他の変異株に比べ，オミクロン変異株に対する中和能が低いことが判った。2回接種後 3か月で抗体レベルが降下したが，3回目接種により，オミクロン株を効果的に中和するレベルまで上昇した。ワクチンの有効性については評価されておらず，単に実験室内での抗体の活動性についてのみ評価されている。Pfizer ワクチンの 3回目接種後のオミクロンに対する抗体レベルは，2回目接種後のデルタ株に対するレベルと同等だった。3回目接種により，オミクロン株に対して 2回目接種の 2.5倍近い抗体レベルが確認された。過去に COVID-19 症状がなかったヒトに比べ，症状を発症しいずれかのワクチンを 2回接種した患者でも，より高い抗体レベルが確認された ...
(参考文献).
[B] アフリカ: 小児
情報源 CIDRAP (Center for Infectious Disease Research and Policy) 2022年1月20日
他の地域に比べて，サブサハラ 6カ国の小児 COVID-19 入院患者，特に乳児および持病のある小児の，感染数および死者数が著しく高いと報告された。[JAMA Pediatrics ]
コンゴ(民)，ガーナ，ケニア，ナイジェリア，南アフリカ，ウガンダの 25病院の，2020年3月1日から 12月31日までのデータが検討された。469例の小児入院患者 hospitalized COVID-19 patients 0-19 years old は，年齢の中間値が 5.9 歳で，24.5% に何らかの持病があった。18人の患者 (3.8%) が confirmed multisystem inflammatory syndrome in children (MIS-C) 疑いまたは確定例であり，集中治療室入院例 69例中 22例 (31.9%) および MIS-C 22.2% を含め（469例の）8.3% が死亡した。高所得国からの死亡例の報告は rates of 1%-5% である。15-19歳の患児との比較において，1歳未満は 4.89倍重症化しやすかった The adjusted odds ratio (aOR) of more versus fewer severe outcomes were 4.89 times higher。不良の転帰の因子には，高血圧 (aOR, 5.91), 慢性肺疾患 (aOR, 2.97), 血液疾患 (aOR, 3.10) などがあった ...
[C] 英国: COVID 検査 testing
情報源 CIDRAP (Center for Infectious Disease Research and Policy) 2022年1月20日
英国の 440万人についての調査で，軽症，検査機関の場所が判らない，COVID-19 特異症状についての無知 confusion が，新型コロナウイルスの検査を受けないことのリスク因子となっていることが，22日の PLOS Global Public Health で報告された。自己申告および検査結果報告のためのスマートフォンアプリで集められた情報による調査で，40.4% の対象者が，発熱，新たな持続性咳嗽，嗅覚または味覚変容，の PCR 検査を受けるべき 3主徴 polymerase chain reaction (PCR) test-qualifying symptoms すべてを答えることができなかった。COVID-19 の症状が 1つだけの患者は，複数の症状のある患者より，無料検査を受ける割合が低かった (27.1% vs 14.6%）。また症状が短期間（1～2日間）だと，長期の症状のある場合に比べ検査を受ける割合が低かった (30.1% vs 14.6%, P < 0.001).
[4] WHO: daily new cases reported (as of 20 Jan 2022)
情報源 WHO 2022年1月20日https://covid19.who.int/table
[Data by country, area, or territory for 20 Jan 2022]
[5] Global update: Worldometer accessed 20 Jan 2022 15:50 EST (GMT-5)
Date: Thu 20 Jan 2022
情報源 Worldometer 2022年1月20日
Total number of reported deaths: 5 593 183
Total number of worldwide cases: 343 046 635
Number of newly confirmed cases in the past 24 hours: 3 560 347
[A 7-day series of cumulative totals reported by countries, territories, and reporting entities ]
関連項目
COVID-19 update (26): China (Hong Kong) animal, hamster, OIE 20220122.8701017