2022年1月3日


● 鳥インフルエンザ デンマーク
PRO/AH/EDR> Avian influenza (05): Europe (Denmark) poultry, HPAI H5N1, spread
Archive Number: 20220103.8700655
 情報源 YeniSafak 2022年1月3日
デンマーク獣医学当局 the Danish Veterinary and Food Administration は 3日,1月1日に鳥インフルエンザ the highly contagious avian influenza H5N1 の発生が確認された,the town of Stokkemarke in Lolland municipality 近郊の農場において,3万6千羽のシチメンチョウの処分を開始した,と明らかにした ... 

● COVID-19(04)ブレイクスルー感染 再感染 若年成人

PRO/AH/EDR> COVID-19 update (04): USA, reinfection, young adult, comment
Archive Number: 20220103.8700652
[1] 米国 US: breakthrough infection
 情報源 JAMA Internal Medicine 2021年12月28日
原著タイトル Association between immune dysfunction and COVID-19 breakthrough infection after SARS-CoV-2 vaccination in the US. JAMA Intern Med. Published online 28 Dec 2021. doi:10.1001/jamainternmed.2021.7024. PMID: 34962505
 ... 
Results: 合計 664 722人の患者の検体 the National COVID Cohort Collaborative (N3C) sample が調べられた。年齢の中間値は 51歳。2回の接種完了者の間の COVID-19 breakthrough infection ブレイクスルー感染の発生率5 per 1000 person-months であったが,デルタ株 the delta variant が優位 the dominant SARS-CoV-2 strain となった後でより高い数字となった。(incidence rate before vs after 20 Jun 2021, 2.2 vs 7.3 per 1000 person-months) ワクチン接種が完了していない partial vaccination 場合と比較して,full vaccination ではブレイクスルー感染のリスクが 28% 低下していた。接種完了後のブレイクスルー感染に関して,高齢および女性で発生率がより高かった。HIV 感染,関節リウマチ,固形臓器移植者では,ブレイクスルー感染の発生率が高かった ... 
[2] 再感染: review
 情報源 BMJ Journals, Journal of Investigative Medicine 2021年7月26日
原著タイトル COVID-19 reinfection: a rapid systematic review of case reports and case series. BMJ. Journal of Investigative Medicine
Abstract
COVID-19 感染から回復した患者は,強固な免疫反応があり防御免疫が成立すると考えられてきたが,2020年8月にはじめて報告されて以降,多くの再感染例が報告されている。感染例の多くで,2回の感染の遺伝子データが欠如しており,異なる株による感染かどうかは明らかではない。今回 a rapid systematic review により,PCR およびウイルス遺伝子解析で確認された,異なるウイルス株 different genetic strains of SARS-CoV-2 による感染と確定された,合計 17 cases of genetically confirmed COVID-19 reinfection を確認した。初感染は軽症であった免疫不全の患者 1名が,2回目の感染で重症化し死亡した。全体的にみると the 2nd episode では 1回目の感染と比べて,68.8% (11/16) では 重症度は同じ; 18.8% (3/16) ではより重症化; 12.5% (2/16) では軽症だった。以上より,異なるウイルス株により再感染し,一部の症例では 2回目の感染でより重症化する可能性があることが示された ... 
[3] Teens and young adults
 情報源 The Guardian 2022年1月1日
 ... between [21 Dec and 27 Dec 2021] の間の全年齢層での入院患者数の増加は 19% であったところ,米国内の小児の入院 The US 7-day average for pediatric hospitalizations は 58% 増加し 334人となっている。米国の小児のワクチン接種は 25%未満である。Los Angeles county では adults between 18 and 49 の症例が 70% of the coronavirus cases recorded between [22 Dec and 28 Dec 2021] を占めていた。persons from 18 to 29 では,1か月前の 8倍以上の増加となっている。adults in their 30s and 40s についても 6倍となっている ... 
[4] Comment 20220101.8700616について
 投稿者 印・Retired as Professor in Christian Medical College,T Jacob John, 2022年1月2日
記事 article
 ... オミクロンによる疾患は,COVID-19 についての説明と異なっていることが様々な報告で示されている。この論文では,オミクロンが細胞合胞体を誘導せず, 培養肺上皮細胞上で複製能 replication kinetics を減少させたと記述されている。SARS-CoV-2 のような細胞表面融合 cell surface fusion ではなく,オミクロンではエンドソーム融合 through endosomal fusion により細胞への侵入が行われている。オミクロンは単なる変異株ではなくgenotypic and phenotypic changes を伴う a "deviant" 逸脱株で,drift ではなく antigenic shift病原性メカニズムと疾患特性の変更,であるという事実に行き着く。他の情報源から,咳嗽は一般的症状ではなく,病変は主に上気道にある:すべての従来株と比べて,高熱となることは少なく infrequent,通常肺炎や ARDS はみられず,低酸素血症はまれであり,致死率は低い。 ... COVID-21 と呼ぶべきではないか?
[5] WHO: daily new cases reported (as of 2 Jan 2022)
[6] Global update: Worldometer accessed 2 Jan 2022 20:57 EST (GMT-5)
 情報源 Worldometer 2022年1月2日
Total number of reported deaths: 5 460 449
Total number of worldwide cases: 290 640 023
関連項目 
COVID-19 update (03): Antarctica, omicron, S Africa, China 20220102.8700640

● MERS-CoV(01)サウジアラビア
PRO/AH/EDR> MERS-CoV (01): Saudi Arabia (RI,MK,SH)
Archive Number: 20220103.8700645
[1] Media report
 情報源 Outbreak News Today 2022年1月2日
サウジアラビア保健省は,過去 2か月間について新たに 4例の Middle East respiratory syndrome coronavirus (MERS-CoV) cases を報告した。10月31日に報告され,ラクダとの接触が認められ,持病により死亡した Hafer Albatin city の 50歳男性も含まれている。11月の a case in a 45 year old man in Riyadh city および 12月のラクダとの接触歴がない 1例 -- a 79 year old man in Riyadh city, Riyadh died -- と,an active case in a 49 year old in Turabah city, Taif with no contact with camels である。2021年のサウジアラビアの MERS-CoV 感染例は 17例となった。the United Arab Emirates から 2例が報告されている。
[2] サウジアラビア Saudi Arabian MOH
 情報源 Saudi MOH 2022年1月2日
[A] Date of case report: 31 Oct 2021
50 year old male in Hafer Albatin city, Hafer Albatin (Ash Sharqiyah - Eastern Province)
Case classification: primary
Outcome: deceased
[B] Date of case report: 8 Nov 2021
45 year old male in Riyadh City, Riyadh
Case classification: primary
Outcome: recovered
[C] Date of report: 12 Dec 2021
79 year old male in Riyadh City, Riyadh
Case classification: primary
Outcome: deceased
[D] Date of report: 29 Dec 2021
49 year old in Turabah city, Taif (Makkah)
Case classification: primary
Current status: active
Outcome: pending
a map of Saudi Arabia showing regions, see
関連項目 2021
MERS-CoV (04): UAE, Saudi Arabia 20211215.8700274

● ポリオ(01) 
PRO/EDR> Poliomyelitis update (01): WPV1 (ES), cVDPV1+2 (AFP) 2021, COVID
Archive Number: 20220103.8700644
[1] Global as of 29 Dec 2021 - GPEI/WHO WPV1 (ES Pakistan) cVDPV1 (AFP Madagascar), cVDPV2 (AFP DR Congo, Ethiopia, Nigeria, Senegal, Yemen)
 情報源 Global Polio Eradication Initiative / WHO 2021年12月30日
[2] Global as of 22 Dec 2021 - GPEI/WHO cVDPV2 (AFP DR Congo, Niger, Nigeria, Yemen; ES Egypt, Mauritania, Senegal)
 情報源 Global Polio Eradication Initiative / WHO 2021年12月23日
[3] COVID-19 impact
 情報源 Healio 2021年12月29日
 ... 原文参照願います。
参考項目 2021
Poliomyelitis update (25): global cVDPV2 (multicountry) Pakistan violence 20211218.8700356

● 鳥インフルエンザ カナダ 野鳥
PRO/AH/EDR> Avian influenza (04): Americas (Canada) wild bird
Archive Number: 20220103.8700643
[1] 情報源 CBC News 2021年12月31日
Environment Canada が,The Avalon Peninsula の農場で確認されていた鳥インフルエンザ a highly pathogenic avian influenza が,birds around the St John's area からも検出されたと,明らかにした ... 
[2] 情報源 The Star 2021年12月31日
 ... 原文参照願います。

● 原因不明の疾患 南スーダン

PRO/AH/EDR> Undiagnosed deaths - South Sudan: (JG) RFI
Archive Number: 20220103.8700639
 情報源 Newsweek 2021年12月24日
the World Health Organization が南スーダンの原因不明の疾患について調査を行っている。北部 Fangak, Jonglei State でこれまでに 97人が死亡している。患者は主に高齢者と 14歳以下の小児で,咳,下痢,発熱,頭痛,関節痛,食欲低下,筋力低下,胸痛などの症状が認められている。この地域は最近激しい洪水に見舞われ,医療機関にはマラリアやコレラなどの地域感染の疾患による負荷がかかっている ... 
関連項目 2021
Undiagnosed deaths - South Sudan (02): (JG) malaria susp 20211217.8700345