2022年1月2日

COVID-19(03)南極 南アフリカ 中国
COVID-19(02)南アフリカ 仏 英 唾液検体

● COVID-19(03)南極 南アフリカ 中国
PRO/AH/EDR> COVID-19 update (03): Antarctica, omicron, S Africa, China
Archive Number: 20220102.8700640
[1] 南極 Antarctica: Princess Elizabeth Polar station
 情報源 The Brussels Times 2021年12月29日
the Princess Elisabeth Polar Station in Antarctica 南極基地内のスタッフ 25名のうち 2/3 が感染している。重症者はいない。基地へ向かうスタッフは,南アフリカへ出発する 2時間前にベルギーで PCR 検査を受け,さらにケープタウン Cape Town 到着の 5日後に検査を受け,10日間の隔離を受ける。南極へ向けケープタウンを出発する際にもう 1度検査を受け,さらに到着の 5日後に PCR 検査を受けなければならない。しかし,12月14日に 7日前に到着した一団の検査で 1例の陽性患者が確認され,ただちに隔離されたが,他の 2名が感染した。12月23日にこの 3人が搬送されたが,ウイルス感染循環が続いた。
[2] Omicron spreading
 情報源 National Public Radio 2021年12月31日
11月のオスロ Oslo, Norway で,110人以上が集まるクリスマスパーティーが行われ,ほとんどの参加者はワクチン接種を完了していたが,このうちの 1人が数日前に南アフリカから帰国した際に気づかずに the omicron variant of SARS-CoV-2 ウイルスを持ち込んでいた。最終的におよそ 70% が感染した ... 他の感染例など, ... 原文参照願います。
[3] 南アフリカ South Africa: hospitalization outcome
 情報源 JAMA Research Letter 2021年12月30日
原著タイトル Characteristics and outcomes of hospitalized patients in South Africa during the COVID-19 omicron wave compared with previous waves. JAMA Research Letter. 2021 [published online 30 Dec 2021]; doi: 10.1001/jama.2021.24868.
2021年11月24日,南アフリカにおいて a SARS-CoV-2 variant of concern, omicron (B.1.1.529) が確認され,COVID-19 の第4波の原因とされた。スパイクタンパクに多数の変異があり,ワクチンを回避し感染拡大につながるとの懸念が高まった。第4波で,陽性結果のため入院となった患者について,以前の流行との比較を行った。
Results
第4波の入院患者数の最多は 2351人,第3波は6342人。第3波では救急室を受診し検査陽性となった患者の 68%-69% が入院となったのに対し,第4波では 41.3% だった。第4波の入院患者の年齢はより若かった (median age, 36 years vs maximum 59 years in wave 3) で女性の比率が高かった。第4波では持病を持つ患者がかなり少なく,急性呼吸器症状を呈する割合も低かった (31.6% in wave 4 vs maximum 91.2% in wave 3)。971 patients admitted in wave 4 のうち,24.2% がワクチンを接種しており,66.4% がワクチンを接種していなかった。酸素を必要とした患者の割合は有意に減少 (17.6% in wave 4 vs 74% in wave 3) し,人工呼吸器を装着された割合も同様だった。ICU 入院は 18.5% in wave 4 vs 29.9% in wave 3 であった。平均滞在日数は,従来波で 7-8日であったところ,第4波では 3日間に短縮し,致死率between 19.7% in wave 1 and 29.1% in wave 3 and decreased to 2.7% in wave 4 であった。
Discussion ... 
[4] 中国 China: case count
 情報源 Al Jazeera 2022年1月1日
 ... 原文参照願います。
[5] WHO: daily new cases reported (as of 1 Jan 2022)
[6] Global update: Worldometer accessed 1 Jan 2022 22:25 EST (GMT-5)
 情報源 Worldometer 2022年1月1日
Total number of reported deaths: 5 457 335
Total number of worldwide cases: 289 716 372
Number of newly confirmed cases in the past 24 hours: 1 197 108
[A 7-day series of cumulative totals reported by countries, territories, and reporting entities ]
関連項目 
COVID-19 update (02): South Africa, France, UK, test protocols 20220102.8700630
 
● 鳥インフルエンザ 韓国 イスラエル 家きん
PRO/AH/EDR> Avian influenza (03): Asia (South Korea,Israel) HPAI H5N1, poultry, spread
Archive Number: 20220102.8700634
[1] 韓国 South Korea: North Jeolla Province, ducks
 情報源 Korean Broadcasting System (KBS) 2021年12月29日
[2] イスラエル Israel: laying hens, turkeys, spread
 情報源 Poultrymed [in Hebrew] 2022年1月1日

● COVID-19(02)南アフリカ 仏 英

PRO/AH/EDR> COVID-19 update (02): South Africa, France, UK, test protocols
Archive Number: 20220102.8700630
[1] 南アフリカ South Africa: government statement
 情報源 South African Government 2021年12月30日
30日の特別国会で,the Adjusted Alert Level 1 COVID-19 regulations についていくつかの変更が認められた。updates on the management of the current 4th wave of COVID-19 in South Africa を了承した。the week ending 25 Dec 2021 に新規患者数(8万9千人)は,前週(12万7千人)から 29.7% の減少が認められ,全国的に the peak of the 4th wave を超えたことが示されている ... 
[2] フランス France: omicron cases
 情報源 France 24 2021年12月31日
フランスにおいてオミクロン Omicron が優位 the main coronavirus strain となった。新規感染者数は 2日連続で 20万人を超えた。"62.4% of tests showed a profile compatible with the omicron variant" at the start of the week compared with 15% the previous week ... 
[3] 英国 UK: update
 情報源 UK Health Security Agency 2021年12月31日
オミクロンに対するワクチンの有効性に関するブリーフィング ... 原文参照願います。
[4] Test protocols
South African study suggests nasal swabs aren't the best way to test for omicron
 情報源 MedPage Today 2021年12月27日
the University of Cape Town 研究者らが,オミクロン株による感染では,鼻腔 [鼻咽頭?] よりも,唾液検体による PCR analyses 検査の方がより正確である,と the medRxiv  への投稿で発表した。
[5] WHO: daily new cases reported (as of 31 Dec 2021)
[6] Global update: Worldometer accessed 31 Dec 2021 20:39 EST (GMT-5
 情報源 Worldometer 2021年12月31日
Total number of reported deaths: 5 452 937
Total number of worldwide cases: 288 416 950
Number of newly confirmed cases in the past 24 hours: 1 627 346
A series of cumulative totals reported by countries, territories, and reporting entities in the past 7 days
関連項目 
COVID-19 update (01): omicron severity & changes, Germany, T-cell reactivity 20220101.8700616