2022年2月8日

◎ 腸管侵入性大腸菌 米国 O143
COVID-19 Paxlovid、小児、モノクローナル抗体

◎ 腸管侵入性大腸菌 米国 O143
PRO/AH/EDR> E. coli, enteroinvasive - USA: O143, unknown source, FDA
Archive Number: 20220208.8701350
 情報源 Food Safety News 2022年2月8日
Food and Drug Administration investigating new _Escherichia coli_ outbreak
政府当局は,腸管侵入性大腸菌アウトブレイク a new outbreak of enteroinvasive _E. coli_ O143:H26 infections の調査を行っているが,現時点で感染源明らかになっていない。少なくとも 16人が発病しているが,発生地域も明らかにされていない。a traceback investigation も開始されていないため,製造業者や供給業者,現場調査や検体採取なども行えていない。7日現在,the Centers for Disease Control and Prevention からも何ら情報提供はなされていないが,感染源が特定されていない段階において特別なことではない not unusual ... 
[Mod.LLthe FDA の最新情報においても,感染の原因は特定されていない。
様々な種類の大腸菌が,腸管病原性・下痢原性大腸菌と呼ぶべき病原体となる,
毒性因子 their virulence factors を獲得しており,毒性因子と臨床症状に基づき,以下のように呼ばれている。
 - 毒素原性 enterotoxigenic _E. coli_ (ETEC)
 - 腸管病原性 enteropathogenic _E. coli_ (EPEC)
 - 腸管出血性 enterohemorrhagic _E. coli_ (EHEC)
 - 腸管凝集性 enteroaggregative _E. coli_ (EAEC)
 - 腸管侵入性 enteroinvasive _E. coli_ (EIEC)
 - diffusely adherent _E. coli_ (DAEC) [* 参考  NIID]
過去,多くの検査機関において腸管出血性大腸菌 EHEC を除いて,これらを鑑別することはできなかったが,multiplex PCR (polymerase chain reaction) を用いる新しい手法が利用可能となり,基幹となる検査機関だけでなく一般の臨床検査施設にも拡がり,クラスター発生時に検査が行われている。
特定可能となった病原体として,以下のものが含まれる。
- Enteric adenovirus - Astrovirus - Norovirus - Rotavirus A - Sapovirus - cryptosporidium - _Cyclospora cayetanensis_ - _Entamoeba histolytica_ - _Giardia lamblia_ - _Campylobacter (jejuni, coli and upsaliensis_) - _Clostridium difficile_ (toxin A/B) - _Plesiomonas shigelloides_ - salmonella - shigella - _Yersinia enterocolitica_ - _Vibrio (parahaemolyticus_, _vulnificus_, and _cholerae_) - enteroaggregative _E. coli_ (EAEC) - enteropathogenic _E. coli_ (EPEC) - enterotoxigenic _E. coli_ (ETEC) - enterohemorrhagic _E. coli_ (EHEC) - enteroinvasive _E. coli_ (EIEC)
EIEC はヒトの腸管病原体で血性下痢 dysentery の原因となり,汚染された食品や水,他者との接触,により感染が伝播される。発展途上国で発生することが多い。
The 1971 outbreak in the United States は,輸入チーズが関係していた。最近では,2012年のイタリアと 2014年の英国で野菜が関係するアウトブレイクが起きている。A 2018 outbreak investigation では,EIEC の感染源は特定できなかった]

● コレラ フィリピン
PRO/EDR> Cholera, diarrhea & dysentery update (05): Asia (Philippines) fatal
Archive Number: 20220208.8701349
 情報源 Philippine News Agency 2022年2月7日
Caraga town in Davao Oriental のコレラアウトブレイク The cholera outbreak は,先週発生しこれまでに少なくとも 6人が死亡したと,7日州政府当局 the provincial health office (PHO) が発表した。the Philippine News Agency に届いたデータでは,[31 Jan 2022] 以降,the town において合計 491 cholera cases が報告されており,84人が各病院で治療を受けている。住民から下痢症の報告が届き始めたのは [29 Jan 2022] との説明がなされた。

● 鳥インフルエンザ ドイツ・ロシア、日本、米国
PRO/AH/EDR> Avian influenza (38): Europe, poultry, wild bird, HPAI H5N1, H5N2, OIE
Archive Number: 20220208.8701344
 [1] ドイツ Germany (Baden-Württemberg): wild bird, HPAI H5N2
 情報源 OIE-WAHIS (World Animal Health Information System) 2022 2022年2月7日
 [2] ロシア Russia (Stavropol): poultry, HPAI H5N1
 情報源 OIE-WAHIS (World Animal Health Information System) 2022 2022年2月8日

PRO/AH/EDR> Avian influenza (37): Asia (Japan) wild bird, HPAI H5N1, OIE
Archive Number: 20220208.8701340
Highly pathogenic influenza A viruses (non-poultry including wild birds) (2017-), Japan
 情報源 OIE-WAHIS (World Animal Health Information System) 2022 2022年2月2日

PRO/AH/EDR> Avian influenza (36): Americas (USA) wild bird, HPAI H5N1
Archive Number: 20220208.8701339
 情報源 Feedstuffs 2022年2月7日

● ハンセン病 ドミニカ共和国 減少
PRO/EDR> Leprosy - Dominican Republic: incidence fall
Archive Number: 20220208.8701343
 情報源 Outbreak News Today 2022年2月5日
昨年 [2021],ドミニカ共和国で報告されたハンセン病患者数 cases of leprosy148例で,近年で最も低い数字となったと報じられている。1966年の皮膚病研究所 the Huberto Bogaert Dermatological Institute の創設以来,国内で 14 321 cases of leprosy が報告されているが,500 cases in 1974 to 177 in 2020, and 148 in 2021 と,その数は劇的に減少してきた。南北アメリカにおいて,20カ国以上がハンセン病感染例を報告しており,一部の国が年間 100例以上の報告であり,地域全体ではブラジルが登録患者の大部分を占めている ...  

● COVID-19 Paxlovid 小児 モノクローナル抗体

PRO/AH/EDR> COVID-19 update (42): Paxlovid, children, mAb, omicron, WHO
Archive Number: 20220208.8701334
[1] 米国: Pfizer Paxlovid distribution
 情報源 NBC News 2022年2月5日
Paxlovid (nirmatrelvir and ritonavir) は,COVID に対する 5日間の経口治療薬で,入院と死亡率を大きく減少させるが,2021年12月21日の緊急承認以降,危機的な供給不足が続いている。オミクロン株による冬期の患者増により,入院させずに治療を行う必要があるなか,医療従事者は(治療の)選択肢を奪われている。各州政府当局が,重症化および死亡リスクが最も高い,免疫不全やワクチンを打つことができない人々を優先していないことが,さらに事態を悪化させている。同薬の不足により,オミクロン株感染治療の承認を受けている,モノクローナル抗体治療 GlaxoSmithKline and Vir Biotechnology's monoclonal antibody treatment にも影響が出ている。重症化リスクがあると判断された場合,(治療開始の)タイミングが重要である。処方(供給量)の不安に加え,発症から 5日以内に開始しなければならない(という制限もある)。
Restricting antiviral prescriptions 処方制限
政府は 2000万人分の 20 million Paxlovid courses を購入するとしており,うち半数は 6月後半までに,残りは 9月末までに Pfizer 社から届けられる予定である。4月までは,十分な治療の提供 A robust supply of the treatment は期待できない。2022年1月の全米の感染者数は約 2000万人,関連する死者数は 55000人が報告される中,保健当局が配布できたのはわずか just 265 000 Paxlovid courses であった。感染数の減少が見られてはいるが,なお 1日あたり 14万人以上が入院し,数千人が死亡している ... 取材 an NBC News survey of state health departments によると,処方を(ハイリスクのみに)制限しているのは,Michigan, Minnesota, and New Mexico などの州に限られている。これらの州の医師は,Paxlovid を the highest-risk patients のみに処方するよう指示されている ... 他の州 -- Indiana, Maryland, North Carolina, Pennsylvania, West Virginia, and Wisconsin -- ではかなり緩められ,最も適した患者に処方するようアドバイス communiqués to healthcare providers が送られているにすぎない。Tennessee などでは,抗ウイルス薬使用の優先(患者の)ガイダンスを送ることもされていない
A better distribution system?
Who should get the antivirals first?
the National Institutes of Health は以下を the greatest risk of severe COVID として,最優先処方の対象としている:
- 免疫不全 immunocompromised.
- ワクチン未接種の 75歳以上の高齢者
- ワクチン未接種の 65歳以上の基礎疾患のある高齢者
- この次に,ワクチン未接種のすべての 65歳以上の高齢者と,ワクチン未接種のリスクをもつすべての人々
Paxlovid が,ワクチン接種を済ませた人々に有効であるかは明らかになっていない。the FDA に提出された研究結果は,ハイリスクのワクチン未接種者のみを対象としたものだった。しかし当局は,重症化リスクが高い人々への使用を承認しており,ワクチン接種の有無は問われていない ... 
[2] 教育への影響 Impact of COVID-19 on education
 情報源 World Bank Blogs 2022年2月1日
世界中の政府当局により,2022年に約 USD 5 trillion が教育費 K-12 education (education from kindergarten through 12th grade) として費やされるが,学校が再開されなければ,この世代はその 2~3倍の損失を被ることになる lose 2 or 3 times that amount in earning losses。1つめの影響は COVID-19 により多数の命が奪われたこと。2つめは仕事の不安定と貧困に苦しむこと。3つめは学校に通わなければならないはずの子供らが,家に留まるよう指示されたこと ...  原文参照願います。
[3] Fact checks
 情報源 University of Exeter 2022年2月3日
COVID-19 の間違った理解に対するファクトチェックは,当初には有効だが時とともに効果が乏しくなる。Nature Human Behaviour 掲載の新たな報告によると,COVID-19 に対する fact checks は,読んだ直後は人々の誤解を解くことに有効だが,その効果は続かないとされている。新型コロナウイルスに関する間違った false 主張に対する効果的な対応として,繰り返し否定することが必要である。さもなければ,人々は以前信じていたことに戻ってしまう傾向がある,と研究者は述べている ... 
[出典 The ephemeral effects of fact-checks on COVID-19 misperceptions in the United States, Great Britain, and Canada. Nat Hum Behav. 2022;]
[4] CIDRAP News scan for 7 Feb 2022
 情報源 CIDRAP [Center for Infectious Disease Research and Policy] 2022年2月7日
 [A] モノクローナル抗体 Monoclonal antibodies
High-risk COVID outpatients least likely to receive monoclonal antibodies
重症化のリスクが高いが入院していない患者が,しばしばモノクローナル抗体療法 monoclonal antibodies (mAbs) を最も受けにくくなっていると,JAMA 掲載の Medicare beneficiaries 190万人以上の調査で示された。Harvard Medical School researcher の研究者チームが,from November 2020-August 2021 の期間の,外来,救急室,検査機関からの fee-for-service Medicare beneficiaries の保険請求を調査した。mAbs for use in COVID-19 patients は 2020年11月から利用可能となった。the 1 902 914 participants のうち,7.2% が mAbs の治療を受けていた。持病が少ない方が,多くの持病のある患者よりもこの治療を受ける可能性が高かった (23.2% with 0 chronic conditions vs 6.3%, 6.0%, and 4.7% with 1 to 3, 4 or 5, and 6 or more chronic conditions, respectively)  ... 85歳以上では 65-74歳の患者よりも 42% 高かった。州によっても大きな違いがあり,Rhode Island (24.9%) and Louisiana (21.2%) administering the most, while Alaska (1.1%) and Washington (0.7%) had the lowest rates.  ... 著者らは,最もリスクが高い患者らは mAb を受けるために多くのステップ(確認)が必要であり,その中には 10日以内に治療を受けるための適時の診断,紹介,予約がある。さらに mAb supply を行う医師が少ない地域がある,と述べている。
[出典 Behr CL, Joynt Maddox KE, Meara E, et al. Anti-SARS-CoV-2 monoclonal antibody distribution to high-risk Medicare beneficiaries, 2020-2021. JAMA. 2022; ]
 [B] 心血管系合併症 Cardiovascular complications
COVID-19 patients at increased risk for cardiovascular complications
Nature Medicine 掲載の新たな研究によると,COVID-19 患者には感染後の様々な心血管系合併症 a variety of cardiovascular complications のリスクの増加がみられることが,the US Department of Veterans Affairs からのデータで示されている。153 760 veterans with COVID-19 と,2 cohorts of controls の比較において,入院していない症例も含めたすべての患者に心血管系合併症が生じていたが,リスク入院していない症例入院症例ICU 入院症例だった。心筋梗塞 ? Strokes, 不整脈 dysrhythmias, 心筋炎 inflammation of the heart muscle, 虚血性心疾患 ischemic heart disease が COVID-19 patients で多くみられた ... 
[出典 Long-term cardiovascular outcomes of COVID-19. Nat Med. 2022;]
 [C] Omicron variant
Omicron strain much less likely to cause severe outcomes
The 1st peer-reviewed US study of COVID-19 outcomes in patients infected with the omicron (B.1.1.529) variant shows that, relative to patients infected with previous variants delta (B1617.2) and alpha (B117), omicron patients were younger, had significantly higher vaccine breakthrough rates, and were significantly less likely to be hospitalized ... 
[出典 Signals of significantly increased vaccine breakthrough, decreased hospitalization rates, and less severe disease in patients with COVID-19 caused by the omicron variant of SARS-CoV-2 in Houston, Texas. Am J Pathol. 2022: S0002-9440(22)00044-X;]
[5] WHO: daily new cases reported (as of 7 Feb 2022)
 情報源 WHO 2022年2月7日
[Data by country, area, or territory for 7 Feb 2022 ]
[6] Global update: Worldometer accessed 7 Feb 2022 19:23 EST (GMT-5)
 情報源 Worldometer 2022年2月7日
Total number of reported deaths: 5 768 797
Total number of worldwide cases: 398 093 224
Number of newly confirmed cases in the past 24 hours: 2 116 829
[A 7-day series of cumulative totals reported by countries, territories, and reporting entities ]
関連項目 
COVID-19 update (41): vaccine, nasal, Spikevax, long COVID, mRNA Africa, WHO 20220206.8701297

● ラッサ熱 ナイジェリア
PRO/AH/EDR> Lassa fever - West Africa (03): Nigeria
Archive Number: 20220208.8701326
 情報源 Nigeria Center for Disease Control (NCDC) 2022年1月30日
Key points
Current week (4): 24-30 Jan 2022 / Cumulative 2022 weeks 1-4 / Cumulative 2021 weeks 1-4
- Suspected cases: 229 / 981 / 507
- Confirmed cases: 42 / 211 / 54
- Probable cases: 1 / 2 / 0
- Deaths: 6 / 40 / 12
- Case fatality rate (CFR [%]): 14.3 / 19.0 / 22.2
- Number of states affected: 5 / 14 / 8
- Local government areas (LGAs) affected: 16 / 43 / 23
Highlights
- In week 4, the number of new confirmed cases decreased from 74 in week 3, 2022, to 42 cases. These were reported from Ondo, Bauchi, Edo, Enugu, and Delta states (Table 3)

● 口蹄疫 南アフリカ ウシ
PRO/AH> Foot & mouth disease - South Africa: (NL) cattle, st SAT-2
Archive Number: 20220208.8701324
 情報源 Farmer's Weekly 2022年2月7日
the Mtubatuba district of KwaZulu-Natal の農業従事者らは,the previously reduced disease management area (DMA) これまで管理が緩和されていた地域のタンク a dip tank で確認された口蹄疫 the foot and mouth disease (FMD) case が,この地域での感染拡大を意味するものではないことを願っている

● 外来種ダニ 東アフリカ
PRO/AH/EDR> Invasive tick - East Africa
Archive Number: 20220208.8701310
 情報源 The East African 2022年2月5日
ウシの致死性疾患をもたらせるおそれのある新たなダニベクターの,この地域内での生息域が急速に拡がっていると,ケニアの科学者が警告を発している。このダニ The invasive blue tick は,ヒトにも感染するおそれのある発熱性疾患の原因となり,これまでアフリカには存在していなかったが,マダガスカル経由で輸入されるアジアからのウシにより持ち込まれ,ケニア,ウガンダ,南スーダンとブルンジでその数を増やしている。the invasive blue tick or _Rhipicephalus microplus は,the _Babesia bovis_, _Babesia bigemina_, and _Anaplasma marginale_ pathogens を伝播する。
A map of East Africa