2022年3月16日

ジカウイルス 先天性ジカ症候群 PLoS、代謝調節障害 Cell、INF 回避  J Virol.
COVID-19 デルタクロン

● ジカウイルス
PRO/AH/EDR> Zika virus (01): Americas, Asia, research, observations
Archive Number: 20220316.8701999
[1] 各地症例数 Cases in various countries:
南北アメリカ WHO/PAHO Cases of Zika virus infections
ブラジル Brazil [in Portuguese]
 - Minas Gerais state. 9 Mar 2022. As of 8 Mar 2022 (probable) 518 cases (conf.) 1; no deaths so far in 2022.
 - Ceara state. 17 Feb 2022. (reported) 7 cases.
インド India
 - National. 10 Dec 2021. (reported) 237 cases. State most affected: Uttar Pradesh 152 cases.
 - Uttar Pradesh state. 19 Jan 2022. (reported) 66 cases of which 30 are in Kanpur district.
 - Lucknow, Uttar Pradesh state. 21 Nov 2021. (conf.) 3 cases.
 - Kerala state. 26 Nov 2021. (conf.) a single case now recovered.
 - Delhi. 11 Dec 2021. (conf.) a single case.
[2] プエルトリコ USA (Puerto Rico): ウイルスの進化 Zika virus evolution
 情報源 Emerging Infectious Diseases journal 20201年11月
原著タイトル Tracing the origin, spread, and molecular evolution of Zika virus in Puerto Rico, 2016-2017. Emerg Infect Dis. 2021; 27(11): 2971-2973
要約 
the 2016-2017 にプエルトリコにおける感染流行 Zika virus [ZIKV] epidemic in Puerto Rico の起源,拡大,進化過程を,完全なゲノムを用いて明らかに [再構築] した。この感染流行は複数回の導入が全島に拡大し,複雑な進化のパターンと約 10か月間の顕在化しない感染伝播によって推し進められたことが明らかになった ... 原文参照願います。
[3] 先天性ジカ症候群の神経・発達学的転帰
Neurological and neurodevelopmental outcomes of children with CZS
 情報源 PLoS (Public Library of Science) ONE 2021年9月15日
原著タイトル Heterogeneous development of children with congenital Zika syndrome-associated microcephaly. PLoS One. 2021; 16(9): e0256444
要約
Method Salvador のクリニックにおいて,先天性ジカ症候群による小頭症の小児のフォローアップとして,the Hammersmith Infant Neurological Examination (HINE) and Bayley Scales of Infant and Toddler Neurodevelopment (Bayley-III) respectively による評価を行った。
 ... 
Conclusion 
小頭症児は,時間経過とともに同年代の小児と比べ,重症の神経発達遅滞遅い成長率を示した。しかし,長期間の転帰と相関する神経学的検査スコア neurological exam scores に基づく,神経発達プロフィール一様ではなかった remarkably heterogeneous 。HINE scores は,患児らの神経学的能力の不均一性を効果的に捉え,認知および行動発達過程の予測に資する可能性が示された。
[4] 代謝調節障害と病原性 Dysregulated metabolism and pathogenicity
 情報源 Cell Reports 37, 110118 2021年12月14日
原著タイトル Dysregulated metabolism underpins Zika-virus-infection-associated impairment in fetal development. Cell Rep. 2021; 37(11): 110118
要約 [訂正しました]  
... 膜タンパクの単一の置換 a single phenylalanine-to-leucine substitution (M-F37L) in the membrane (M) protein を有する対を含む,複数株のジカウイルス Zika virus (ZIKV) を unbiased genomics [のウイルス?] と組み合わせ,軽症と重症感染を分ける境界を調べた demarcate the border between attenuated and pathogenic infection 。
感染により誘導される代謝調節障害 infection-induced metabolic dysregulation が,(高)病原性ウイルス pathogenic ZIKV strains と低病原性 attenuated ウイルスを分ける,最小限の宿主変容 a minimal set of host alterations であると特定した。
解糖系の変化 Glycolytic rewiring の結果,酸化的リン酸化障害ミトコンドリア機能障害が発生し,炎症およびアポトーシスにつながったが,このことは pathogenic (ウイルス)では観察されたが,attenuated ZIKV strains では認められなかった。さらに,in vitro においては,ピルビン酸の補給により細胞死が防がれ,ZIKV-infected dams [雌蚊] の胎児発育が救済された。
本研究により,調節性を失った代謝が ZIKV の病原性に影響を与え underpinning ,先天性ジカ症候群の発症予防として,妊娠女性に対するピルビン酸補給有用である可能性が示された。
[5] インターフェロン回避 Interferon evasion
 情報源 Journal of Virology 2022年1月12日
原著タイトル human STAT2 coiled-coil domain contains a degron for Zika virus interferon evasion. J Virol. 2022; 96(1): e0130121
要約 
 ... フラビウイルス Flaviviruses は,インターフェロンによる抗ウイルスシステム the type I and type III interferon (IFN) antiviral systems などの自然免疫バリアによる破壊を受ける rely on the subversion of innate immune barriers。ジカウイルス感染は,インターフェロンによって誘導される遺伝子翻訳因子 the IFN-stimulated gene transcription factor ISGF3 の必須成分 STAT2, an essential component の分解を誘導する。そのメカニズムは十分理解されていないが,STAT2 に結合してプロテアソームを介する分解の標的とする,ウイルスタンパク NS5 が関与することが判っている ... 本研究により,ウイルスがインターフェロンシグナル伝達をどう抑制するかを明らかにし,治療上の脆弱性の解明につながる可能性が示された。
[6] 米国内の先天性欠損 USA: Zika-associated birth defects
 情報源 CDC. MMWR Morb Mortal Wkly Rep 2022; 71(3); 73-79 2022年1月21日
原著タイトル Zika-associated birth defects reported in pregnancies with laboratory evidence of confirmed or possible Zika virus infection -- US Zika Pregnancy and Infant Registry, December 1, 2015-March 31, 2018
要約 What is added by this report?
the US. Zika Pregnancy and Infant Registry (USZPIR) に登録されたジカ関連の先天性欠損の頻度が示され,USZPIR の児の約 5% 脳または眼の欠損 any Zika-associated brain or eye defect が確認された。各症例において,複数の欠損が報告されることが多かった
[7] ブラジル Brazil: 先天性ジカ症候群による死亡 
 mortality from congenital Zika syndrome
 情報源 New England Journal of Medicine 2022年2月24日
原著タイトル Mortality from congenital Zika Syndrome -- Nationwide cohort study in Brazil. N Engl J Med. 2022; 386(8): 757-767
要約
Results 合計 1148万人あまりの新生児が,生後 36か月までフォローアップされた。先天性ジカ症候群の出生児 live-born children with congenital Zika syndrome 死亡数 52.6 deaths per 1000 person-years に対し,症候群ではない出生児では 5.6 deaths per 1000 person-years であり,congenital Zika syndrome 児の致死率が 11.3倍 (95% CI, 10.2 to 12.4) だった。妊娠 32週未満,または出生児体重 1500g 未満の児の死亡リスクには congenital Zika syndrome status は関係しなかった。満期産児では,congenital Zika syndrome がある場合に死亡するリスクは,非症候群児の 14.3 倍 (mortality rate, 38.4 vs. 2.7 deaths per 1000 person-years) となった。出産時体重が 2500g 以上の児については 12.9 倍となった ... 死亡リスクの上昇は,生後 3年間持続した。
参考項目 2021
Zika virus (05): Americas, Asia, research 20211112.8699612

● トスカーナウイルス イタリア、精液 EID
PRO/AH/EDR> Toscana virus - Italy: (TC) seminal fluid
Archive Number: 20220316.8702022
 情報源 Emerging Infectious Diseases 2022年3月9日
原著タイトル Infectious Toscana Virus in Seminal Fluid of Young Man Returning from Elba Island, Italy. Emerg Infect Dis. 2022; 28(4);
要約 
エルバ島 Elba Island からイタリアに戻った 25歳男性の精液中で,感染性のトスカーナウイルス infectious Toscana virus が確認されたので報告する。精液中で感染力のあるウイルスが確認されたことは,体液中にウイルスが存在し性感染の可能性のあるウイルスのリストに Toscana virus が加わることを意味する

● COVID-19 デルタクロン

PRO/AH/EDR> COVID-19 update (72): France mask restrictions, deltacron, US prisons, WHO
Archive Number: 20220316.8702014
[1] フランス Francemask restrictions
 情報源 France 24 2022年3月12日
14日に仏政府当局がほとんどの制限 most COVID-19 restrictions を緩和する準備を進める中,大統領選を前にした政治的な要請による拙速な動きに,一部の医療関係者らの間に失望が拡がっている。数週間の減少のあと,COVID-19 は再び増加しつつある。保健当局 Santé publique France は 11日,新規感染者数が前週の 6万人から 7万3千人に増加したと明らかにした。 7日間平均では 20% の増加となった ... 欧州各国でも感染増加が見られる中,フランス政府だけが制限緩和のスケジュールに固執している。14日にワクチンパスポートの呈示義務がなくなり,屋内でのマスク着用要求も同様に終了する。マスク着用の義務は,公共交通機関,病院,高齢者施設のみとなる。ICU 入院患者数を 1500 人未満とする目標は達成されておらず,最近ようやく 2021年12月以降最低となる 2000人以下となったばかりである。
Politics trumping health concerns
Overcoming vaccine scepticism in the Caribbean 
 ... ワクチン接種率が 45% の仏領グアドループの感染状況への懸念。
[2] デルタクロン株 Deltacron recombinant
 情報源 Forbes 2022年3月12日
新たな変異株 デルタクロン The deltacron の名称は,the delta and omicron variants の特徴を併せ持った新たなウイルス a new version of the severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) を発見した the University of Cyprus の研究者らにより, 2022年1月に初めて使用された。キプロスで当時入院中であった 25人の患者 patients with COVID-19 からの検体のうち,11人のサンプルでこのタイプのウイルスが検出された ... This new "deltacron" recombinant には,the delta GK/AY.4 and omicron GRA/BA.1 lineages の双方の構造が含まれている。Louisiana State University (LSU) Health Shreveport の教授によると,この新たな組み換えウイルス this new recombinant は 1月初旬から感染循環しており,the Institut Pasteur team により,フランス各地でも確認されている。2月に EU 内で最初に制限緩和を決めたデンマークや,オランダでも同じウイルスは確認されている。コントロールが徹底されていない欧米において 2つの変異株の感染が拡大し,すでに多数の患者がデルタ株とオミクロン株に同時に感染する中,組み換えウイルスが出現しても不思議ではない。新たな株のウイルスが出現すれば必ず,従来株より感染力が強いのか,あるいは重症化しやすいのかという疑問がわいてくる。ワクチンや自然感染による免疫を回避するのか,という疑問もある。さらに,抗体や抗ウイルス薬の有効性に対する不安もある。これら 4つの疑問に対する答えを得るには,cases of "deltacron" variant infections の報告数が少なすぎる。今のところ,a "variant of interest" or a "variant of concern," as defined by the WHO のいずれにも指定されていないが,注視することが必要だ。
[3] SARSCoV-2 virus evolution
 情報源 Nature 2022年3月14日
[原著タイトル Antigenic evolution will lead to new SARS-CoV-2 variants with unpredictable severity. Nat Rev Microbiol (2022). ]
A key question is predicting the epidemiological and clinical parameters of this continuous circulation (2) and the future population burden of COVID-19。
[4] 米国 US: prisons
 情報源 CIDRAP (Center for Infectious Disease Research & Policy) News 2022年3月14日
2020年5月から 2021年1月までの全米の刑務所 101 US federal prisons の受刑者と職員の感染率についての研究によると,周辺の地域 surrounding counties と比べ 3倍高いことが示された ... . 
[原著タイトル A study of SARS-COV-2 outbreaks in US federal prisons: the linkage between staff, incarcerated populations, and community transmission. BMC Public Health 22, 482 (2022). ]
[5] WHO: Daily new cases reported (as of 14 Mar 2022)
 情報源 WHO 2022年3月14日
[Data by country, area, or territory for 14 Mar 2022]
[6] Global update: Worldometer accessed 14 Mar 2022 20:27 EST (GMT-5)
 情報源 Worldometer 2022年3月14日
Total number of reported deaths: 6 067 662
Total number of worldwide cases: 460 186 544
Number of newly confirmed cases in the past 24 hours: 1 664 406
[A 7-day series of cumulative data reported by countries, territories, and reporting entities]
関連項目 
COVID-19 update (71): mortality, China, Pfizer, WHO 20220313.8701952

● コレラ ナイジェリア、インド
PRO/EDR> Cholera, diarrhea & dysentery update (09): Africa (Nigeria), Asia (India)
Archive Number: 20220316.8701937
[1] コレラ Cholera - ナイジェリア Nigeria
 情報源 Cable 2022年3月14日
ナイジェリア保健当局 The Nigeria Centre for Disease Control (NCDC) は,2022年初からの 2か月間に国内で 701例のコレラ感染疑い患者 suspected cases of cholera が登録されている,と明らかにした。最新報告によると,患者は 12の地域 states: Abia, Adamawa, Bauchi, Bayelsa, Borno, Cross River, Kwara, Lagos, Nasarawa, Rivers, Taraba, and Zamfara で確認されている。the suspected cases のうち,19例が死亡した。week 8 に確認されているのは,Nasarawa and Rivers states の 2例とされている ... 
[2] コレラ - インド India (Gujarat)
 情報源 Gujarati [in Gujarati] 2022年3月9日
Gandhinagar district および周辺地域 Tantra で,2日間に小児を含む 100人がコレラに感染し,生後 8か月の乳児 1名が死亡した。the eastern part of Kalol city において,下痢と嘔吐の患者が増え続けている

● 食中毒 トルコ,インド(2件)
PRO/EDR> Foodborne illness - Turkey (04): (EG)
Archive Number: 20220316.8701990
 情報源 Sabah [in Turkish] 2022年3月15日
Elazig in the Yemişlik region の建設現場労働者 15人が食中毒により入院した。健康状態に問題はない (命に別状はない good 

PRO/EDR> Foodborne illness - India (03): (AR) eggs
Archive Number: 20220316.8701989
 情報源 Deccan Chronicle 2022年3月12日
92人が通う the Viswanagar area of Nandyal town in Kurnool district の公立校の生徒のうち約 42名が,11日に校内での昼食 their mid-day meal のあと体調を崩した。料理に傷んだ卵が使用されたことが原因とされている。生徒らが嘔吐し始め,Nandyal town の病院に搬送された。the Friday menu として決められている昼食として,コメ,アスパラガス,ゆで卵,チキンが出された。昼食後教室に戻ったあとすぐに,腹痛と嘔吐が始まった。

● 麻疹 リベリア,アフガニスタン
PRO/EDR> Measles update (05): Liberia, Afghanistan
Archive Number: 20220316.8701998
[1] リベリア Liberia
 情報源 The New Dawn Liberia 2022年3月4日
保健省は Montserrado, Nimba, Bong, Margibi, and Maryland countiescounties [in Liberia] の a total of 322例の麻疹感染 suspected measles cases が確認され,検査により 72人の感染が確定されていると明らかにした。
[2] アフガニスタン Afghanistan: increasing cases
 情報源 The Khaama Press 2022年3月13日
2022年初以降,アフガニスタン各地で 1万5900人の小児が麻疹に感染した。保健省 The Ministry of Public Health of the Islamic Emirate of Afghanistan は 124人が死亡したと述べた。小児の死亡が多く発生した地域は,the Afghan capital Kabul, Helmand, and Kunduz provinces である一方,感染者数が多い地域は Jawzjan, Ghor, and Kunduz provinces であった。

● E型肝炎 スペイン、rat virus
PRO/AH/EDR> Hepatitis E - Spain: human, rat virus, 1st report
Archive Number: 20220315.8702011
 情報源 Outbreak News Today 2022年3月13日
欧州で初めて確認された,ヒトにおけるラット E型肝炎ウイルスによる急性肝炎患者 the first cases of acute hepatitis related to _Orthohepevirus_ C infection (HEV-C), also known as rat Hepatitis E virus が Journal of Hepatology in Feb 2022 で報告された ... 
Conclusions
cases of _Orthohepevirus_ C in patients with acute hepatitis を欧州で初めて報告した。欧州において新興感染症となる可能性が示された。
原著タイトル _Orthohepevirus_ C infection as an emerging cause of acute hepatitis in Spain: first report in Europe. J Hepatol. (in press)

● ブルセラ症 オーストラリア
PRO/AH/EDR> Brucellosis - Australia: (NS) feral pig, alert
Archive Number: 20220316.8702027
 情報源 The Singleton Argus 2022年3月15日
the Hunter region [New South Wales/NSW] 初のブルセラ菌 _Brucella suis_ が確認されたとして,Hunter Local Land Services (LLS) が注意喚起を発出した。the Upper Hunter at Cassilis で捕獲された野生ブタ 1頭 a feral pig が,_B. suis_ 検査で陽性となったとして,土地所有者や地域内の動物管理に携わるハンター pig hunters に注意するよう呼びかけられている ... 

● 日本脳炎 オーストラリア
PRO/AH/EDR> Japanese encephalitis - Australia (09): (VI) pig
Archive Number: 20220316.8702024
 情報源 The Canberra Times 2022年3月15日
ビクトリア州農業当局 Agriculture Victoria により,新たに 4カ所の養豚場 Victorian piggeries で日本脳炎ウイルス Japanese encephalitis virus が検出されたことが確認された。ウイルスが検出されたのは,the Campaspe, Loddon, Gannawarra, and Northern Grampians shires の 4地域。これまでに,Loddon, Campaspe, Wangaratta, Gannawarra, Greater Shepparton, and Greater Bendigo においてウイルスの存在が確認されていた。New South Wales, Queensland, and South Australia 各州の養豚場で,日本脳炎ウイルスが確認されている

● 鳥インフルエンザ 米国
PRO/AH/EDR> Avian influenza (68): Americas (USA) mixed flocks, HPAI
Archive Number: 20220316.8702021
[1] South Dakota (Charles Mix County): commercial flock
 情報源 Hot 97.5 FM 2022年3月8日
[2] Delaware (New Castle County) and Maryland (Queen Anne's County): commercial flocks, HPAI H5N1
 情報源 Delaware.gov, Department of Agriculture 2022年3月9日
[3] Delaware, Maryland, Missouri: commercial flocks, HPAI H5N1
 情報源 CIDRAP (Center for Infectious Disease Research and Policy) 2022年3月9日
[4] Iowa (Taylor County): commercial flock
 情報源 Iowa Capital Dispatch 2022年3月11日
[5] Illinois (Will and McLean counties) and Kansas (Franklin County): backyard flocks
 情報源 USDA Animal and Plant Health Inspection Service (APHIS) 2022年3月12日
[6] Wisconsin (Jefferson County): commercial poultry
 情報源 ABC News 2022年3月14日

● ブドウの病気 チェコ
PRO/PL> Flavescence doree, grapevine - Czech Republic: 1st rep
Archive Number: 20220316.8702020
 情報源 European Plant Protection Organisation (EPPO) Reporting Service 02/2022/015 2022年1月
The NPPO [National Plant Protection Organisation] of the Czech Republic が最近, 国内初の grapevine flavescence dorée (EPPO A2 List) の報告を行った。この病原体 The phytoplasma が確認されたのはオーストリアとの国境に近い southern Moravia である。

● 炭疽 アゼルバイジャン ウシ
PRO/AH/EDR> Anthrax - Azerbaijan: (Aran) cattle, OIE
Archive Number: 20220316.8702016
 情報源 OIE-WAHIS (World Animal Health Information System) 2022 2022年3月15日
Anthrax, Azerbaijan
感染開始時期 13 Mar 2022
Last occurrence: 10 Dec 2021
病原体: _Bacillus anthracis_
新たな感染流行
Outbreak location 1: Turkler village, Beylagan [or Beilagan], Aran,backyard
種/個体数/感染/死亡/廃棄/と畜/ワクチン接種
ウシ Cattle / 12 / 1 / 1 / 0 / 0 / 11
Sheep/goats (mixed herd) / 2 / 0 / 0 / 0 / 0 / 2
Affected population: Vaccination has been done in early April 2021.