● 腸管出血性大腸菌 英国，米国
英国
_E. coli_ outbreak at Lanarkshire primary school as 10 pupils test positive and entire class closed
PRO/AH/EDR> E. coli EHEC - UK (05): (Scotland) school
Archive Number: 20221006.8706002
情報源 Glasgow Live 2022年10月5日
大腸菌感染症アウトブレイク an outbreak of _E. coli_ の発生により，小学校の全校生徒が帰宅させられた。the primary one/two class の生徒 10人が検査で陽性となり，Tinto Primary in Lanarkshire の調査が開始された ...
関連項目
E. coli EHEC - UK (04): (Scotland) O157, nurseries 20220902.8705370
米国
Shiga toxin-producing _E. coli_ O26 Infections Associated with Torero's Mexican Restaurant in Renton, Washington
PRO/AH/EDR> E. coli EHEC - USA (14): (WA) O26, restaurant
Archive Number: 20221006.8706000
情報源 King County WA Department of Health 2022年10月3日
Cases: 3
Hospitalizations: 0
Deaths: 0
Status: Investigation is in progress
Location: Torero's Mexican Restaurant, 920 N 10th St, Renton, WA 98057
Meal dates: 3 and 7 Sep 2022
Range of dates reported to Public Health: 8-16 Sep 2022
Prior food safety inspections and current rating: GOOD
要約
Torero's Mexican Restaurant in Renton における，下痢と腹痛を伴う腸管出血性大腸菌感染症アウトブレイク an outbreak of Shiga toxin-producing _E. coli_ (also known as enterohemorrhagic _E coli_, EHEC) の調査が行われている。現時点で感染の範囲はレストランに限局している ...
● 食中毒 日本 クワズイモ
PRO/AH/EDR> Foodborne illness - Japan (03): (OT) Alocasia plant, human illness
Archive Number: 20221006.8706001
情報源 大分合同新聞 2022年10月5日より
有毒のクワズイモ、11人が食中毒 臼杵市の農家が間違えて出荷
県は４日、臼杵市など県中部保健所管内の４０～６０代の男女１１人が毒性のあるクワズイモの茎を食べて食中毒になったと発表した。口や舌の痛みを訴え、重症者はいない。同市内の農家がハスイモ（テンジク）と間違えて出荷。
● コレラ ハイチ
Epidemiological Alert: Resurgence of cholera in Haiti
PRO/EDR> Cholera, diarrhea & dysentery update (29): Americas (Haiti) resurgence
Archive Number: 20221006.8705998
情報源 Pan American Health Organization (PAHO) Epidemiological Alert 2022年10月2日
Between October 2010 and February 2019, over 820 000 cases of cholera, including nearly 10 000 deaths, were reported in Haiti ...
2 Oct 2022, more than 20 suspected cases of cholera, including 7 deaths, from these areas were detected by healthcare personnel. On [2 Oct 2022], 2 cases were confirmed as _Vibrio cholerae_ O1 among the samples tested by the LNSP. Toxigenicity and genomics testing are pending.
● アシネトバクター感染症 南アフリカ 新生児集中治療室
PRO/EDR> Acinetobacter baumannii - South Africa: (NL) fatal, neonatal ICU
Archive Number: 20221006.8705987
情報源 Outbreak News Today 2022年10月5日
8月16日，the Centre for Healthcare Infections, Antimicrobial Resistance and Mycoses (CHARM) at the NICD [National Institute for Communicable Diseases] に対し，the KwaZulu-Natal Province, South Africa の地域病院・新生児集中治療室 a neonatal ICU において，多剤耐性アシネトバクター感染例 cases of multidrug-resistant _Acinetobacter baumannii_ (MDR-AB) infections の増加が報告された。髄液（3例），血液（1例），気管内吸引（1例）の培養で MDR-AB が確認された新生児 5人のクラスターで，いずれも基礎疾患があり，4例が死亡した ...
● サル痘（82）
PRO/AH/EDR> Monkeypox update (82)
Archive Number: 20221006.8705986
[1] 世界 Confirmed and suspected cases by country as of 5 Oct 2022
情報源 Centers for Disease Control and Prevention (CDC)
Total confirmed cases: 70 420
Total deaths: 27
[2] 米国 The US CDC reports cases in the following states:
情報源 Centers for Disease Control and Prevention (CDC)
Total confirmed monkeypox/orthopoxvirus cases: 26 311
[3] Virus mutation
情報源 Nature 2022年10月5日
ミネソタ州保健当局 the Minnesota Department of Health in St Paul が数ヶ月前に行ったサル痘ウイルスの遺伝子解析 sequencing samples で驚くべき結果が判明した。1人の感染患者の検体で，ウイルス遺伝子ゲノムに大きな欠損 a large chunk of the virus's genome was missing があり，別の部分がそっくりそのまま別の部位に移動していた ...
関連項目
Monkeypox update (81) 20221005.8705969
● エボラ（24）ウガンダ
PRO/AH/EDR> Ebola update (24): Uganda, polymerase/suramin complex research
Archive Number: 20221006.8705984
[1] Healthcare worker: fatality（医療従事者の死亡）
情報源 VOA 2022年10月5日
ウガンダ保健省 Uganda's ministry of health が，the spreading Ebola outbreak による 4人目の医療従事者の死亡を発表した。58歳のこの麻酔医は，17日間の闘病の末死亡した。2年前に引退していた医師だった。
2] Ebola polymerase complex
情報源 Nature 2022年9月28日
原著タイトル Structure of the Ebola virus polymerase complex. Nature. 2022; https://doi.org/10.1038/s41586-022-05271-2.
要約
エボラウイルスなどのフィロウイルス Filoviruses が公衆衛生上の脅威となっている。2種類の the Ebola virus disease 治療用モノクローナル抗体が承認されているが，様々なフィロウイルスに対応できる，broadly reactive drugs で認可されたものはない。Filovirus は a large polymerase (L) protein and the cofactor viral protein 35 (VP35) を有し，ウイルス RNA ゲノム合成の基礎ユニットを構成している。その恒常性 conservation から，the L-VP35 polymerase complex は，抗ウイルス薬の外されることのない標的 a promising target for broadly reactive antiviral drugs とされてきた。今回，cryo-electron microscopy を用いて，the structure of Ebola virus L protein in complex with tetrameric VP35 構造を特定した。その解析から，Ebola virus L が RNA 合成に不可欠な a filovirus-specific insertion element（挿入エレメント）であり ... 原文参照願います。
Discussion
the structure of EBOV L protein in complex with tetrameric VP35 and capture a previously missing structural snapshot of mononegavirus polymerase in the non-initiation state, with a supporting helix and priming loop getting away from the active site.
Of note, we demonstrate that suramin（スラミン）could inhibit EBOV L-VP35 activity and elucidate the structural basis of suramin binding to RdRp, suggesting the feasibility of developing non-nucleoside antiviral drugs to treat filovirus infection.
● 柑橘類の病気 ブラジル
PRO/PL> Greening disease, citrus - Brazil: increase
Archive Number: 20221006.8705985
情報源 FreshPlaza, Citrus Industry report 2022年9月28日
ブラジルの柑橘類栽培地域 Brazil's citrus belt の，グリーニング病の平均的な発生率 The average incidence of greening disease が，from 22% in 2021 to 24% in 2022 と上昇し，一部地域では数年前から 74% を超える高率となっている。
● 樹木の病気 アイルランド
PRO/PL> Fireblight, amenity trees - Ireland: (DN)
Archive Number: 20221006.8705983
情報源 Dublin People 2022年9月28日
火傷病 the contagious fireblight が確認され，110本以上の樹木 amenity trees が撤去された。植物衛生当局 The Horticulture and Plants Health Division of the Department of Agriculture が，枯死した多数の街路樹の検体で確認した。農作物や苗床の被害のおそれもあるため，法律 EU law 上，アウトブレイク発生時の対応が定められている
● 鳥インフルエンザ オランダ 家きん
PRO/AH/EDR> Avian influenza (183): Europe (Netherlands) poultry, HPAI, spread
Archive Number: 20221006.8705982
[1] Kiel-Windeweer [Groningen]: commercial farm, media report
情報源 Reuters via US News & World Report 2022年10月4日
[2] Kiel-Windeweer [Groningen]: commercial broilers farm, official press release
情報源 Dutch Ministry of Agriculture, Nature and Food Quality [in Dutch] 2022年10月4日
養鶏場 a poultry farm in Kiel-Windeweer (municipality of Midden-Groningen, province of Groningen) において鳥インフルエンザが診断され，高病原性であることが疑われている。施設内の約 10万羽の broilers の処分が行われている。1km 圏内に他の養鶏場はない ...
[3] Groningen: organic laying poultry farm
情報源 112Groningen.nl [in Dutch] 10月5日
● ブドウの病気 オーストラリア
PRO/PL> Grapevine red blotch virus - Australia: 1st rep
Archive Number: 20221006.8705980
情報源 Australian Broadcasting Corporation (ABC) Rural 2022年9月23日
South Australia, Western Australia, and Victoria 各州でのランダム検査 during random biosecurity testing により，ワイン用ブドウのウイルス Red blotch virus 感染が確認されている。感染が確認されたのは繁殖 propagation 用のブドウであったが，これまでのところ，苗床やブドウ栽培地 nurseries or vineyards では，ウイルスは確認されていない。感染のある国，おそらくは米国から持ち込まれた可能性がある ...