PRO/AH/EDR> E. coli O104 - EU (08) & USA: genetic analysis, more cases
Archive Number: 20110603.1692
[1] EU report
Update on the ongoing outbreak of haemolytic uraemic syndrome due to Shiga toxin-producing _Escherichia coli_ (STEC) serotype O104, Germany, May 2011
情報源 Eurosurveillance edition 2011; 16(22)、2011年6月2日
5月上旬以降、ドイツ国内で、志賀毒素産生大腸菌 Shiga toxin-producing _E. coli_ (STEC) による、溶血性尿毒症症候群 hemolytic uremic syndrome (HUS) と血性下痢の大規模流行の発生が確認されている。北部を中心に発生しているが、患者は、ドイツ国内全土及び他国からも報告されている。5月26日の報告後、ドイツ国内では新たに470人の HUS 患者が増え、多くの患者らにおいて STEC serotype O104 が検出されている ... 以下、流行状況、HUS 患者発生の地理的分布、疫学調査の進展、年齢及び性別、死亡例、ドイツ国外の患者、状況分析、疫学活動、参考文献 ...
[2] WHO report
EHEC outbreak: increase in cases in Germany
情報源 WHO Outbreak Reports、2011年6月2日 FORTH より
溶血性尿毒症症候群 (HUS) と腸管出血性大腸菌 (EHEC) 感染の症例がドイツで増加しており、WHO/欧州には10カ国から症例発生報告があった。5月31日現在、ドイツでは9人の患者が HUS で死亡し、6人が EHEC 感染で死亡した。スウェーデンでは1人が死亡した。入院患者、透析を含む集中治療が必要な患者もいる。ドイツ国内では、STEC (志賀毒素産生性大腸菌) による HUS と血性下痢症を呈している患者は 470人、EHEC感染症患者は1064人。欧州全体は、499人の HUSと1,115人の EHEC 感染症患者が報告されており、あわせて 1614人である。これまでにオーストリア (HUS0,EHEC2)、デンマーク (7,7)、フランス (0,6)、オランダ (4,4)、ノルウェー (0,1)、スペイン (1,0)、スウェーデン (15,28)、スイス (0,2)、および英国 (2,1)から届出があり、2人を除くすべての人は、最近ドイツに渡航した人であるか、ドイツ北部から来た人と接触した人(1人)である。アウトブレイクの原因は、まだ明らかにされていない。WHOは、このアウトブレイクに関連する地域との通商を制限することについて勧告していない。
[3] Science Journal: commentary on the organism
DNA sequence yields clues to Germany's 'super toxic' _E. coli_ outbreak
情報源 Science Insider, American Association for the Advancement of Science (AAAS)、2011年6月2日
... 大腸菌の解析に関する初期の結果 early results from sequencing projects of the enterohemorrhagic _E. coli_ (EHEC) strain から、複数の細菌株の最も悪影響をもたらせる部分が組み合わさった、これまでに確認されたことがないハイブリット菌であることが、今回の事態の原因であることが分かってきた。
[1] EU report
Update on the ongoing outbreak of haemolytic uraemic syndrome due to Shiga toxin-producing _Escherichia coli_ (STEC) serotype O104, Germany, May 2011
情報源 Eurosurveillance edition 2011; 16(22)、2011年6月2日
5月上旬以降、ドイツ国内で、志賀毒素産生大腸菌 Shiga toxin-producing _E. coli_ (STEC) による、溶血性尿毒症症候群 hemolytic uremic syndrome (HUS) と血性下痢の大規模流行の発生が確認されている。北部を中心に発生しているが、患者は、ドイツ国内全土及び他国からも報告されている。5月26日の報告後、ドイツ国内では新たに470人の HUS 患者が増え、多くの患者らにおいて STEC serotype O104 が検出されている ... 以下、流行状況、HUS 患者発生の地理的分布、疫学調査の進展、年齢及び性別、死亡例、ドイツ国外の患者、状況分析、疫学活動、参考文献 ...
[2] WHO report
EHEC outbreak: increase in cases in Germany
情報源 WHO Outbreak Reports、2011年6月2日 FORTH より
溶血性尿毒症症候群 (HUS) と腸管出血性大腸菌 (EHEC) 感染の症例がドイツで増加しており、WHO/欧州には10カ国から症例発生報告があった。5月31日現在、ドイツでは9人の患者が HUS で死亡し、6人が EHEC 感染で死亡した。スウェーデンでは1人が死亡した。入院患者、透析を含む集中治療が必要な患者もいる。ドイツ国内では、STEC (志賀毒素産生性大腸菌) による HUS と血性下痢症を呈している患者は 470人、EHEC感染症患者は1064人。欧州全体は、499人の HUSと1,115人の EHEC 感染症患者が報告されており、あわせて 1614人である。これまでにオーストリア (HUS0,EHEC2)、デンマーク (7,7)、フランス (0,6)、オランダ (4,4)、ノルウェー (0,1)、スペイン (1,0)、スウェーデン (15,28)、スイス (0,2)、および英国 (2,1)から届出があり、2人を除くすべての人は、最近ドイツに渡航した人であるか、ドイツ北部から来た人と接触した人(1人)である。アウトブレイクの原因は、まだ明らかにされていない。WHOは、このアウトブレイクに関連する地域との通商を制限することについて勧告していない。
[3] Science Journal: commentary on the organism
DNA sequence yields clues to Germany's 'super toxic' _E. coli_ outbreak
情報源 Science Insider, American Association for the Advancement of Science (AAAS)、2011年6月2日
... 大腸菌の解析に関する初期の結果 early results from sequencing projects of the enterohemorrhagic _E. coli_ (EHEC) strain から、複数の細菌株の最も悪影響をもたらせる部分が組み合わさった、これまでに確認されたことがないハイブリット菌であることが、今回の事態の原因であることが分かってきた。
中国 ・ 深センの研究所 The Beijing Genomics Institute (BGI) は2日、遺伝子の全塩基対の解析を終えた結果、いくつかの毒性遺伝子が獲得されることによって、腸管出血性大腸菌が "超毒性 super toxic" のタイプに変化することが分かったと発表した ...
2つめの論文として、いわゆる第3世代の遺伝子解析装置のメーカーである、Life Technologies Corporation 社は2日、 ドイツの大学との共同研究で、問題となっている菌が、a new hybrid type of pathogenic _E. coli_ strains. である可能性が強く示唆される、との見解を発表した。米国及びドイツの同社広報は、詳細を明らかにしなかった。 同社の解析装置の最上位機種 "Further analyses on Ion PGMT" によってこのデータが確認されることになる、と記者会見で約束した。一方、同じく Life Technologies equipment 社製検査機器を使用する BGI は、同菌の塩基配列は、中央アフリカ共和国で分離され、重症下痢症を引き起こすことが知られている EAEC 55989 _E. coli_ と93%重複することを明らかにしている。より病原性を増すことにつながる複数の遺伝子の獲得は、細菌の遺伝学情報交換に利用される、horizontal gene transfer と呼ばれる課程の中で起きたと考えられている。director of BGI's marketing departmentは、遺伝子フラグメントの1つが、食中毒を起こすサルモネラ菌 _Salmonella enterica_ に由来する一方で、他の遺伝子は O25:H4-ST131など、系統発生学的に異なる大腸菌内で確認されているものと、かなり相同性のある highly homologous と電子メールに書き記されている。塩基配列を公開している BGI の解析により、この細菌が、アミノグリコシド、マクロライド、βラクタムなど多くの抗生物質に耐性であることも確認されている ...
[4] Nature Journal: commentary on the organism
German _E. coli_ outbreak caused by previously unknown strain
情報源 Nature News、2011年6月2日
ドイツ国内で発生中の the current outbreak of enterohemorrhagic _E. coli_ (EHEC) infections の原因菌は、これまでヒトから分離されたことのない菌であることが、2日、WHO の食品安全事務所の発表で明らかにされ、感染対策が困難となる可能性があることがわかった ... 同菌は、広範囲スペクトラムを持つ beta-lactamase enzymes を産生する点で、通常の菌とは異なっている。
[4] Nature Journal: commentary on the organism
German _E. coli_ outbreak caused by previously unknown strain
情報源 Nature News、2011年6月2日
ドイツ国内で発生中の the current outbreak of enterohemorrhagic _E. coli_ (EHEC) infections の原因菌は、これまでヒトから分離されたことのない菌であることが、2日、WHO の食品安全事務所の発表で明らかにされ、感染対策が困難となる可能性があることがわかった ... 同菌は、広範囲スペクトラムを持つ beta-lactamase enzymes を産生する点で、通常の菌とは異なっている。
EHEC に感染した患者は通常抗生物質で治療されることはないが、耐性菌であることが、環境中でより生き延びやすいことにつながることが考えられる。
"EHEC outbreaks は2週間程度しか継続しないことが多いが、今回は5月1日かそれ以前から続いている" ことが指摘されている。生鮮野菜が最も疑われているが、感染源は食品だけとは限らないとされている。これまでどの動物でも確認されたことのない菌であることから、自然界から直接ヒトが感染した可能性もあるという。
獣医細菌学の研究者は、抗生物質だけでなく、鉱物のテルル the mineral tellurite (二酸化テルル tellurium dioxide) への耐性遺伝子も持っている点が懸念されると述べている。Tellurium oxides は、抗生物質ができる前に、ハンセン氏病や結核などの病気に対して、抗菌薬として使用されてきた。歴史上医療用として使用されたり、鉱業や電子産業での使用による環境中 （水や土壌） への流出が増加したりしたことで、一部の菌が耐性を獲得した可能性がある。
また、菌の遺伝学的特徴の解析により、成人や女性に感染が多い理由も明らかにされつつある。EHEC は通常小児に感染し、男児と女児に差はない。Initial theories は、若い女性は、野菜サラダを購入したり、調理したり、食べたりすることが多いというものである ... telltale sign として、細菌の、腸管の細胞への接着を可能にする、接着蛋白 intimin をコードする the eae gene を持たないことが分かっている。Eae-negative EHEC はこれまで、特に成人での感染に特異的に関係してきたが、なぜこの蛋白が、小児よりも成人の腸管に効果的に接着するかについては、よく分かっていない ...
[5] ノルウェー (疑い)
情報源 Health Canal、2011年5月31日。
ノルウェー公衆衛生研究所に対し、ドイツでのアウトブレイクに関係すると見られる EHEC infection の患者1例に関する報告があった。血性下痢のために入院となった40歳代の男性1名で、ドイツの菌と同じ細菌であるか、はまだ分かっていない。
[6] デンマーク
情報源 Crienglish.com, Xinhua News Agency report、2011年5月31日。
デンマーク国内で確定診断された _E. coli_ [O104] cases が14人となり、少なくとも26人について感染が疑われている。
[7] 米国
情報源 msnbc.com、2011年6月2日。
最近ドイツを旅行した米国民で、3人目の感染者が入院となっている、と2日、CDC から発表された。この患者は、他の2人と一緒に旅行していたが、このうちの1人が、欧州で18人が死亡し1600人以上が感染した集団食中毒の患者の疑いがあるとして、現在検査が行われている
[5] ノルウェー (疑い)
情報源 Health Canal、2011年5月31日。
ノルウェー公衆衛生研究所に対し、ドイツでのアウトブレイクに関係すると見られる EHEC infection の患者1例に関する報告があった。血性下痢のために入院となった40歳代の男性1名で、ドイツの菌と同じ細菌であるか、はまだ分かっていない。
[6] デンマーク
情報源 Crienglish.com, Xinhua News Agency report、2011年5月31日。
デンマーク国内で確定診断された _E. coli_ [O104] cases が14人となり、少なくとも26人について感染が疑われている。
[7] 米国
情報源 msnbc.com、2011年6月2日。
最近ドイツを旅行した米国民で、3人目の感染者が入院となっている、と2日、CDC から発表された。この患者は、他の2人と一緒に旅行していたが、このうちの1人が、欧州で18人が死亡し1600人以上が感染した集団食中毒の患者の疑いがあるとして、現在検査が行われている
PRO/AH/EDR> E. coli O104 - EU (09) & USA 20110603.1701
[1] 症例報告
情報源 Associated Press、2011年6月3日
ドイツの疾病対策担当局によると、6月に入ってから2日間で、新たに200人以上の大腸菌 _E. coli_ [O104:H4] infection 感染患者が報告されている。国内の感染者数は1733人に達し、18人が死亡した。死者のうち、スウェーデンで死亡した1人を除いて、すべてドイツ国内で発生している。The Robert Koch Institute によると、520人が、腎不全を起こし死亡する可能性のある合併症を併発している。欧州内では、他の9か国で80人の患者が報告されている、と WHO が発表している。そのほとんどが、ドイツへの旅行歴がある。
[2] WHO statement
情報源 WHO International Health Regulations 、2011年6月2日
ドイツにおける感染流行の患者から分離された腸管出血性大腸菌 The strain of enterohemorrhagic _E. coli_ (EHEC) O104:H4 は、これまでヒトでの感染で検出されたことはあるが、EHEC outbreak. の原因となったことのない、まれなタイプである ... WHO は、新たな治療法を勧告していない。通常の衛生手順に従うべきで； トイレの後、食品を触る前に手を洗うことがそれである ...
[3] 米国 Servicemen in Germany：Fox News 、2011年6月3日
ドイツ駐留の2人の米国人 USA service members が、欧州における大腸菌感染流行 Europe's [EHEC] _E. coli_ outbreak により感染したことが疑われている。このうちの1人である飛行士は、ドイツ西部の the Spangahlem Air Base の病院に収容された ...
[4] 英国：BBC、2011年6月3日
ドイツの感染流行に関連し、英国内で新たに4人の大腸菌感染 _E. coli_ infection 患者が発生したことが、当局 The Health Protection Agency から発表され、患者数は合計11人となった。いずれも最近ドイツを旅行している。
[5] スイス：World Radio、2011年6月1日
スイス国内では2人目となる、ドイツへの旅行後の大腸菌感染患者が発生した ... 例年、スイス国内ではおよそ60人が EHEC に感染するが、2011年のこれまでの患者数は23人と例年並みである。
● 鳥インフルエンザ、ヒト インドネシア WHO
● 鳥インフルエンザ、ヒト インドネシア WHO
PRO/AH/EDR> Avian influenza, human (45): Indonesia (JK), WHO 20110603.1700
情報源 World Health Organisation (WHO), Global Alert and Response, Disease Outbreak News 、2011年6月3日 FORTH
Avian influenza situation in Indonesia -- WHO update 5
インドネシア保健省は、鳥インフルエンザ Avian influenza A型ウイルス (H5N1) のヒト感染例を確認したことを発表した。この症例は、ジャカルタ首都特別州の北ジャカルタ地方に住む1歳の女児で、4月3日に発症し、4月8日に病院に移送され、現在では完治している。発症の一週間前に、この患者は父親と一緒に市場へ行きニワトリと接触していた。インドネシアではこれまでに178人が感染し、146人が死亡している。
Avian influenza situation in Indonesia -- WHO update 5
インドネシア保健省は、鳥インフルエンザ Avian influenza A型ウイルス (H5N1) のヒト感染例を確認したことを発表した。この症例は、ジャカルタ首都特別州の北ジャカルタ地方に住む1歳の女児で、4月3日に発症し、4月8日に病院に移送され、現在では完治している。発症の一週間前に、この患者は父親と一緒に市場へ行きニワトリと接触していた。インドネシアではこれまでに178人が感染し、146人が死亡している。
● RS ウイルス チリ
PRO/EDR> Respiratory syncytial virus - Chile: (Santiago) 20110603.1699
情報源 terra [in Spanish]、2011年6月3日
Poor air quality exacerbates respiratory syncytial virus outbreak
2011年は早い時期から、RS ウイルス感染症 respiratory syncytial virus (RSV) infection の患者が発生している。5月はじめに患者数の増加が認められ、第21週 [5月29日までの週] には320人を超えた。2010年のピーク時である7月に迫る人数で、1か月 [sic] 遅かった。大気汚染と雨不足、低温、室内の換気不十分などが相まって、小児での季節性の感染の開始時期が早まった
Poor air quality exacerbates respiratory syncytial virus outbreak
2011年は早い時期から、RS ウイルス感染症 respiratory syncytial virus (RSV) infection の患者が発生している。5月はじめに患者数の増加が認められ、第21週 [5月29日までの週] には320人を超えた。2010年のピーク時である7月に迫る人数で、1か月 [sic] 遅かった。大気汚染と雨不足、低温、室内の換気不十分などが相まって、小児での季節性の感染の開始時期が早まった
● 炭疽 バングラデシュ
PRO/AH/EDR> Anthrax, human, livestock - Bangladesh (04): (PB) 20110603.1698
情報源 BDNews24.com、2011年6月3日
Faridpur Upazila [subdistrict] in Pabna で新たに2人が炭疽菌 Anthrax に感染したことが分かった。この2人の女性の感染を加え、4日間で地域内 in the upazila で感染した患者数が12人となった
PRO/AH/EDR> Anthrax, human, livestock - Bangladesh (04): (PB) 20110603.1698
情報源 BDNews24.com、2011年6月3日
Faridpur Upazila [subdistrict] in Pabna で新たに2人が炭疽菌 Anthrax に感染したことが分かった。この2人の女性の感染を加え、4日間で地域内 in the upazila で感染した患者数が12人となった
● コレラ ウクライナ
PRO/EDR> Cholera, diarrhea & dysentery update 2011 (13): Ukraine (DT) 20110603.1697
[1] 情報源 KyivPost, Interfax-Ukraine report、2011年6月2日
1日現在、Mariupol (Donetsk region)で4人のコレラ患者が報告されているほか、入院中の1人についても感染が疑われている。飲料水や汚水などの水質、食品、魚類について、検査が行われている。中央市場の魚類 (sprat) で Non-O1 group _Vibrio_ が検出されているが、コレラの原因菌ではないので、引き続き調査している、と当局は発表している。
[2] 情報源 Xinhua News Agency、2011年6月2日
Mariupol city of Donetsk region in the Eastern Ukraine で、5人目のコレラ感染が確定診断されたことが、2日、保健省から公表された。5月29日以降、合計13人の入院患者についてコレラ感染が疑われており、4人については、アゾフ海 the Sea of Azov からの取水や魚類の摂取により、コレラに感染したことが確認されていた。
[Mod.LL－ non-O1 _Vibrio cholerae_ が1匹の魚から検出されたようであるが、過去には serotype O1 が確認されている。ことに、the 1994-1995 epidemic については、過去のProMED-mail に詳しく報告されている]
関連情報 FORTH
PRO/EDR> Cholera, diarrhea & dysentery update 2011 (13): Ukraine (DT) 20110603.1697
[1] 情報源 KyivPost, Interfax-Ukraine report、2011年6月2日
1日現在、Mariupol (Donetsk region)で4人のコレラ患者が報告されているほか、入院中の1人についても感染が疑われている。飲料水や汚水などの水質、食品、魚類について、検査が行われている。中央市場の魚類 (sprat) で Non-O1 group _Vibrio_ が検出されているが、コレラの原因菌ではないので、引き続き調査している、と当局は発表している。
[2] 情報源 Xinhua News Agency、2011年6月2日
Mariupol city of Donetsk region in the Eastern Ukraine で、5人目のコレラ感染が確定診断されたことが、2日、保健省から公表された。5月29日以降、合計13人の入院患者についてコレラ感染が疑われており、4人については、アゾフ海 the Sea of Azov からの取水や魚類の摂取により、コレラに感染したことが確認されていた。
[Mod.LL－ non-O1 _Vibrio cholerae_ が1匹の魚から検出されたようであるが、過去には serotype O1 が確認されている。ことに、the 1994-1995 epidemic については、過去のProMED-mail に詳しく報告されている]
関連情報 FORTH
● ライム病 米国
PRO/AH/EDR> Lyme disease - USA: (PA, WI) increased incidence 20110603.1694
[1] Pennsylvania
情報源 WDUQNews、2011年6月1日
2010年、ライム病 Lyme disease と診断されたアメリカ人の患者数は3万人近くに上り、ペンシルベニア Pennsylvania 州は全米で最も確定診断された患者が多かった。Allegheny County 郡保健当局者によると、郡内の住民における感染者数は、ここしばらくは年間20-30人の間を推移しているが、その感染経路に変化が見られる。かつては地域外への旅行中に感染することが多かったが、最近は、地域内で感染する人の数が急激に増えている。しかし、これは驚くには当たらないと当局者は述べている。ライム病を伝播するダニ the deer tick が、郡内のヒトやペットで発見されるダニとして最も多いからである。2009年、州内でライム病と診断された患者は4950人だった
PRO/AH/EDR> Lyme disease - USA: (PA, WI) increased incidence 20110603.1694
[1] Pennsylvania
情報源 WDUQNews、2011年6月1日
2010年、ライム病 Lyme disease と診断されたアメリカ人の患者数は3万人近くに上り、ペンシルベニア Pennsylvania 州は全米で最も確定診断された患者が多かった。Allegheny County 郡保健当局者によると、郡内の住民における感染者数は、ここしばらくは年間20-30人の間を推移しているが、その感染経路に変化が見られる。かつては地域外への旅行中に感染することが多かったが、最近は、地域内で感染する人の数が急激に増えている。しかし、これは驚くには当たらないと当局者は述べている。ライム病を伝播するダニ the deer tick が、郡内のヒトやペットで発見されるダニとして最も多いからである。2009年、州内でライム病と診断された患者は4950人だった
[2] Wisconsin
情報源 WQOW News、2011年6月1日
州内のライム病患者が増えつつあり、2009年の1948人から、2010年は2511人に増加した。Eau Claire （158人から196人) 及び Chippewa Counties （79人から125人) の両郡で増加が見られた
the Infectious Diseases Society of America Guidelines
写真 ダニと病変
● ヘルペスウイルス、動物園のゾウ ドイツ
PRO/AH/EDR> Herpesvirus, zoo elephants - Germany: (Berlin) 20110603.1696
情報源 WQOW News、2011年6月1日
州内のライム病患者が増えつつあり、2009年の1948人から、2010年は2511人に増加した。Eau Claire （158人から196人) 及び Chippewa Counties （79人から125人) の両郡で増加が見られた
the Infectious Diseases Society of America Guidelines
写真 ダニと病変
● ヘルペスウイルス、動物園のゾウ ドイツ
PRO/AH/EDR> Herpesvirus, zoo elephants - Germany: (Berlin) 20110603.1696
情報源 The Local 5月28日
2歳のメスのゾウが、5月27日にヘルペスウイルス感染により死亡した。わずか8週間前にも、きょうだいのゾウが同じ病気で死亡している ...
参考情報 20071208.3958
2歳のメスのゾウが、5月27日にヘルペスウイルス感染により死亡した。わずか8週間前にも、きょうだいのゾウが同じ病気で死亡している ...
参考情報 20071208.3958
● Black rot、ブドウ－米国
PRO/PL> Black rot, grapevine - USA: (OH) 20110603.1693
情報源 ZanesvilleTimesRecorder、2011年5月30日
Black rot on grapes
雨が続くことで、オハイオ Ohio 州で最も深刻なブドウの病気である black rot の感染が広がりやすくなっている ...
[Mod.DHA－ Black rot of grapevine は、真菌の_Guignardia bidwellii_ を原因とする］
Black rot on grapes
雨が続くことで、オハイオ Ohio 州で最も深刻なブドウの病気である black rot の感染が広がりやすくなっている ...
[Mod.DHA－ Black rot of grapevine は、真菌の_Guignardia bidwellii_ を原因とする］