新型コロナウイルス サウジアラビア、全遺伝子解析
● エボラウイルス病 ウガンダ
PRO/AH/EDR> Ebola virus disease - Uganda (25): (LO) new, fatal
Archive Number: 20121114.1409832
[1] 終息宣言から 1ヶ月で新たな感染流行発生
情報源 NZweek, Xinhua report、2012年11月14日
ウガンダ中央部 the central Ugandan district of Luwero において、エボラ出血熱 The deadly Ebola hemorrhagic fever が発生した。the World Health Organization (WHO) による終息宣言declared free of the disease から約 1ヶ月後のことである。 [14 Nov 2012] WHO の当局者は、13日に検査で陽性が確認されたことを明らかにした。流行発生の中心地は Sombwe Parish, Nyimbwa Sub County, Luwero district で、首都カンパラ Kampala から北へおよそ 40 km に位置する。the Luwero district health officer が、週末の間に同じ家族内の 2人が死亡した、と発言したことが伝えられている。国内西部の複数の地域で今もマールブルグ熱 the deadly Marburg fever の発生が続いている中での (エボラ) 発生となった。今年 7月には、中西部 the mid-western Ugandan district of Kibaale で the Ebola outbreak が発生し、少なくとも 20人が死亡している ...
[2] 同じ家族の2人が死亡
情報源 Africa Review、2012年11月14日
Luweero District in Uganda において、新たなエボラウイルス感染流行 Ebola [virus disease infection] in a fresh outbreak により 2人が死亡したことが、14日保健当局者から報告された。同地域内の、別の 2人の死亡についても、エボラウイルス感染が原因である可能性が疑われている。Ebola-free が宣言されてからわずか 1ヶ月後の発生となった。the Central Public Health Laboratory において、死亡した 2人の患者の血液検体の検査が行われ、Ebola virus disease of the Sudan strain であることが確認された。死亡した患者らは Nyimbwa sub-county of Luweero District に住む同じ家族だった。同じく死亡原因が分からない別の 2人の患者について行われた、 Marburg virus infection 検査の結果は陰性だった、と当局者が説明した。保健省は、最近流行が発生し調査中の Ebola from Kibaale もしくは Marburg from Kabale、Ibanda and Kabalore districts から波及した可能性がある、と考えている。ウガンダでは、20人が死亡した Kibaale District の Ebola が終息した後、西部のいくつかの地域で Marburg virus disease outbreaks が発生し、現在も続いている。
[Mod.CP－the previous outbreak of Ebola virus disease this year (2012) が起きた Kibaale District は Luwero District の西に位置する。The 2 Districts 間の距離は、最も近い場所でも 約 100 km 離れており、Marburg virus disease の発生が続く Kabale district は、どちらの地域にも接していない。the Marburg virus outbreak in Kabale の患者は、大部分が同じ家族内のメンバーだった。the new outbreak of Ebola virus disease in Luwero district も同じ状況のようである。different filoviruses が central Uganda でほぼ同時に発生したことは、何らかの共通因子 some common environmental source or ecological factor が、ヒトへのフィロウイルス filovirus infections に関与していることを示唆する]
関連項目 Ebola virus disease - Uganda (24): (KI) outbreak declared over, WHO 20121005.1326565
● 黄熱 スーダン
PRO/AH/EDR> Yellow fever - Africa (16): Sudan (Darfur, Khartoum) 20121114.1409831
情報源 Alertnet、2012年11月14日
スーダン西部における黄熱感染流行による死者の数が、13日 107人に達し、ワクチンの一斉接種が来月まで行われないことから、ある専門家は、ダルフール Darfur を越えて広がれば、a "pending catastrophe" に陥る可能性があると警告を発している。the Pasteur Institute in Paris の専門家は "This is a terribly serious situation" と述べ、 "もし [the epidemic の] 感染拡大が本当に勢いを増せば、何もできなくなるだろう..." と述べている。2003年に反政府勢力 rebels が武装化して以来、Darfur では内戦が続き、the central government は地方を切り捨てている、と言われている。最大規模の平和維持軍が展開 the presence of the world's largest peacekeeping operation, the United Nations-African Union Mission in Darfur (UNAMID) されているにもかかわらず、人道支援に携わる人々humanitarian workers がしばしば襲われている ... ワクチンの到着の遅れなど。
関連項目 (15): Sudan (Darfur) WHO 20121113.1407906
● ウエストナイルウイルス チュニジア
PRO/AH/EDR> West Nile virus - North Africa (04): Tunisia 20121114.1409705
情報源 DirectInfo [in French]、2012年11月 13日
地域保健当局者 regional public health director (Mahdia governorate) は 12日、7 人のウエストナイルウイルス感染患者 cases of West Nile virus [WNV] infection が、the Mahdia Regional Hospital に入院したことを明らかにした。3人が退院となり、残る 4人は今も治療を受けている
関連項目 (03): Tunisia 20121111.1403911
● ロッキー山紅斑熱 メキシコ
● 馬インフルエンザ フランス、アイルランドから
PRO/AH> Equine influenza - France (03): ex Ireland, update 20121114.1409790
情報源 The Horse、2012年11月13日
アイルランド Ireland で 2012年10月に行われたウマの売買 horse sales の間に感染が広がった、馬インフルエンザウイルス an equine influenza virus の影響が、欧州内の数カ国に及ぶ可能性があることが、仏ウマ疾病調査センター the French surveillance center for equine pathologies (Reseau d'Epidemio-Surveillance de Pathologie Equine; RESPE) in Caen により明らかにされた。フランス国内でもすでに、19 cases at 3 different sites の感染が確認されている
● 炭疽 スロバキア（2件）
PRO/AH> Anthrax, bovine - Slovakia (03): warning 20121114.1409706
情報源 Polskie Radio、2012年11月13日
スロバキア Slovakiaで炭疽感染のあったウシの群れ an anthrax-infected herd の中の 3頭が、2012年9月に ポーランドの業者 a Polish abattoir に売り渡されていたことが分かった。スロバキアでの炭疽感染が発覚した [おそらく、ポーランドに通知された日の意] のは、11月12日になってからのことで、ポーランドのどの地域に送られたかは分かっていない。この家畜がポーランドに到着したのは 9月27日のことであり、感染が判明する 30日以上も前だった
● ロッキー山紅斑熱 メキシコ
PRO/EDR> Rocky Mountain spotted fever - Mexico (02): (CA Coahuila) 20121114.1409214
情報源 Zocalo [in Spanish],2012年11月12日
保健省 The Health Ministry は 4 人のダニ媒介性紅斑熱 tickborne spotted fever の患者を確認するとともに、さらに4人が感染も疑われていることから、4 colonies of Saltillo [Coahuila] に衛生的隔離 a sanitary cordon を実施している。確定診断された 4人の患者のうち、1人は Saltillo、もう 1人は Parras de la Fuente、あとの 2人は Torreon の患者で、the 4 probable cases は州都 the state capital [Saltillo] の患者である。the Valle de las Aves colony in this sector と the colonies of Lomas de Zapaliname, Pedregal, and Nueva Imagen において、少なくとも 2人の少女が死亡するという非常事態であることを受け、週末 [10-11 Nov 2012] から感染予防対策が実施されている。この地域は上下水道や舗装が未整備であり、付近の河川にはゴミがあふれ、イヌの繁殖場となり、ヒトへの感染が起きている、と説明されている。
● 新型コロナウイルス サウジアラビア
PRO/AH/EDR> Novel coronavirus - Saudi Arabia (16): whole genome sequence 20121114.1409556
[1] HPA press release
Whole genome sequence from the UK case of novel coronavirus
情報源 Health Protection Agency (HPA), News Centre, Press release、2012年11月13日
The Health Protection Agency (HPA) は 13日、9月22日に診断が確定されていた新型コロナウイルス novel coronavirus に感染した英国の患者からの遺伝子について、全塩基配列を解読し発表した。患者は今も a London hospital で治療中である ... 遺伝子解析でも、今回のコロナウイルスに最も近い関係にあるウイルスは、オランダで 2008年に確認されたコウモリのウイルスであることが示されている
[2] Health Protection Agency (HPA): whole genome sequence
情報源 Health Protection Agency (HPA)、2012年11月13日
The England 1 Coronavirus genome (England1_CoV) が、80 overlapping PCR fragments of between 0.5-1.5 kb を用いて構成された。変性プライマー Degenerate primers は an alignment of the EMC [the Netherlands slate] virus and bat coronavirus HKU4 & HKU5 と相対して設計を行った designed against 。竿州的に塩基配列が解析された復元遺伝子 The final sequenced genome coverage は 2 and 11 fold となり、材料 the material sequenced は臨床検体 clinical material から直接得られたものであって、NOT from a virus isolate (分離ウイルスではない) ... 詳細な解析方法の説明など [The sequence and coding regions] ...
情報源 Zocalo [in Spanish],2012年11月12日
保健省 The Health Ministry は 4 人のダニ媒介性紅斑熱 tickborne spotted fever の患者を確認するとともに、さらに4人が感染も疑われていることから、4 colonies of Saltillo [Coahuila] に衛生的隔離 a sanitary cordon を実施している。確定診断された 4人の患者のうち、1人は Saltillo、もう 1人は Parras de la Fuente、あとの 2人は Torreon の患者で、the 4 probable cases は州都 the state capital [Saltillo] の患者である。the Valle de las Aves colony in this sector と the colonies of Lomas de Zapaliname, Pedregal, and Nueva Imagen において、少なくとも 2人の少女が死亡するという非常事態であることを受け、週末 [10-11 Nov 2012] から感染予防対策が実施されている。この地域は上下水道や舗装が未整備であり、付近の河川にはゴミがあふれ、イヌの繁殖場となり、ヒトへの感染が起きている、と説明されている。
● 新型コロナウイルス サウジアラビア
PRO/AH/EDR> Novel coronavirus - Saudi Arabia (16): whole genome sequence 20121114.1409556
[1] HPA press release
Whole genome sequence from the UK case of novel coronavirus
情報源 Health Protection Agency (HPA), News Centre, Press release、2012年11月13日
The Health Protection Agency (HPA) は 13日、9月22日に診断が確定されていた新型コロナウイルス novel coronavirus に感染した英国の患者からの遺伝子について、全塩基配列を解読し発表した。患者は今も a London hospital で治療中である ... 遺伝子解析でも、今回のコロナウイルスに最も近い関係にあるウイルスは、オランダで 2008年に確認されたコウモリのウイルスであることが示されている
[2] Health Protection Agency (HPA): whole genome sequence
情報源 Health Protection Agency (HPA)、2012年11月13日
The England 1 Coronavirus genome (England1_CoV) が、80 overlapping PCR fragments of between 0.5-1.5 kb を用いて構成された。変性プライマー Degenerate primers は an alignment of the EMC [the Netherlands slate] virus and bat coronavirus HKU4 & HKU5 と相対して設計を行った designed against 。竿州的に塩基配列が解析された復元遺伝子 The final sequenced genome coverage は 2 and 11 fold となり、材料 the material sequenced は臨床検体 clinical material から直接得られたものであって、NOT from a virus isolate (分離ウイルスではない) ... 詳細な解析方法の説明など [The sequence and coding regions] ...
関連項目 (15): new case 20121104.1391285
● レプトスピラ症 ドミニカ共和国
PRO/AH/EDR> Leptospirosis - Dominican Republic: fatal, susp 20121114.1409325
情報源 DiarioLider [in Spanish]、2012年11月13日
雨期のあと、レプトスピラ症 leptospirosis による死亡が増えている。全国的に流行レベル epidemic proportions に達している。今週、合計 11 suspected cases of leptospirosis が報告された。1月から10月までの間に、当局は 944 cases suspected cases, including 58 deaths を報告している
● レプトスピラ症 ドミニカ共和国
PRO/AH/EDR> Leptospirosis - Dominican Republic: fatal, susp 20121114.1409325
情報源 DiarioLider [in Spanish]、2012年11月13日
雨期のあと、レプトスピラ症 leptospirosis による死亡が増えている。全国的に流行レベル epidemic proportions に達している。今週、合計 11 suspected cases of leptospirosis が報告された。1月から10月までの間に、当局は 944 cases suspected cases, including 58 deaths を報告している
PRO/AH> Equine influenza - France (03): ex Ireland, update 20121114.1409790
情報源 The Horse、2012年11月13日
アイルランド Ireland で 2012年10月に行われたウマの売買 horse sales の間に感染が広がった、馬インフルエンザウイルス an equine influenza virus の影響が、欧州内の数カ国に及ぶ可能性があることが、仏ウマ疾病調査センター the French surveillance center for equine pathologies (Reseau d'Epidemio-Surveillance de Pathologie Equine; RESPE) in Caen により明らかにされた。フランス国内でもすでに、19 cases at 3 different sites の感染が確認されている
● 炭疽 スロバキア（2件）
PRO/AH> Anthrax, bovine - Slovakia (03): warning 20121114.1409706
情報源 Polskie Radio、2012年11月13日
スロバキア Slovakiaで炭疽感染のあったウシの群れ an anthrax-infected herd の中の 3頭が、2012年9月に ポーランドの業者 a Polish abattoir に売り渡されていたことが分かった。スロバキアでの炭疽感染が発覚した [おそらく、ポーランドに通知された日の意] のは、11月12日になってからのことで、ポーランドのどの地域に送られたかは分かっていない。この家畜がポーランドに到着したのは 9月27日のことであり、感染が判明する 30日以上も前だった
PRO/AH> Anthrax, bovine - Slovakia (02): (PV) OIE 20121114.1409324
情報源 OIE, WAHID (World Animal Health Information Database), weekly disease information 2012; 25(46)、2012年11月13日
Anthrax, Slovakia、reoccurrence of a listed disease
感染開始時期 2012年11月5日
前回流行時期 2010年8月
原因菌 _Bacillus anthracis_
新たな感染流行 (2)
発生地 Staskovce, Stropkov, Presov
感染した種 /全体頭数 / 感染頭数 / 死亡/ 廃棄 / 処分
ウシ Cattle / 277 / 4 / 4 / 0 / 0
情報源 OIE, WAHID (World Animal Health Information Database), weekly disease information 2012; 25(46)、2012年11月13日
Anthrax, Slovakia、reoccurrence of a listed disease
感染開始時期 2012年11月5日
前回流行時期 2010年8月
原因菌 _Bacillus anthracis_
新たな感染流行 (2)
発生地 Staskovce, Stropkov, Presov
感染した種 /全体頭数 / 感染頭数 / 死亡/ 廃棄 / 処分
ウシ Cattle / 277 / 4 / 4 / 0 / 0
● カンキツグリーニング病 ブラジル
PRO/PL> Huanglongbing, citrus - Brazil: (SP Sao Paulo) update 20121114.1408468
情報源 Agra-net Food News、2012年11月13日
Spike in greening cases worries orange producers
サンパウロ州 Sao Paulo state でこのところ、カンキツグリーニング病 huanglongbing (HLB, or greening) disease に感染する柑橘類の樹木が急激に増えている A recent spike ことは、ブラジルの柑橘類栽培部門にとって憂慮すべき事態 a "worrying" development であるとの見解が、national citrus production defence fund, Fundecitrus の研究者らから出されている
Spike in greening cases worries orange producers
サンパウロ州 Sao Paulo state でこのところ、カンキツグリーニング病 huanglongbing (HLB, or greening) disease に感染する柑橘類の樹木が急激に増えている A recent spike ことは、ブラジルの柑橘類栽培部門にとって憂慮すべき事態 a "worrying" development であるとの見解が、national citrus production defence fund, Fundecitrus の研究者らから出されている
● 大量死、家畜 ウガンダ
PRO/AH> Die-off, livestock - Uganda: (Acholiland) RFI 20121114.1408510
情報源 Acholi Times、2012年11月12日
Contagious disease depleting livestock in Lamwo district
未だ原因が判明していない伝染病 contagious disease により、2several sub-counties in Lamwo で 2ヶ月間に 100以上の群れの家畜が死亡している。sub-counties of Agoro, Lokung, Padibe, and Madi Opei において、50以上のウシの群れと 60以上のヤギの群れで死亡が発生したとされ、ブタのほとんどが死滅したため、わずかに残ったものだけが治療を受けている状態である。the 3 villages of Awena Olwiyo, Ngomoromo, and Apuk でも、ほとんどのブタが死亡した