新型コロナウイルス (26～28) 中国 保有動物，アフリカ，研究
● 新型コロナウイルス(28) 中国 保有動物
PRO/AH/EDR> Novel coronavirus (28): China (HU) animal reservoir
Archive Number: 20200201.6943858
[1] 中国国内の野生動物取引規制と保護策
Measures to regulate the trade and maintenance of wild animals in China
情報源 Xinhuanet News [in Chinese]
1月26日，中国当局 the China Centers for Disease Control and Prevention は，武漢市海鮮市場 the South China Seafood Market in Wuhan の環境中から，新たにコロナウイルスが検出されたと発表した。同市場で販売されていた野生動物由来であった。これを受け，関係各局は 26日共同で，今後国内の流行が終息するまでの間の動物の商取引を禁止し，ウイルス感染源とその伝播を断ち切ると発表した ... 一部の地域では，生きた鳥類の取引も停止されている，原文参照願います。
[2] Virus detection in environmental samples from the seafood market
情報源 China's National Microbiology Data Center [in Chinese] 2020年1月26日
武漢の海鮮市場 2 batches of South China Seafood City で採取された合計 585検体のうちの 33検体で，新型コロナウイルスの遺伝子の核酸が確認され，陽性の環境検体からウイルスの分離にも成功した ... 陽性となったのは，22軒の店とゴミ収集車 1台から採取された検体で，93.9% (31/33) positive specimens が，the areas near 7th and 8th streets を中心に，野生動物の取扱業者が集中していた the western part of the South China Seafood Market のものだった ...
[3] 流行初期の情報 Initial epidemiology, public announcement, 31 Dec 2019
Wuhan Municipal Health and Health Commission's briefing on the current pneumonia epidemic situation in our city
Issuing authority: Wuhan City health committee.
Published: 31 Dec 2019 13:38:05
情報源 Public announcement, Wuhan Municipal Health Committee [in Chinese] 2019年12月31日
最近，複数の医療施設が，海鮮市場 South China Seafood City が関係する多数の肺炎患者を受け入れている。これらの報告を受け，市保健当局 the Municipal Health and Health Commission が直ちに症例検索と海鮮市場に関係する後向調査を開始したところ; 27 cases が判明しうち 7 例が重症例であった ... 主な症状は発熱で，一部の患者に呼吸困難が見られ，胸部放射線検査で両側の肺の浸潤病変 bilateral lung infiltrative lesions が認められていた。現時点ですべての患者を隔離して治療を行っている ... 疫学調査と検査所見から，ウイルス性肺炎とみられている。現時点で明らかなヒト－ヒト感染および医療従事者の感染は認められていない。病原体の同定が進められている ...
The following timeline data, extracted from the paper, have relevance to the assessment of animal involvement in 2019nCoV:
1. 8 Dec 2019: 1st human case; not linked to Huanan (Southern China) Seafood Wholesale Market.
2. 10 Dec 2019: 2nd human case; not linked to Huanan market.
3. 13 Dec 2019: 3rd human case; linked to Huanan market.
4. Between 14-28 Dec 2019, 30 new cases, of which 11 cases not linked, 19 cases linked to the Huanan market.
5. 29 Dec 2019: "Pneumonia cases [declared] linked to the Huanan Seafood Wholesale Market."
6. 30 Dec 2019: Case finding activated
7. 31 Dec 2019: "Outbreak announced by WHC; NHC and China CDC involved in investigation and response."
8. 1 Jan 2020: Huanan Seafood Wholesale Market closed.
1月1日以前に発症の症例の大部分 (55%) が the Huanan Seafood Wholesale Market と関連していたのに対し，その後の症例は 8.6% に留まっている，と書かれている。
市場閉鎖の経緯，また 1月9日の Sina Technology (in Chinese) には，海鮮市場で売られていた野生動物がウイルス感染源として調査されていると記載されている ...
参考資料
1. Early Transmission Dynamics in Wuhan, China, of Novel Coronavirus-Infected Pneumonia. NEJM. 29 Jan 2020. DOI: 10.1056/NEJMoa2001316.
2. Discovery of a novel coronavirus associated with the recent pneumonia outbreak in humans and its potential bat origin. bioRxiv. 2020.01.22.914952; doi: https://doi.org/10.1101/2020.01.22.914952.
● 新型コロナウイルス(27) アフリカ
PRO/AH/EDR> Novel coronavirus (27): updates, Africa
Archive Number: 20200201.6943724
情報源 South China Morning Post 2020年1月31日
アフリカで新たに 4カ国が，中国から到着する乗客らの検疫を行っている ... スーダン，赤道ギニア，モーリシャス，アンゴラ，コートジボワール，スーダン，ケニア，エチオピア，南アフリカ，ナイジェリア，ガーナ，ルワンダ，ウガンダ，ザンビアの，検疫や検査等の情報。
● 新型コロナウイルス(26)
PRO/AH/EDR> Novel coronavirus (26): research, early spread in Wuhan, China
Archive Number: 20200201.6943519
情報源 The New England Journal of Medicine 2020年1月29日
原著タイトル Early Transmission Dynamics in Wuhan, China, of Novel Coronavirus-Infected Pneumonia. New England Journal of Medicine. 2020; DOI: 10.1056/NEJMoa2001316
要約
the epidemiologic characteristics of NCIP を明らかにするために，1月22日までの流行初期段階の武漢の 425例 confirmed cases in Wuhan についてのデータを収集・解析した
（結果）
平均年齢は 59歳，1月1日以前に発症の症例の 55％に the Huanan Seafood Wholesale Market との関連が認められたのに対し，その後に発生した症例 the subsequent cases では 8.6% だった。平均の潜伏期間は 5.2 days (95% confidence interval [CI], 4.1-7.0) で，the 95th percentile が 12.5日以内だった。初期段階では every 7.4 days ごとに倍増していた。
（結論）
2019年12月中旬以降，濃厚接触者間で human-to-human transmission among close contacts が起きていた。
（議論）
We estimated an R0 of approximately 2.2 ... The R0 of SARS はおよそ 3で，患者の隔離と感染コントロールにより終息に成功した。NCIP では，多数の軽症例が存在すること，患者および濃厚接触者の隔離のソースが限られていること，が対応を難しくしている ... 初期の感染例に小児が少ないことは注目すべき事で，425例のほぼ半数が 60歳以上の高齢者である。小児が感染しにくいのか，あるいは感染してもより軽症となるのか。いずれの状況であっても，確定患者数は実際より少なくなる。第 1波後の血清学的調査で明らかになるだろう。医療従事者の感染も起きているが，during the SARS and MERS outbreaks ほど高くない。SARS and MERS outbreaks の特徴の 1つがその感染伝播率 transmissibility で，特にスーパースプレッダー事例の，とりわけ病院内での発生 the occurrence of super-spreading events があった。今のところ NCIP では発生していないが ... 患者の 27% が発症から 2日以内の短期間に受診しているが，入院までの期間はより長く，少なくとも 5日以上かかっている。すなわち，初期段階での症例の同定と隔離が困難であることを現している ...
関連項目
Novel coronavirus (25): updates, China, Italy, Russia, UK 20200131.6940058
● 新型コロナウイルス(28) 中国 保有動物
PRO/AH/EDR> Novel coronavirus (28): China (HU) animal reservoir
Archive Number: 20200201.6943858
[1] 中国国内の野生動物取引規制と保護策
Measures to regulate the trade and maintenance of wild animals in China
情報源 Xinhuanet News [in Chinese]
1月26日，中国当局 the China Centers for Disease Control and Prevention は，武漢市海鮮市場 the South China Seafood Market in Wuhan の環境中から，新たにコロナウイルスが検出されたと発表した。同市場で販売されていた野生動物由来であった。これを受け，関係各局は 26日共同で，今後国内の流行が終息するまでの間の動物の商取引を禁止し，ウイルス感染源とその伝播を断ち切ると発表した ... 一部の地域では，生きた鳥類の取引も停止されている，原文参照願います。
[2] Virus detection in environmental samples from the seafood market
情報源 China's National Microbiology Data Center [in Chinese] 2020年1月26日
武漢の海鮮市場 2 batches of South China Seafood City で採取された合計 585検体のうちの 33検体で，新型コロナウイルスの遺伝子の核酸が確認され，陽性の環境検体からウイルスの分離にも成功した ... 陽性となったのは，22軒の店とゴミ収集車 1台から採取された検体で，93.9% (31/33) positive specimens が，the areas near 7th and 8th streets を中心に，野生動物の取扱業者が集中していた the western part of the South China Seafood Market のものだった ...
[3] 流行初期の情報 Initial epidemiology, public announcement, 31 Dec 2019
Wuhan Municipal Health and Health Commission's briefing on the current pneumonia epidemic situation in our city
Issuing authority: Wuhan City health committee.
Published: 31 Dec 2019 13:38:05
情報源 Public announcement, Wuhan Municipal Health Committee [in Chinese] 2019年12月31日
最近，複数の医療施設が，海鮮市場 South China Seafood City が関係する多数の肺炎患者を受け入れている。これらの報告を受け，市保健当局 the Municipal Health and Health Commission が直ちに症例検索と海鮮市場に関係する後向調査を開始したところ; 27 cases が判明しうち 7 例が重症例であった ... 主な症状は発熱で，一部の患者に呼吸困難が見られ，胸部放射線検査で両側の肺の浸潤病変 bilateral lung infiltrative lesions が認められていた。現時点ですべての患者を隔離して治療を行っている ... 疫学調査と検査所見から，ウイルス性肺炎とみられている。現時点で明らかなヒト－ヒト感染および医療従事者の感染は認められていない。病原体の同定が進められている ...
The following timeline data, extracted from the paper, have relevance to the assessment of animal involvement in 2019nCoV:
1. 8 Dec 2019: 1st human case; not linked to Huanan (Southern China) Seafood Wholesale Market.
2. 10 Dec 2019: 2nd human case; not linked to Huanan market.
3. 13 Dec 2019: 3rd human case; linked to Huanan market.
4. Between 14-28 Dec 2019, 30 new cases, of which 11 cases not linked, 19 cases linked to the Huanan market.
5. 29 Dec 2019: "Pneumonia cases [declared] linked to the Huanan Seafood Wholesale Market."
6. 30 Dec 2019: Case finding activated
7. 31 Dec 2019: "Outbreak announced by WHC; NHC and China CDC involved in investigation and response."
8. 1 Jan 2020: Huanan Seafood Wholesale Market closed.
1月1日以前に発症の症例の大部分 (55%) が the Huanan Seafood Wholesale Market と関連していたのに対し，その後の症例は 8.6% に留まっている，と書かれている。
市場閉鎖の経緯，また 1月9日の Sina Technology (in Chinese) には，海鮮市場で売られていた野生動物がウイルス感染源として調査されていると記載されている ...
参考資料
1. Early Transmission Dynamics in Wuhan, China, of Novel Coronavirus-Infected Pneumonia. NEJM. 29 Jan 2020. DOI: 10.1056/NEJMoa2001316.
2. Discovery of a novel coronavirus associated with the recent pneumonia outbreak in humans and its potential bat origin. bioRxiv. 2020.01.22.914952; doi: https://doi.org/10.1101/2020.01.22.914952.
● 新型コロナウイルス(27) アフリカ
PRO/AH/EDR> Novel coronavirus (27): updates, Africa
Archive Number: 20200201.6943724
情報源 South China Morning Post 2020年1月31日
アフリカで新たに 4カ国が，中国から到着する乗客らの検疫を行っている ... スーダン，赤道ギニア，モーリシャス，アンゴラ，コートジボワール，スーダン，ケニア，エチオピア，南アフリカ，ナイジェリア，ガーナ，ルワンダ，ウガンダ，ザンビアの，検疫や検査等の情報。
● 新型コロナウイルス(26)
PRO/AH/EDR> Novel coronavirus (26): research, early spread in Wuhan, China
Archive Number: 20200201.6943519
情報源 The New England Journal of Medicine 2020年1月29日
原著タイトル Early Transmission Dynamics in Wuhan, China, of Novel Coronavirus-Infected Pneumonia. New England Journal of Medicine. 2020; DOI: 10.1056/NEJMoa2001316
要約
the epidemiologic characteristics of NCIP を明らかにするために，1月22日までの流行初期段階の武漢の 425例 confirmed cases in Wuhan についてのデータを収集・解析した
（結果）
平均年齢は 59歳，1月1日以前に発症の症例の 55％に the Huanan Seafood Wholesale Market との関連が認められたのに対し，その後に発生した症例 the subsequent cases では 8.6% だった。平均の潜伏期間は 5.2 days (95% confidence interval [CI], 4.1-7.0) で，the 95th percentile が 12.5日以内だった。初期段階では every 7.4 days ごとに倍増していた。
（結論）
2019年12月中旬以降，濃厚接触者間で human-to-human transmission among close contacts が起きていた。
（議論）
We estimated an R0 of approximately 2.2 ... The R0 of SARS はおよそ 3で，患者の隔離と感染コントロールにより終息に成功した。NCIP では，多数の軽症例が存在すること，患者および濃厚接触者の隔離のソースが限られていること，が対応を難しくしている ... 初期の感染例に小児が少ないことは注目すべき事で，425例のほぼ半数が 60歳以上の高齢者である。小児が感染しにくいのか，あるいは感染してもより軽症となるのか。いずれの状況であっても，確定患者数は実際より少なくなる。第 1波後の血清学的調査で明らかになるだろう。医療従事者の感染も起きているが，during the SARS and MERS outbreaks ほど高くない。SARS and MERS outbreaks の特徴の 1つがその感染伝播率 transmissibility で，特にスーパースプレッダー事例の，とりわけ病院内での発生 the occurrence of super-spreading events があった。今のところ NCIP では発生していないが ... 患者の 27% が発症から 2日以内の短期間に受診しているが，入院までの期間はより長く，少なくとも 5日以上かかっている。すなわち，初期段階での症例の同定と隔離が困難であることを現している ...
関連項目
Novel coronavirus (25): updates, China, Italy, Russia, UK 20200131.6940058