新型コロナウイルス(40)(41)
無症候性症例からの感染伝播，センザンコウ 中間宿主疑い
● 小反芻獣疫－モロッコ ヤギ OIE
Peste des petits ruminants, Morocco，Recurrence of a listed disease
PRO/AH/EDR> Peste des petits ruminants - Morocco: (TC) goats, OIE
Archive Number: 20200210.6975540
情報源 OIE, WAHID (World Animal Health Information Database), weekly disease information 2020; 33(07) 2020年2月7日
感染開始時期 21 Jan 2020
前回流行時期 3 Sep 2015
原因ウイルス Peste des petits ruminants virus
新たな感染流行(1)
Outbreak 1: Daidat, Hjar Ennahal, Tanger-Assilah, Tanger-Tetouan-Al Hoceima: farm
感染した種/頭数/症例数/死亡/殺処分・廃棄/処理
ヤギ Goats / 140 / 92 / 68 / 0 / 0
● トマトウイルス，トウガラシ－オーストラリア
PRO/PL> Tomato mottle mosaic virus, capsicum seed - Australia: interception
Archive Number: 20200210.6976116
情報源 Australasian Plant Disease Notes 2020年2月7日
Since April 2019, all capsicum and tomato seeds imported to Australia have been tested for ToBRFV as a part of regulations imposed by the Department of Agriculture. In May 2019, an imported shipment of approximately 6000 capsicum seeds was submitted for testing on-shore. A total of 15 sub-samples (400 seeds per sample) was tested using a one-step RT-PCR. Nine [sub-samples] produced an amplicon of 811 base pairs (bp). Sequencing indicated a 98%-99% nucleotide (nt) identity to the same region in ToMMV isolates and less than 90% nt identity to ToBRFV, ToMV, and TMV isolates. Sequences [were] confirmed by high throughput sequencing and bioinformatics analysis.
● 新型コロナウイルス(41) 中国 無症候性症例からの感染伝播 WHO
PRO/AH/EDR> Novel coronavirus (41): China, global, clinical pics, asymptomatic trans., WHO
Archive Number: 20200210.6976117
In this update:
[1] 中国: China National Health Commission 11 Feb 2020
[2] Global update: Johns Hopkins CSSE [accessed at 7:15 p.m. GMT-5]
[3] Asymptomatic transmission
[4] Clinical characteristics of 2019 novel coronavirus infection in China
[5] False negative NAT tests: comment/query
[6] Selected media reports of transmission outside of Mainland China
[7] WHO situation report 21 (as of 10 Feb 2020*)
[1] 中国: China National Health Commission 11 Feb 2020
Update on the epidemic situation of new coronavirus pneumonia as of 24:00 on 10 Feb [2020]
情報源 China National Health Commission [in Chinese] 2020年2月11日
At 04:00 on [10 Feb 2020], 31 provinces (autonomous regions, municipalities) and the Xinjiang Production and Construction Corps reported that 2478 new cases were confirmed (2097 in Hubei), adding 849 severe cases (839 in Hubei). There were 108 deaths (103 cases in Hubei and 1 each in Beijing, Tianjin, Heilongjiang, Anhui, and Henan) and 3536 suspected cases (1814 in Hubei).
On the same day, 716 new cases were cured and discharged (427 cases in Hubei), and 26 724 close contacts were lifted from medical observation.
As of 20:00 on [10 Feb 2020], according to reports from 31 provinces (autonomous regions and municipalities) and the Xinjiang Production and Construction Corps, there were 37 726 confirmed cases (of which 7333 were severe cases), and a total of 3996 discharged patients were cured (1 in Zhejiang province) A total of 1016 deaths were reported; 42 638 confirmed cases were reported (12 cases were subtracted from Zhejiang nuclear, and 1 case was increased from Jiangxi nuclear) ...
[2] Global update: Johns Hopkins CSSE [accessed at 10:40 p.m. GMT-5]
情報源 Johns Hopkins CSSE (Center for Systems Science and Engineering) 2020年2月11日
Confirmed cases
(2 Feb 2020 / 3/ 4(early) / 4(end of day) / 5/ 6/ 7/ 8/ 9/ 9late / Country/Region
17 187 / 19 693 / 20 636 / 23 746 / 27 396 / 30 553 / 34 524 / 37 174 / 37 199 / 40 157 / 42 310 / 中国本土
20 / 20 / 20 / 22 / 22 / 45 / 25 / 25 / 26 / 26 / 26 / 26 / 日本 ...
Total reported deaths: 1013
湖北省 Hubei Mainland China: 974 deaths
河南省 Henan Mainland China: 6 deaths
黒竜江省 Heilongjiang Mainland China: 7 deaths
Data sources: WHO, CDC, ECDC, NHC, and DXY
[3] 無症候性症例からの感染伝播 Asymptomatic transmission
2019-nCoV asymptomatic transmission in Germany - interview with Chinese index patient
投稿者 独・LMU Hospital Munich, Div. of Infectious Diseases and Tropical Medicine，Dr. Camilla Rothe 2020年2月10日
1月30日投稿の我々のレター our letter published in the New England Journal of Medicine (Rothe C et al., "Transmission of 2019-nCoV Infection from an Asymptomatic Contact in Germany") を批判する論調 alleged fraud がここ数日間寄せられた。その論点は，真に "asymptomatic (無症候性) " の患者としてよい rightly termed のか，それとも何らかの前駆症状を示していたのではないのか，という疑問である。現在の状況を考えると，われわれの観察をできるだけ早く医療界に伝えたいと思っている。従って我々の出した結論は主に，受け持った患者の所見に基づくもので，患者らは 3日間の集中会議やワークショップで，呼吸感染症を疑わせる臨床所見に気づかれていない中国人の発端となった患者とともに過ごしていた。レターが掲載されるまで，われわれはこの中国人の患者と直接話す機会はなかった。そして，中国に戻った発端患者と電話で話す機会が与えられ，ドイツ国内滞在中に何らかの症状があった可能性を聞くことができた ... According to the personal opinion of the authors, the message of our initial letter still stands.
Link to the new appendix:
［Mod.MPP 注－The supplementary appendix に the actual interview with the patient が入っている。
ー1月19日 上海を出発し，直行便でミュンヘンに到着。後ろの席で咳をする乗客あり。
－1月20日 1st meeting day, No symptoms whatsoever during the workday. 少し熱かったが，発熱ではないと感じた。999という中国の市販薬を1錠服用 (女性によるとアセトアミノフェンが含まれている)。翌日に備えて念のため服用したもので，ドイツ滞在中に服用した薬剤は，これのみ。
－1月21日 午後3時以降疲労を感じたが時差のせいだと考えた。筋肉や肋骨のある部分を触った時に少しの痛みがあった。熱感はなく，他の症状もなかった。
－1月22日 午後6時まで終日会議。朝，薄着 light business attire だったため少し寒く案じたが，ショールを羽織ったあとは感じなくなった。午後10時20分にミュンヘンを離れた。
－1月23日 現地時間午後4時に上海に到着し,やや疲労感があった以外は問題なし。 同日夕刻に体調が悪くなったと報告している ("This is the 1st moment I recognized getting sick.")。深夜に体温を測定したところ 38℃で，局所の胸の痛みも感じていた。
－1月24日 一日忙しくしていたが，夕方に 38.7℃。
－1月25日 医師の診察を受け入院。
－1月26日 時々，乾性咳嗽が出始めた。
－1月27日 別の病院に搬送。
－1月28日 湿性咳嗽に変化，3日間続いたが治まった。
－2月 5日 インタビューの日。まだ入院中。
the definition of asymptomatic (無症候性の定義) と，他者も本人も気づかないような軽症のウイルス感染前駆症状，との違いについては議論があると思われるが，注目すべき事として，オリジナルの報告の改訂稿で，(この中国人女性から初めて感染した) ドイツの発端となった男性の症例が，回復して症状がなくなった後の，喀痰のウイルス量検査のフォローアップ follow-up viral load assays について触れられている : "Follow-up qRT-PCR assay により，その後の男性の喀痰中に高用量のウイルス a high viral load of 108 copies per milliliter が確認されており，最新の結果は 1月29日である" 。
著者の結論: "回復期の患者の喀痰中で高用量のウイルス 2019-nCoV and a high sputum viral load が確認されたことから，回復後も長期にウイルスの排出が続くことへの懸念が生じた。ただし，患者からの検体の qRT-PCR 検査で確認された 2019-nCoV ウイルスの生存 the viability については，ウイルス培養で確認する必要がある]
[4] Clinical characteristics of 2019 novel coronavirus infection in China
情報源 Medrxiv 2020年2月9日
原著タイトル Clinical characteristics of 2019 novel coronavirus infection in China. MedRxiv. Posted online 9 Feb 2020. doi .
要約
...
方法: 1月29日までに 31の省・市の 552病院の患者 2019-nCoV ARD 1099人 patients with laboratory-confirmed のデータを用いた。
結果: 平均年齢は 47.0歳。女性が 41.90%。野生動物との接触歴があったのは，わずか 1.18%であったのに対し，31.30% が武漢市 Wuhan を訪れ，71.80% に people from Wuhan との接触歴があった。
発熱 (87.9%) と咳 (67.7%) が最も多く見られる症状だった。下痢は uncommon。平均の潜伏期間は 3.0日 (range 0 to 24.0 days)。入院時のすりガラス様陰影 ground-glass opacity が，胸部 CT 検査の典型的な (50.00%) 放射線医学所見だった。非重症例と比較して，放射線医学的異常所見を伴わず，症状と rt-PCR 検査により診断される症例が，重症例でより多かった (23.87% vs. 5.20%)。82.1% の患者でリンパ球数減少が認められた。55 patients (5.00%) が集中治療室に入院し，15 (1.36%) が死亡した ...
結論: The 2019-nCoV epidemic spreads rapidly by human-to-human transmission. 2019-nCoV infection の患者の一部は，放射線医学検査で異常が認められなかった。疾患の重症度 (酸素飽和度，呼吸数，白血球・リンパ球数，胸部X線/CT 所見など) が臨床的予後の指標となる。
［Mod.MPP 注－アウトブレイクの覚知から約 2か月，確定診断ができるようになってわずか 1か月であることを考えると，今回の報告は，広い範囲の多数の患者で，症例の臨床および疫学的特徴を明らかにする良い試みである。
要約には記載されていない (全文中の) 興味深い記述は，発熱は最もよく見られる症状であるが，受診時に発熱が確認された患者はわずか 43.8% にすぎず，87.9% が入院後に (発熱の) 症状が現れていたことから，当初の「受診時に発熱のある呼吸器疾患」として観察される，とは限らない。下痢が見られたのは 3.7% で，嘔吐は 5.0% of cases で観察されている。the source URL にある表には，画像も含む生のデータが示されている]
[5] 検査の偽陰性 False negative NAT tests: comment/query
投稿者 York Region Public Health，Richard Gould 2020年2月10日
"gold standard" との比較なしで，偽陰性率をどのようにして計算したかに興味がある。新型コロナウイルスについて，偽陽性や偽陰性の正確な算出のための a "gold standard" が存在するだろうか？そしてインフルエンザシーズンのまっただ中で，かつ他の呼吸器疾患を起こす多数のウイルスも循環する中，もしも基本的に臨床症状に基づくものなら，偽陰性率を議論するのはチャレンジする価値がないのではないか wouldn't～ be challenging 。
［Mod.MPP 注－(検査の偽陰性に関する) 逸話的報告の多くがセンセーショナルに報じられている。現在用いられている the NAT tests の感度と特異度を評価する，きちんとした研究の必要性を議論することの価値がある]
[6] Selected media reports of transmission outside mainland China
A. 日本のクルーズ船 Japanese cruise ship
情報源 Kyodo News [日本語] 2020年2月11日
厚労省は 10日，横浜に停泊中のクルーズ船で新たに 65人の新型コロナウイルス感染が確認され，船内の 135人を含め，日本で確認された患者が 161人になったと発表した。運行会社は 66人としていたが，厚労省は重複があったのではないかとしている ... 約 3600人の乗員乗客らは，日本国内への感染拡大を防止するため，19日まで洋上の船内に隔離される予定。同船は 1月20日に横浜港を出港し，鹿児島，香港，ベトナム，台湾，沖縄を回って，2月3日に帰港した。到着時に感染が確認された患者は，日本国内で入院となっている。
B. Singapore
情報源 New Straits Times 2020年2月10日
シンガポール保健省は 10日，新たに 2名の患者を確認し，国内の患者は合計 45名になったと明らかにした。1月30日に武漢から帰還した 2歳のシンガポール人と，the Chingay 2020 event に従事していた，the Certis Cisco Centre の 37歳のシンガポール人の社員である ...
C. 英国：Coronavirus: number of confirmed UK cases rises from 4 to 8.
情報源 The Guardian 2020年2月10日
英国内の感染者数が，4人から 8人に倍増した。新たな 4人の患者は，診断された Brighton からロンドン London に移送され，特別なケアを受けている。Public Health England (PHE) はこのうち 2人は医療従事者であると明らかにした。英国内で診断された患者のうち，5人は先週 Brighton で感染が確認されたビジネスマン a businessman に近い関係がある ... 新たに確認されたうちの 1人は，the Brighton outbreak の中心にいる男性とともに，フランスのシャモニー近郊のスキーリゾート a resort near Chamonix への団体旅行に参加していた男性医師である。ほかの 3人もこのスキー旅行中に感染していた。The businessman はロンドン南部の St Thomas' hospital 病院で治療を受けており, この病院は NHS が指定するイングランドの高次感染症治療施設 the NHS's network of specialist high-consequence infectious diseases (HCID) treatment centres in England の １つとなっている。医師のウイルス検査が陽性となったことを受け，プライマリケア施設 A GP practice in Brighton, the County Oak Medical Centre は閉鎖されている。他の 4人の患者らは，ロンドン北部の the HCID unit at the Royal Free hospital で治療を受けている。ヨーク York でコロナウイルス陽性と診断された中国籍の 2名の患者は the HCID centre in Newcastle に入院中である ...
D. 香港：CHP follows up on 2 cases of novel coronavirus infection in Hong Mei House, Cheung Hong Estate
情報源 Hong Kong Center for Health Protection Press Release 2020年2月11日
The Centre for Health Protection (CHP) of the Department of Health (DH) は 11日，2 cases of novel coronavirus infection in Hong Mei House, Cheung Hong Estate in Tsing Yi の調査を行っており，直ちに the 07 units of Hong Mei House 内でまだ診断されていない症例の洗い出しにとりかかると発表した。the 07 unit on different floors in Hong Mei House, Cheung Hong Estate で 11および 12例目となる，62歳と 75歳の症例が 1月30日に発表された ...
[7] WHO situation report 21 (as of 10 Feb 2020*)
情報源 World Health Organization 2020年2月10日
Highlights
- No new countries reported cases of 2019-nCoV in the past 24 hours.
... URL のウェブサイト，厚生労働省検疫所 FORTH 等参照願います。
● 新型コロナウイルス(40) 保有宿主動物，センザンコウ 中間宿主疑い
PRO/AH/EDR> Novel coronavirus (40): animal reservoir, pangolin poss intermediate host
Archive Number: 20200210.6972104
情報源 Nature 2020年2月7日
中国の研究者が，中国伝統医学の薬品として用いられることもある，長い鼻でアリを食べるほ乳類のセンザンコウ pangolins が，コロナウイルスアウトブレイクの，動物の感染源である可能性があると報告した。科学者らは，遺伝子解析に基づいたこの仮説は妥当だが，まだ全文が公開されていないので注意が必要としている ... 2019-nCoV と命名されたこのウイルスの，動物の感染源の特定は，研究者らが答えを追い求めている重要な疑問の 1つである。コロナウイルスは，ほ乳類と鳥類の間で循環していることが知られており，他の既知のコロナウイルスと遺伝子配列が類似していることから，コウモリ由来であるとの示唆がすでにされている。しかしこのウイルスがヒトに感染伝播したのは，他の動物からである可能性が高い ... 研究者のうちの 2人が，動物(センザンコウ)から得られたコロナウイルスと，アウトブレイクで感染したヒトや汚染されたものからのコロナウイルスとを，遺伝学的に比較し，the potential source of 2019-nCoV 感染源の候補がセンザンコウであることを突き止めた，としている。遺伝子配列が 99% 一致していたと, 2月7日に記者会見で明らかにした。これ以前，センザンコウがコロナウイルス感染で死亡する可能性があることと，2019-nCoV とセンザンコウから得られたコロナウイルスが細胞に感染する際に，同じ分子構造を持つレセプター (受容体) を使用することが指摘されていた。センザンコウはこれ以前から，可能性の高い新型コロナウイルスの中間宿主 a good candidate とされており，このように近い遺伝子配列を有することはとても興味深いと，英国の研究者も述べている。センザンコウは保護動物であるにもかかわらず，違法な取引が広く行われており，絶滅危惧種となっている。食用肉や鱗，また伝統医学の医薬品として売られている ... 1月に北京の科学者が，ヘビが 2019-nCoV の感染源と主張したが他の研究者によって否定された ...
写真 a picture of a Chinese pangolin, _Manis pentadactyla_,
関連項目
Novel coronavirus (39): China, global, false negative NAT tests, WHO 20200209.6972103
無症候性症例からの感染伝播，センザンコウ 中間宿主疑い
● 小反芻獣疫－モロッコ ヤギ OIE
Peste des petits ruminants, Morocco，Recurrence of a listed disease
PRO/AH/EDR> Peste des petits ruminants - Morocco: (TC) goats, OIE
Archive Number: 20200210.6975540
情報源 OIE, WAHID (World Animal Health Information Database), weekly disease information 2020; 33(07) 2020年2月7日
感染開始時期 21 Jan 2020
前回流行時期 3 Sep 2015
原因ウイルス Peste des petits ruminants virus
新たな感染流行(1)
Outbreak 1: Daidat, Hjar Ennahal, Tanger-Assilah, Tanger-Tetouan-Al Hoceima: farm
感染した種/頭数/症例数/死亡/殺処分・廃棄/処理
ヤギ Goats / 140 / 92 / 68 / 0 / 0
● トマトウイルス，トウガラシ－オーストラリア
PRO/PL> Tomato mottle mosaic virus, capsicum seed - Australia: interception
Archive Number: 20200210.6976116
情報源 Australasian Plant Disease Notes 2020年2月7日
Since April 2019, all capsicum and tomato seeds imported to Australia have been tested for ToBRFV as a part of regulations imposed by the Department of Agriculture. In May 2019, an imported shipment of approximately 6000 capsicum seeds was submitted for testing on-shore. A total of 15 sub-samples (400 seeds per sample) was tested using a one-step RT-PCR. Nine [sub-samples] produced an amplicon of 811 base pairs (bp). Sequencing indicated a 98%-99% nucleotide (nt) identity to the same region in ToMMV isolates and less than 90% nt identity to ToBRFV, ToMV, and TMV isolates. Sequences [were] confirmed by high throughput sequencing and bioinformatics analysis.
● 新型コロナウイルス(41) 中国 無症候性症例からの感染伝播 WHO
PRO/AH/EDR> Novel coronavirus (41): China, global, clinical pics, asymptomatic trans., WHO
Archive Number: 20200210.6976117
In this update:
[1] 中国: China National Health Commission 11 Feb 2020
[2] Global update: Johns Hopkins CSSE [accessed at 7:15 p.m. GMT-5]
[3] Asymptomatic transmission
[4] Clinical characteristics of 2019 novel coronavirus infection in China
[5] False negative NAT tests: comment/query
[6] Selected media reports of transmission outside of Mainland China
[7] WHO situation report 21 (as of 10 Feb 2020*)
[1] 中国: China National Health Commission 11 Feb 2020
Update on the epidemic situation of new coronavirus pneumonia as of 24:00 on 10 Feb [2020]
情報源 China National Health Commission [in Chinese] 2020年2月11日
At 04:00 on [10 Feb 2020], 31 provinces (autonomous regions, municipalities) and the Xinjiang Production and Construction Corps reported that 2478 new cases were confirmed (2097 in Hubei), adding 849 severe cases (839 in Hubei). There were 108 deaths (103 cases in Hubei and 1 each in Beijing, Tianjin, Heilongjiang, Anhui, and Henan) and 3536 suspected cases (1814 in Hubei).
On the same day, 716 new cases were cured and discharged (427 cases in Hubei), and 26 724 close contacts were lifted from medical observation.
As of 20:00 on [10 Feb 2020], according to reports from 31 provinces (autonomous regions and municipalities) and the Xinjiang Production and Construction Corps, there were 37 726 confirmed cases (of which 7333 were severe cases), and a total of 3996 discharged patients were cured (1 in Zhejiang province) A total of 1016 deaths were reported; 42 638 confirmed cases were reported (12 cases were subtracted from Zhejiang nuclear, and 1 case was increased from Jiangxi nuclear) ...
[2] Global update: Johns Hopkins CSSE [accessed at 10:40 p.m. GMT-5]
情報源 Johns Hopkins CSSE (Center for Systems Science and Engineering) 2020年2月11日
Confirmed cases
(2 Feb 2020 / 3/ 4(early) / 4(end of day) / 5/ 6/ 7/ 8/ 9/ 9late / Country/Region
17 187 / 19 693 / 20 636 / 23 746 / 27 396 / 30 553 / 34 524 / 37 174 / 37 199 / 40 157 / 42 310 / 中国本土
20 / 20 / 20 / 22 / 22 / 45 / 25 / 25 / 26 / 26 / 26 / 26 / 日本 ...
Total reported deaths: 1013
湖北省 Hubei Mainland China: 974 deaths
河南省 Henan Mainland China: 6 deaths
黒竜江省 Heilongjiang Mainland China: 7 deaths
Data sources: WHO, CDC, ECDC, NHC, and DXY
[3] 無症候性症例からの感染伝播 Asymptomatic transmission
2019-nCoV asymptomatic transmission in Germany - interview with Chinese index patient
投稿者 独・LMU Hospital Munich, Div. of Infectious Diseases and Tropical Medicine，Dr. Camilla Rothe 2020年2月10日
1月30日投稿の我々のレター our letter published in the New England Journal of Medicine (Rothe C et al., "Transmission of 2019-nCoV Infection from an Asymptomatic Contact in Germany") を批判する論調 alleged fraud がここ数日間寄せられた。その論点は，真に "asymptomatic (無症候性) " の患者としてよい rightly termed のか，それとも何らかの前駆症状を示していたのではないのか，という疑問である。現在の状況を考えると，われわれの観察をできるだけ早く医療界に伝えたいと思っている。従って我々の出した結論は主に，受け持った患者の所見に基づくもので，患者らは 3日間の集中会議やワークショップで，呼吸感染症を疑わせる臨床所見に気づかれていない中国人の発端となった患者とともに過ごしていた。レターが掲載されるまで，われわれはこの中国人の患者と直接話す機会はなかった。そして，中国に戻った発端患者と電話で話す機会が与えられ，ドイツ国内滞在中に何らかの症状があった可能性を聞くことができた ... According to the personal opinion of the authors, the message of our initial letter still stands.
Link to the new appendix:
［Mod.MPP 注－The supplementary appendix に the actual interview with the patient が入っている。
ー1月19日 上海を出発し，直行便でミュンヘンに到着。後ろの席で咳をする乗客あり。
－1月20日 1st meeting day, No symptoms whatsoever during the workday. 少し熱かったが，発熱ではないと感じた。999という中国の市販薬を1錠服用 (女性によるとアセトアミノフェンが含まれている)。翌日に備えて念のため服用したもので，ドイツ滞在中に服用した薬剤は，これのみ。
－1月21日 午後3時以降疲労を感じたが時差のせいだと考えた。筋肉や肋骨のある部分を触った時に少しの痛みがあった。熱感はなく，他の症状もなかった。
－1月22日 午後6時まで終日会議。朝，薄着 light business attire だったため少し寒く案じたが，ショールを羽織ったあとは感じなくなった。午後10時20分にミュンヘンを離れた。
－1月23日 現地時間午後4時に上海に到着し,やや疲労感があった以外は問題なし。 同日夕刻に体調が悪くなったと報告している ("This is the 1st moment I recognized getting sick.")。深夜に体温を測定したところ 38℃で，局所の胸の痛みも感じていた。
－1月24日 一日忙しくしていたが，夕方に 38.7℃。
－1月25日 医師の診察を受け入院。
－1月26日 時々，乾性咳嗽が出始めた。
－1月27日 別の病院に搬送。
－1月28日 湿性咳嗽に変化，3日間続いたが治まった。
－2月 5日 インタビューの日。まだ入院中。
the definition of asymptomatic (無症候性の定義) と，他者も本人も気づかないような軽症のウイルス感染前駆症状，との違いについては議論があると思われるが，注目すべき事として，オリジナルの報告の改訂稿で，(この中国人女性から初めて感染した) ドイツの発端となった男性の症例が，回復して症状がなくなった後の，喀痰のウイルス量検査のフォローアップ follow-up viral load assays について触れられている : "Follow-up qRT-PCR assay により，その後の男性の喀痰中に高用量のウイルス a high viral load of 108 copies per milliliter が確認されており，最新の結果は 1月29日である" 。
著者の結論: "回復期の患者の喀痰中で高用量のウイルス 2019-nCoV and a high sputum viral load が確認されたことから，回復後も長期にウイルスの排出が続くことへの懸念が生じた。ただし，患者からの検体の qRT-PCR 検査で確認された 2019-nCoV ウイルスの生存 the viability については，ウイルス培養で確認する必要がある]
[4] Clinical characteristics of 2019 novel coronavirus infection in China
情報源 Medrxiv 2020年2月9日
原著タイトル Clinical characteristics of 2019 novel coronavirus infection in China. MedRxiv. Posted online 9 Feb 2020. doi .
要約
...
方法: 1月29日までに 31の省・市の 552病院の患者 2019-nCoV ARD 1099人 patients with laboratory-confirmed のデータを用いた。
結果: 平均年齢は 47.0歳。女性が 41.90%。野生動物との接触歴があったのは，わずか 1.18%であったのに対し，31.30% が武漢市 Wuhan を訪れ，71.80% に people from Wuhan との接触歴があった。
発熱 (87.9%) と咳 (67.7%) が最も多く見られる症状だった。下痢は uncommon。平均の潜伏期間は 3.0日 (range 0 to 24.0 days)。入院時のすりガラス様陰影 ground-glass opacity が，胸部 CT 検査の典型的な (50.00%) 放射線医学所見だった。非重症例と比較して，放射線医学的異常所見を伴わず，症状と rt-PCR 検査により診断される症例が，重症例でより多かった (23.87% vs. 5.20%)。82.1% の患者でリンパ球数減少が認められた。55 patients (5.00%) が集中治療室に入院し，15 (1.36%) が死亡した ...
結論: The 2019-nCoV epidemic spreads rapidly by human-to-human transmission. 2019-nCoV infection の患者の一部は，放射線医学検査で異常が認められなかった。疾患の重症度 (酸素飽和度，呼吸数，白血球・リンパ球数，胸部X線/CT 所見など) が臨床的予後の指標となる。
［Mod.MPP 注－アウトブレイクの覚知から約 2か月，確定診断ができるようになってわずか 1か月であることを考えると，今回の報告は，広い範囲の多数の患者で，症例の臨床および疫学的特徴を明らかにする良い試みである。
要約には記載されていない (全文中の) 興味深い記述は，発熱は最もよく見られる症状であるが，受診時に発熱が確認された患者はわずか 43.8% にすぎず，87.9% が入院後に (発熱の) 症状が現れていたことから，当初の「受診時に発熱のある呼吸器疾患」として観察される，とは限らない。下痢が見られたのは 3.7% で，嘔吐は 5.0% of cases で観察されている。the source URL にある表には，画像も含む生のデータが示されている]
[5] 検査の偽陰性 False negative NAT tests: comment/query
投稿者 York Region Public Health，Richard Gould 2020年2月10日
"gold standard" との比較なしで，偽陰性率をどのようにして計算したかに興味がある。新型コロナウイルスについて，偽陽性や偽陰性の正確な算出のための a "gold standard" が存在するだろうか？そしてインフルエンザシーズンのまっただ中で，かつ他の呼吸器疾患を起こす多数のウイルスも循環する中，もしも基本的に臨床症状に基づくものなら，偽陰性率を議論するのはチャレンジする価値がないのではないか wouldn't～ be challenging 。
［Mod.MPP 注－(検査の偽陰性に関する) 逸話的報告の多くがセンセーショナルに報じられている。現在用いられている the NAT tests の感度と特異度を評価する，きちんとした研究の必要性を議論することの価値がある]
[6] Selected media reports of transmission outside mainland China
A. 日本のクルーズ船 Japanese cruise ship
情報源 Kyodo News [日本語] 2020年2月11日
厚労省は 10日，横浜に停泊中のクルーズ船で新たに 65人の新型コロナウイルス感染が確認され，船内の 135人を含め，日本で確認された患者が 161人になったと発表した。運行会社は 66人としていたが，厚労省は重複があったのではないかとしている ... 約 3600人の乗員乗客らは，日本国内への感染拡大を防止するため，19日まで洋上の船内に隔離される予定。同船は 1月20日に横浜港を出港し，鹿児島，香港，ベトナム，台湾，沖縄を回って，2月3日に帰港した。到着時に感染が確認された患者は，日本国内で入院となっている。
B. Singapore
情報源 New Straits Times 2020年2月10日
シンガポール保健省は 10日，新たに 2名の患者を確認し，国内の患者は合計 45名になったと明らかにした。1月30日に武漢から帰還した 2歳のシンガポール人と，the Chingay 2020 event に従事していた，the Certis Cisco Centre の 37歳のシンガポール人の社員である ...
C. 英国：Coronavirus: number of confirmed UK cases rises from 4 to 8.
情報源 The Guardian 2020年2月10日
英国内の感染者数が，4人から 8人に倍増した。新たな 4人の患者は，診断された Brighton からロンドン London に移送され，特別なケアを受けている。Public Health England (PHE) はこのうち 2人は医療従事者であると明らかにした。英国内で診断された患者のうち，5人は先週 Brighton で感染が確認されたビジネスマン a businessman に近い関係がある ... 新たに確認されたうちの 1人は，the Brighton outbreak の中心にいる男性とともに，フランスのシャモニー近郊のスキーリゾート a resort near Chamonix への団体旅行に参加していた男性医師である。ほかの 3人もこのスキー旅行中に感染していた。The businessman はロンドン南部の St Thomas' hospital 病院で治療を受けており, この病院は NHS が指定するイングランドの高次感染症治療施設 the NHS's network of specialist high-consequence infectious diseases (HCID) treatment centres in England の １つとなっている。医師のウイルス検査が陽性となったことを受け，プライマリケア施設 A GP practice in Brighton, the County Oak Medical Centre は閉鎖されている。他の 4人の患者らは，ロンドン北部の the HCID unit at the Royal Free hospital で治療を受けている。ヨーク York でコロナウイルス陽性と診断された中国籍の 2名の患者は the HCID centre in Newcastle に入院中である ...
D. 香港：CHP follows up on 2 cases of novel coronavirus infection in Hong Mei House, Cheung Hong Estate
情報源 Hong Kong Center for Health Protection Press Release 2020年2月11日
The Centre for Health Protection (CHP) of the Department of Health (DH) は 11日，2 cases of novel coronavirus infection in Hong Mei House, Cheung Hong Estate in Tsing Yi の調査を行っており，直ちに the 07 units of Hong Mei House 内でまだ診断されていない症例の洗い出しにとりかかると発表した。the 07 unit on different floors in Hong Mei House, Cheung Hong Estate で 11および 12例目となる，62歳と 75歳の症例が 1月30日に発表された ...
[7] WHO situation report 21 (as of 10 Feb 2020*)
情報源 World Health Organization 2020年2月10日
Highlights
- No new countries reported cases of 2019-nCoV in the past 24 hours.
... URL のウェブサイト，厚生労働省検疫所 FORTH 等参照願います。
● 新型コロナウイルス(40) 保有宿主動物，センザンコウ 中間宿主疑い
PRO/AH/EDR> Novel coronavirus (40): animal reservoir, pangolin poss intermediate host
Archive Number: 20200210.6972104
情報源 Nature 2020年2月7日
中国の研究者が，中国伝統医学の薬品として用いられることもある，長い鼻でアリを食べるほ乳類のセンザンコウ pangolins が，コロナウイルスアウトブレイクの，動物の感染源である可能性があると報告した。科学者らは，遺伝子解析に基づいたこの仮説は妥当だが，まだ全文が公開されていないので注意が必要としている ... 2019-nCoV と命名されたこのウイルスの，動物の感染源の特定は，研究者らが答えを追い求めている重要な疑問の 1つである。コロナウイルスは，ほ乳類と鳥類の間で循環していることが知られており，他の既知のコロナウイルスと遺伝子配列が類似していることから，コウモリ由来であるとの示唆がすでにされている。しかしこのウイルスがヒトに感染伝播したのは，他の動物からである可能性が高い ... 研究者のうちの 2人が，動物(センザンコウ)から得られたコロナウイルスと，アウトブレイクで感染したヒトや汚染されたものからのコロナウイルスとを，遺伝学的に比較し，the potential source of 2019-nCoV 感染源の候補がセンザンコウであることを突き止めた，としている。遺伝子配列が 99% 一致していたと, 2月7日に記者会見で明らかにした。これ以前，センザンコウがコロナウイルス感染で死亡する可能性があることと，2019-nCoV とセンザンコウから得られたコロナウイルスが細胞に感染する際に，同じ分子構造を持つレセプター (受容体) を使用することが指摘されていた。センザンコウはこれ以前から，可能性の高い新型コロナウイルスの中間宿主 a good candidate とされており，このように近い遺伝子配列を有することはとても興味深いと，英国の研究者も述べている。センザンコウは保護動物であるにもかかわらず，違法な取引が広く行われており，絶滅危惧種となっている。食用肉や鱗，また伝統医学の医薬品として売られている ... 1月に北京の科学者が，ヘビが 2019-nCoV の感染源と主張したが他の研究者によって否定された ...
写真 a picture of a Chinese pangolin, _Manis pentadactyla_,
関連項目
Novel coronavirus (39): China, global, false negative NAT tests, WHO 20200209.6972103