COVID-19(11)(12) 中国 イラン クルーズ船 センザンコウ疑い
麻疹－チャド，中央アフリカ，英国
● COVID-19(12) 中国，イラン クルーズ船疫学情報 WHO
PRO/AH/EDR> COVID-19 update (12): China, global, Iran, cruise ship epidemiology, WHO
Archive Number: 20200220.7009533
In this update:
[1] China: China National Health Commission 20 Feb 2020
[2] Global update: Johns Hopkins CSSE [accessed at 7:20 p.m. GMT-5]
[3] Iran (Qom): 3 additional cases confirmed, RFI
[4] Epidemiology of COVID-19 on Diamond Princess
[5] Selected media reports of transmission outside of mainland China
[1] 中国
Update on the epidemic situation of new coronavirus pneumonia as of 24:00 on [20 Feb 2020]
情報源 China National Health Commission [in Chinese] 2020年2月20日
At 04:00 on [20 Feb 2020], 31 provinces (autonomous regions and municipalities) and the Xinjiang Production and Construction Corps reported 889 new confirmed cases and 118 new deaths (115 in Hubei and 1 each in Zhejiang, Chongqing, and Yunnan). There were 1614 new suspected cases.
On the same day, 2109 new cases were cured and discharged, ...
As of 24:00 on [20 Feb 2020], according to reports from 31 provinces (autonomous regions, municipalities) and the Xinjiang Production and Construction Corps, there were 54 965 confirmed cases (among which 11 633 were severe cases), 18 264 were cured and discharged, and 2236 had died. A total of 75 465 confirmed cases have been reported, and 5206 suspected cases have been reported. ...
［Mod.MPP 注－中国国内で 75 465 cases of confirmed COVID-19 が報告されており，この 24時間に 889 cases, of which 631 (71.0%) were in Hubei 湖北省 だった。昨日の 394名から 889名に増えたが，1月下旬から 2月上旬に報告された 1日あたり 2000-3000名よりも少ない。WHO は仕事や学校の再開に伴う増加の可能性に注意が必要としてい]
地図 A good map of China showing provinces
[2] Global update: Johns Hopkins CSSE [accessed at 7:20 p.m. GMT-5]
情報源 Johns Hopkins CSSE (Center for Systems Science and Engineering) 2020年2月20日
Confirmed cases
2 Feb 2020 / ... / 18 / 19 / 20 Feb 2020 / Country / Region
17 187 / ... / 74 135 / 74 576 / 75 004 / Mainland China
20 / ... / 74 / 84 / 94 / Japan
18 / ... / 81 / 84 / 84 / Singapore
15 / ... / 31 / 31 / 104 / South Korea ...
0 / ... / 542 / 621 / 634 / Others (Diamond Princess)
Data sources: WHO, CDC, ECDC, NHC, and DXY
［Mod.MPP 注－ ... 韓国で 24時間に 73例の増加があった ... ]
[3] Iran (Qom): 3 additional cases confirmed, RFI
A.
情報源 Entekhab.ir [in Farsi] 2020年2月20日
Qom から Tehran に 5例の疑い患者 suspected coroners が移送されたとの発表に続き，保健当局者 the head of the Ministry of Health's Public Relations and Information Center は，イランへの感染伝播経路は未だ解明されていない，と述べた ...
B.
情報源 Al Jezeera 2020年2月20日
the city of Qom で2人が死亡した翌日，イラン国内で新たに 3例のコロナウイルス感染が確認された。これまでに 5例の感染が確認されている。 "20日に新たに確認された 3例は 2 in Qom and 1 in Araq in central Iran であり，Araq の感染例は医師だった" と述べ，イランへのウイルス伝播経路は不明と説明した ... 18日のイランでの死亡例は，中東地域では初めての死者で，中国国外においても 7例目と 8例目のウイルス感染による死者だった。これらの患者は，中国籍を含む外国人との接触歴は確認されていない。保健省は，首都テヘランから 140 km 離れた Qom の宗教施設への出入りを制限している。同市内の学校および大学も閉鎖されている。Qom の人々は落ち着いており，マスクをすることなくカフェで寛いでいると，the online website Qom News の編集者が市内の様子を伝えている。3カ所の病院がウイルス感染患者を受け入れることになっており，政府系の医師らは休暇の取得を中止させられ，全病院が警戒態勢に入っている ... 他の複数の都市でも，疑い例に対する検査が行われている，との情報もある。the northern city of Babol でも 2人の患者がウイルス感染を疑われ隔離された，と述べている ...
［Mod.MPP 注－Qom は，イスラム教シーア派の重要な巡礼地の 1つ a major pilgrimage location for the Shiite Islam followers で，多数の人の出入りがある場所である。イランはインフルエンザシーズンのピークに入っており，influenza B を中心に感染が拡がっているとの報道もある。インフルエンザの患者と the SARS-CoV2 の患者を見分けることは至難の業となるであろう。3人のうちの 1人が医師であることは注目すべきで，どこに勤務し，症状があったときに診察を行っていたかの情報は与えられていない。発表より多い 9人が死亡している，との情報にも触れているが，ProMED-mail が噂の製造所にならないよう，信頼できる情報筋からの提供を歓迎する]
地図 A good map of Iran showing provinces
[4] Epidemiology of COVID-19 on Diamond Princess (クルーズ船内の状況)
情報源 Japan National Institute of Infectious Diseases (NIID) [日本語] 2020年2月18日
（抜粋）
背景
クルーズ船ダイアモンドプリンセス号（以下クルーズ船）は、2020年1月20日、横浜港を出発し、鹿児島、香港、ベトナム、台湾、および沖縄に立ち寄り、2月3日に横浜港に帰港した。この航行中の1月25日に香港で下船した乗客が、1月19日から咳をみとめ、1月30日に発熱し、2月1日に新型コロナウイルス陽性であることが確認された ... 2月3日からの2日間、全乗員乗客の健康診断が検疫官により行われ、症状のある人、およびその濃厚接触者から新型コロナウイルスの検査実施のために咽頭ぬぐい液が採取された。2月5日に検査結果よりCOVID-19陽性者が確認されたことから、クルーズ船に対して同日午前7時より14日間の検疫が開始された。この時点でクルーズ船には、乗客2,666人、乗員1,045人、合計3,711人が乗船していた。
検疫の状況
乗員には個人防護具。2月7日乗客には体温計が配布、発熱コールセンターへ連絡する健康観察が開始。発熱した乗客は船内の医療チームに照会され、新型コロナウイルスの検査が行われた。COVID-19陽性者は下船し、国内の病院に入院し治療、隔離。 ... 陰性であった場合は、陽性患者との最終接触日から14日間船内での隔離となった。 ... 一部の乗員は、船の運航を維持するために、検疫下においても限定的ではあるものの勤務を継続した。
データ収集
当初は有症状者とその濃厚接触者に対してのみ，その後の検査体制の整備拡大に伴い、2月11日に 80歳以上の高齢者と糖尿病や心疾患等の基礎疾患を有する人から（年齢順に）検体採取が開始 ... 。
暫定的な結果
2月18日の時点で、65名の乗員と466名の乗客を含む、531名が確定例であった（2月5日時点の乗船者の14.3％）。 ... 終日検疫が実施された 2月6日より前に発症した人が 33名（18％）、2月6日以降に発症した人が151名（82％）。確定例のうち255名（48％、乗員8名、乗客247名）は、検体が採取された時点では無症状（下船後の発症の有無はは不明） ...
暫定的な結論
2月5日にクルーズ船で検疫が開始される前にCOVID-19の実質的な伝播が起こっていたことが分かる ... 2月19日に近づくにつれ、感染伝播は乗員あるいは客室内で発生している傾向。
暫定的対応とガイダンス
14日間の検疫を終了し、かつ、検査陰性で、14日目の健康診断で異常が確認されなかった者（そのほとんどが乗客）は2月19日から順次下船が開始される(原稿記載時)。
確定例との接触がある者は、最終接触日から14日間が隔離期間となる。この該当者には隔離期間中の乗客に対する食事の配膳等の生活支援に貢献していた、乗員の大半が含まれる。
A. Japanese cruise ship: 2 deaths
情報源 AP 2020年2月20日
ダイアモンドプリンセス号の乗客であった，ともに 80歳代の日本人の高齢者 2名が，新型ウイルスの感染により死亡したと，20日厚労省が発表した。ウイルス感染が拡がった船内で初めての死者となった ... 死亡した 2名は，2月5日の船内の検疫開始時の健康診断を受ける前に，すでに感染していたと見られている。2月11日と12日にそれぞれ入院となり，翌日にウイルス検査陽性が確認されていた。なぜ症状があり医療室を受診していたもっと早い時期に検査が行われていなかったのかは不明 ... やや長文。
B. South Korea: 73 new cases
情報源 NPR 2020年2月20日
韓国国内の患者が，24時間で 51人から 2倍の 104人となったと，20日 保健当局 the Korea Centers for Disease Control and Prevention が明らかにした。患者の多くが a Christian sect in Daegu (南部・大邸市＝Taegu) に関係していた。Korea's CDC は 18日，国内 31例目となる感染例の女性は，the Shincheonji Church of Jesus，The Temple of the Tabernacle of the Testimony と呼ばれる宗教団体が催した行事 services に参加していたと明らかにしていた。この女性は 1959年生まれの 60歳で，武漢市を訪れていた。1160人の接触者があると報告されている。
C. Canada (BC) ex Iran
情報源 Tri City News 2020年2月20日
イランから帰国した British Columbia 州の 30歳代の女性が，6例目の新型コロナウイルス感染例と確認されたと，20日保健当局者 Provincial health officer が明らかにし，女性の症状は比較的軽症で，接触者は隔離されていると述べた ... 最近，イランで患者が報告され始めていた ... 今週初め，すでにウイルス感染が診断された 5名中 4名は無症状と説明されている。上海から帰国した 5例目の 30歳代の女性は自宅 her home in B.C.'s Interior 待機している。B.C. では 500人以上がウイルス検査を受け，そのうちの多くがインフルエンザ検査で陽性だったという。Ontario 州でも 3例のウイルス患者が確認されている。
［Mod.MPP 注－イラン国内でのウイルス感染循環の可能性。(6例目の患者の) 渡航時期とイラン国内外を含めた渡航先に興味が持たれる。 ... ]
[6] WHO situation report 31 (as of 20 Feb 2020*)
情報源 World Health Organization 2020年2月20日
Highlights
- One new country (Islamic Republic of Iran) reported cases of COVID-19 in the past 24 hours.
- 中国の患者報告分類から "clinically diagnosed (湖北省で使用)" を廃止し，すべての地域で "suspected" and "confirmed (検査による確定が必要)" のみを使用する。"clinically diagnosed" cases のうち，検査で陰性が確認されたものは (報告患者数から) 棄却される。
● COVID-19(11) 保有動物，中間宿主 センザンコウ疑い
PRO/AH/EDR> COVID-19 update (11): animal reservoir, intermediate hosts, pangolin susp.
Archive Number: 20200220.7009213
情報源 People's Daily Online [in Chinese] 2020年2月15日
15日 the State Council's Joint Prevention and Control System の記者会見で，保健当局者 director of the Department of Social Development and Science & Technology in the Ministry of Science and Technology が，ウイルスの由来の疫学調査が非常に重要と述べた ... ウイルス学研究所 the Chinese Center for Disease Control and Prevention's Virology Institute は 585件の海鮮市場内の環境および動物 environmental and animal samples from the Huanan Seafood Market および武漢市内の many fresh markets を調査し，このうち 33件が novel coronavirus 陽性で，31件は野生動物が売られていた the Western District [of Huanan] の検体だった。このような (陽性例が) 集中した結果から，アウトブレイクには野生動物の取引が関与した可能性があると考える。たとえば，最近動物衛生当局 the team of the China Animal Health and Epidemiology Center は 4800頭以上のブタ，家きん，イヌ，ネコなどの動物から検体を採取し検査したが，すべて陰性との結果を得ている。暫定的ながら，新型コロナウイルスは，家きんや家畜由来ではないとしてよいだろう。遺伝子解析結果の比較からも，コウモリが自然界の宿主である可能性が高いとの結果が示されている。様々な研究から，新型コロナウイルスの感染経路は，経気道および接触感染が主な伝播経路とされている。後向きの検討では，新型コロナウイルス肺炎の患者の便から，新型コロナウイルスが分離されている ...
センザンコウ pangolin が新型コロナウイルスの中間宿主の 1つであるかも知れない，とのthe South China Agricultural University team's suggestion に関し，この仮説を検証するための科学調査チームが編成されている。センザンコウからヒトへの新型コロナウイルス感染伝播に関する研究も進められている。
［Mod.AS 注－ ブタなどからの 4800件の動物の検体すべてが検査で陰性であったというのは，(野生?) 動物の検体が華南市場 the Huanan Seafood Market の環境から採取された検体 the "environmental" material に含まれていた，という情報とともに [?]，新たな情報である ... 華南市場はアウトブレイク開始直後に消毒作業が行われてしまったため，市場の野生動物の中からウイルスの感染源を特定することは困難である。2019-nCoV と近い関係にあるコロナウイルスの 1種が，2013年に雲南省のコウモリ a _Rhinolophus affinis_ bat in Yunnan で確認されているが，他の野生動物種から，これに近いウイルス closely related viruses が分離されたことはない。
中間宿主動物の調査を行った中国の研究チームの報告の要約：
中国南部の密輸捜査 anti-smuggling operations で捕獲されたセンザンコウ pangolins (_Manis javanica_) で，2019-nCoV-related coronaviruses を発見したので報告する。遺伝子解析 Metagenomic sequencing の結果，このセンザンコウコロナウイルス pangolin-associated CoVs は 2 sub-lineages of 2019-nCoV-related coronaviruses に属し，１つはレセプター結合ドメイン領域が 2019-nCoV と非常に近い関係にあった。複数の種類のセンザンコウコロナウイルス multiple lineages of pangolin coronavirus が発見され，それらと 2019-nCoV に相同性が確認されたことから，センザンコウが，新型ヒトコロナウイルスの中間宿主である可能性を検討すべきであり，生きものを売る市場から取り除かなければならない"。テストされたサンプルが採取された時期，対象動物および地域は，August 2017-January 2018 from Malayan pangolins (_Manis javanica_) obtained during anti-smuggling operations by Guangxi Customs 広西壮族自治区税関であった。2019年3月に貴州省 Guangzhou の密輸で押収されたセンザンコウでも，同様の所見が得られている。]
関連項目
COVID-19 update (08): companion animals, RFI 20200218.7002276
● ベネズエラウマ脳炎，ウマ－ベリーズ OIE
Venezuelan equine encephalomyelitis, Belize，reoccurrence of a listed disease
PRO/AH/EDR> Venezuelan equine encephalitis - Belize: (CZ) horse, OIE
Archive Number: 20200220.7008958
情報源 OIE, WAHIS (World Animal Health Information System), weekly disease information 2020 2020年2月15日
感染開始時期 30 Oct 2019
前回流行時期 12 Dec 2014
原因ウイルス Venezuelan equine encephalomyelitis virus
新たな感染流行(1)
Outbreak location 1: Little Belize area, Corozal South, Newland, Corozal: farm
Outbreak status: resolved on 12 Feb 2020
感染した種/頭数/症例数/死亡/殺処分・廃棄/処理
Equidae / 5 / 4 / 4 / 0 / 0
Affected population: recently established Mennonite community in forested area in the north of Belize. Horses used as draught animals and for transportation - horse and buggy.
● 麻疹－チャド/中央アフリカ共和国 WHO，英国
PRO/EDR> Measles update (07)
Archive Number: 20200220.7006260
[1] Chad, Central African Republic: WHO
情報源 CIDRAP (Center for Infectious Disease Research & Policy) News 2020年2月18日
The WHO's African regional office によると，チャドと中央アフリカ共和国で麻疹のアウトブレイクが発生 are in the midst of measles outbreaks し，1月1日以降，患者数の増加が報告されている。
チャドでは 1276 cases, including 14 deaths since 1 Jan 2020 ... 78% にワクチンが接種されていなかった，と WHO が報告している。60% が 5歳未満の患者で，5歳から 14歳までが 19%，15歳以上が 14% と報告されている。
中央アフリカ共和国では，1498 suspected measles cases, including 15 deaths が報告。2019年初旬からアウトブレイクが続いていおり，2019年1月1日から 2020年2月9日までの患者数は 5724 suspected measles cases, including 83 deaths (case fatality rate, 1.45%) in 13 health districts が報告されている。およそ 3/4 が 5歳未満の小児である。
[2] 英国 (Wandsworth, London)
情報源 Local London 2020年2月17日
Wandsworth [London borough] では，2019年9月末以降，100例以上の麻疹患者が報告され，多くは学童と若年成人の患者である ...
[3] Research: Paramyxovirus enzyme complex structure
情報源 Scienmag 2020年2月17日
- パラミクソウイルス paramyxoviruses, a family of RNA viruses 内の，重要な酵素複合体の原子構造 atomic structure of a key enzyme complex を明らかにした初めての報告
- 酵素は RNA 分子の組み立てに与るため，新たな抗ウイルス薬 (開発の際) の作用部位となる
- (パラミクソウイルスとは) 異なる科に属するが，コロナウイルスも同様の動作を示す
- Researchers used cryo-EM, a revolutionary technique that gives a clear view of proteins
Northwestern University の研究者らが，初めて the 3D atomic structure of a key complex in paramyxoviruses の構造を決定した：同ウイルス科には，麻疹，ムンプス，ヒトパラインフルエンザ，respiratory syncytial virus (RSV) などのウイルスが属する。得られた情報は，これらのウイルスだけでなく，パラミクソウイルスと振る舞いが似るコロナウイルスに対しても，抗ウイルス薬のデザインや開発に役立つ ... 研究方法の説明など。
参考文献 Structure of a paramyxovirus polymerase complex reveals a unique methyltransferase-CTD conformation. PNAS. 2020; 201919837; https://doi.org/10.1073/pnas.1919837117
[4] 合併症 Measles complications：肝炎，虫垂炎，髄膜炎
Complications of measles can include hepatitis, appendicitis, and viral meningitis, doctors warn
情報源 Scienmag 2020年2月17日
2017年，世界中の麻疹による死者は 11万人に達し，ほとんどが幼いこどもだった。著者らは，感染が直接の原因となった付加的合併症のある 3例の麻疹患者を治療した。
1例目は，小児期に 1回目の麻疹ワクチン接種のみを受けていた若年男性で，肝炎を併発した。
2例目は，麻疹に伴って虫垂炎を併発した若年女性。
3例目は，かすみ目 blurred vision と激しい頭痛を訴えた中年男性で，麻疹感染に伴うウイルス性髄膜炎と診断された。
3例はいずれも適切な治療により完治し，後遺症は認められていない。しかし，麻疹感染により免疫システムが抑制され，全身のあらゆる臓器の合併症を伴っていると強調し，報告された全患者の約 1/3 に 1つ以上の合併症が見られたと指摘している。合併症として，肺炎，熱性けいれん，神経症状を引き起こす脳脊髄炎などが挙げられている ... SSPE (subacute sclerosing panencephalitis，亜急性硬化性汎脳炎) など。
原著タイトル Complications of measles: a case series. BMJ Case Rep. 2020; 13(2). doi: 10.1136/bcr-2019-232408;
麻疹－チャド，中央アフリカ，英国
● COVID-19(12) 中国，イラン クルーズ船疫学情報 WHO
PRO/AH/EDR> COVID-19 update (12): China, global, Iran, cruise ship epidemiology, WHO
Archive Number: 20200220.7009533
In this update:
[1] China: China National Health Commission 20 Feb 2020
[2] Global update: Johns Hopkins CSSE [accessed at 7:20 p.m. GMT-5]
[3] Iran (Qom): 3 additional cases confirmed, RFI
[4] Epidemiology of COVID-19 on Diamond Princess
[5] Selected media reports of transmission outside of mainland China
[1] 中国
Update on the epidemic situation of new coronavirus pneumonia as of 24:00 on [20 Feb 2020]
情報源 China National Health Commission [in Chinese] 2020年2月20日
At 04:00 on [20 Feb 2020], 31 provinces (autonomous regions and municipalities) and the Xinjiang Production and Construction Corps reported 889 new confirmed cases and 118 new deaths (115 in Hubei and 1 each in Zhejiang, Chongqing, and Yunnan). There were 1614 new suspected cases.
On the same day, 2109 new cases were cured and discharged, ...
As of 24:00 on [20 Feb 2020], according to reports from 31 provinces (autonomous regions, municipalities) and the Xinjiang Production and Construction Corps, there were 54 965 confirmed cases (among which 11 633 were severe cases), 18 264 were cured and discharged, and 2236 had died. A total of 75 465 confirmed cases have been reported, and 5206 suspected cases have been reported. ...
［Mod.MPP 注－中国国内で 75 465 cases of confirmed COVID-19 が報告されており，この 24時間に 889 cases, of which 631 (71.0%) were in Hubei 湖北省 だった。昨日の 394名から 889名に増えたが，1月下旬から 2月上旬に報告された 1日あたり 2000-3000名よりも少ない。WHO は仕事や学校の再開に伴う増加の可能性に注意が必要としてい]
地図 A good map of China showing provinces
[2] Global update: Johns Hopkins CSSE [accessed at 7:20 p.m. GMT-5]
情報源 Johns Hopkins CSSE (Center for Systems Science and Engineering) 2020年2月20日
Confirmed cases
2 Feb 2020 / ... / 18 / 19 / 20 Feb 2020 / Country / Region
17 187 / ... / 74 135 / 74 576 / 75 004 / Mainland China
20 / ... / 74 / 84 / 94 / Japan
18 / ... / 81 / 84 / 84 / Singapore
15 / ... / 31 / 31 / 104 / South Korea ...
0 / ... / 542 / 621 / 634 / Others (Diamond Princess)
Data sources: WHO, CDC, ECDC, NHC, and DXY
［Mod.MPP 注－ ... 韓国で 24時間に 73例の増加があった ... ]
[3] Iran (Qom): 3 additional cases confirmed, RFI
A.
情報源 Entekhab.ir [in Farsi] 2020年2月20日
Qom から Tehran に 5例の疑い患者 suspected coroners が移送されたとの発表に続き，保健当局者 the head of the Ministry of Health's Public Relations and Information Center は，イランへの感染伝播経路は未だ解明されていない，と述べた ...
B.
情報源 Al Jezeera 2020年2月20日
the city of Qom で2人が死亡した翌日，イラン国内で新たに 3例のコロナウイルス感染が確認された。これまでに 5例の感染が確認されている。 "20日に新たに確認された 3例は 2 in Qom and 1 in Araq in central Iran であり，Araq の感染例は医師だった" と述べ，イランへのウイルス伝播経路は不明と説明した ... 18日のイランでの死亡例は，中東地域では初めての死者で，中国国外においても 7例目と 8例目のウイルス感染による死者だった。これらの患者は，中国籍を含む外国人との接触歴は確認されていない。保健省は，首都テヘランから 140 km 離れた Qom の宗教施設への出入りを制限している。同市内の学校および大学も閉鎖されている。Qom の人々は落ち着いており，マスクをすることなくカフェで寛いでいると，the online website Qom News の編集者が市内の様子を伝えている。3カ所の病院がウイルス感染患者を受け入れることになっており，政府系の医師らは休暇の取得を中止させられ，全病院が警戒態勢に入っている ... 他の複数の都市でも，疑い例に対する検査が行われている，との情報もある。the northern city of Babol でも 2人の患者がウイルス感染を疑われ隔離された，と述べている ...
［Mod.MPP 注－Qom は，イスラム教シーア派の重要な巡礼地の 1つ a major pilgrimage location for the Shiite Islam followers で，多数の人の出入りがある場所である。イランはインフルエンザシーズンのピークに入っており，influenza B を中心に感染が拡がっているとの報道もある。インフルエンザの患者と the SARS-CoV2 の患者を見分けることは至難の業となるであろう。3人のうちの 1人が医師であることは注目すべきで，どこに勤務し，症状があったときに診察を行っていたかの情報は与えられていない。発表より多い 9人が死亡している，との情報にも触れているが，ProMED-mail が噂の製造所にならないよう，信頼できる情報筋からの提供を歓迎する]
地図 A good map of Iran showing provinces
[4] Epidemiology of COVID-19 on Diamond Princess (クルーズ船内の状況)
情報源 Japan National Institute of Infectious Diseases (NIID) [日本語] 2020年2月18日
（抜粋）
背景
クルーズ船ダイアモンドプリンセス号（以下クルーズ船）は、2020年1月20日、横浜港を出発し、鹿児島、香港、ベトナム、台湾、および沖縄に立ち寄り、2月3日に横浜港に帰港した。この航行中の1月25日に香港で下船した乗客が、1月19日から咳をみとめ、1月30日に発熱し、2月1日に新型コロナウイルス陽性であることが確認された ... 2月3日からの2日間、全乗員乗客の健康診断が検疫官により行われ、症状のある人、およびその濃厚接触者から新型コロナウイルスの検査実施のために咽頭ぬぐい液が採取された。2月5日に検査結果よりCOVID-19陽性者が確認されたことから、クルーズ船に対して同日午前7時より14日間の検疫が開始された。この時点でクルーズ船には、乗客2,666人、乗員1,045人、合計3,711人が乗船していた。
検疫の状況
乗員には個人防護具。2月7日乗客には体温計が配布、発熱コールセンターへ連絡する健康観察が開始。発熱した乗客は船内の医療チームに照会され、新型コロナウイルスの検査が行われた。COVID-19陽性者は下船し、国内の病院に入院し治療、隔離。 ... 陰性であった場合は、陽性患者との最終接触日から14日間船内での隔離となった。 ... 一部の乗員は、船の運航を維持するために、検疫下においても限定的ではあるものの勤務を継続した。
データ収集
当初は有症状者とその濃厚接触者に対してのみ，その後の検査体制の整備拡大に伴い、2月11日に 80歳以上の高齢者と糖尿病や心疾患等の基礎疾患を有する人から（年齢順に）検体採取が開始 ... 。
暫定的な結果
2月18日の時点で、65名の乗員と466名の乗客を含む、531名が確定例であった（2月5日時点の乗船者の14.3％）。 ... 終日検疫が実施された 2月6日より前に発症した人が 33名（18％）、2月6日以降に発症した人が151名（82％）。確定例のうち255名（48％、乗員8名、乗客247名）は、検体が採取された時点では無症状（下船後の発症の有無はは不明） ...
暫定的な結論
2月5日にクルーズ船で検疫が開始される前にCOVID-19の実質的な伝播が起こっていたことが分かる ... 2月19日に近づくにつれ、感染伝播は乗員あるいは客室内で発生している傾向。
暫定的対応とガイダンス
14日間の検疫を終了し、かつ、検査陰性で、14日目の健康診断で異常が確認されなかった者（そのほとんどが乗客）は2月19日から順次下船が開始される(原稿記載時)。
確定例との接触がある者は、最終接触日から14日間が隔離期間となる。この該当者には隔離期間中の乗客に対する食事の配膳等の生活支援に貢献していた、乗員の大半が含まれる。
［Mod.MPP 注－ ... 無症候性で PCR 検査陽性であったうち，どれくらいの割合が発症するのか，また発症した症例はいつ頃ウイルスに暴露したのか，の情報をわれわれはまだ知らない。上記の報告によると，合計 531人が the SARS-CoV-2 で陽性となり，このうち 255 (48.0%) は検体採取時には無症状であった。発症した無症候性検査陽性例の疫学曲線から，検疫開始以後の船内での感染伝播による第 2波の感染が示されるかも知れない]
[5] Selected media reports of transmission outside of mainland ChinaA. Japanese cruise ship: 2 deaths
情報源 AP 2020年2月20日
ダイアモンドプリンセス号の乗客であった，ともに 80歳代の日本人の高齢者 2名が，新型ウイルスの感染により死亡したと，20日厚労省が発表した。ウイルス感染が拡がった船内で初めての死者となった ... 死亡した 2名は，2月5日の船内の検疫開始時の健康診断を受ける前に，すでに感染していたと見られている。2月11日と12日にそれぞれ入院となり，翌日にウイルス検査陽性が確認されていた。なぜ症状があり医療室を受診していたもっと早い時期に検査が行われていなかったのかは不明 ... やや長文。
B. South Korea: 73 new cases
情報源 NPR 2020年2月20日
韓国国内の患者が，24時間で 51人から 2倍の 104人となったと，20日 保健当局 the Korea Centers for Disease Control and Prevention が明らかにした。患者の多くが a Christian sect in Daegu (南部・大邸市＝Taegu) に関係していた。Korea's CDC は 18日，国内 31例目となる感染例の女性は，the Shincheonji Church of Jesus，The Temple of the Tabernacle of the Testimony と呼ばれる宗教団体が催した行事 services に参加していたと明らかにしていた。この女性は 1959年生まれの 60歳で，武漢市を訪れていた。1160人の接触者があると報告されている。
C. Canada (BC) ex Iran
情報源 Tri City News 2020年2月20日
イランから帰国した British Columbia 州の 30歳代の女性が，6例目の新型コロナウイルス感染例と確認されたと，20日保健当局者 Provincial health officer が明らかにし，女性の症状は比較的軽症で，接触者は隔離されていると述べた ... 最近，イランで患者が報告され始めていた ... 今週初め，すでにウイルス感染が診断された 5名中 4名は無症状と説明されている。上海から帰国した 5例目の 30歳代の女性は自宅 her home in B.C.'s Interior 待機している。B.C. では 500人以上がウイルス検査を受け，そのうちの多くがインフルエンザ検査で陽性だったという。Ontario 州でも 3例のウイルス患者が確認されている。
［Mod.MPP 注－イラン国内でのウイルス感染循環の可能性。(6例目の患者の) 渡航時期とイラン国内外を含めた渡航先に興味が持たれる。 ... ]
[6] WHO situation report 31 (as of 20 Feb 2020*)
情報源 World Health Organization 2020年2月20日
Highlights
- One new country (Islamic Republic of Iran) reported cases of COVID-19 in the past 24 hours.
- 中国の患者報告分類から "clinically diagnosed (湖北省で使用)" を廃止し，すべての地域で "suspected" and "confirmed (検査による確定が必要)" のみを使用する。"clinically diagnosed" cases のうち，検査で陰性が確認されたものは (報告患者数から) 棄却される。
● COVID-19(11) 保有動物，中間宿主 センザンコウ疑い
PRO/AH/EDR> COVID-19 update (11): animal reservoir, intermediate hosts, pangolin susp.
Archive Number: 20200220.7009213
情報源 People's Daily Online [in Chinese] 2020年2月15日
15日 the State Council's Joint Prevention and Control System の記者会見で，保健当局者 director of the Department of Social Development and Science & Technology in the Ministry of Science and Technology が，ウイルスの由来の疫学調査が非常に重要と述べた ... ウイルス学研究所 the Chinese Center for Disease Control and Prevention's Virology Institute は 585件の海鮮市場内の環境および動物 environmental and animal samples from the Huanan Seafood Market および武漢市内の many fresh markets を調査し，このうち 33件が novel coronavirus 陽性で，31件は野生動物が売られていた the Western District [of Huanan] の検体だった。このような (陽性例が) 集中した結果から，アウトブレイクには野生動物の取引が関与した可能性があると考える。たとえば，最近動物衛生当局 the team of the China Animal Health and Epidemiology Center は 4800頭以上のブタ，家きん，イヌ，ネコなどの動物から検体を採取し検査したが，すべて陰性との結果を得ている。暫定的ながら，新型コロナウイルスは，家きんや家畜由来ではないとしてよいだろう。遺伝子解析結果の比較からも，コウモリが自然界の宿主である可能性が高いとの結果が示されている。様々な研究から，新型コロナウイルスの感染経路は，経気道および接触感染が主な伝播経路とされている。後向きの検討では，新型コロナウイルス肺炎の患者の便から，新型コロナウイルスが分離されている ...
センザンコウ pangolin が新型コロナウイルスの中間宿主の 1つであるかも知れない，とのthe South China Agricultural University team's suggestion に関し，この仮説を検証するための科学調査チームが編成されている。センザンコウからヒトへの新型コロナウイルス感染伝播に関する研究も進められている。
［Mod.AS 注－ ブタなどからの 4800件の動物の検体すべてが検査で陰性であったというのは，(野生?) 動物の検体が華南市場 the Huanan Seafood Market の環境から採取された検体 the "environmental" material に含まれていた，という情報とともに [?]，新たな情報である ... 華南市場はアウトブレイク開始直後に消毒作業が行われてしまったため，市場の野生動物の中からウイルスの感染源を特定することは困難である。2019-nCoV と近い関係にあるコロナウイルスの 1種が，2013年に雲南省のコウモリ a _Rhinolophus affinis_ bat in Yunnan で確認されているが，他の野生動物種から，これに近いウイルス closely related viruses が分離されたことはない。
中間宿主動物の調査を行った中国の研究チームの報告の要約：
中国南部の密輸捜査 anti-smuggling operations で捕獲されたセンザンコウ pangolins (_Manis javanica_) で，2019-nCoV-related coronaviruses を発見したので報告する。遺伝子解析 Metagenomic sequencing の結果，このセンザンコウコロナウイルス pangolin-associated CoVs は 2 sub-lineages of 2019-nCoV-related coronaviruses に属し，１つはレセプター結合ドメイン領域が 2019-nCoV と非常に近い関係にあった。複数の種類のセンザンコウコロナウイルス multiple lineages of pangolin coronavirus が発見され，それらと 2019-nCoV に相同性が確認されたことから，センザンコウが，新型ヒトコロナウイルスの中間宿主である可能性を検討すべきであり，生きものを売る市場から取り除かなければならない"。テストされたサンプルが採取された時期，対象動物および地域は，August 2017-January 2018 from Malayan pangolins (_Manis javanica_) obtained during anti-smuggling operations by Guangxi Customs 広西壮族自治区税関であった。2019年3月に貴州省 Guangzhou の密輸で押収されたセンザンコウでも，同様の所見が得られている。]
関連項目
COVID-19 update (08): companion animals, RFI 20200218.7002276
● ベネズエラウマ脳炎，ウマ－ベリーズ OIE
Venezuelan equine encephalomyelitis, Belize，reoccurrence of a listed disease
PRO/AH/EDR> Venezuelan equine encephalitis - Belize: (CZ) horse, OIE
Archive Number: 20200220.7008958
情報源 OIE, WAHIS (World Animal Health Information System), weekly disease information 2020 2020年2月15日
感染開始時期 30 Oct 2019
前回流行時期 12 Dec 2014
原因ウイルス Venezuelan equine encephalomyelitis virus
新たな感染流行(1)
Outbreak location 1: Little Belize area, Corozal South, Newland, Corozal: farm
Outbreak status: resolved on 12 Feb 2020
感染した種/頭数/症例数/死亡/殺処分・廃棄/処理
Equidae / 5 / 4 / 4 / 0 / 0
Affected population: recently established Mennonite community in forested area in the north of Belize. Horses used as draught animals and for transportation - horse and buggy.
● 鳥インフルエンザ(27)－ブルガリア 家きん，HPAI H5N8 OIE
Highly pathogenic avian influenza, Bulgaria，recurrence of a listed disease
PRO/AH/EDR> Avian influenza (27): Bulgaria (PD) poultry, HPAI H5N8, OIE
Archive Number: 20200220.7008828
情報源 OIE, WAHID (World Animal Health Information Database), weekly disease information 2020 2020年2月17日
感染開始時期 17 Feb 2020
前回流行時期 5 Apr 2019
原因ウイルス highly pathogenic avian influenza [HPAI] virus
Serotype: H5N8
新たな感染流行 (1)
Outbreak location: Plovdiv, Bulgaria: farm
感染した種/頭数/症例数/死亡/殺処分・廃棄/処理
鳥類 Birds / 15 729 / 9142 / 9142 / 5830 / 0
Highly pathogenic avian influenza, Bulgaria，recurrence of a listed disease
PRO/AH/EDR> Avian influenza (27): Bulgaria (PD) poultry, HPAI H5N8, OIE
Archive Number: 20200220.7008828
情報源 OIE, WAHID (World Animal Health Information Database), weekly disease information 2020 2020年2月17日
感染開始時期 17 Feb 2020
前回流行時期 5 Apr 2019
原因ウイルス highly pathogenic avian influenza [HPAI] virus
Serotype: H5N8
新たな感染流行 (1)
Outbreak location: Plovdiv, Bulgaria: farm
感染した種/頭数/症例数/死亡/殺処分・廃棄/処理
鳥類 Birds / 15 729 / 9142 / 9142 / 5830 / 0
● アフリカ豚熱 (ASF)－ミャンマー，家畜 OIE
African swine fever [ASF], Myanmar，Recurrence of a listed disease
PRO/AH/EDR> African swine fever - Asia (04): Myanmar (SH) domestic, OIE
Archive Number: 20200220.7008827
情報源 OIE, WAHID (World Animal Health Information Database), weekly disease information 2020; 33(08) 2020年2月17日
感染開始時期 6 Feb 2020
前回流行時期 27 Dec 2019
原因ウイルス African swine fever virus
新たな感染流行 1
Outbreak location: NaungMon, Lashio, Lashio, Shan State: farm
感染した種/頭数/症例数/死亡/殺処分・廃棄/処理
ブタ Swine / 10 / 7 / 6 / 0 / 0
● 麻疹－チャド/中央アフリカ共和国 WHO，英国
PRO/EDR> Measles update (07)
Archive Number: 20200220.7006260
[1] Chad, Central African Republic: WHO
情報源 CIDRAP (Center for Infectious Disease Research & Policy) News 2020年2月18日
The WHO's African regional office によると，チャドと中央アフリカ共和国で麻疹のアウトブレイクが発生 are in the midst of measles outbreaks し，1月1日以降，患者数の増加が報告されている。
チャドでは 1276 cases, including 14 deaths since 1 Jan 2020 ... 78% にワクチンが接種されていなかった，と WHO が報告している。60% が 5歳未満の患者で，5歳から 14歳までが 19%，15歳以上が 14% と報告されている。
中央アフリカ共和国では，1498 suspected measles cases, including 15 deaths が報告。2019年初旬からアウトブレイクが続いていおり，2019年1月1日から 2020年2月9日までの患者数は 5724 suspected measles cases, including 83 deaths (case fatality rate, 1.45%) in 13 health districts が報告されている。およそ 3/4 が 5歳未満の小児である。
[2] 英国 (Wandsworth, London)
情報源 Local London 2020年2月17日
Wandsworth [London borough] では，2019年9月末以降，100例以上の麻疹患者が報告され，多くは学童と若年成人の患者である ...
[3] Research: Paramyxovirus enzyme complex structure
情報源 Scienmag 2020年2月17日
- パラミクソウイルス paramyxoviruses, a family of RNA viruses 内の，重要な酵素複合体の原子構造 atomic structure of a key enzyme complex を明らかにした初めての報告
- 酵素は RNA 分子の組み立てに与るため，新たな抗ウイルス薬 (開発の際) の作用部位となる
- (パラミクソウイルスとは) 異なる科に属するが，コロナウイルスも同様の動作を示す
- Researchers used cryo-EM, a revolutionary technique that gives a clear view of proteins
Northwestern University の研究者らが，初めて the 3D atomic structure of a key complex in paramyxoviruses の構造を決定した：同ウイルス科には，麻疹，ムンプス，ヒトパラインフルエンザ，respiratory syncytial virus (RSV) などのウイルスが属する。得られた情報は，これらのウイルスだけでなく，パラミクソウイルスと振る舞いが似るコロナウイルスに対しても，抗ウイルス薬のデザインや開発に役立つ ... 研究方法の説明など。
参考文献 Structure of a paramyxovirus polymerase complex reveals a unique methyltransferase-CTD conformation. PNAS. 2020; 201919837; https://doi.org/10.1073/pnas.1919837117
[4] 合併症 Measles complications：肝炎，虫垂炎，髄膜炎
Complications of measles can include hepatitis, appendicitis, and viral meningitis, doctors warn
情報源 Scienmag 2020年2月17日
2017年，世界中の麻疹による死者は 11万人に達し，ほとんどが幼いこどもだった。著者らは，感染が直接の原因となった付加的合併症のある 3例の麻疹患者を治療した。
1例目は，小児期に 1回目の麻疹ワクチン接種のみを受けていた若年男性で，肝炎を併発した。
2例目は，麻疹に伴って虫垂炎を併発した若年女性。
3例目は，かすみ目 blurred vision と激しい頭痛を訴えた中年男性で，麻疹感染に伴うウイルス性髄膜炎と診断された。
3例はいずれも適切な治療により完治し，後遺症は認められていない。しかし，麻疹感染により免疫システムが抑制され，全身のあらゆる臓器の合併症を伴っていると強調し，報告された全患者の約 1/3 に 1つ以上の合併症が見られたと指摘している。合併症として，肺炎，熱性けいれん，神経症状を引き起こす脳脊髄炎などが挙げられている ... SSPE (subacute sclerosing panencephalitis，亜急性硬化性汎脳炎) など。
原著タイトル Complications of measles: a case series. BMJ Case Rep. 2020; 13(2). doi: 10.1136/bcr-2019-232408;