ProMED-mail 情報: 2022年1月1日

COVID-19（01）オミクロン重症度ドイツ T細胞反応性

●　鳥インフルエンザ　ベニン家きん

Highly pathogenic avian influenza, Benin

PRO/AH/EDR> Avian influenza (02): Africa (Benin) poultry, HPAI H5N1, OIE

Archive Number: 20220101.8700629

　情報源 OIE-WAHIS (World Animal Health Information System) 2021 2021年12月27日

感染開始時期　5 Oct 2021

前回流行時期　30 Apr 2008

Causal agent: highly pathogenic avian influenza virus

Serotype: H5N1

Outbreak location: District of Tohoue, village of Dja, Seme-Kpodji, Oueme，farm

種/個体数/感染/死亡/廃棄/と畜/ワクチン接種

Birds / 5661 / 5661 / 5661 / 0 / 0 / 0

Affected population: Commercial farm with 5661 head of poultry showing 100% mortality.

●　ハンタウイルス米国

PRO/AH/EDR> Hantavirus - Americas (01): USA (WA)

Archive Number: 20220101.8700618

　情報源 Public Health Insider 2021年12月30日

... Since 1997 there have been 8 cases of HPS in King County, including a recent case we are currently investigating in an adult resident of south east King County, who was hospitalized in December 2021 and is now recovering.

●　鳥インフルエンザ仏，英，スロベニア

PRO/AH/EDR> Avian influenza (01): Europe (France,UK,Slovenia) poultry, wild, spread, OIE

Archive Number: 20220101.8700627

[1] フランス France, southwest, geese

　情報源 AFP/The Local 2021年12月31日

[2] Europe: update

　情報源 Daily Sabah 2021年12月30日

[3] 英国 UK: commercial poultry farms, spread

　情報源 The Poultry Site 2021年12月30日

[4] スロベニア Slovenia (Bistrica): backyard farm, 1st case since 2006, OIE (in commentary)

　情報源 Reuters via Saltwire 2021年12月27日

●　原発性アメーバ髄膜脳炎中国

PRO/AH/EDR> Amebic meningoencephalitis, primary - China: (GZ) Balamuthia mandrillaris, fatal

Archive Number: 20220101.8700623

　情報源 Outbreak News Today 2021年12月27日

土壌アメーバ a free-living soil ameba の _Balamuthia mandrillaris_ は，1990年にはじめてヒトとヒヒの髄膜脳炎の原因として報告された。_B. mandrillaris_ amoebic encephalitis (BAE) は，カリフォルニア州南部 Southern California や南米など，気温のより高い地域で多く確認されている。これまで世界中で報告された症例は 200例あまりにすぎないが，致死率は 95% を超える。アジアできわめて少数の報告があり，言うまでもなく中国も含まれる。感染症誌 Genetics and Evolution に，2019年5月に発熱と精神状態の変容のため入院となった，貴州省 Guizhou Province の 15歳の少年が死亡したことが報告された。

●　リーシュマニア症インド

PRO/AH/EDR> Leishmaniasis - India: visceral, increase

Archive Number: 20220101.8700621

　情報源 Daily Pioneer 2021年12月30日

顧みられることのない内臓リーシュマニア症 the neglected disease visceral leishmaniasis, commonly known as kala-azar による死者数が，2021年11月に 30人に達し，7年ぶりの高い数字となった。Bihar tops the list with 24 mortalities followed by Jharkhand, which has reported 7 deaths ...

●　狂犬病ブラジル，カナダ，米国

PRO/AH/EDR> Rabies (01): Americas (Brazil,Canada,USA) animal, human exp

Archive Number: 20220101.8700617

[1] 米国 North Carolina (Cumberland County): cat, dogs, human exposure

　情報源 The Sentinel 2021年12月21日

[2] 米国 Montana (Big Horn County): skunk, dog

　情報源 Montana Government Department of Livestock 2021年12月21日

[3] ブラジル Rio Grande do Norte: cattle, horse

　情報源 Globo [in Portuguese] 2021年12月22日

[4] カナダ Nunavut: fox, dog

　情報源 Nunavut News 2021年12月30日

●　COVID-19（01）オミクロン重症度ドイツ T細胞反応性

PRO/AH/EDR> COVID-19 update (01): omicron severity & changes, Germany, T-cell reactivity

Archive Number: 20220101.8700616

[1] Omicron

　[A] 重症度

　情報源 Research Square 2021年12月28日

原著タイトル Early signals of omicron severity in sentinel UK hospitals [preprint]. Research Square. 2021; https://doi.org/10.21203/rs.3.rs-1203019/v1

...

Discussion

...

病院の検査データ上で拡大を示し，デルタ株に取って代わろうとするオミクロン株の高い割合をみると，デルタ株との比較で重症度が低下している (Imperial College, 2021)としても，病院の負担を回避するには十分ではない可能性がある ...

　[B] Variant changes

　情報源 MRC-University of Glasgow Centre for Viral Research 2021年12月28日

なぜオミクロン株がこれほど急速に拡大したかについては不明である ...

- 実験室でのテストで，omicron は 2 doses of COVID-19 vaccine で得られる抗体にはほとんど影響を受けなかったが，a 3rd dose booster により反応が改善された。

- real-world infection data でも裏付けられた; omicron escapes immunity from 2 vaccine doses, but 3 doses restores good levels of protection.

- オミクロンはヒトの細胞への侵入経路を変更した，との証拠も得られた。このことは，感染拡大と，感染可能な細胞のタイプに影響を与えた可能性もある。

原著タイトル The hyper-transmissible SARS-CoV-2 omicron variant exhibits significant antigenic change, vaccine escape and a switch in cell entry mechanism. 2021; https://www.gla.ac.uk/media/Media_829360_smxx.pdf

[2] ドイツ Germany: case count

　情報源 Reuters 2021年12月29日

保健相は 29日，公式発表される患者数の報告が過少であり，実際の感染者数は約 2-3倍であると述べた。過少報告の原因として，休暇中の職場や医院で検査数が少なかったことと，その結果のうちの少数しか当局に提出されなかったこととされている ...

[3] T-cell reactivity

　情報源 bioRxiv 2021年12月30日

原著タイトル Preserved T cell reactivity to the SARS-CoV-2 omicron variant indicates continued protection in vaccinated individuals [preprint]. bioRxiv. 2021;

要約

デザイン: Prospective monocentric observational study.

設定: Conducted between 20-21 Dec 2021 at the Santa Lucia Foundation IRCCS.

参加者: 異なるワクチン接種か感染のあった 61 volunteers (mean age 41.62, range 21-62; 38 female/23 male) から提供された血液 15 mL。最近抗がん治療を終えた 1人と，モノクローナル抗体療法治療を受けた 1人のほかは，健康上の問題はなかった。

方法 Main outcome(s) and measure(s): 結果は，オミクロン株変異領域 the mutated regions of the spike protein of the omicron SARS-CoV-2 variant に対する T細胞反応性 T-cell reactivity の測定と，peptide libraries の刺激によるスパイクタンパクに対する残存する T細胞反応性の評価から得られた。

結果採血直後の血液検体からリンパ球を分離し，ただちに the spike protein of SARS-CoV-2 に対する反応性を調べた。オミクロン株の変異領域をカバーするペプチドに対する T細胞反応は，ワクチンの基となった株 the ancestral vaccine strain の同じ領域への反応と比較して，47% 低下していた。しかし，全タンパク領域のペプチド the peptide library of the full-length protein に対する全般的な反応性は，おおむね保たれていた（推定 83%）。ワクチン接種後の群と既感染の群の血液の間で，免疫認識の喪失に有意の差はなかった。

結論: the spike protein の変異があるにもかかわらず, the SARS-CoV-2 omicron variant は免疫システムの細胞コンポーネントにより認識された。入院と重症化に対する防御効果は保たれると仮定することに合理性はある。

Discussion

... 原文参照願います。

[4] WHO: daily new cases reported (as of 30 Dec 2021)

[5] Global update: Worldometer accessed 30 Dec 2021 21:15 EST (GMT-5)

　情報源 Worldometer 2021年12月30日

Total number of reported deaths: 5 446 315

Total number of worldwide cases: 286 891 918

Number of newly confirmed cases in the past 24 hours: 1 982 780

[the detailed global data]]

[A 7-day series of cumulative totals reported by countries, territories, and reporting entities ]

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