2022年2月16日

A型肝炎 台湾
COVID-19 ECDC、Long COVID、オミクロンワクチン Nature

● サルモネラ感染症 米国
PRO/AH/EDR> Salmonellosis - USA: (MA) human, dog treats
Archive Number: 20220216.8701502
 情報源 Boston 25 News 2022年2月16日
サルモネラ菌感染 salmonellosis リスクがあるとして,イヌのおやつ certain dog treats を廃棄するよう呼びかけられている。"Dog Gone Dog Treats" を触った,70代の 2人と小児 1人の, 3人がサルモネラ菌に感染 3 cases of salmonellosis した。いずれも residents of Essex County だった。開封および未開封の袋から,the State Public Health Laboratory での検査でサルモネラ菌が検出された。
The treats were sold at:
- Essex County Co-Op in Topsfield
- New England Dog Biscuit Company in Salem
- Gimme Chews & Moore in Haverhill
- Animal Krackers in Gloucester.

● A型肝炎 台湾

PRO/EDR> Hepatitis A - Taiwan: Thai workers, possible meat vehicle, RFI
Archive Number: 20220216.8701497
 情報源 Taiwan News 2022年2月16日
2022年,台湾で 2月15日までに 28例の急性 A型肝炎 cases of acute hepatitis A が報告されており,このうち 18人がタイ人労働者だった。タイ人の患者らの居住地は,Taoyuan, Taichung, Tainan, New Taipei, Changhua and Nantou である。The Taiwan Centers for Disease Control (CDC) は,汚染のある肉の生食が原因とみて調査を進めている。

● COVID-19

PRO/AH/EDR> COVID-19 update (49): Eurosurv., transm.&screen., long COVID, mRNA omicron, WHO
Archive Number: 20220216.8701479
[1] Selections from Eurosurveillance
 情報源 Eurosurveillance 2022, 27(6) 2022年2月12日
 [A] SARS-CoV2 transmission
 A1. フランス France
原著タイトル Early chains of transmission of COVID-1 in France, January to March 2020. Euro Surveill. 2022; 27(6): pii=2001953; 
from [24 Jan -- 30 Mar 2020]. のフランスでの調査において
Results: 735例の感染例の 6082人の接触者が追跡され,二次感染率4.1% だった。患者および接触者の年齢により増加した。職場の同僚や友人と比べ,家族内の接触者が感染する可能性が高く医療施設内の接触者のリスクは低かった。328組の感染者と被感染者のペアをみると,49%が家族内だった。二次感染者の 80% が,10%の感染例からの感染だった。平均の感染までの期間は 5.1日間で,後ろ向きの検討では 6.8日間となった。
 A2. デンマーク Denmark
原著タイトル Nationwide study on SARS-CoV-2 transmission within households from lockdown to reopening, Denmark, 27 Feb 2020 to 1 Aug 2020. Euro Surveill. 2022; 27(6): pii =2001800; 
 ... 
Results: 家庭内で検査陽性者が確認されたあと the day after receiving a positive test result,二次感染のおそれのある家族 35% (788/2226) の検査が行われ,このうち 13% (98/779) が陽性だった。6782 households について,二次感染のおそれのある 82% (1827/2226) が 14日以内に検査を受け 17% (371/2226) が二次感染陽性と判明した。[implying an attack rate of 17%:?] ... 
 [B] スクリーニングテストと疫学的予測 Screening tests and epidemiologic prediction
原著タイトル Epidemiological and clinical insights from SARS-CoV-2 RT-PCR crossing threshold values, France, January to November 2020. Euro Surveill. 2022; 27(6): pii=2100406; 
 ... 
Results: ラボラトリーごとのアッセイによる値 the number of quantification cycles (Cq) の変動がみられたが,患者の年齢,発症日から検査までの日数,検査日の流行状況と,強い関係性のある傾向を認めた。また経時的再生算数を予測することで,著しく誤差を小さくできる。 ... 原文参照願います。
 [C] フランス France: Normandy
 原著タイトル Investigation of outbreak cases infected with the SARS-CoV-2 B.1.640 variant in a fully vaccinated elderly population, Normandy, France, November to December 2021. Euro Surveill. 2022; 27(6): pii=2200078;
Normandy, north-western France in late November 2021 で 3例の the SARS-CoV-2 B.1.640 variant の感染例が確認された。同じクラスターが関連する,2件のイベントが確認された。合計 5 confirmed and probable B.1.640 cases が報告されている。いずれも,初回ワクチン接種完了者だった。62人が 65歳以上だった。症状があったのは 56例で,4例が入院となった。
 [D] オランダ Netherlands
 原著タイトル serial intervals in SARS-CoV-2 cases with omicron BA.1 variant compared with delta variant, the Netherlands, 13 to 26 December 2021. Euro Surveill. 2022; 27(6): pii=2200042; 
omicron BA.1 の指標である S gene target failure (SGTF) を用いて,908 SGTF と 1,621 non-SGTF の serial intervals in the same period を評価した。家庭内の the mean serial interval for SGTF cases は 0.2 であり,0.6 days shorter than for non-SGTF cases だった。a shorter serial interval が,omicron の拡大に資すると考えられた。
[2] Long COVID
 情報源 CIDRAP (Center for Infectious Disease Research and Policy) 2022年2月14日
Long COVID-19 symptoms には,SARS-CoV-2 ウイルスの迷走神経 the vagus nerve への影響が関係し,血流を増加させる enhanced external counterpulsation (EECP) による改善の可能性があることを,それぞれ示唆する 2件の研究が出された。
Long COVID-19 は,感染から回復した患者の最大 15% に認められ,倦怠感,筋肉痛,認知機能障害などの症状が,数ヶ月にわたって続く。
Long COVID, vagus nerve symptoms may overlap
4月のポルトガルでの開催が予定されている the European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases (ECCMID) において,スペインの研究者らが,the role of the vagus nerve in long COVID について議論すると,an ECCMID news release で伝えられている ... dysphonia 発生障害,dysphagia 嚥下障害,dizziness めまい, tachycardia 頻脈, orthostatic hypotension 起立性低血圧,下痢 diarrhea などが Long COVID の症状として引き起こされる可能性がある。研究者らは 2021年3月から6月までに,スペインの病院 a Spanish hospitalhaving long COVID と診断された 348人の患者の,迷走神経の形態および機能学的側面を評価した。228 (66%) に,少なくとも 1つの迷走神経機能障害 vagus nerve dysfunction (VND) が起因する症状が認められた ... 
Improvement in functional scores, fatigue after EECP
scientists from EECP provider Flow Therapy が the effect of the therapy in 50 COVID-19 survivors の評価を行った。20人に心冠血管疾患 coronary artery disease (CAD) があり,平均年齢は 54歳だった。[an ACC news release ]
EECP とは,腓腹筋,大腿,臀部下部に巻いたカフに送排気を行って圧迫と解放を行い,心筋,脳,その他の部分に酸素を十分に含んだ血液を送る治療である。1回あたり 1時間で,7週間に 35回の治療が行われる ... 質問票への回答により,疲労感,息切れ,等で改善が認められた ... 

[3] オミクロンワクチン Vaccine: m-RNA omicron

 情報源 Nature 2022年2月4日
原著タイトル mRNA-1273 or mRNA-omicron boost in vaccinated macaques elicits comparable B cell expansion, neutralizing antibodies and protection against omicron. bioRxiv 2022.02.03.479037 [preprint]
要約 SARS-CoV-2 omicron は非常に感染力が強く,従来株のスパイクにマッチさせたワクチン接種による中和抗体に抵抗性を示している。omicron-specific vaccines による追加接種が免疫および感染防御を高めるか,については明らかではない。mRNA-1273 [a novel lipid nanoparticle (LNP)-encapsulated mRNA-based vaccine that encodes for a full-length, prefusion stabilized spike (S) protein of SARS-CoV-2. - Mod.LK] を 0 および 4週に接種された非ヒト霊長類について,41週に mRNA-1273 または mRNA-omicron ワクチンを追加接種した。D614G に対する中和抗体価 titers は 4760,reciprocal ID50 at week 6 (peak) で,追加接種前の 41週に 270となり,omicron に対してはそれぞれ 320 and 110 だった。mrna-1273 の追加接種の 2週間後,titers against D614G and omicron increased to 5360 and 2980, respectively となり,mrna-omicron ワクチンでは 2670 and 1930 だった。いずれのワクチンにおいてもブースター接種後,spike-specific B cells B細胞の 70-80% に,both WA1 and omicron に対する交差反応性 cross-reactive が認められ,また下気道でのウイルス複製の抑制 Significant and equivalent control も確認された。以上より,オミクロンワクチンによる追加接種で,現行の mRNA-1273 vaccine の追加接種よりも高い免疫や防御効果が得られるということはない
Discussion ... 
[4] WHO: Daily new cases reported (as of 14 Feb 2022)
 情報源 WHO 2022年2月14日
[Data by country, area, or territory for 14 Feb 2022 ]
[5] Global update: Worldometer accessed 14 Feb 2022 20:12 EST (GMT-5)
 情報源 Worldometer 2022年2月14日
Total number of reported deaths: 5 844 728
Total number of worldwide cases: 413 977 604
Number of newly confirmed cases in the past 24 hours: 1 719 205
[A 7-day series of cumulative data reported by countries, territories, and reporting entities]
関連項目 
COVID-19 update (47): Russia, antivirals, genomic surv, child vacc, WHO 20220213.8701430

● 鳥インフルエンザ アイルランド、ルーマニア
PRO/AH/EDR> Avian influenza (47): Europe, poultry, fox, HPAI H5N1, OIE
Archive Number: 20220216.8701500
[1] アイルランド Ireland (Donegal): red fox, HPAI H5N1
 情報源 OIE-WAHIS (World Animal Health Information System) 2022 2022年2月14日
感染開始時期 3 Feb 2022. 
HPAI subtype H5N1 was detected in a barnacle goose and a red fox (_Vulpes vulpes_) in Benduff, Donegal. 
The barnacle goose has been reported in the HPAI A H5N1 event from Ireland (see evt_4049 ).
[2] ルーマニア Romania (Ialomita): poultry, HPAI H5N1
 情報源 OIE-WAHIS (World Animal Health Information System) 2022 2022年2月14日
感染開始時期 10 Feb 2022. 
HPAI subtype H5N1 was detected in a backyard in Tandarei, Ialomita.
種/個体数/感染/死亡/廃棄/と畜/ワクチン接種
Birds / 65 / 65 / 49 / 16 / 0 / 0

● 口蹄疫 マラウイ
Foot-and-mouth disease virus (inf. with), Malawi
PRO/AH/EDR> Foot & mouth disease - Malawi: (MC) cattle, st pending, OIE
Archive Number: 20220216.8701495
 情報源 OIE, WAHID (World Animal Health Information Database), weekly disease information 2022 2022年2月15日
感染開始時期 4 Feb 2022
Reason for notification: 1st occurrence in a zone or a compartment
病原体 Foot and mouth disease virus,Subtype: pending
Outbreak location: Lifiledi, TA Zulu, Mchinji,village
種/個体数/感染/死亡/廃棄/と畜/ワクチン接種
ウシ Cattle / 17 000 / 107 / 0 / 0 / 0 / 0
Affected populationthe animals are herded by herders from different villages to the nearest mountains during this rainy season since the fields from which crop residues are used have been prepared with crops.
Epidemiological comments: the cattle population in this area graze in communal grazing land and animals meet from different villages and locations. There is also uncontrolled livestock movement within the locality and near the border villages.

● バナナの病気、パナマ病 ベトナム
PRO/PL> Panama disease, banana - Viet Nam: pathogen diversity
Archive Number: 20220216.8701506
 情報源 PhysOrg 2022年2月14日
_Fusarium oxysporum_ f. sp. _cubense_ (Foc) の影響により,今後 25年以内に最大 71% のベトナムのバナナ生産量が損失するとみられている。世界中で the TR4 strain の拡大が懸念されている ... Foc TR4, now _F. odoratissimum_ in the FOSC は現時点では優位ではなく,感染の 10% を占めるに過ぎない ... 

● ランピースキン病 シリア ウシ
PRO/AH> Lumpy skin disease - Asia: Syria (SU) cattle, control, vaccination
Archive Number: 20220216.8701483
 情報源 Syrian Arabic Republic/Presidency of the Council of Ministers - News [in Arabic] 2022年2月13日
Sweida governorate の農業当局 The directorate of agriculture が,ウシに対して,ランピースキン病 nodular dermatitis [lumpy skin disease] ワクチンの無料接種を開始した 

● イネの病気 中国 初報告
PRO/PL> Pantoea leaf blight, rice - China: 1st rep
Archive Number: 20220216.8701489
 情報源 Plant Disease 2022年1月
原著タイトル First Report of New Bacterial Leaf Blight of Rice Caused by _Pantoea ananatis_ in Southeast China. Plant Disease. 2022; 106 (1); doi: 10.1094/PDIS-05-21-0988-PDN.
2020年秋,浙江省 Zhejiang と江西省 Jiangxi provinces において,複数種のイネ a number of varieties of rice (_Oryza sativa_) の葉枯れ病 leaf blight が 40-50% の割合で発生した。_Xanthomonas oryzae_ pv. _oryzae_ (Xoo), the pathogen of rice bacterial blight の症状とみられている ...