● ポリオ 米国 下水
PRO/EDR> Poliomyelitis update (03): USA, wastewater cVDPV2, comment
Archive Number: 20230107.8707675
[1] 米国 USA (NY): positive wastewater for cVDPV2（下水中の確認）
情報源 Lohud 2023年1月6日
Orange County の下水の検査で，新たな検体 A new batch of wastewater samples がポリオ polio 陽性となった。州全体 throughout downstate New York において，6週連続で陰性となっていた ...
One sample was collected from the Harriman Sewage Treatment Plant and one sample was collected from the Middletown Sewage Treatment Plant.
12月16日に陽性と確認されたこれら 2件の検体のウイルスは，a Rockland County case of paralytic polio discovered in July 2022 の感染例と遺伝学的関連性を有していた。最後に陽性が確認されたのは 11月4日だった ... やや長文です。
[2] パキスタン Pakistan: violence comment
投稿者 Prof. T Jacob John 2023年1月6日
20230106.8707649 の the moderator's comment:
... Since IPV is exquisitely efficacious, OPV campaigns can be discontinued.
● COVID-19（01）
PRO/AH/EDR> COVID-19 update (01): China, Hong Kong, XBB.1.5, PAHO, treatment, testing, WHO
Archive Number: 20230107.8707667
[1] 中国 China（感染拡大，データ開示要求）
[A] Survey in North China's Ordos shows 1.75% of city's infections asymptomatic
情報源 Global Times 2023年1月1日
[B] WHO wants more data from China as omicron drives COVID surge
情報源 Bloomberg 1月4日
[2] 香港 Hong Kong（制限緩和）
[A] Hong Kong to lift year-long ban on hamster imports as it opens borders
情報源 BBC 2023年1月5日
[B] Hong Kong to reopen 4 border checkpoints on Sunday, as mainland China scraps most COVID travel rules
情報源 Hong Kong Free Press 2022年1月5日
[3] Omicron subvariant XBB.1.5
[A] 欧州 EU: Update on SARS-CoV-2 variants -- ECDC assessment of the XBB.1.5 sub-lineage
情報源 European Centre for Disease Prevention and Control (ECDC) 2023年1月5日
要約:
XBB.1.5 is a sub-lineage of the SARS-CoV-2 lineage XBB, and is currently estimated to have a large growth advantage over previously circulating lineages in North America (139%) and Europe (137%), although these estimates are associated with significant uncertainty.
この変異株は現時点では，欧州 the EU/EEA 内においてその割合は極めて低いため，来月中にということはないが（今後）感染者数増加に寄与する可能性がある。
XBB.1.5 は a sub-lineage of XBB であり，新たな変異 an additional spike RBD mutation S486P が加わっている。10月22日の米国内の検体ではじめて確認されたあと感染が拡大し ... 3日までに確認されている 3456 sequences の多くが，米国 (3080 sequences) と英国 (106 sequences) から提出された検体である。EU/EEA countries -- デンマーク Denmark, フランス France, オーストリア Austria, オランダ Netherlands, ドイツ Germany, イタリア Italy, スペイン Spain, スウェーデン Sweden, アイスランド Iceland, ベルギー Belgium, チェコ Czechia, ポルトガル Portugal, and アイルランド Ireland でも確認されている。
以前に循環した系統に比べて増加する割合が高く have a large growth advantage，in North America (139%) and Europe (137%) となっているが，その意義は未確定である。
米・疾病対策センター The US Centers for Disease Prevention and Control (US CDC) は，the proportion of XBB.1.5 による患者の割合が 9日間で倍増していると報告し，現在の全米の症例の約 40% を占め，1週間以内に優位株 dominant になるとみている。このことが必ずしも，the EU/EEA での優位株になることは意味しない。
the growth advantage の考えられる理由など。
[B] カナダ Canada: 21 cases of COVID subvariant XBB.1.5 detected in Canada, says public health agency
情報源 CTVNews 2023年1月4日
[参考資料 Alarming antibody evasion properties of rising SARS-CoV-2 BQ and XBB subvariants. Cell. 2022;
Neutralization against BA.2.75.2, BQ.1.1, and XBB from mRNA bivalent booster. N Engl J Med. 2022; ]
[C] 上海 Shanghai detects omicron subvariants BQ.1 and XBB from imported cases
情報源 Global Times 2022年1月2日
[4] 汎米保健機関 Pan American Health Organization:
Epidemiological alert -- Increase of COVID-19 cases and hospitalizations
情報源 Pan American Health Organization (PAHO) 2022年12月29日
この数週間に，12 countries/territories in the Region of the Americas において新規外来および入院患者数 new outpatient COVID-19 casesthere の増加が見られ，平行して増えているインフルエンザ，RSV，ほかの呼吸器ウイルスの入院とともに保健サービス需要に影響を与えている ...
[5] 治療（ARB はアウトカムを改善しなかった）:
Angiotensin receptor blockers not effective against COVID-19, study published in the British Medical Journal
情報源 JAMA Network 2022年12月27日
ランダム化臨床試験 A pragmatic randomized clinical trial により，angiotensin receptor blockers (ARBs，アンギオテンシンレセプター阻害薬) は，COVID-19 入院患者の臨床アウトカムを改善させない，との結果が示された ...
[原著タイトル Angiotensin receptor blockers for the treatment of covid-19: pragmatic, adaptive, multicentre, phase 3, randomised controlled trial. BMJ. 2022; 379: e072175; ]
[6] 検査（変異の検査への影響）:
SARS-CoV-2 viral mutations -- Impact on COVID-19 tests
情報源 US Food and Drug Administration (FDA) 2022年12月29日
[The US FDA recently updated its page on SARS-CoV-2 viral mutations -- Impact on COVID-19 tests. Relevant excerpts are listed below. - Mod.LWW]
...
General information for clinical laboratory staff and healthcare providers
COVID-19 diagnostic tests は，すべての既知の変異株を検出するよう設計されていると理解しているものと思われるが，患者の検体中の特殊な変異株 the specific type of SARS-CoV-2 variant (such as delta or omicron) は，基本的には検出できない typically not able to identify 。
どの分子学的検査でも，特に検出部位のウイルス遺伝子に変異が起きた場合は，偽陰性が生じることを知っておく必要がある ...
The FDA recommends clinical laboratory staff and healthcare providers who use SARS-CoV-2 tests note the following:
- Genetic variants of SARS-CoV-2 arise regularly, and false-negative test results can occur.
- Consider negative results in combination with clinical observations, patient history, and epidemiological information.
- Consider repeat testing with a different EUA-authorized or FDA-cleared molecular diagnostic test (with different genetic targets) if COVID-19 is still suspected after receiving a negative test result.
- Test performance may be impacted by certain variants.
- Tests with single targets are more susceptible to changes in performance due to viral mutations, meaning they are more likely to fail to detect new variants.
...
Omicron variant and sub-variants: Impact on antigen diagnostic tests
...
Early data from these preliminary studies suggest that antigen tests do detect the omicron variant but may have reduced sensitivity（感度の低下）.
...
[7] WHO
Grand total: 657 430 133 (293 279) / 6 676 645 (1026)
[8] Global update: Worldometer
Total number of reported cases: 666 909 951
Total number of reported deaths: 6 704 756
Number of newly confirmed cases in the past 7 days: 3 575 997
Number of newly reported deaths: 13 386
● A群連鎖球菌 オランダ 英国
PRO/EDR> Streptococcus, gp A update (01): Netherlands, UK, iGAS, fatal, children, 2022
Archive Number: 20230107.8707666
[1] オランダ Netherlands
情報源 Eurosurveillance 2023年1月5日
原著タイトル Increase in invasive group A streptococcal (_Streptococcus pyogenes_) infections (iGAS) in young children in the Netherlands, 2022. Euro Surveill. 2023;28(1):pii=2200941.
Abstract
2022年，0－5歳児の侵襲性 A群連鎖球菌感染例の報告数 the number of notifiable invasive _Streptococcus pyogenes_ (iGAS) infections は，pre-COVID-19 pandemic years と比べて 7倍増となった。同年齢層の 42例のうち，7例に先行もしくは同時期の水痘感染 varicella zoster infections があり，9人が死亡した。a specific emm type による増加への影響は認められなかった ...
[2] 英・イングランド England
情報源 Eurosurveillance 2023年1月5日
原著タイトル Increase in invasive group A streptococcal infection notifications, England, 2022 Euro Surveill. 2023;28(1):pii=2200942.
Abstract
イングランド全体 across England で，今シーズン [epidemiological] weeks 37 to 48 in 2022 の小児を中心とする invasive group A streptococcal (iGAS) infection and associated deaths 感染と関連死亡の，季節性を考慮した予想を上回る増加が見られている (772 notifications)。2022年11月に，15歳未満の小児の下気道検体で iGAS infection と診断された症例は 28% 増加した。異常な数の，膿胸 pulmonary empyema を伴う小児症例の確認など，例外的な増加について医療従事者らに周知されている。
参考項目 2022
Streptococcus, gp A update (05): UK, fatal, scarlet fever, iGAS 20221231.8707549
● 炭疽 ケニア ヒト，動物
Kisii announces free vaccination to combat anthrax outbreak in Bobasi
PRO/AH/EDR> Anthrax - Kenya (03): (KI) human, cattle cases, free vaccination scheduled
Archive Number: 20230107.8707681
情報源 The Star 2023年1月7日
郡当局 Kisii County は，動物の死亡の発生につながっている炭疽 an anthrax outbreak at Sugubo in Bobasi 対策として，無料のワクチンを提供すると発表した。7日現在，すべての動物の移動 in or out of Bobasi が禁止されている。
関係する地域： The constituency is vast, bordering Transmara to the West, Nyaribari Masaba and Nyaribari Chache to the North and Bonchari to the North East. It also annexes some parts of the Kisii town suburbs.
これまでに 3頭のウシの死亡と，汚染のある肉を摂取した住民 villagers within Sugubo and Nyacheki の感染が確認されている。
Sugubo lies along the common border between Kisii and Transmara, Narok county.