2023年5月30日

COVID-19 ワクチン, ワクチン接種後の感染死亡,long COVID スコア
黄熱 コートジボワール

● COVID-19(20)
PRO/AH/EDR> COVID-19 update (20): countries, paxlovid, vaccine, WHO
Archive Number: 20230530.8710317
[1] Country updates
 [A] 中国 China: current low prevalence, mild symptoms; lockdowns unlikely
 情報源 China Daily, Xinhua News Agency report 2023年5月28日
5月中旬以降,中国国内の COVID-19 感染状況は落ち着いており have entered a low prevalence level ,感染例は概ね軽症であると専門家が述べた。最近増加がみられたものの,発熱外来の患者数は前回ピーク時を大きく下回っており,患者のほとんどが軽症であると,a researcher with the Chinese Center for Disease Control and Prevention (China CDC)が述べた ... 
Another China CDC researcher はモニタリングデータをもとに,輸入感染例及び国内感染例共に現在 the XBB subvariants が優位であり,病原性 pathogenicity に大きな変化はみられないとしている。
 [B] ニュージーランド New Zealand: case numbers fall slightly, 36 more deaths
 情報源 Stuff 2023年5月29日
先週,全国で1万4371 cases of COVID-19 が報告されたと保健省 The Ministry of Health が29日の週報 its latest weekly update -- covering the period from Mon 22 May 2023 to Sun 28 May 2023 -- で明らかにした。前週の1万4657例からは微減であったが,7日間移動平均は1982例で,前週の1891例から増加したと報告されている。36例の死亡が報告されている ... 
 [C] ソロモン諸島 Solomon Islands: restrictions lifted ahead of Pacific Games
 情報源 The National 2023年5月29日
The Solomon Islands, due to host the Pacific Games in November [2023], has lifted all coronavirus (COVID-19) entry requirements. 
 [D] カザフスタン Kazakhstan: all restrictions cancelled
 情報源 United News of India (UNI) 5月28日
[Mod.LWW- しかしながら,多くの国で COVID-19 とその他の呼吸器疾患感染防御対策としてマスク着用が推奨されている(California State Government)]
 [E] 米国 USA: outbreak at CDC conference, 181 infected
 情報源 The Washington Post 5月26日
4月に行われた CDC の会議 a high-profile Centers for Disease Control and Prevention conference の出席後の COVID-19 感染例は少なくとも181人に上ると5月26日発表されたが,入院した患者はいない ... 会議の多くが混み合った小さな部屋で対面での接触があり,約70%の参加者はマスクを着用していなかったと答えている ... 
[2] 米国 USA: Paxlovid gains full approval
 情報源 Reuters 2023年5月25日
米国・食品医薬品局 The US Food and Drug Administration は25日,パキロビッド Pfizer's (PFE.N) oral antiviral COVID-19 treatment Paxlovid に対する全面的な承認 full approval を与え,米国政府からの供給が減少する中,市場での販売が可能となった。2021年後半に緊急承認を得ていた ... 
[3] COVID-19 vaccines may undergo major overhaul this fall
 情報源 Science 2023年5月23日
2023年に入り,米国政府当局は新たな COVID-19 ワクチン戦略を決定した。毎年のインフルエンザワクチン同様,ウイルスの進化をもとに毎年ワクチンが更新され,秋に接種が開始される。6月15日,どのウイルス which strain or strains of SARS-CoV-2  を重視し次期ワクチンを産生するかのアドバイスが行われ,それを受けて各社が大量生産に入る。武漢株 The ancestral strain は除くべきとの意見が多い。COVID-19 ワクチンの変更は,2022年9月の野生株とオミクロン BA.5 の2価ワクチンへの変更以外,行われたことがない。(2価ワクチンの)米国内での接種はわずか17%に留まっている(毎年のインフルエンザワクチン接種は約50%)。また2価ワクチン追加接種には,期待されたほどの効果がなかった。
(2価ワクチンの組成に)野生株が残されたのは,もし全く新しい変異株が新興したときに,オミクロン株だけのワクチンでは効果がない falter against  のではないかとの懸念からの判断だった。この担保は根拠のないものとなった: 新たな変異株はすべて,2021年11月に南アフリカで初めて確認されたオミクロン株の系統であった。
また,現行株とすでに消滅した株の異なる株を含むワクチンの不協和 a vaccine split が,ウイルスに対する強い免疫反応を妨げる(起こしにくくする)とのエビデンスが積み上げられている。たとえば5月4日に a virologist at Columbia University は,the original vaccine 4回接種と,同3回接種後に a bivalent booster を受けた,合計72人を対象とする研究 (bioRxiv) を発表し,(2価ワクチンによる)追加接種 the booster ではオミクロン株中和に有効な抗体は産生されなかったとしている。その理由として,ある株 - この場合は野生株 the ancestral one - に繰り返し免疫システムが暴露する,免疫学的刷り込み immunological imprinting と呼ばれる現象により,免疫反応(の対象)が逸れてしまう skews the immune response in that direction ためと説明されている。the ancestral strain をワクチンに残すことが決められた時点で imprinting はおそらく重要視 a dominant consideration されていなかったと思うが,しかし今は考慮すべき,と述べている。a virologist at the Icahn School of Medicine at Mount Sinai もこの意見に同意している。今月の The Lancet Microbe 誌において,16人について,2価ワクチン追加接種の1か月前と接種の2週間後の血液を調べた結果を報告した。追加接種後,血液中の抗体は BA.5 よりも the ancestral strain の中和にやや良好な作用を示した。BA.5 だけに反応する特異抗体は確認できなかったと述べている。
先週 [week of 15 May 2023] a WHO advisory group 諮問委員会は,現行の COVID-19 ワクチンは重症化を防ぐものの,発症予防の効果は限定的で短期間 limited and less durable と述べた。2価ワクチンの代わりに,今秋については,現在優位となっている the XBB.1 lineage に対する1価ワクチン a single-strain fall vaccine の接種を推奨した。ただし,他の有効なワクチン組成 vaccine recipes も妨げないとしている。a single-strain XBB.1 vaccine か,multiple omicron strains にするか,が議論の的となっている。
この数ヶ月間に,2 closely related XBB substrains, XBB.1.5 and XBB.1.16 が他のオミクロン変異株を押しのけている。
重要な疑問として,現行のウイルス株にマッチしたワクチンが,重症化を減少させるだけでなく,感染伝播も減らせるかということがあり,おそらく今のワクチンはあまり有効ではない。2023年4月の The New England Journal of Medicine (NEJM) では,BA.5 が消退し他のオミクロン株が新興したあと,2価ワクチンの感染伝播防止効果は,接種の2週間後に約30%の効果がピークとなり,16週間後には0%となったと報告されている。 他の研究者も,the updated vaccines は the messenger RNA formulations made by Pfizer and Moderna だけに限定すべきではないとしている。Novavax は a protein subunit vaccine を開発しているが,適時に新たなワクチンを量産化できるかは不透明である ... 
[4] スペイン Spain (Catalonia): air pollution exposure linked to severe COVID-19 outcomes
 情報源 CIDRAP (Center for Infectious Disease Research and Policy) News 2023年5月25日
大気汚染への暴露が,COVID-19 感染時に ISU 入院や死亡などの重症化のリスクを高める可能性があると,the Barcelona Institute for Global Health (ISGlobal) が Nature Communications に投稿した ...
Nitrogen dioxide exposure raises risk of hospitalization
Pollution could prime lungs for infection
[出典 Long-term exposure to air pollution and severe COVID-19 in Catalonia: a population-based cohort study. Nat Commun. 2023; 14(1): 2916;
要約
"長期間の大気汚染暴露と,重症 COVID-19 との関連性について確かめられたことはない。2020年の Catalonia, Spain における,466万0502 adults from the general population についての観察で ... Higher exposure to PM2.5, NO2, and BC was associated with an increased risk of COVID-19 hospitalization, ICU admission, death, and hospital length of stay ... "]
[5] Study finds COVID-19 variants in cats followed the same timeline as the human population
 情報源 University of Glasgow 2023年5月22日
Household cats acquired the same COVID-19 variants as their owners throughout the pandemic, according to new research ... 
[6] Immunovirological and environmental screening reveals actionable risk factors for fatal COVID-19 during post-vaccination nursing home outbreaks
 情報源 Nature Aging journal 2023年5月22日
原著タイトル Immunovirological and environmental screening reveals actionable risk factors for fatal COVID-19 during post-vaccination nursing home outbreaks. Nat Aging. 2023
要約
ワクチン接種後の COVID-19 による死亡のリスク因子についてよく分かっていない。3件の高齢者施設での大規模アウトブレイク large nursing home outbreaks (20-35% fatal cases among residents) について,同ウイルスのエアロゾルモニタリング,系統発生学的遺伝子解析 whole-genome phylogenetic analysis,および鼻粘膜の免疫ウイルス学的プロファイリング immunovirological profiling of nasal mucosa by digital nCounter transcriptomics を組み合わせた包括的な検討を行った。
系統発生学的解析では,各アウトブレイクが a single introduction event から発生していることが示された。ただし,それぞれ異なる変異株(デルタ,ガンマ,ミュー)によるものであった。SARS-CoV-2 は初発感染から最長52日後までエアロゾルサンプル中で検出された。
各因子を統合する Combining demographic, immune, and viral parameters と,最良の死亡予測モデル the best predictive models for mortality は IFNB1 or age, viral ORF7a, and ACE2 receptor transcripts で構成された。
Comparison with published pre-vaccine fatal COVID-19 transcriptomic and genomic signatures uncovered a unique IRF3 low/IRF7 high immune signature in post-vaccine fatal COVID-19 outbreaks. A multi-layered strategy, including environmental sampling, immunomonitoring, and early antiviral therapy, should be considered to prevent post-vaccination COVID-19 mortality in nursing homes]
[7] Study suggests definition of long COVID
 情報源 The Washington Post 5月25日
COVID-19 感染後,今も健康上の問題を抱える人々が報告する症状は200種類以上に上っている。今回新たな研究で,long COVID を定義するもっとも有効な12のキーとなる症状が示された。JAMA 誌に掲載されたこの論文は,the National Institutes of Health が資金提供を行って4年間続けられた the RECOVER initiative と呼ばれる9764人を対象とする研究に基づいている。
the definition of long COVID 定義の標準化を目指し,診断と研究に有意義な影響をもたらせることが期待されている。the key symptoms を明らかにすると同時に,long COVID と他の疾患との鑑別(可能性)のための自己申告のポイントスコアリングシステムも用いられている。COVID-19 以外ではあまり見られない味覚・嗅覚障害や運動後倦怠感や,COVID-19 でも他の疾患でもみられる brain fog や動悸などが含まれる。
To meet the study's definition of long COVID, a participant needed to score a total of 12 points once all their symptoms were added up. The 12 key symptoms and their corresponding scores are:
 - Loss of smell or taste(嗅覚・味覚障害): 8 points.
 - Post-exertional malaise(運動後倦怠感): 7 points.
 - Chronic cough(慢性咳嗽): 4 points.
 - Brain fog(ブレインフォグ): 3 points.
 - Thirst(口渇感): 3 points.
 - Heart palpitations(動悸): 2 points.
 - Chest pain(胸痛): 2 points.
 - Fatigue(疲労感): 1 point.
 - Dizziness(めまい): 1 point.
 - Gastrointestinal symptoms(胃腸症状): 1 point.
 - Issues with sexual desire or capacity(: 1 point.
 - Abnormal movements (including tremors, slowed movements, rigidity, or sudden, unintended, and uncontrollable jerky movements): 1 point.
概して高得点スコアであるほど,日常生活に困難を来している the worse their ability to carry out everyday activities,と説明されている。Massachusetts General Hospital and Harvard Medical School の研究者らが主導した。
[出典 Development of a definition of postacute sequelae of SARS-CoV-2 infection. The Journal of the American Medical Association (JAMA). Published online 25 May 2023; 
Abstract ... ]
[8] WHO: weekly epidemiological update (25 May 2023)
 情報源 WHO 2023年5月25日
 ... 
SARS-CoV-2 variants of interest and variants under monitoring
Globally, from 24 Apr to 21 May 2023 (28 days), 25 415 SARS-CoV-2 sequences were shared through GISAID. WHO is currently monitoring 2 variants of interest (VOIs), XBB.1.5 and XBB.1.16, along with 7 variants under monitoring (VUMs) and their descendent lineages: BA.2.75, CH.1.1, BQ.1, XBB, XBB.1.9.1, XBB.1.9.2, and XBB.2.3.
Globally, XBB.1.5 has been reported from 113 countries. In epidemiological week 18 (1 to 7 May 2023), XBB.1.5 accounted for 41.6% of sequences, a decrease from 50.4% in epidemiological week 14 (3 to 9 Apr 2023). XBB.1.16 has been reported from 58 countries. In week 18, XBB.1.16 accounted for 13.2% of sequences, an increase from 6.9% in week 14.
[9] Global update: Worldometer
 Total number of reported cases: 689 235 761
 Total number of reported deaths: 6 882 332
 Number of newly confirmed cases in the past 7 days: 721 218
 Number of newly reported deaths in the past 7 days: 6502
関連項目 
COVID-19 update (19): countries, vaccine composition, XBB1.16, WHO, global 20230522.8710178

● 黄熱 コートジボワール
PRO/AH/EDR> Yellow fever - Africa (03): Cote d'Ivoire (AB)
Archive Number: 20230530.8710308
 情報源 Outbreak News Today 2023年5月29日
コートジボワールで黄熱感染例 A polymerase chain reaction (PCR)-positive case of yellow fever が報告された。8日,the Institut Pasteur in Dakar で確認された。アビジャン Cocody-Bengerville in Abidjan の35歳男性で,黄熱ワクチン接種歴は不明であり,4月4日に発症し,同6日に検体が採取された ... 
[Mod.TY- the Cote d'Ivoire では散発性に黄熱の発生があり,同国を含むアフリカの広い範囲に常在する。2023年1月3日,the WHO は2022年に12 countries in the WHO African Region (カメルーン Cameroon, 中央アフリカ共和国 the Central African Republic, チャド Chad, コートジボワール Côte d'Ivoire, コンゴ民主共和国 the Democratic Republic of the Congo, ガーナ Ghana, ケニア Kenya, ニジェール Niger, ナイジェリア Nigeria, コンゴ共和国 the Republic of the Congo, シエラレオネ Sierra Leone, and ウガンダ Uganda)から黄熱が報告され,うち8か国(カメルーン,中央アフリカ,チャド,コートジボワール,コンゴ(民),ガーナ,ナイジェリア,コンゴ共和国)では2021年から感染伝播が継続しているとしている (20230105.8707616)。コートジボワールでは2023年4月に入っても黄熱ウイルス感染伝播が続いていることが報告された。同国内の現在のワクチン接種状況については報告されていない]
参考項目 2019
Yellow fever - Africa (10): Cote d'Ivoire 20190730.6596818