2024年9月27日

マールブルグ病 ルワンダ
COVID-19 the new XEC variant
狂犬病 マレーシア

● ハンタウイルス チリ
PRO/AH/EDR> Hantavirus - Americas (20): Chile (BI)
Archive Number: 20240927.8719020
 情報源 ADN [in Spanish] 2024年9月25日
受刑者1名 an inmate from the Concepción prison in the Biobío region がハンタウイルス the hantavirus 感染のため医療センターに移送された。
発生後の module 3 の調査でげっ歯類の糞が発見された。
関連項目 
Hantavirus - Americas (18): Chile (LG), Panama (VR) 20240725.8717741

● リステリア症 スイス
PRO/EDR> Listeriosis - Switzerland: baker's yeast products, 2022-2024, fatal
Archive Number: 20240927.8719010
 情報源 Emerging Infectious Diseases(EID)2024年9月25日
原著タイトル Outbreak of listeriosis likely associated with baker's yeast products, Switzerland, 2022-2024. Emerg Infect Dis. 2024.
34人の患者が発生した,スイス国内の長期間に広範囲のリステリア症アウトブレイク a prolonged and diffuse outbreak of listeriosis in Switzerland について報告する。
The first case は April 2022 に発生し,2023年にピークとなった。
The last known case は June 2024 に報告された。
the Swiss Federal Office of Public Health による質問票によるアウトブレイク調査が開始されたが,食品の特定には至らなかった。
患者の年齢の中央値は79歳(0-93歳)で,国内の発生地域は広範囲に分布している。
34例のうち7例が死亡し,いずれもリステリア症が直接的な死因だった。
血液(28)と髄液(2),顔面皮膚病変のスワブ(1)から the 34 human _Listeria monocytogenes_ isolates recovered が分離された。
遺伝子解析方法 ... 
すべての患者からの分離菌と,市販のパン酵母製品と同製品の製造ラインから分離された菌に近い関連性が認められた genetically closely related (<2 allelic difference) to _L. monocytogenes_ isolated from baker's yeast (_Saccharomyces cerevisiae_) products from a commercial yeast factory and its production lines 。
2022年にこの酵母の製造会社 the baker's yeast manufacturer が,サンプル中の菌発生 the occurrence of _L. monocytogenes_ in yeast product samples を確認している。
References
[Mod.LL- 指摘されているとおり,酵母製品は菌の繁殖を抑える加熱処理が行われているが,大腸菌やサルモネラ菌の raw dough-associated illness outbreaks で得られた証拠から,baker's yeast or contaminated raw dough が生で摂取されたり交差汚染されたりすることによる健康被害のおそれがある]

● マールブルグ病 ルワンダ
PRO/AH/EDR> Marburg virus disease - Rwanda (01): conf, MOH, RFI
Archive Number: 20240927.8719034
 情報源 Reuters 2024年9月27日
ルワンダ初のウイルス出血熱のマールブルグ病症例 its first cases of Marburg disease が確認されたと,27日に保健省が明らかにした。感染源の調査が行われている。感染の症例数は明らかにされておらず,few cases と発表されている。
Marburg は致死率が88% と高率で,エボラ Ebola の原因ウイルスと同じ科のウイルスであり,オオコウモリ fruit bats からヒトは感染する。感染した患者の体液との接触により感染が拡がる。高熱,激しい頭痛,嘔吐,筋肉痛,胃痛などの症状がある。
隣国のタンザニアでは2023年に患者が発生し,ウガンダでも2017年に同様の症例が発生している。
[Mod.JH- Equatorial Guinea also had cases of Marburg in 2023.]
参考項目 2023
Marburg virus disease - Equatorial Guinea (11): outbreak ended, WHO 20230608.8710487

● COVID-19

PRO/AH/EDR> COVID-19 update (40): selected countries/regions, XEC, oscillatory patterns, WHO
Archive Number: 20240927.8719005
[1] Selected countries/regions
 [A] カナダ Canada: Health Canada OKs Novavax's updated JN.1 COVID-19 vaccine for fall
 情報源 CBC News 2024年9月19日
カナダ保健当局 Health Canada が19日、最新のノババックス社のワクチン Novavax's updated COVID-19 vaccine の12歳以上への接種を承認したことを明らかにした。販売名は Nuvaxovid で、タンパク・ベースワクチン a protein-based vaccine である。
Health Canada によると,このワクチンは the JN.1 variant, an offshoot of Omicron を標的とするものに更新されている。全国的に現在、the JN.1 group が the main lineage in Canada となっており、The variant set off a massive wave of infections worldwide in November 2021.
ガイドライン
Guidance from the National Advisory Committee on Immunization (NACI) strongly recommends updated COVID-19 vaccinations starting this fall for high-risk groups:
 - All adults 65 and older(65歳以上)
 - 長期滞在施設入所者
 - 重症化リスクのある持病
 - Individuals in or from First Nations, Métis, and Inuit communities.
 - Members of racialized and other equity-deserving communities.
 - Those who are pregnant(妊娠女性)
 - People who provide essential community services.
 - All other individuals aged 6 months and older may also receive COVID-19 vaccines, NACI recommended.
 [B] 米国 US: New XEC subvariant potential threat heading into winter; vaccinations urged
 情報源 Los Angeles Times 2024年9月23日
 - ドイツで初めて報告された XEC は Western Europe に拡大
 - XEC makes up 13% of coronavirus samples in Germany and 7% in Britain. Will America be next? (1) ... 長文
 [C] US: Dominant variant KP.3.1.1 accounts for over 50% of cases, says CDC
 情報源 USA Today 2024年9月19日
COVID-19 variant KP.3.1.1 が全米の検査陽性例の半数以上を占めていることが、最新データ the latest projections from the Centers for Disease Control and Prevention (CDC) で示された。
the KP.3.1.1 variant accounted for 52.7% of positive infections, followed by KP.2.3 at 12.2%, in the 2-week stretch starting on 1 Sep and ending on 14 Sep [2024].
KP.3.1.1 は、7月後半からの2週間 the 2-week period starting on 21 Jul and ending on 3 Aug [2024] にはじめて the leading variant となった。
"The KP.3.1.1 variant は,米国内で感染循環する他の変異株と酷似 very similar し,現在の系統株はすべて All current lineages,2023年後半に新興した株の系統 descendants of JN.1 である" と a spokesperson at the CDC が説明されていた。
[Mod.LWW- At the time of writing, the page, last updated on 20 Sep 2024, reported 633 sequences detected in 28 countries and 23 US states (1). ]
 [D] ニュージーランド New Zealand: 1012 new cases, 2 more deaths
 情報源 Radio New Zealand (RNZ) 9月23日
ニュージーランドの新規感染例 The number of new cases of COVID-19 in New Zealand が先週以降増加しているが、関連する死者数は減少した。
over the week to Sunday [22 Sep 2024] に新たに1012 new cases  and 2 further deaths が確認され、このうち641例は再感染例 reinfections であった。
 [E] オーストラリア Australia: Infectious new strain could strike by Christmas
 情報源 Daily Mail 9月22日
また新たな変異株 another new COVID variant が世界中に拡がっており、クリスマスまでにオーストラリアに波及するおそれがある。
The "potentially more infectious" XEC strain は2024年6月にはじめてドイツで報告され,その後27か国で確認されている。専門家らは,北半球で気温が下がるこの数か月間に優位株になると予想している。
"XEC is a recombinant of 2 other sub variants " 
[2] What to know about the new COVID-19 XEC variant
 情報源 New Scientist 2024年9月20日
XEC と呼ばれる新たな変異株 A new COVID-19 variant が欧州を中心に拡大し、過去の変異株に比べて伝播しやすいとの証拠が示されている。専門家は過去のウイルスとほぼ同じで、現在のワクチンも有効としている。
What is the new COVID-19 XEC variant?
XEC は a combination of 2 other SARS-CoV-2 variants known as KP.3.3 and KS.1.1 で、たとえば1人の人間に2種類の変異株が感染し、遺伝情報がシェアされることで生まれる。2021年に南アフリカではじめて確認された感染力の強い変異株のオミクロンの子孫 a genetic offshoot of omicron である。
When and where was XEC identified?
XEC は2024年8月に、2か月前にベルリン Berlin で採取された検体から発見された。このウイルスの最初の感染例は5月にイタリアで発生していたが、9月になるまで国際データベース an international database that tracks SARS-CoV-2 variants, called the Global Initiative on Sharing All Influenza Data (GISAID) に登録されていなかった。
How many cases of XEC are there?
Data from GISAID では more than 600 cases of XEC が the UK, Germany, Canada, and the US(英国、ドイツ、カナダ、米国など)を含む27か国で確認されている。遺伝子配列解析が行われた検体の中でもっとも割合が高いのはフランスの約21%で、ドイツは15%、英国は8%、米国では1%となっている。
What are the symptoms of XEC?
So far, XEC causes the same symptoms as other COVID-19 variants 
How dangerous is XEC?
XEC doesn't appear to be more dangerous or produce more severe disease than past COVID-19 variants
Is XEC more transmissible?
It is too early to say whether XEC is more transmissible than other variants
Do COVID-19 vaccines still work against XEC?
現行のワクチン current COVID-19 vaccines に、防御効果 protect against XEC が期待できるとされている。
[3] Researchers identify new oscillatory patterns in COVID-19 cases across the US
 情報源 MSN.com 9月23日
the journal Scientific Reports 誌掲載の最近の研究の中で、これまで気づかれていなかった全米の感染パターン previously unrecognized spatiotemporal oscillations in coronavirus disease 2019 (COVID-19) cases throughout the United States が解析されている。
2020年1月以降、COVID-19 の原因ウイルスである the severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) に、全米で1億人近くが感染し、100万人以上が死亡した。
米国内において、冬季の感染が増加し、地域ごとに異なる時空間パターン Spatiotemporal patterns of SARS-CoV-2 transmission がみられてきた。このパターンのメカニズムの理解に、より詳しい研究が必要となっている。
About the study
感染開始から2022年8月15日までの937日間の、The New York Times からの48州の日別感染率 Daily COVID-19 case rates を解析した。郡レベル county-level analyses では、3108 counties within the continental US が対象となり、290万か所の data points の 1億5000万例の報告が得られた。 
These oscillatory waves(振動波)は全米内を予測された様式で移動し、6ヶ月ごとに between high and low case の間で変化するregional sub-epidemics を形成した。郡により2週間ごとの報告となっていたことから、a 14-day moving average を採用した
Study findings
州レベルのデータでは、顕著な南北振動 A prominent north-south oscillation of COVID-19 case rates を認めた。
Conclusions
937日間の3108郡で記録された約300万のデータポイントから、The COVID-19 epidemic は予測していなかった時空間データセット an unprecedented spatiotemporal dataset が得られた。
One significant finding として米国東部振動 the eastern US COVID-19 oscillation (EUCO) があり、北緯37度を挟んで感染率が変わる a north-south pattern である。
This oscillation accounted for only 5.2% of the total variance; however, it explained much of the regional variation in the northeast and southeast.
出典:原著タイトル Oscillating spatiotemporal patterns of COVID-19 in the United States. Sci Rep. 2024; 14,21562. 
[4] WHO: COVID-19 epidemiological update - 17 Sep 2024
 情報源 Would Health Organization(WHO)2024年9月17日
During the 4-week reporting period from 22 Jul to 18 Aug 2024, weekly SARS-CoV-2 PCR percent test positivity(検査陽性率)が12.4% から 10.2% に低下した。
世界的に JN.1 が最も多く報告されている変異株 the most reported variant of interest (VOI) で 20.6% of sequences in week 33 を占めているが、22.2% in week 30 から減少した。 KP.3.1.1 (a descendent lineage of JN.1 and a variant of interest, or VUM) が増えつつある increasing prevalence, 一方 LB.1 and JN.1.18, both also descendent lineages of JN.1 and VUMs の割合は安定している。
KP.3.1.1 は、week 33 に29.1% を占め、21.2% in week 30 であった。
during the 28-day period (22 Jul to 18 Aug 2024) の世界全体では、新規感染例と死者数がその前の28日間と比べて 23% and 44% 増加し、91か国からの報告例は23万8千例だった。
関連項目
COVID-19 update (39): S. Korea, US, India (RJ), subvariant XEC, WHO SE Asia, long COVID 20240915.8718765 

● 狂犬病 マレーシア

PRO/AH/EDR> Rabies (80): Malaysia (SK) stray dog, spread
Archive Number: 20240927.8719023
 情報源 The Strait Times News 2024年9月26日
サラワク州 along the Malaysia-Indonesia border in Sarawak の野犬の狂犬病 rabies の感染拡大が続いている。獣医学当局者 Veterinary Service Department (JPV) Director-General は、Sarawak 州内を狂犬病の症状のある野犬が自由に動き回っており、感染伝播につながっていると述べた。
"2017年以降、74例の狂犬病に寄る死亡例が記録されており、このうち6例2024年に発生している" と説明した。
一方、マレー半島 Peninsular Malaysia,中でもタイ国境の Perlis, Kedah, Perak, and Kelantan などの地域では、ワクチン接種によりこのような症例は発生していないと述べられている。
"たとえば Perlis では,継続してイヌを含む動物に対してワクチンを接種することで,国境から a 50 to 80 km の範囲に免疫ベルト地帯 an immune belt が確立されている。" 
関連項目
Rabies (52): Malaysia (SK) additional cases, human, fatal 20240615.8717052

● 食中毒 ベトナム
PRO/EDR> Foodborne illness - Viet Nam (25): (VL) update, legal procedures
Archive Number: 20240927.8719021
 情報源 VN Express [in Vietnamese] 2024年9月25日
セレウス菌 _Bacillus cereus_, 大腸菌 _E. coli_, and サルモネラ菌 _Salmonella_ spp. bacteria が、豆と人参入り豚肉炒め stir-fried pork with beans and carrots から検出された。工業団地の被服産業労働者287人の食中毒 poisoning for 287 garment workers in Hoa Phu industrial park の原因となった食品である。Bo Hsing Company Limited (specializing in garment, in Hoa Phu industrial park, Long Ho district) 社における食中毒から1ヶ月半が経過した、9月25日に食品安全衛生局 the Food Safety and Hygiene Department of Vinh Long province から発表された。 
8月12日のランチで、savory dishes [such as] white rice(白米), braised pork(豚肉)with duck eggs(ダックの卵), stir-fried corn(コーン)with lean meat and radish(ラディッシュ), and seaweed(海藻)soup, [while] vegetarian meals included dishes such as stir-fried corn, fried tofu(とうふ), and vegetarian stew が提供された。The common desserts デザートは Vinamilk yogurt(ヨーグルト)and Moc Chau fresh milk(ミルク)だった。
食事の後、287 workers が胃痛、嘔気、下痢などの症状を発症し、221人が救急室を受診したが現在は落ち着いている。
関連項目
Foodborne illness - Viet Nam (24): (BK) school setting, S. aureus 20240924.8718943

● 髄膜炎菌性疾患 ベトナム
PRO/EDR> Meningococcal disease - Viet Nam: (HC) fatal
Archive Number: 20240927.8719019
 情報源 VN Express [in Vietnamese] 2024年9月25日
髄膜炎菌性疾患 meningococcal disease のためホーチミン市熱帯病病院 the Ho Chi Minh City Hospital for Tropical Diseases に入院した52歳の患者が6時間後に死亡し、数年ぶりの地域内感染による死亡例となった。
Binh Chanh District 在住のこの患者は、地図状の皮下出血 a state of skin hemorrhages (map-like) と壊死を伴う発疹のため、9月24日に入院した。前日に発熱、悪寒、痛みの症状があり、医師らは人工呼吸器、血液透析、抗生物質と昇圧剤などによる治療を行ったがまもなく死亡した。
患者は夫とともに a motel in Da Phuoc commune, Binh Chanh district に住み、a company in Long An province に勤務していた。濃厚接触者2名に症状は認められず、予防的抗生物質が投与されている。
関連項目
Meningitis - Viet Nam: (PT) Streptococcus suis, pork offal 20240704.8717373

● 東部ウマ脳炎 カナダ、米国
PRO/AH/EDR> Eastern equine encephalitis - North America (18): Canada, USA, horse
Archive Number: 20240927.8719025
カナダ Canada
[1] Quebec (Lanaudière and Mirabel): horses
 情報源 News 24 [in French] 2024年9月19日
2 Québec horses positive for EEE
Two horses from Québec recently tested positive for Eastern equine encephalitis (EEE). The horses lived in Lanaudière and Mirabel.
[2] Ontario (Hastings County): miniature horse: The Horse 9月25日
Ontario Stallion Tests Positive for EEE
On 23 Sep 2024 a 4-year-old Miniature Horse stallion in Hastings County, Ontario, tested positive for Eastern equine encephalitis (EEE). 
米国 USA
[3] Maine (Penobscot County): horse: EquiManagement 9月16日
2 Maine Horses Test Positive for EEE
Two horses in Penobscot County, Maine, recently tested positive for Eastern equine encephalitis (EEE). 
[4] New Jersey (Salem County): horse
 情報源 : New Jersey Department of Agriculture 2024年9月12日
Second Eastern Equine Encephalitis Case for New Jersey in 2024
A Salem County geriatric gelding has been identified as a confirmed case of Eastern Equine Encephalitis (EEE), a serious mosquito-borne illness in horses, in New Jersey. It is the 2nd reported case of EEE for a New Jersey horse in 2024. 
[5] Michigan (Kalamazoo, St. Joseph, Allegan Counties): horses: Equus Magazine 9月18日
EEE and WNV cases confirmed in Michigan
Three horses in Michigan recently contracted mosquito-borne diseases. The horses lived in Kalamazoo, St. Joseph and Allegan counties.
[6] New York (Franklin County) horse: Equimanagement 9月19日
EEE Confirmed in New York Horse
On 18 Sep 2024, State Animal Health Officials reported a 9-year-old crossbreed horse on a farm in Franklin County, New York, tested positive for Eastern equine encephalitis (EEE). 
関連項目
Eastern equine encephalitis - North America (17): USA (NY) human, fatal 20240926.8718947

● ランピースキン病 韓国
PRO/AH/EDR> Lumpy skin disease - South Korea (05): cattle, domestic, WOAH
Archive Number: 20240927.8719022
 情報源 WOAH-WAHIS (World Animal Health Information System) 2024年9月25日
Korea (Rep. of) - Lumpy skin disease virus (Inf. with) - Follow-up report 3
Started: 12 Aug 2024
Reason for notification: Recurrence of an eradicated disease
Date of last occurrence: 21 Dec 2023
Disease: Lumpy skin disease virus (Inf. with)
Causal agent: Lumpy skin disease virus
Event status: Ongoing
This event pertains to areas within the country.
Quantitative data summary
Outbreak location: Gimsaeng-ro, Geumga-myeon, Chungju-si, Chungcheongbuk-do, Republic of Korea: Farm
種/頭数/症例数/死亡/廃棄/処分/ワクチン
Cattle (domestic) / 35 / 2 / - / 2 / - / -
関連項目
Lumpy skin disease - South Korea (04): cattle, domestic, WOAH 20240921.8718896

● 炭疽 エルサルバドル
PRO/AH/EDR> Anthrax - El Salvador: cattle, fatal
Archive Number: 20240927.8719018
 情報源 El Mundo [in Spanish] 2024年9月18日
Cattle ranchers on alert for disease, but say herd remains healthy
農業委員会 The Rural and Indigenous Agricultural Board が、炭疽によるウシの散発的な死亡 sporadic deaths of cattle due to blackleg and anthrax を報告している。